MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 1742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018604	ATAAAA	2	12	892	903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380779
2	NC_018604	TATGTT	2	12	3354	3365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434380782
3	NC_018604	TATCAG	2	12	4774	4785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434380785
4	NC_018604	TCCATA	2	12	5186	5197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
5	NC_018604	TCATTA	2	12	5244	5255	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434380785
6	NC_018604	AAAAAG	2	12	7399	7410	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434380787
7	NC_018604	GCTTTT	2	12	7687	7698	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434380787
8	NC_018604	TTAATG	2	12	8069	8080	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434380787
9	NC_018604	ATTTTT	2	12	9016	9027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380789
10	NC_018604	TCTATT	2	12	9150	9161	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434380789
11	NC_018604	TTTTCT	2	12	9415	9426	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380789
12	NC_018604	GTTGGG	2	12	11399	11410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434380790
13	NC_018604	GTTGGG	2	12	12604	12615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434380791
14	NC_018604	ATTTTA	2	12	13425	13436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380792
15	NC_018604	TTTTCT	2	12	14109	14120	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380792
16	NC_018604	TTGTGA	2	12	14992	15003	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434380793
17	NC_018604	AGATAG	2	12	15775	15786	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434380793
18	NC_018604	CATTAT	2	12	17035	17046	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434380794
19	NC_018604	TATTTT	2	12	17698	17709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380795
20	NC_018604	GGAGAT	2	12	19496	19507	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434380797
21	NC_018604	AGGTGC	2	12	26553	26564	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434380803
22	NC_018604	AATATA	2	12	27317	27328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380804
23	NC_018604	TAATTA	2	12	29523	29534	50 %	50 %	0 %	0 %	434380806
24	NC_018604	TTAATT	2	12	32083	32094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380809
25	NC_018604	ATTAAC	2	12	33168	33179	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380811
26	NC_018604	TATTTT	2	12	37082	37093	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380816
27	NC_018604	AAAGCA	2	12	38653	38664	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	434380817
28	NC_018604	TCCTTC	2	12	41612	41623	0 %	50 %	0 %	50 %	434380819
29	NC_018604	ATTTTT	2	12	42888	42899	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380820
30	NC_018604	AGAAAT	2	12	43392	43403	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380821
31	NC_018604	TAAAAA	2	12	43671	43682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380821
32	NC_018604	TCAAAT	2	12	43960	43971	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380821
33	NC_018604	ACTGTA	2	12	53457	53468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434380827
34	NC_018604	ATCAAC	2	12	54290	54301	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434380827
35	NC_018604	AGCATA	2	12	55925	55936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434380828
36	NC_018604	TTTGAG	2	12	57422	57433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434380829
37	NC_018604	ATATGG	2	12	58215	58226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380830
38	NC_018604	CTGCTC	2	12	60357	60368	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	434380833
39	NC_018604	TTTTGT	2	12	61767	61778	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	434380834
40	NC_018604	ATGTTA	2	12	64664	64675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434380837
41	NC_018604	GTATTG	2	12	65216	65227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434380837
42	NC_018604	TGTATG	2	12	65439	65450	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434380837
43	NC_018604	TCTTTT	2	12	72789	72800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380843
44	NC_018604	TAATTT	2	12	73289	73300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380843
45	NC_018604	AATGAA	2	12	74943	74954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380844
46	NC_018604	TATCAA	2	12	75477	75488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380844
47	NC_018604	ATATTA	2	12	75607	75618	50 %	50 %	0 %	0 %	434380844
48	NC_018604	TTTTAC	2	12	76705	76716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434380846
49	NC_018604	ATAAAG	2	12	80509	80520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380849
50	NC_018604	AAAGAT	2	12	84743	84754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380853
51	NC_018604	GCAAGG	2	12	91661	91672	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	434380862
52	NC_018604	TAAAAT	2	12	93648	93659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380864
53	NC_018604	TGCTAT	2	12	97717	97728	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434380867
54	NC_018604	ATTGCT	2	12	99779	99790	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434380870
55	NC_018604	GAACGC	2	12	100770	100781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380871
