MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 1949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018604	ATAAAA	2	12	892	903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380779
2	NC_018604	TATGTT	2	12	3354	3365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434380782
3	NC_018604	TATCAG	2	12	4774	4785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434380785
4	NC_018604	TCCATA	2	12	5186	5197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
5	NC_018604	TCATTA	2	12	5244	5255	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434380785
6	NC_018604	ATTAAT	2	12	6708	6719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018604	AAAAAG	2	12	7399	7410	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434380787
8	NC_018604	GCTTTT	2	12	7687	7698	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434380787
9	NC_018604	TTAATG	2	12	8069	8080	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434380787
10	NC_018604	ATTTTT	2	12	9016	9027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380789
11	NC_018604	TCTATT	2	12	9150	9161	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434380789
12	NC_018604	TTTTCT	2	12	9415	9426	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380789
13	NC_018604	GTTGGG	2	12	11399	11410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434380790
14	NC_018604	GTTGGG	2	12	12604	12615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434380791
15	NC_018604	ATTTTA	2	12	13425	13436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380792
16	NC_018604	TTTTCT	2	12	14109	14120	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380792
17	NC_018604	TTGTGA	2	12	14992	15003	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434380793
18	NC_018604	AGATAG	2	12	15775	15786	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434380793
19	NC_018604	CATTAT	2	12	17035	17046	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434380794
20	NC_018604	TATTTT	2	12	17698	17709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380795
21	NC_018604	GGAGAT	2	12	19496	19507	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434380797
22	NC_018604	AGGTGC	2	12	26553	26564	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434380803
23	NC_018604	AATATA	2	12	27317	27328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380804
24	NC_018604	TAATTA	2	12	29523	29534	50 %	50 %	0 %	0 %	434380806
25	NC_018604	TTAATT	2	12	32083	32094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380809
26	NC_018604	ATTAAC	2	12	33168	33179	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380811
27	NC_018604	TATTTT	2	12	37082	37093	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380816
28	NC_018604	AAAGCA	2	12	38653	38664	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	434380817
29	NC_018604	TCCTTC	2	12	41612	41623	0 %	50 %	0 %	50 %	434380819
30	NC_018604	ATTTTT	2	12	42888	42899	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380820
31	NC_018604	AGAAAT	2	12	43392	43403	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380821
32	NC_018604	TAAAAA	2	12	43671	43682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380821
33	NC_018604	TCAAAT	2	12	43960	43971	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380821
34	NC_018604	ACTGTA	2	12	53457	53468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434380827
35	NC_018604	ATCAAC	2	12	54290	54301	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434380827
36	NC_018604	AGCATA	2	12	55925	55936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434380828
37	NC_018604	TTTGAG	2	12	57422	57433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434380829
38	NC_018604	TATAAT	2	12	58014	58025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018604	ATATGG	2	12	58215	58226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380830
40	NC_018604	CTGCTC	2	12	60357	60368	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	434380833
41	NC_018604	TTTTGT	2	12	61767	61778	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	434380834
42	NC_018604	ATGTTA	2	12	64664	64675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434380837
43	NC_018604	GTATTG	2	12	65216	65227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434380837
44	NC_018604	TGTATG	2	12	65439	65450	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434380837
45	NC_018604	TCTTTT	2	12	72789	72800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380843
46	NC_018604	TAATTT	2	12	73289	73300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380843
47	NC_018604	AATGAA	2	12	74943	74954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380844
48	NC_018604	TATCAA	2	12	75477	75488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380844
49	NC_018604	ATATTA	2	12	75607	75618	50 %	50 %	0 %	0 %	434380844
50	NC_018604	TTTTAC	2	12	76705	76716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434380846
51	NC_018604	ATAAAG	2	12	80509	80520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380849
52	NC_018604	AAAGAT	2	12	84743	84754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380853
53	NC_018604	TTGGTA	2	12	88340	88351	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018604	GCAAGG	2	12	91661	91672	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	434380862
55	NC_018604	TAAAAT	2	12	93648	93659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380864
56	NC_018604	TTTTTA	2	12	96567	96578	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018604	TGCTAT	2	12	97717	97728	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434380867
58	NC_018604	ATTGCT	2	12	99779	99790	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434380870
59	NC_018604	GAACGC	2	12	100770	100781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380871
60	NC_018604	ATAAAA	2	12	109635	109646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380880
61	NC_018604	TTCTTT	2	12	110310	110321	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380881
62	NC_018604	ACCAGA	2	12	110455	110466	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434380881
63	NC_018604	TGATAG	2	12	111263	111274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018604	GAAAAA	2	12	112917	112928	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434380884
65	NC_018604	TTGCTA	2	12	116144	116155	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434380887
66	NC_018604	ATGTTT	2	12	117416	117427	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434380887
67	NC_018604	ATTTTC	2	12	118998	119009	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434380889
68	NC_018604	ATCATA	2	12	119045	119056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380889
69	NC_018604	TAAAAC	2	12	126248	126259	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018604	AAAAAT	2	12	128116	128127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380897
71	NC_018604	ATTTAT	2	12	128928	128939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380897
72	NC_018604	TATTAA	2	12	129989	130000	50 %	50 %	0 %	0 %	434380897
73	NC_018604	TATTTT	2	12	130097	130108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380897
74	NC_018604	ATTTTA	2	12	130718	130729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380897
75	NC_018604	AGAAAA	2	12	133843	133854	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434380901
76	NC_018604	TAAATA	2	12	133977	133988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380902
77	NC_018604	TAAACT	2	12	134650	134661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380903
78	NC_018604	TATTTT	2	12	136609	136620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380904
79	NC_018604	TAAAGA	2	12	137683	137694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380905
80	NC_018604	TTATGA	2	12	142322	142333	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434380911
