MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella

Total Repeats: 283

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018605	TTTTCT	2	12	296	307	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	409913918
2	NC_018605	ATTTTT	2	12	2500	2511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406024903
3	NC_018605	AGCAGA	2	12	8189	8200	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406024908
4	NC_018605	GATACA	2	12	9230	9241	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406024910
5	NC_018605	ATACTG	5	30	9702	9731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406024910
6	NC_018605	GATACA	2	12	10454	10465	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406024911
7	NC_018605	ACGTAG	2	12	10672	10683	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406024911
8	NC_018605	TCTGAA	2	12	11192	11203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406024911
9	NC_018605	TAAATA	2	12	16354	16365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024917
10	NC_018605	CAATCG	2	12	18256	18267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406024918
11	NC_018605	AAGAAA	2	12	22335	22346	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406024921
12	NC_018605	AGATCA	2	12	22596	22607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406024922
13	NC_018605	CATTAC	2	12	22722	22733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024922
14	NC_018605	TTTTCT	2	12	25707	25718	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406024925
15	NC_018605	TAATCC	2	12	27645	27656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024926
16	NC_018605	GATATT	2	12	28937	28948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406024927
17	NC_018605	AAAATA	2	12	30791	30802	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406024928
18	NC_018605	TTTTAC	2	12	31724	31735	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406024929
19	NC_018605	GTAATG	2	12	36180	36191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024932
20	NC_018605	TTTTCT	2	12	36566	36577	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406024932
21	NC_018605	CAAAAG	2	12	42584	42595	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406024938
22	NC_018605	AGAAAA	2	12	44086	44097	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406024939
23	NC_018605	AATGAA	2	12	46239	46250	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406024941
24	NC_018605	TGTAAT	2	12	48689	48700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406024944
25	NC_018605	GCATAG	2	12	49363	49374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406024944
26	NC_018605	ACTCCA	2	12	52280	52291	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	406024948
27	NC_018605	GCTTTA	2	12	53443	53454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406024949
28	NC_018605	ACATCG	2	12	60093	60104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406024954
29	NC_018605	TAAACT	2	12	60328	60339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406024954
30	NC_018605	GTAATG	2	12	61812	61823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024955
31	NC_018605	TTTTCT	2	12	62198	62209	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406024955
32	NC_018605	AAGGGA	2	12	67968	67979	50 %	0 %	50 %	0 %	406024961
33	NC_018605	ATCCTT	2	12	69678	69689	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406024962
34	NC_018605	ATTTTG	2	12	74279	74290	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406024968
35	NC_018605	ACAATA	2	12	74352	74363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406024968
36	NC_018605	GGTAAT	2	12	77799	77810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024970
37	NC_018605	GATATG	2	12	80019	80030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024974
38	NC_018605	ATACAC	2	12	80047	80058	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406024974
39	NC_018605	ATGGTT	2	12	80798	80809	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406024977
40	NC_018605	TATCAA	2	12	85557	85568	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406024984
41	NC_018605	TAAAAA	2	12	86338	86349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406024985
42	NC_018605	CATTAC	2	12	91695	91706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024991
43	NC_018605	TCCATA	2	12	91924	91935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024992
44	NC_018605	CTTCTC	2	12	92936	92947	0 %	50 %	0 %	50 %	406024993
45	NC_018605	GTAATG	2	12	93657	93668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024994
46	NC_018605	AGATGG	2	12	100265	100276	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	406025000
47	NC_018605	AAATAA	2	12	104513	104524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406025003
48	NC_018605	ATTGCA	2	12	108103	108114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025005
49	NC_018605	GCTATG	2	12	115857	115868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406025013
50	NC_018605	TAAAAC	2	12	122894	122905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406025018
51	NC_018605	TTGGTT	2	12	134634	134645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025026
52	NC_018605	AAATAA	2	12	136313	136324	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406025029
53	NC_018605	TTTGTT	2	12	139198	139209	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406025035
54	NC_018605	ACCTTT	2	12	141615	141626	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406025042
55	NC_018605	CTTGCC	2	12	141689	141700	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	406025042
56	NC_018605	AATGGT	2	12	142428	142439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025043
57	NC_018605	ATTGCG	2	12	143354	143365	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406025046
58	NC_018605	TTTTTG	2	12	144688	144699	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406025048
59	NC_018605	CAAAAA	2	12	146348	146359	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	406025050
60	NC_018605	AAACAA	2	12	146582	146593	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	406025050
61	NC_018605	AAACAA	2	12	146819	146830	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	406025050
62	NC_018605	AAACAA	2	12	147050	147061	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	406025050
63	NC_018605	AACAAA	2	12	147291	147302	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	406025050
64	NC_018605	ATATTC	2	12	152828	152839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406025058
65	NC_018605	TACTTT	2	12	153700	153711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406025059