56	NC_018604	ATAAAA	2	12	109635	109646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380880
57	NC_018604	TTCTTT	2	12	110310	110321	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380881
58	NC_018604	ACCAGA	2	12	110455	110466	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434380881
59	NC_018604	GAAAAA	2	12	112917	112928	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434380884
60	NC_018604	TTGCTA	2	12	116144	116155	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434380887
61	NC_018604	ATGTTT	2	12	117416	117427	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434380887
62	NC_018604	ATTTTC	2	12	118998	119009	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434380889
63	NC_018604	ATCATA	2	12	119045	119056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380889
64	NC_018604	AAAAAT	2	12	128116	128127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380897
65	NC_018604	ATTTAT	2	12	128928	128939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380897
66	NC_018604	TATTAA	2	12	129989	130000	50 %	50 %	0 %	0 %	434380897
67	NC_018604	TATTTT	2	12	130097	130108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380897
68	NC_018604	ATTTTA	2	12	130718	130729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380897
69	NC_018604	AGAAAA	2	12	133843	133854	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434380901
70	NC_018604	TAAATA	2	12	133977	133988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380902
71	NC_018604	TAAACT	2	12	134650	134661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380903
72	NC_018604	TATTTT	2	12	136609	136620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380904
73	NC_018604	TAAAGA	2	12	137683	137694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380905
74	NC_018604	TTATGA	2	12	142322	142333	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434380911
75	NC_018604	TATTTA	2	12	145486	145497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380913
76	NC_018604	ATTTAT	2	12	145502	145513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380913
77	NC_018604	TTTTAT	2	12	148734	148745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380918
78	NC_018604	ACAGAT	2	12	152020	152031	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434380919
79	NC_018604	TAGATA	2	12	152282	152293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380919
80	NC_018604	TAAGAA	2	12	163651	163662	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380927
81	NC_018604	AGAAAA	2	12	163906	163917	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434380928
82	NC_018604	ATAATT	2	12	164010	164021	50 %	50 %	0 %	0 %	434380928
83	NC_018604	AGAAAA	2	12	164053	164064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434380928
84	NC_018604	ATGAAG	2	12	164559	164570	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434380928
85	NC_018604	AATAGC	2	12	165567	165578	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434380930
86	NC_018604	GATATA	2	12	168533	168544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380934
87	NC_018604	ATGATA	2	12	168792	168803	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380934
88	NC_018604	TTCTTT	2	12	170236	170247	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380935
89	NC_018604	ATAAAA	2	12	176011	176022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380940
90	NC_018604	TATTTT	2	12	181612	181623	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380946
91	NC_018604	CTGCTC	2	12	182310	182321	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	434380947
92	NC_018604	AGTTAT	2	12	184710	184721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434380950
93	NC_018604	ACATTA	2	12	187948	187959	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434380955
94	NC_018604	CTGGTA	2	12	192565	192576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434380959
95	NC_018604	TGAAAA	2	12	192803	192814	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434380959
96	NC_018604	TCTATA	2	12	193827	193838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434380960
97	NC_018604	TTTTCT	2	12	194303	194314	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380961
98	NC_018604	TATATT	2	12	197439	197450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380964
99	NC_018604	TAAGAG	2	12	202408	202419	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434380970
100	NC_018604	TTTATT	2	12	202515	202526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434380970
101	NC_018604	TCTATG	2	12	203466	203477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434380970
102	NC_018604	TCAGCT	2	12	204003	204014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434380970
103	NC_018604	TCTTTT	2	12	205377	205388	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434380970
104	NC_018604	AAAATA	2	12	213691	213702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380978
105	NC_018604	AAGTAT	2	12	217651	217662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380983
106	NC_018604	AATACC	2	12	218131	218142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434380983
107	NC_018604	TTCATC	2	12	224236	224247	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434380988
108	NC_018604	ATTAAA	2	12	228516	228527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380992
109	NC_018604	TAAATG	2	12	228773	228784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434380992
110	NC_018604	GCTATA	2	12	230421	230432	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434380994