81	NC_018604	TATTTA	2	12	145486	145497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380913
82	NC_018604	ATTTAT	2	12	145502	145513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380913
83	NC_018604	TTTTAT	2	12	148734	148745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380918
84	NC_018604	ACAGAT	2	12	152020	152031	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434380919
85	NC_018604	TAGATA	2	12	152282	152293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380919
86	NC_018604	TAAGAA	2	12	163651	163662	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380927
87	NC_018604	AGAAAA	2	12	163906	163917	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434380928
88	NC_018604	ATAATT	2	12	164010	164021	50 %	50 %	0 %	0 %	434380928
89	NC_018604	AGAAAA	2	12	164053	164064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434380928
90	NC_018604	ATGAAG	2	12	164559	164570	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434380928
91	NC_018604	AATAGC	2	12	165567	165578	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434380930
92	NC_018604	TTATGT	2	12	167855	167866	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018604	ATTTTT	2	12	168359	168370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018604	GATATA	2	12	168533	168544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380934
95	NC_018604	ATGATA	2	12	168792	168803	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380934
96	NC_018604	TTCTTT	2	12	170236	170247	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380935
97	NC_018604	ATAAAA	2	12	176011	176022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380940
98	NC_018604	AATTAA	2	12	177440	177451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018604	AGTTAA	2	12	177498	177509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018604	TATAAT	2	12	181212	181223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018604	TATTTT	2	12	181612	181623	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380946
102	NC_018604	CTGCTC	2	12	182310	182321	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	434380947
103	NC_018604	AGTTAT	2	12	184710	184721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434380950
104	NC_018604	ACATTA	2	12	187948	187959	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380955
105	NC_018604	ATAATT	2	12	189691	189702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018604	CTGGTA	2	12	192565	192576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434380959
107	NC_018604	TGAAAA	2	12	192803	192814	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380959
108	NC_018604	TCTATA	2	12	193827	193838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434380960
109	NC_018604	TTTTCT	2	12	194303	194314	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380961
110	NC_018604	ATTTTA	2	12	196612	196623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018604	TATATT	2	12	197439	197450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380964
112	NC_018604	TAAGAG	2	12	202408	202419	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434380970
113	NC_018604	TTTATT	2	12	202515	202526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380970
114	NC_018604	TCTATG	2	12	203466	203477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434380970
115	NC_018604	TCAGCT	2	12	204003	204014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434380970
116	NC_018604	TCTTTT	2	12	205377	205388	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380970
117	NC_018604	AAAATA	2	12	213691	213702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380978
118	NC_018604	AAGTAT	2	12	217651	217662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380983
119	NC_018604	AATACC	2	12	218131	218142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434380983
120	NC_018604	ATAAAA	2	12	223362	223373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018604	TTCATC	2	12	224236	224247	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434380988
122	NC_018604	ATTAAA	2	12	228516	228527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380992
123	NC_018604	TAAATG	2	12	228773	228784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380992
124	NC_018604	GCTATA	2	12	230421	230432	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434380994
125	NC_018604	CTATGG	2	12	235788	235799	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434381002
126	NC_018604	TCTATA	2	12	236498	236509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434381002
127	NC_018604	ACTATA	2	12	237391	237402	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018604	CTGTTG	2	12	244250	244261	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434381010
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130	NC_018604	ATTATG	2	12	246380	246391	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434381012
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142	NC_018604	AACAAA	2	12	265875	265886	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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240	NC_018604	ATTTTT	2	12	421373	421384	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_018604	TCAGCA	2	12	425169	425180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434381185
242	NC_018604	TTTTTA	2	12	425748	425759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434381186
243	NC_018604	AAAGCT	2	12	427527	427538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434381187
244	NC_018604	ATATTA	2	12	435630	435641	50 %	50 %	0 %	0 %	434381194
245	NC_018604	TTTCTT	2	12	435901	435912	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434381195
246	NC_018604	TTTCTT	2	12	436186	436197	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434381195
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249	NC_018604	TATTTT	2	12	443471	443482	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_018604	TCTTTT	2	12	447012	447023	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434381208
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279	NC_018604	TAGCAA	2	12	486621	486632	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434381239
280	NC_018604	CCTGGA	2	12	490292	490303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434381243
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347	NC_018604	TAAAGC	2	12	576999	577010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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350	NC_018604	ATAATT	2	12	578462	578473	50 %	50 %	0 %	0 %	434381317
351	NC_018604	ACATAA	2	12	578587	578598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434381317
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357	NC_018604	AGTTTT	2	12	588189	588200	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434381326
358	NC_018604	TATCAA	2	12	588366	588377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
359	NC_018604	AAATTA	2	12	590267	590278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434381329
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362	NC_018604	TCTTTT	2	12	592678	592689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434381332
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373	NC_018604	TTTAAA	2	12	604010	604021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
374	NC_018604	TATAGC	2	12	607355	607366	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434381348
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381	NC_018604	AATATA	2	12	627045	627056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434381365
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390	NC_018604	ATATTT	2	12	635440	635451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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