MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 1440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018604	CTAA	2	8	107	114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018604	TTAA	2	8	166	173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018604	TAAA	2	8	422	429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018604	TAAT	2	8	2303	2310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018604	ATTA	2	8	3527	3534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018604	AGCC	2	8	5563	5570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018604	ATTT	2	8	5585	5592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018604	TTTA	2	8	5675	5682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018604	CGTG	2	8	6465	6472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018604	TGGG	2	8	6500	6507	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018604	TTAG	2	8	6523	6530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018604	AATT	2	8	14244	14251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018604	TTTA	2	8	14327	14334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018604	TAAA	2	8	19824	19831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018604	TAAA	2	8	20025	20032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018604	GAAA	2	8	20096	20103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018604	AATT	2	8	20170	20177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018604	ATAA	2	8	26785	26792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018604	ATTA	2	8	28054	28061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018604	ATTA	2	8	28648	28655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018604	CTTC	2	8	31126	31133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018604	TAAT	2	8	33650	33657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018604	ACAA	2	8	41988	41995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018604	TTAA	2	8	47447	47454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018604	CACG	2	8	47485	47492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018604	TAAA	2	8	48593	48600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018604	ATTT	2	8	57648	57655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018604	TAAA	2	8	57794	57801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018604	AATT	2	8	60673	60680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018604	TTTA	2	8	67575	67582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018604	ATTT	2	8	67622	67629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018604	TAAT	2	8	68842	68849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018604	ATTT	2	8	76907	76914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018604	ATGT	2	8	76939	76946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018604	TAAA	2	8	77013	77020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018604	AATA	2	8	81638	81645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018604	TAAT	2	8	83127	83134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018604	TATT	2	8	83220	83227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018604	ATTA	2	8	88637	88644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018604	TAAA	2	8	91796	91803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018604	TTTA	2	8	91804	91811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018604	TAAA	2	8	92058	92065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018604	TCAT	2	8	92133	92140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018604	ATTT	2	8	94918	94925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018604	AAAT	2	8	95800	95807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018604	CAAA	2	8	96857	96864	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018604	TAAA	2	8	104229	104236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018604	AAAT	2	8	104882	104889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018604	ATAA	2	8	106070	106077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018604	ATAA	2	8	106107	106114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018604	TACC	2	8	107441	107448	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018604	TAAT	2	8	109017	109024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018604	AAGC	2	8	109788	109795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018604	TAAA	2	8	115635	115642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018604	AAAT	2	8	121054	121061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018604	ATTT	2	8	121079	121086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018604	TTAC	2	8	122791	122798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018604	AAAC	2	8	126341	126348	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018604	AAAC	12	48	127949	127996	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018604	AATG	2	8	144484	144491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018604	ATAA	2	8	144498	144505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018604	TAAA	2	8	160490	160497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018604	TAAT	2	8	161201	161208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018604	TAAT	2	8	161293	161300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018604	ATTA	2	8	162371	162378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018604	CGCC	2	8	162389	162396	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_018604	TAAT	2	8	162472	162479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018604	ATAA	2	8	163727	163734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018604	TCAA	3	12	165910	165921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018604	GGGC	2	8	167231	167238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018604	GATA	2	8	167772	167779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018604	TAAA	2	8	168334	168341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018604	TTTA	2	8	168347	168354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018604	TAAA	2	8	171461	171468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018604	AATA	2	8	171480	171487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018604	ATTT	2	8	172183	172190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018604	TAAA	2	8	172207	172214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018604	TAAA	2	8	173170	173177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018604	TTTA	2	8	173806	173813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018604	ATAA	2	8	177721	177728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018604	TTAT	2	8	177970	177977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018604	ATAA	2	8	178237	178244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018604	TAAT	2	8	180013	180020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018604	TCCC	2	8	180097	180104	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_018604	TATT	2	8	181979	181986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018604	GTAT	2	8	182012	182019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018604	TTTA	2	8	183152	183159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018604	TGGT	15	60	185085	185144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018604	ATTA	2	8	185212	185219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018604	GAGT	2	8	185829	185836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018604	GGGT	2	8	189172	189179	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018604	ATTT	2	8	189279	189286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018604	GCCC	2	8	189293	189300	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_018604	TTTA	2	8	189336	189343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018604	CGCC	2	8	189370	189377	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_018604	TTTA	2	8	189383	189390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018604	AAAT	2	8	189594	189601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018604	ATTA	2	8	189683	189690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018604	GTTT	2	8	189719	189726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018604	TATT	2	8	193184	193191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018604	GCGT	2	8	196646	196653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018604	TTGT	2	8	196674	196681	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018604	ATAA	2	8	199700	199707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018604	TAAA	2	8	202259	202266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018604	ATAA	2	8	205484	205491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018604	ATAA	2	8	205950	205957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018604	TTAT	2	8	206890	206897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018604	AATA	2	8	209818	209825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018604	GTTT	2	8	209895	209902	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018604	GAAG	2	8	211791	211798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018604	AAAT	2	8	212024	212031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018604	ATTT	2	8	213977	213984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018604	TAAA	2	8	215691	215698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018604	TTTA	2	8	215743	215750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018604	TATG	2	8	215791	215798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018604	TAAA	2	8	217025	217032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018604	TAAG	2	8	218569	218576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018604	CAAT	2	8	218611	218618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018604	TTTA	2	8	221639	221646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018604	ATGT	2	8	222338	222345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018604	CTTC	2	8	223583	223590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018604	TATT	2	8	227728	227735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018604	CAAT	2	8	230072	230079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018604	TAAT	2	8	231923	231930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018604	ATTA	2	8	237417	237424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018604	CTTC	2	8	237497	237504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018604	ATAA	2	8	237574	237581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018604	TCAT	2	8	237856	237863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018604	CTTC	2	8	238834	238841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018604	TAAT	2	8	242327	242334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018604	TGAA	2	8	243829	243836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018604	ATTT	2	8	244498	244505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018604	ATTA	2	8	245871	245878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018604	TACT	2	8	246036	246043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018604	TAAA	2	8	246080	246087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018604	TAAA	2	8	246602	246609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018604	TAAT	3	12	250984	250995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018604	ATAA	2	8	252502	252509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018604	ATTA	2	8	257466	257473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018604	ATTA	2	8	261620	261627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018604	TTTA	2	8	263074	263081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018604	CGCC	2	8	263551	263558	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_018604	CGCA	2	8	263592	263599	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018604	ATTA	2	8	264954	264961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018604	ATTA	2	8	265866	265873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018604	ATAA	2	8	270793	270800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018604	AAGA	2	8	276013	276020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018604	TTTA	2	8	278059	278066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018604	TTTA	2	8	279555	279562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018604	TTAT	2	8	283026	283033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018604	ACGC	2	8	284312	284319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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153	NC_018604	TAAA	2	8	284467	284474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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