MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella

Total Repeats: 757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018605	AGATC	2	10	2407	2416	40 %	20 %	20 %	20 %	406024903
2	NC_018605	GAACT	2	10	3582	3591	40 %	20 %	20 %	20 %	406024904
3	NC_018605	AAAAT	2	10	4638	4647	80 %	20 %	0 %	0 %	406024904
4	NC_018605	TTGGC	2	10	5092	5101	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018605	AAGGC	2	10	5376	5385	40 %	0 %	40 %	20 %	406024905
6	NC_018605	AGTTA	2	10	6353	6362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018605	TACAA	2	10	6869	6878	60 %	20 %	0 %	20 %	406024907
8	NC_018605	AGCCA	2	10	7670	7679	40 %	0 %	20 %	40 %	406024908
9	NC_018605	ATAGT	2	10	8464	8473	40 %	40 %	20 %	0 %	406024908
10	NC_018605	ATATA	2	10	8953	8962	60 %	40 %	0 %	0 %	406024910
11	NC_018605	GCACT	2	10	9393	9402	20 %	20 %	20 %	40 %	406024910
12	NC_018605	AATGG	2	10	11238	11247	40 %	20 %	40 %	0 %	406024911
13	NC_018605	AGTGG	2	10	12488	12497	20 %	20 %	60 %	0 %	406024913
14	NC_018605	TAAAA	2	10	14342	14351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018605	TAAAA	2	10	15795	15804	80 %	20 %	0 %	0 %	406024916
16	NC_018605	TTTAT	2	10	16377	16386	20 %	80 %	0 %	0 %	406024917
17	NC_018605	ATTTT	2	10	16986	16995	20 %	80 %	0 %	0 %	406024917
18	NC_018605	GGTAT	2	10	19439	19448	20 %	40 %	40 %	0 %	406024918
19	NC_018605	GCTCT	2	10	20059	20068	0 %	40 %	20 %	40 %	406024918
20	NC_018605	CTATG	2	10	20831	20840	20 %	40 %	20 %	20 %	406024919
21	NC_018605	GGATC	2	10	21598	21607	20 %	20 %	40 %	20 %	406024919
22	NC_018605	TTTGA	2	10	24275	24284	20 %	60 %	20 %	0 %	406024924
23	NC_018605	TAATA	2	10	26723	26732	60 %	40 %	0 %	0 %	406024925
24	NC_018605	TATTG	2	10	27717	27726	20 %	60 %	20 %	0 %	406024926
25	NC_018605	TTTTC	2	10	29699	29708	0 %	80 %	0 %	20 %	406024927
26	NC_018605	TGATT	2	10	30210	30219	20 %	60 %	20 %	0 %	406024927
27	NC_018605	TATTT	2	10	32827	32836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018605	ATCAC	2	10	33089	33098	40 %	20 %	0 %	40 %	406024930
29	NC_018605	GGTAC	2	10	33164	33173	20 %	20 %	40 %	20 %	406024930
30	NC_018605	CTCTT	2	10	33253	33262	0 %	60 %	0 %	40 %	406024930
31	NC_018605	CAGCT	2	10	33580	33589	20 %	20 %	20 %	40 %	406024930
32	NC_018605	AGGCC	2	10	35305	35314	20 %	0 %	40 %	40 %	406024931
33	NC_018605	CCAGC	2	10	39144	39153	20 %	0 %	20 %	60 %	406024937
34	NC_018605	GCATG	2	10	39303	39312	20 %	20 %	40 %	20 %	406024937
35	NC_018605	CAATA	2	10	41214	41223	60 %	20 %	0 %	20 %	406024938
36	NC_018605	AAGGG	2	10	42376	42385	40 %	0 %	60 %	0 %	406024938
37	NC_018605	AAATA	2	10	43488	43497	80 %	20 %	0 %	0 %	406024938
38	NC_018605	TAATC	2	10	43607	43616	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018605	TATAG	2	10	44608	44617	40 %	40 %	20 %	0 %	406024940
40	NC_018605	GGTAA	2	10	45109	45118	40 %	20 %	40 %	0 %	406024940
41	NC_018605	ATGGT	2	10	45588	45597	20 %	40 %	40 %	0 %	406024940
42	NC_018605	CAACA	2	10	47061	47070	60 %	0 %	0 %	40 %	406024941
43	NC_018605	AAATT	2	10	48507	48516	60 %	40 %	0 %	0 %	406024944
44	NC_018605	CTTTT	2	10	51999	52008	0 %	80 %	0 %	20 %	406024948
45	NC_018605	CCTAG	2	10	52463	52472	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018605	TTACG	2	10	52935	52944	20 %	40 %	20 %	20 %	406024949
47	NC_018605	ATAGA	2	10	53884	53893	60 %	20 %	20 %	0 %	406024949
