MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella

Total Repeats: 10120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018605	TTA	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409913918
2	NC_018605	ACT	3	9	99	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409913918
3	NC_018605	TTA	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409913918
4	NC_018605	CTA	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409913918
5	NC_018605	CTT	2	6	310	315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409913918
6	NC_018605	TAA	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409913918
7	NC_018605	CAT	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409913918
8	NC_018605	GAA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409913918
9	NC_018605	GCT	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024903
10	NC_018605	GTT	2	6	792	797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406024903
11	NC_018605	TCC	2	6	831	836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406024903
12	NC_018605	ATG	2	6	914	919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024903
13	NC_018605	ATT	2	6	1077	1082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024903
14	NC_018605	CAG	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024903
15	NC_018605	TCT	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024903
16	NC_018605	CTA	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024903
17	NC_018605	ACG	2	6	1404	1409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024903
18	NC_018605	TTC	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024903
19	NC_018605	TAA	2	6	1576	1581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024903
20	NC_018605	GTA	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024903
21	NC_018605	TTA	2	6	1600	1605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024903
22	NC_018605	ATC	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024903
23	NC_018605	TCA	2	6	2032	2037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024903
24	NC_018605	CAC	2	6	2145	2150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024903
25	NC_018605	TCT	2	6	2155	2160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024903
26	NC_018605	TAG	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024903
27	NC_018605	TTC	2	6	2328	2333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024903
28	NC_018605	TGG	2	6	2397	2402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406024903
29	NC_018605	TCA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024904
30	NC_018605	ATA	2	6	2910	2915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024904
31	NC_018605	CTA	2	6	2989	2994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024904
32	NC_018605	ATG	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024904
33	NC_018605	GCT	2	6	3098	3103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024904
34	NC_018605	TTA	2	6	3104	3109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024904
35	NC_018605	ATA	2	6	3186	3191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024904
36	NC_018605	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024904
37	NC_018605	CAA	2	6	3506	3511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024904
38	NC_018605	GAA	2	6	3557	3562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024904
39	NC_018605	ATT	2	6	3639	3644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024904
40	NC_018605	AGG	2	6	3769	3774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406024904
41	NC_018605	AAC	2	6	3864	3869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024904
42	NC_018605	CCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024904
43	NC_018605	CTG	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024904
44	NC_018605	ACC	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024904
45	NC_018605	AGA	2	6	4093	4098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024904
46	NC_018605	TAC	2	6	4230	4235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024904
47	NC_018605	AAG	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024904
48	NC_018605	TAG	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024904
49	NC_018605	ATG	2	6	4548	4553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024904
50	NC_018605	CAG	2	6	4721	4726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024904
51	NC_018605	AAG	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024905
52	NC_018605	TAA	2	6	5205	5210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024905
53	NC_018605	AGG	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406024905
54	NC_018605	AGC	2	6	5392	5397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024905
55	NC_018605	AGA	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024905
56	NC_018605	GTA	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024905
57	NC_018605	ATA	2	6	5498	5503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024905
58	NC_018605	GAA	2	6	5504	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024905
59	NC_018605	CAG	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024905
60	NC_018605	CAG	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024905
61	NC_018605	AGC	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024905
62	NC_018605	ACC	3	9	5674	5682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024905
63	NC_018605	CAG	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024905
64	NC_018605	GGT	2	6	5774	5779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406024905
65	NC_018605	GTC	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024905
66	NC_018605	ACA	3	9	5830	5838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024905
67	NC_018605	AAT	2	6	5843	5848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024905
68	NC_018605	AAT	2	6	5867	5872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024905
69	NC_018605	TAC	2	6	5878	5883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024905
70	NC_018605	ATA	2	6	6202	6207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024906
71	NC_018605	CCT	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406024907
72	NC_018605	AAT	2	6	6582	6587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024907
73	NC_018605	ACC	2	6	6887	6892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024907
74	NC_018605	GTT	2	6	7039	7044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406024907
75	NC_018605	TAT	2	6	7152	7157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024907
76	NC_018605	GTA	2	6	7176	7181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024907
77	NC_018605	CTA	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024908
78	NC_018605	AGC	2	6	7742	7747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024908
79	NC_018605	GTT	2	6	7899	7904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406024908
80	NC_018605	GAA	3	9	8148	8156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024908
81	NC_018605	CAA	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024908
