MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018604	ATTTT	2	10	138	147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018604	TATAA	2	10	454	463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018604	TTAAT	2	10	12105	12114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018604	ATTAT	2	10	14364	14373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018604	AAAAT	2	10	26859	26868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018604	AATTA	2	10	31036	31045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018604	TAATA	2	10	35563	35572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018604	TTATA	2	10	42054	42063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018604	TTATA	2	10	43264	43273	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018604	AATTA	2	10	57770	57779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018604	TAAAT	2	10	60986	60995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018604	TATAA	2	10	63900	63909	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018604	TATAT	2	10	64530	64539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018604	ATATA	2	10	68867	68876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018604	GTTAT	2	10	74189	74198	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018604	TAAAG	2	10	77035	77044	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018604	ATTAT	2	10	81676	81685	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018604	AGGCA	2	10	88325	88334	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018604	TAATT	2	10	88415	88424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018604	AGCAT	2	10	88471	88480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018604	TATAA	2	10	88626	88635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018604	TAGAA	2	10	88672	88681	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018604	ATTTA	2	10	91163	91172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018604	AAAGT	2	10	91689	91698	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018604	ATATT	2	10	91822	91831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018604	CGCAT	9	45	91974	92018	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_018604	TTATT	2	10	92610	92619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018604	TAATA	2	10	94835	94844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018604	TTATT	2	10	96709	96718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018604	TTATA	2	10	103948	103957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018604	TATAT	2	10	103958	103967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018604	TATAT	2	10	104292	104301	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018604	ATTTT	2	10	104960	104969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018604	ATATT	2	10	106042	106051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018604	ATATA	2	10	109058	109067	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018604	TAAAA	2	10	119602	119611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018604	TAAAA	2	10	127854	127863	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018604	ATATT	2	10	127881	127890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018604	TTAAA	2	10	153530	153539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018604	TACTT	2	10	155543	155552	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018604	TTTTA	2	10	160462	160471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018604	AAAAT	2	10	162284	162293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018604	TATTT	2	10	163702	163711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018604	TTTAG	2	10	167056	167065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018604	AACAA	2	10	167128	167137	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018604	TATAA	2	10	167267	167276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018604	TATTT	2	10	167283	167292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018604	TATTT	2	10	169692	169701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018604	ATGCT	2	10	171561	171570	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018604	AATTA	2	10	171617	171626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018604	TATAA	2	10	175476	175485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018604	AAAAG	2	10	177631	177640	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018604	ATAGT	2	10	177779	177788	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018604	TAAAA	2	10	178091	178100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018604	AAATT	2	10	189228	189237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018604	TAGTT	2	10	189563	189572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018604	ATTTT	2	10	191554	191563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018604	ATTTA	2	10	196558	196567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018604	TAATT	2	10	211897	211906	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018604	TAAAA	2	10	217009	217018	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018604	AGATA	2	10	222635	222644	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018604	ATTAC	2	10	226019	226028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018604	ATATA	2	10	226097	226106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018604	AATTT	2	10	231951	231960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018604	ATATT	2	10	233624	233633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018604	TATAA	2	10	237284	237293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018604	ATGCT	2	10	237684	237693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018604	AATTA	2	10	237740	237749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018604	TAAAA	2	10	238749	238758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018604	ACAAT	2	10	245946	245955	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018604	AATAA	2	10	249452	249461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018604	TAAAA	2	10	250922	250931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018604	TTTAT	2	10	261604	261613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018604	TAAAT	2	10	261681	261690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018604	TTATA	2	10	265933	265942	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018604	ATATT	2	10	270643	270652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018604	AAATT	2	10	270775	270784	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018604	CAAAT	2	10	272546	272555	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018604	ATTTA	2	10	278159	278168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018604	TATAT	2	10	278325	278334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018604	AAATA	2	10	283119	283128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018604	AATTA	2	10	284254	284263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018604	TAATA	2	10	284652	284661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018604	TAATT	2	10	286971	286980	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018604	GGTAT	2	10	290799	290808	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018604	TTTTA	2	10	296712	296721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018604	ATATT	2	10	313542	313551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018604	TAAAA	2	10	314040	314049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018604	ATCTA	2	10	314107	314116	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018604	TAAAA	2	10	326914	326923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018604	TTTTA	2	10	350211	350220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018604	AAAAT	2	10	352785	352794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018604	GTATA	2	10	384539	384548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018604	AGTAT	2	10	390123	390132	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018604	AAAAT	2	10	396372	396381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018604	TTAAT	2	10	396786	396795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018604	ATTAA	2	10	399574	399583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018604	ATTAA	2	10	409534	409543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018604	TAAAT	2	10	410932	410941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018604	ATAAA	2	10	417203	417212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018604	AGTAG	2	10	417431	417440	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018604	TCGTG	2	10	418278	418287	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018604	ATAAA	2	10	419008	419017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018604	TGTTA	2	10	420714	420723	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018604	TAAAA	2	10	420793	420802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018604	AATAA	2	10	421703	421712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018604	ATACT	2	10	421732	421741	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018604	ATGCT	2	10	433594	433603	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018604	AATTA	2	10	433650	433659	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018604	AATAA	2	10	443564	443573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018604	TTTAT	2	10	455425	455434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018604	AAAAT	2	10	457325	457334	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018604	TTTGA	2	10	458728	458737	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018604	ATTAT	2	10	458976	458985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018604	TAAAA	2	10	465436	465445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018604	TATTT	2	10	468687	468696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018604	ATACT	2	10	472942	472951	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018604	TATAT	2	10	482689	482698	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018604	TAAAT	2	10	491954	491963	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018604	GGTAT	2	10	496106	496115	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018604	TAATT	2	10	496184	496193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018604	AATAA	2	10	496293	496302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018604	ATAAA	2	10	507173	507182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018604	TTAAA	2	10	523074	523083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018604	TTTTA	2	10	528044	528053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018604	TAAAA	2	10	534851	534860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018604	AAAAG	2	10	542080	542089	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018604	ATAGT	2	10	542228	542237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018604	TATTT	2	10	544769	544778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018604	TTGAA	2	10	552608	552617	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018604	TTAAT	2	10	554173	554182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018604	TTTTA	2	10	559673	559682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018604	TATTT	2	10	559770	559779	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018604	AAATA	2	10	561282	561291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018604	AGGCA	2	10	563880	563889	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018604	TAATT	2	10	563947	563956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018604	AGCAT	2	10	564003	564012	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018604	TATAA	2	10	566686	566695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018604	AATAA	3	15	571521	571535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018604	TTTTC	2	10	573344	573353	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018604	AATAA	2	10	573459	573468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018604	ATTTT	2	10	581527	581536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018604	AATAA	2	10	584612	584621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018604	TAATT	2	10	599921	599930	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018604	TTTTA	2	10	599942	599951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018604	AATAA	2	10	600153	600162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018604	TATAT	2	10	603718	603727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018604	ATATT	2	10	608272	608281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018604	TAATA	2	10	635430	635439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_018604	ATATA	2	10	679432	679441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_018604	TAATT	2	10	1078570	1078579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_018604	ATATT	2	10	1203908	1203917	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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