48	NC_018605	TAAAA	2	10	55463	55472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018605	ATTTG	2	10	56702	56711	20 %	60 %	20 %	0 %	406024952
50	NC_018605	AACAG	2	10	57066	57075	60 %	0 %	20 %	20 %	406024952
51	NC_018605	TGTTC	2	10	58046	58055	0 %	60 %	20 %	20 %	406024953
52	NC_018605	GCTGA	2	10	58810	58819	20 %	20 %	40 %	20 %	406024953
53	NC_018605	ATACA	2	10	60212	60221	60 %	20 %	0 %	20 %	406024954
54	NC_018605	TGGTC	2	10	63221	63230	0 %	40 %	40 %	20 %	406024956
55	NC_018605	AGAAA	2	10	65271	65280	80 %	0 %	20 %	0 %	406024958
56	NC_018605	ATTTT	2	10	65340	65349	20 %	80 %	0 %	0 %	406024958
57	NC_018605	CAACG	2	10	66413	66422	40 %	0 %	20 %	40 %	406024959
58	NC_018605	GTTTT	2	10	69301	69310	0 %	80 %	20 %	0 %	406024961
59	NC_018605	CTCTA	2	10	69840	69849	20 %	40 %	0 %	40 %	406024962
60	NC_018605	AAATC	2	10	71619	71628	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018605	AAATA	2	10	72239	72248	80 %	20 %	0 %	0 %	406024965
62	NC_018605	ATAGA	2	10	72519	72528	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018605	CAATA	2	10	73031	73040	60 %	20 %	0 %	20 %	406024966
64	NC_018605	AAATA	2	10	73939	73948	80 %	20 %	0 %	0 %	406024967
65	NC_018605	TTGCT	2	10	75241	75250	0 %	60 %	20 %	20 %	406024968
66	NC_018605	ATCCA	2	10	77833	77842	40 %	20 %	0 %	40 %	406024970
67	NC_018605	CTGCG	2	10	78797	78806	0 %	20 %	40 %	40 %	406024972
68	NC_018605	GGCAA	2	10	79149	79158	40 %	0 %	40 %	20 %	406024973
69	NC_018605	AGACA	2	10	81887	81896	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018605	GCTTG	2	10	82469	82478	0 %	40 %	40 %	20 %	406024979
71	NC_018605	ATAAA	2	10	85819	85828	80 %	20 %	0 %	0 %	406024984
72	NC_018605	AAGAA	2	10	89782	89791	80 %	0 %	20 %	0 %	406024989
73	NC_018605	AAATC	2	10	90869	90878	60 %	20 %	0 %	20 %	406024990
74	NC_018605	TACCC	2	10	92871	92880	20 %	20 %	0 %	60 %	406024993
75	NC_018605	GAATA	2	10	93185	93194	60 %	20 %	20 %	0 %	406024993
76	NC_018605	ATTTT	2	10	96200	96209	20 %	80 %	0 %	0 %	406024996
77	NC_018605	TGCAT	2	10	97814	97823	20 %	40 %	20 %	20 %	406024998
78	NC_018605	CTATC	2	10	98344	98353	20 %	40 %	0 %	40 %	406024999
79	NC_018605	CGCTT	2	10	98560	98569	0 %	40 %	20 %	40 %	406024999
80	NC_018605	TGGTG	2	10	98676	98685	0 %	40 %	60 %	0 %	406024999
81	NC_018605	ACTGC	2	10	99474	99483	20 %	20 %	20 %	40 %	406024999
82	NC_018605	AATGC	2	10	99740	99749	40 %	20 %	20 %	20 %	406025000
83	NC_018605	TACAC	2	10	100881	100890	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_018605	ATTTT	2	10	101020	101029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018605	ACTCA	2	10	101765	101774	40 %	20 %	0 %	40 %	406025001
86	NC_018605	ATTTT	2	10	102078	102087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018605	AAGAT	2	10	102462	102471	60 %	20 %	20 %	0 %	406025002
88	NC_018605	ATGGT	2	10	103167	103176	20 %	40 %	40 %	0 %	406025003
89	NC_018605	AGCAG	2	10	103298	103307	40 %	0 %	40 %	20 %	406025003
90	NC_018605	TATCT	2	10	103402	103411	20 %	60 %	0 %	20 %	406025003
91	NC_018605	TTGAT	2	10	104045	104054	20 %	60 %	20 %	0 %	406025003
92	NC_018605	TAAAA	2	10	106561	106570	80 %	20 %	0 %	0 %	406025005
93	NC_018605	TGAAT	2	10	106948	106957	40 %	40 %	20 %	0 %	406025005
94	NC_018605	AATTT	2	10	107432	107441	40 %	60 %	0 %	0 %	406025005