82	NC_018605	ACC	2	6	8183	8188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024908
83	NC_018605	AGT	2	6	8319	8324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024908
84	NC_018605	ATC	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024908
85	NC_018605	AGG	2	6	8416	8421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406024908
86	NC_018605	TCA	2	6	8427	8432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024908
87	NC_018605	ACA	2	6	8454	8459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024908
88	NC_018605	ATA	2	6	8494	8499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024908
89	NC_018605	TAG	2	6	8617	8622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024909
90	NC_018605	ATA	2	6	8623	8628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024909
91	NC_018605	ACA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024909
92	NC_018605	GAT	2	6	8667	8672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024909
93	NC_018605	AGC	2	6	8689	8694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024909
94	NC_018605	TAG	2	6	8985	8990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
95	NC_018605	GAT	2	6	9188	9193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
96	NC_018605	GAT	2	6	9215	9220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
97	NC_018605	ACT	2	6	9242	9247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024910
98	NC_018605	AGA	2	6	9265	9270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024910
99	NC_018605	ACA	2	6	9311	9316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024910
100	NC_018605	CAG	3	9	9329	9337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024910
101	NC_018605	TCT	2	6	9368	9373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024910
102	NC_018605	AAG	2	6	9421	9426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024910
103	NC_018605	TGA	2	6	9499	9504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
104	NC_018605	GAT	2	6	9509	9514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
105	NC_018605	GAT	2	6	9521	9526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
106	NC_018605	AAC	2	6	9557	9562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024910
107	NC_018605	TAA	3	9	9586	9594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024910
108	NC_018605	ATA	2	6	9636	9641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024910
109	NC_018605	ATG	2	6	9693	9698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
110	NC_018605	GAT	2	6	9737	9742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
111	NC_018605	TAG	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
112	NC_018605	AGA	2	6	10351	10356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024911
113	NC_018605	GAT	2	6	10412	10417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024911
114	NC_018605	GAT	2	6	10439	10444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024911
115	NC_018605	ACT	2	6	10466	10471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024911
116	NC_018605	AGA	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024911
117	NC_018605	ACA	2	6	10535	10540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024911
118	NC_018605	AGA	2	6	10554	10559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024911
119	NC_018605	CTA	2	6	10569	10574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024911
120	NC_018605	TGA	2	6	10582	10587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024911
121	NC_018605	GCT	2	6	10771	10776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024911
122	NC_018605	TAG	2	6	10864	10869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024911
123	NC_018605	CCA	2	6	10910	10915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024911
124	NC_018605	ATA	2	6	10941	10946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024911
125	NC_018605	ATC	2	6	10963	10968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024911
126	NC_018605	AGA	2	6	11053	11058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024911
127	NC_018605	CAA	2	6	11093	11098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024911
128	NC_018605	TGT	2	6	11116	11121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406024911
129	NC_018605	ATG	3	9	11229	11237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024911
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253	NC_018605	ATT	2	6	22090	22095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024920
254	NC_018605	ATT	2	6	22145	22150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024921
255	NC_018605	TCA	2	6	22173	22178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024921
256	NC_018605	TTC	2	6	22189	22194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024921
257	NC_018605	GAT	2	6	22247	22252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024921
258	NC_018605	AAG	2	6	22327	22332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024921
259	NC_018605	GTA	2	6	22358	22363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024921
260	NC_018605	ATA	2	6	22517	22522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024922
261	NC_018605	GTA	2	6	22556	22561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024922
262	NC_018605	GGC	2	6	22566	22571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406024922
263	NC_018605	ATA	2	6	22830	22835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024922
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274	NC_018605	CAT	2	6	24009	24014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024923
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278	NC_018605	ATA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024923
279	NC_018605	TAT	2	6	24335	24340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024924
280	NC_018605	CAT	2	6	24389	24394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024924
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282	NC_018605	CTA	2	6	24429	24434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024924
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284	NC_018605	TGC	2	6	24471	24476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024924
285	NC_018605	GTA	2	6	24498	24503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024924
286	NC_018605	ATA	2	6	24536	24541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024924
287	NC_018605	ACT	2	6	24590	24595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024924
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289	NC_018605	CCA	2	6	24997	25002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024925
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369	NC_018605	ATC	2	6	31909	31914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024929
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373	NC_018605	AAT	2	6	32289	32294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024929
374	NC_018605	GCA	2	6	32297	32302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024929
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