MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella

Total Repeats: 480

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018605	AGTA	2	8	5057	5064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018605	CGGC	2	8	11621	11628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018605	ATGG	2	8	12786	12793	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018605	TTTG	2	8	18000	18007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018605	TAGT	2	8	21952	21959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018605	TGGA	2	8	21971	21978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018605	TATG	2	8	24238	24245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018605	TTAT	2	8	30364	30371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018605	GTAA	2	8	30547	30554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018605	ATTT	2	8	32646	32653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018605	ACCA	2	8	32701	32708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018605	TTTA	2	8	33014	33021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018605	TAAA	2	8	36944	36951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018605	AATA	2	8	45901	45908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018605	ATTA	2	8	48411	48418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018605	AGAA	2	8	49874	49881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018605	ATAG	2	8	51185	51192	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018605	TTTA	2	8	52567	52574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018605	TTTA	2	8	55407	55414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018605	TAAA	2	8	55453	55460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018605	AAAT	2	8	56424	56431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018605	GGCC	2	8	59864	59871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018605	AAAC	2	8	62465	62472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018605	AGTA	2	8	79311	79318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018605	AGTA	2	8	80199	80206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018605	TAAT	2	8	81945	81952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018605	TTTC	2	8	84060	84067	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018605	CAGT	2	8	87055	87062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018605	TTAT	2	8	89284	89291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018605	AGGA	2	8	104831	104838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018605	TTAG	2	8	104960	104967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018605	ATTG	2	8	104986	104993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018605	AGAA	2	8	105083	105090	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018605	TCTT	2	8	105728	105735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018605	ATAA	2	8	109217	109224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018605	TAGA	2	8	109485	109492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018605	ATAA	2	8	109519	109526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018605	TTGT	2	8	112364	112371	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018605	TAAT	2	8	112414	112421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018605	AAAC	2	8	112585	112592	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018605	CTAA	2	8	118048	118055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018605	TTTA	2	8	120743	120750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018605	AAAT	2	8	121604	121611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018605	ATTT	2	8	121790	121797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018605	TGTT	2	8	121832	121839	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018605	ATTT	2	8	121950	121957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018605	ACAA	2	8	122033	122040	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018605	TTAA	2	8	132403	132410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018605	TAAA	2	8	132432	132439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018605	CTTT	2	8	134525	134532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018605	TAAA	2	8	146046	146053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018605	TTGC	2	8	148573	148580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018605	CTAT	2	8	149408	149415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018605	GCAC	2	8	152447	152454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018605	AATA	2	8	152840	152847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018605	AGGA	2	8	155041	155048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018605	TTGA	2	8	155270	155277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018605	CATT	2	8	155297	155304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018605	AATA	2	8	157682	157689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018605	AACA	2	8	157770	157777	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018605	TTAA	2	8	157877	157884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018605	TTTA	2	8	169072	169079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018605	TGCT	2	8	170489	170496	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018605	AATT	2	8	171411	171418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018605	TTTA	2	8	171536	171543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018605	TTCC	2	8	171742	171749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018605	ATAA	2	8	175688	175695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018605	GAAA	2	8	175722	175729	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018605	AATA	2	8	175738	175745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018605	GTAT	2	8	175855	175862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018605	ACCA	2	8	180077	180084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018605	TTTC	2	8	182718	182725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018605	TTAC	2	8	182820	182827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018605	AATT	2	8	183023	183030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018605	ATGG	2	8	185486	185493	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018605	ACTA	2	8	186219	186226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018605	ATTA	2	8	186242	186249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018605	AGTT	2	8	187322	187329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018605	AATA	2	8	187362	187369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018605	AAAT	2	8	187423	187430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018605	TCCT	2	8	187817	187824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018605	ACGC	2	8	188751	188758	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018605	ATTT	2	8	189095	189102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018605	TGCA	2	8	192549	192556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018605	TGCT	2	8	192647	192654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018605	TAAA	2	8	192714	192721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018605	AATA	2	8	192963	192970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018605	CTAT	2	8	194036	194043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018605	TATG	2	8	201875	201882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018605	GATC	2	8	202044	202051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018605	ATTT	2	8	206132	206139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018605	CAAA	2	8	206285	206292	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018605	AATG	2	8	210507	210514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018605	ATTT	2	8	210519	210526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018605	TCTA	2	8	213728	213735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018605	TGTT	2	8	224245	224252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018605	GGTT	2	8	224317	224324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018605	ATTT	2	8	224364	224371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018605	TTTG	2	8	224474	224481	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018605	TAGA	2	8	227542	227549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018605	TGCT	2	8	229321	229328	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018605	TCCA	2	8	229393	229400	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018605	ATAG	2	8	232222	232229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018605	TACC	2	8	232259	232266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018605	GCAT	2	8	232341	232348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018605	ATTG	17	68	232417	232484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018605	TATT	2	8	232531	232538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018605	ACTG	2	8	233169	233176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018605	TTAT	2	8	237481	237488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018605	ATGC	2	8	240031	240038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018605	CTAA	2	8	241303	241310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018605	TAAA	2	8	241777	241784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018605	TCTA	2	8	252896	252903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018605	TTTG	2	8	260577	260584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018605	TAGG	2	8	260766	260773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018605	CTTG	2	8	265658	265665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018605	ATTC	2	8	265796	265803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018605	AATT	2	8	268515	268522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018605	CTAC	2	8	268597	268604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018605	ATAG	2	8	269059	269066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018605	TTGT	2	8	269317	269324	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018605	TACG	2	8	269358	269365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018605	ATAA	2	8	269482	269489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018605	TAGC	2	8	270049	270056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018605	TGCC	2	8	270159	270166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018605	CTAG	2	8	270247	270254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018605	AATC	2	8	270415	270422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018605	TTTC	2	8	271036	271043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018605	TCAG	2	8	271259	271266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018605	GGGT	2	8	271562	271569	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018605	TTAT	2	8	271680	271687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018605	TATT	2	8	275282	275289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018605	GTAT	2	8	285112	285119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018605	TATT	2	8	286087	286094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018605	CATA	2	8	286100	286107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018605	TATT	2	8	286562	286569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018605	GGTG	2	8	290275	290282	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018605	ACGC	2	8	290284	290291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018605	TATT	2	8	290399	290406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018605	ATTT	2	8	290432	290439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018605	GTTT	2	8	291106	291113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018605	AAAG	2	8	291115	291122	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018605	GTTT	2	8	294523	294530	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018605	TAAA	2	8	295709	295716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018605	AATT	2	8	296714	296721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018605	ATTA	2	8	296743	296750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018605	ATAA	2	8	296890	296897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018605	GTCT	2	8	297809	297816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018605	GATC	2	8	300027	300034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018605	CAGA	2	8	301051	301058	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018605	CAAA	2	8	301283	301290	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.