66	NC_018605	ATCAAA	2	12	156151	156162	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406025061
67	NC_018605	CTGATG	2	12	160248	160259	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406025065
68	NC_018605	TATAAC	2	12	164107	164118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406025068
69	NC_018605	AATTTT	2	12	164176	164187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025068
70	NC_018605	TAAAAA	2	12	170629	170640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406025076
71	NC_018605	ATTAGA	2	12	173384	173395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025077
72	NC_018605	TGAAGA	2	12	173708	173719	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406025077
73	NC_018605	TGGTAG	2	12	174439	174450	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	406025078
74	NC_018605	AGCAGG	2	12	180715	180726	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	406025084
75	NC_018605	ATTTTT	2	12	184161	184172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406025087
76	NC_018605	TTACAT	2	12	184653	184664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406025088
77	NC_018605	GTAACC	2	12	191321	191332	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406025092
78	NC_018605	TGGGAT	2	12	195222	195233	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	406025095
79	NC_018605	GATTCA	2	12	197654	197665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025098
80	NC_018605	AGAATG	2	12	199865	199876	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406025100
81	NC_018605	AAAGAT	2	12	205017	205028	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406025105
82	NC_018605	TTTTCT	2	12	206509	206520	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406025107
83	NC_018605	CTAATA	2	12	206741	206752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406025107
84	NC_018605	GGATTA	2	12	208990	209001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025108
85	NC_018605	TGAACG	2	12	214833	214844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406025114
86	NC_018605	CAGATG	2	12	215189	215200	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406025114
87	NC_018605	TTAATA	2	12	215765	215776	50 %	50 %	0 %	0 %	406025115
88	NC_018605	ATGCCT	2	12	224982	224993	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406025120
89	NC_018605	ATAGAT	2	12	225488	225499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025120
90	NC_018605	ATGTAG	2	12	229606	229617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025122
91	NC_018605	TAGGGT	2	12	230339	230350	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	406025123
92	NC_018605	ATTTGG	2	12	231130	231141	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406025124
93	NC_018605	AAAAAT	2	12	244830	244841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406025137
94	NC_018605	AGGCCA	2	12	245527	245538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025138
95	NC_018605	GCAATC	2	12	250533	250544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406025141
96	NC_018605	ACCAGA	2	12	250901	250912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	406025141
97	NC_018605	AAAACC	2	12	257669	257680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025148
98	NC_018605	AAATTG	2	12	261458	261469	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025152
99	NC_018605	TTCTGT	2	12	264702	264713	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	406025154
100	NC_018605	GAAAAC	2	12	275530	275541	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406025161
101	NC_018605	AGATCA	2	12	275789	275800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406025161
102	NC_018605	CATTAC	2	12	275915	275926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025161
103	NC_018605	TTCTAC	2	12	276969	276980	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406025163
104	NC_018605	TTTCTT	2	12	279770	279781	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406025164
105	NC_018605	TGGTAG	2	12	282053	282064	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	406025165
106	NC_018605	TACTTC	2	12	284868	284879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406025166
107	NC_018605	AAATCT	2	12	288066	288077	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406025173
108	NC_018605	AAAAGA	2	12	288275	288286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406025173
109	NC_018605	GCAAAA	2	12	288696	288707	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406025174
110	NC_018605	AAGAAA	2	12	294785	294796	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406025180
111	NC_018605	AAGAAA	2	12	295133	295144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406025181
112	NC_018605	AGATCA	2	12	295394	295405	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406025181
113	NC_018605	CATTAC	2	12	295520	295531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025181
114	NC_018605	CCTAAA	2	12	297009	297020	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406025183
115	NC_018605	TAGATA	2	12	297673	297684	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025183
116	NC_018605	TAGTAT	2	12	298675	298686	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406025185
117	NC_018605	CAGGTG	2	12	306856	306867	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	406025195
118	NC_018605	ATCAAT	2	12	321924	321935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406025211
119	NC_018605	TTCTTT	2	12	322597	322608	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406025212
120	NC_018605	ATCTGA	2	12	324609	324620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025213
121	NC_018605	TTTAGC	2	12	326686	326697	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406025216
122	NC_018605	TATATT	2	12	334234	334245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025223
123	NC_018605	TTTAAT	2	12	334301	334312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025223
124	NC_018605	TTAACC	2	12	336674	336685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025224
125	NC_018605	AGTTGC	2	12	347023	347034	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406025235
126	NC_018605	TACCCA	2	12	351409	351420	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	406025238
127	NC_018605	AGAAAT	2	12	356020	356031	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406025243
128	NC_018605	TGATTT	2	12	356994	357005	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406025244
129	NC_018605	TCTATT	2	12	364424	364435	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406025248
130	NC_018605	CTTTTT	2	12	366746	366757	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406025249