95	NC_018605	AATTT	2	10	107637	107646	40 %	60 %	0 %	0 %	406025005
96	NC_018605	TACAA	2	10	109110	109119	60 %	20 %	0 %	20 %	406025006
97	NC_018605	TTAGA	2	10	112012	112021	40 %	40 %	20 %	0 %	406025009
98	NC_018605	ATAAA	2	10	112508	112517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018605	AATTA	2	10	112808	112817	60 %	40 %	0 %	0 %	406025010
100	NC_018605	ATGAA	2	10	113818	113827	60 %	20 %	20 %	0 %	406025011
101	NC_018605	AATCA	2	10	115082	115091	60 %	20 %	0 %	20 %	406025012
102	NC_018605	TAAAT	2	10	115329	115338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018605	TTTTA	2	10	115640	115649	20 %	80 %	0 %	0 %	406025013
104	NC_018605	GTATA	2	10	116218	116227	40 %	40 %	20 %	0 %	406025013
105	NC_018605	ATCAC	2	10	118602	118611	40 %	20 %	0 %	40 %	406025015
106	NC_018605	TTTGA	2	10	119756	119765	20 %	60 %	20 %	0 %	406025016
107	NC_018605	TGTAG	2	10	121401	121410	20 %	40 %	40 %	0 %	406025017
108	NC_018605	AAGTT	2	10	121580	121589	40 %	40 %	20 %	0 %	406025017
109	NC_018605	TGTAA	2	10	123640	123649	40 %	40 %	20 %	0 %	406025018
110	NC_018605	AAAAG	2	10	124657	124666	80 %	0 %	20 %	0 %	406025019
111	NC_018605	AAAGA	2	10	125444	125453	80 %	0 %	20 %	0 %	406025019
112	NC_018605	GCAAT	2	10	126605	126614	40 %	20 %	20 %	20 %	406025019
113	NC_018605	CACTA	2	10	128035	128044	40 %	20 %	0 %	40 %	406025019
114	NC_018605	AGAAA	2	10	129118	129127	80 %	0 %	20 %	0 %	406025019
115	NC_018605	TTGTT	2	10	129474	129483	0 %	80 %	20 %	0 %	406025019
116	NC_018605	ATTAT	2	10	130147	130156	40 %	60 %	0 %	0 %	406025020
117	NC_018605	AAAAT	2	10	131893	131902	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018605	TTGCT	2	10	132211	132220	0 %	60 %	20 %	20 %	406025022
119	NC_018605	GCCTA	2	10	133767	133776	20 %	20 %	20 %	40 %	406025024
120	NC_018605	TTTGC	2	10	137747	137756	0 %	60 %	20 %	20 %	406025032
121	NC_018605	TTTAA	2	10	139631	139640	40 %	60 %	0 %	0 %	406025037
122	NC_018605	CTTTT	2	10	141131	141140	0 %	80 %	0 %	20 %	406025040
123	NC_018605	CCTAC	2	10	141449	141458	20 %	20 %	0 %	60 %	406025042
124	NC_018605	TTTAA	2	10	144795	144804	40 %	60 %	0 %	0 %	406025048
125	NC_018605	ACAAA	2	10	147423	147432	80 %	0 %	0 %	20 %	406025050
126	NC_018605	ATAGT	2	10	148616	148625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018605	TTTTG	2	10	150991	151000	0 %	80 %	20 %	0 %	406025055
128	NC_018605	AAAAG	2	10	151015	151024	80 %	0 %	20 %	0 %	406025055
129	NC_018605	ATCCA	2	10	151222	151231	40 %	20 %	0 %	40 %	406025055
130	NC_018605	AATGG	2	10	151565	151574	40 %	20 %	40 %	0 %	406025055
131	NC_018605	TAATT	2	10	156827	156836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018605	ACCAT	2	10	157723	157732	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018605	TAGAT	2	10	158000	158009	40 %	40 %	20 %	0 %	406025063
134	NC_018605	TAAAT	2	10	163522	163531	60 %	40 %	0 %	0 %	406025068
135	NC_018605	GTTTC	2	10	166100	166109	0 %	60 %	20 %	20 %	406025070
136	NC_018605	AACCA	2	10	166315	166324	60 %	0 %	0 %	40 %	406025070
137	NC_018605	CCAAT	2	10	167155	167164	40 %	20 %	0 %	40 %	406025070
138	NC_018605	ATTAA	2	10	167805	167814	60 %	40 %	0 %	0 %	406025071
139	NC_018605	TGCTC	2	10	167991	168000	0 %	40 %	20 %	40 %	406025071
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151	NC_018605	ATGCA	2	10	179663	179672	40 %	20 %	20 %	20 %	406025083