111	NC_018604	CTATGG	2	12	235788	235799	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434381002
112	NC_018604	TCTATA	2	12	236498	236509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434381002
113	NC_018604	CTGTTG	2	12	244250	244261	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434381010
114	NC_018604	ATTATG	2	12	246380	246391	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434381012
115	NC_018604	GATTTA	2	12	247038	247049	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434381013
116	NC_018604	ATGGCT	2	12	247053	247064	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434381013
117	NC_018604	TTTAAA	2	12	248938	248949	50 %	50 %	0 %	0 %	434381015
118	NC_018604	CATTTT	2	12	250746	250757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434381016
119	NC_018604	TATTTG	2	12	255877	255888	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434381020
120	NC_018604	TCAAAT	2	12	256044	256055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434381020
121	NC_018604	TACATT	2	12	256334	256345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434381020
122	NC_018604	AATAAG	2	12	256903	256914	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434381020
123	NC_018604	TTTTAA	2	12	262340	262351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434381027
124	NC_018604	TTTACC	2	12	262694	262705	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434381027
125	NC_018604	TAAAGA	2	12	266993	267004	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434381033
126	NC_018604	ATTCAA	2	12	267370	267381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434381033
127	NC_018604	ATAAAA	2	12	267514	267525	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434381033
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131	NC_018604	ACTATA	2	12	274245	274256	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434381039
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143	NC_018604	TACTGC	2	12	295918	295929	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434381057
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230	NC_018604	TTAATA	2	12	465515	465526	50 %	50 %	0 %	0 %	434381221
231	NC_018604	AAATAT	2	12	468554	468565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434381224
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234	NC_018604	AATATT	2	12	475194	475205	50 %	50 %	0 %	0 %	434381228
235	NC_018604	TTTATT	2	12	476823	476834	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434381230
236	NC_018604	GCTTTA	2	12	478697	478708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434381233
237	NC_018604	AGTAAA	2	12	480328	480339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434381233
238	NC_018604	TTCCGC	2	12	481471	481482	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	434381235
239	NC_018604	TCTTAT	2	12	481694	481705	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434381235
240	NC_018604	TATTTT	2	12	482014	482025	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434381235
241	NC_018604	AAGCAA	2	12	483018	483029	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	434381236
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243	NC_018604	TAGCAA	2	12	485249	485260	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434381238
244	NC_018604	TAGCAA	2	12	486621	486632	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434381239
245	NC_018604	CCTGGA	2	12	490292	490303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434381243
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335	NC_018604	ATTATA	2	12	630411	630422	50 %	50 %	0 %	0 %	434381370
336	NC_018604	GCAAAG	2	12	632145	632156	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	434381372
337	NC_018604	CTTTAA	2	12	634163	634174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434381373
338	NC_018604	GAAAAT	2	12	634812	634823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434381374
339	NC_018604	TGATAA	2	12	634859	634870	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434381374
340	NC_018604	ATAGCT	2	12	637619	637630	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434381376
341	NC_018604	AAATGA	3	18	638756	638773	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434381377
342	NC_018604	AAATAA	2	12	640583	640594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434381378
343	NC_018604	GTTTGT	2	12	641842	641853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434381379
344	NC_018604	AATGAA	2	12	642120	642131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434381380
345	NC_018604	ATTTAT	2	12	643340	643351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434381381
346	NC_018604	TTTGAT	2	12	643431	643442	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434381381
347	NC_018604	ATTTAT	2	12	643469	643480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434381381
348	NC_018604	ATTGTC	2	12	645903	645914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434381383
349	NC_018604	ATATTT	2	12	646300	646311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434381383
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351	NC_018604	CCCAGA	2	12	647496	647507	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	434381384
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468	NC_018604	CTATAG	2	12	811663	811674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434381536
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