131	NC_018605	AATAGC	2	12	367857	367868	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406025249
132	NC_018605	AGAAAA	2	12	368244	368255	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406025249
133	NC_018605	AGAATA	2	12	369214	369225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406025249
134	NC_018605	GGTCAA	2	12	373943	373954	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406025253
135	NC_018605	AGTTTT	2	12	380221	380232	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406025258
136	NC_018605	ACCTGG	2	12	382450	382461	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406025261
137	NC_018605	TCACGT	2	12	384495	384506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406025263
138	NC_018605	CACAAG	2	12	386256	386267	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	406025264
139	NC_018605	TTATCT	2	12	391435	391446	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406025269
140	NC_018605	CAAGAA	2	12	392054	392065	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406025269
141	NC_018605	AAGATG	2	12	393985	393996	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406025271
142	NC_018605	TATTGA	2	12	395687	395698	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406025273
143	NC_018605	GAAAAA	2	12	403968	403979	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406025280
144	NC_018605	GATTAA	2	12	405844	405855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025280
145	NC_018605	CATTAA	2	12	417668	417679	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	406025292
146	NC_018605	AGAAAA	2	12	424046	424057	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406025300
147	NC_018605	GATAAA	2	12	428123	428134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406025304
148	NC_018605	TTTGGT	2	12	441841	441852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025324
149	NC_018605	CACTTT	2	12	446890	446901	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406025328
150	NC_018605	GCCATT	2	12	447832	447843	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406025329
151	NC_018605	CAATCG	2	12	448052	448063	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406025330
152	NC_018605	CGATAG	2	12	450055	450066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406025331
153	NC_018605	CTTATA	2	12	455445	455456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406025336
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159	NC_018605	TGGTGC	2	12	480370	480381	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	406025359
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164	NC_018605	CATAGA	2	12	488555	488566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406025366
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220	NC_018605	AGAACA	2	12	631981	631992	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406025511
221	NC_018605	GTAATG	2	12	647000	647011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025523
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226	NC_018605	CAAGCG	2	12	657264	657275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025534
227	NC_018605	AGATCA	2	12	658319	658330	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406025535
228	NC_018605	AAAAGT	2	12	661253	661264	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406025537
229	NC_018605	TTTTAG	2	12	676854	676865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406025553
230	NC_018605	TGATAA	2	12	683870	683881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025561
231	NC_018605	GATGCA	2	12	686693	686704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406025564
232	NC_018605	TGGCTT	2	12	686718	686729	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	406025564
233	NC_018605	AAAGGA	2	12	687433	687444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025564
234	NC_018605	AGAGGG	2	12	690575	690586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025568
235	NC_018605	ATTTTG	2	12	691038	691049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406025569
236	NC_018605	TTGGTT	2	12	697954	697965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025574
237	NC_018605	ATAAAA	2	12	698526	698537	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406025575
238	NC_018605	AGGAAG	2	12	698940	698951	50 %	0 %	50 %	0 %	406025575
239	NC_018605	ATATAG	2	12	702994	703005	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025578
240	NC_018605	CCTTAC	2	12	709339	709350	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	406025587
241	NC_018605	TTTCTG	2	12	710167	710178	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	406025588
242	NC_018605	CCTATT	2	12	710640	710651	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406025588
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245	NC_018605	CCAGTG	2	12	723131	723142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406025600
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247	NC_018605	AAGAGG	3	18	725487	725504	50 %	0 %	50 %	0 %	406025602
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249	NC_018605	GCATAT	2	12	742200	742211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025620
250	NC_018605	AAAGGA	2	12	745221	745232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025621
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253	NC_018605	TATAGA	2	12	749480	749491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025625
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261	NC_018605	TGTTAC	2	12	783456	783467	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406025653
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263	NC_018605	ATAGGT	2	12	792668	792679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025659
264	NC_018605	TTACTT	2	12	802579	802590	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406025665
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266	NC_018605	ATACAG	2	12	809783	809794	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406025671
267	NC_018605	ACCTCT	2	12	813672	813683	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	406025674
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269	NC_018605	TACGCC	2	12	817156	817167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	406025679
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281	NC_018605	AATGCT	2	12	873268	873279	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025726
282	NC_018605	ACATAG	6	36	881772	881807	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406025733
283	NC_018605	TACATC	2	12	886046	886057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025740

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.