152	NC_018605	AGAAT	2	10	182268	182277	60 %	20 %	20 %	0 %	406025085
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155	NC_018605	AAACC	2	10	185499	185508	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
156	NC_018605	TAAAA	2	10	185531	185540	80 %	20 %	0 %	0 %	406025090
157	NC_018605	TGTTT	2	10	185633	185642	0 %	80 %	20 %	0 %	406025090
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159	NC_018605	TATCT	2	10	186708	186717	20 %	60 %	0 %	20 %	406025091
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184	NC_018605	TTTAC	2	10	217650	217659	20 %	60 %	0 %	20 %	406025116
185	NC_018605	AGTTT	2	10	218251	218260	20 %	60 %	20 %	0 %	406025116
186	NC_018605	ATTAA	2	10	219552	219561	60 %	40 %	0 %	0 %	406025116
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260	NC_018605	TGGTG	2	10	292475	292484	0 %	40 %	60 %	0 %	406025178
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262	NC_018605	CAATA	2	10	294099	294108	60 %	20 %	0 %	20 %	406025179
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264	NC_018605	AATAT	2	10	297037	297046	60 %	40 %	0 %	0 %	406025183
265	NC_018605	TACGT	2	10	297991	298000	20 %	40 %	20 %	20 %	406025184
266	NC_018605	CTTCT	2	10	298410	298419	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
267	NC_018605	AGTAA	2	10	298472	298481	60 %	20 %	20 %	0 %	406025185
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269	NC_018605	ATTTT	2	10	300424	300433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_018605	ATTTA	2	10	300687	300696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_018605	ATTAT	2	10	303961	303970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_018605	GTATT	2	10	305185	305194	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
273	NC_018605	TATAA	2	10	305245	305254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_018605	TATTC	2	10	305468	305477	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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382	NC_018605	TAACG	2	10	426992	427001	40 %	20 %	20 %	20 %	406025303
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398	NC_018605	TAAAA	2	10	447118	447127	80 %	20 %	0 %	0 %	406025328
399	NC_018605	GTAAA	2	10	447233	447242	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
400	NC_018605	ATAGT	2	10	447302	447311	40 %	40 %	20 %	0 %	406025329
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403	NC_018605	CCATT	2	10	451581	451590	20 %	40 %	0 %	40 %	406025332
404	NC_018605	TGAAT	2	10	452635	452644	40 %	40 %	20 %	0 %	406025332
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406	NC_018605	GTTTT	2	10	453755	453764	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_018605	CTTTG	2	10	466316	466325	0 %	60 %	20 %	20 %	406025342
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420	NC_018605	CAATA	2	10	469924	469933	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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441	NC_018605	TTTGA	2	10	500552	500561	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_018605	TTAAA	2	10	512611	512620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_018605	TGATT	2	10	563138	563147	20 %	60 %	20 %	0 %	406025437
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