MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 49787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018604	TAA	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018604	TAA	2	6	79	84	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018604	TAA	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018604	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018604	TAA	3	9	267	275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018604	TAA	2	6	364	369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018604	ATG	2	6	386	391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018604	GTT	2	6	399	404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018604	TAT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018604	TTA	2	6	443	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018604	TAA	2	6	524	529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
12	NC_018604	TAA	2	6	554	559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
13	NC_018604	ATA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
14	NC_018604	TAT	2	6	677	682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
15	NC_018604	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
16	NC_018604	TAG	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380779
17	NC_018604	TAA	2	6	946	951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
18	NC_018604	TTA	2	6	1035	1040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
19	NC_018604	TAA	2	6	1085	1090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
20	NC_018604	TAA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
21	NC_018604	TAA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
22	NC_018604	TTA	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
23	NC_018604	TAT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
24	NC_018604	AGT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380779
25	NC_018604	ATT	2	6	1295	1300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
26	NC_018604	TTA	2	6	1318	1323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
27	NC_018604	TAT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
28	NC_018604	ATA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
29	NC_018604	TAA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
30	NC_018604	CTT	2	6	1478	1483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380780
31	NC_018604	TAA	2	6	1491	1496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
32	NC_018604	TAG	3	9	1730	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380780
33	NC_018604	AGA	2	6	1761	1766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380780
34	NC_018604	TAA	2	6	1802	1807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
35	NC_018604	TGG	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434380780
36	NC_018604	TGT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380780
37	NC_018604	TAA	3	9	1968	1976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
38	NC_018604	ATA	3	9	2018	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
39	NC_018604	AGA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380780
40	NC_018604	TAA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
41	NC_018604	TAA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
42	NC_018604	TAA	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
43	NC_018604	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018604	TAT	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380781
45	NC_018604	CTT	2	6	2377	2382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380781
46	NC_018604	TCT	2	6	2442	2447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380781
47	NC_018604	ATA	2	6	2636	2641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
48	NC_018604	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
49	NC_018604	AAT	2	6	2685	2690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
50	NC_018604	TAT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
51	NC_018604	TAA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
52	NC_018604	TCT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380782
53	NC_018604	ATA	2	6	2876	2881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
54	NC_018604	AGT	2	6	3000	3005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380782
55	NC_018604	AAT	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
56	NC_018604	ATT	2	6	3042	3047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
57	NC_018604	ATA	2	6	3136	3141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
58	NC_018604	TCA	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380782
59	NC_018604	TCT	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380782
60	NC_018604	CCA	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380782
61	NC_018604	TAA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018604	GAT	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018604	ATA	2	6	3681	3686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
64	NC_018604	ATA	2	6	3714	3719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
65	NC_018604	ATA	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
66	NC_018604	GAA	2	6	3788	3793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
67	NC_018604	AGA	3	9	3832	3840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
68	NC_018604	AGT	2	6	3841	3846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380783
69	NC_018604	AGA	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
70	NC_018604	AGA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
71	NC_018604	TTA	2	6	3935	3940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380783
72	NC_018604	TCT	2	6	3968	3973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380784
73	NC_018604	TAT	2	6	4069	4074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380784
74	NC_018604	TCA	2	6	4142	4147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380784
75	NC_018604	ATA	2	6	4153	4158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
76	NC_018604	TAT	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380784
77	NC_018604	ATA	2	6	4261	4266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
78	NC_018604	ATA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
79	NC_018604	TAA	2	6	4760	4765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
80	NC_018604	TCA	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
81	NC_018604	AAT	2	6	4848	4853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
82	NC_018604	AGC	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380785
83	NC_018604	CAT	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
84	NC_018604	TAA	2	6	4946	4951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
85	NC_018604	GTT	2	6	5001	5006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380785
86	NC_018604	ATC	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
87	NC_018604	ATT	2	6	5033	5038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
88	NC_018604	GCA	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380785
89	NC_018604	ATT	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
90	NC_018604	TAT	2	6	5075	5080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
91	NC_018604	AAG	3	9	5207	5215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380785
92	NC_018604	TTA	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
93	NC_018604	AAT	2	6	5310	5315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
94	NC_018604	TAT	3	9	5332	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
95	NC_018604	TAT	2	6	5408	5413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
96	NC_018604	ATT	2	6	5462	5467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
97	NC_018604	ATT	2	6	5486	5491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
98	NC_018604	ATA	3	9	5530	5538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
99	NC_018604	AAT	2	6	5541	5546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
100	NC_018604	TCA	2	6	5557	5562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
101	NC_018604	ATT	2	6	5593	5598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018604	AAT	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018604	TTA	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380786
104	NC_018604	ATC	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380786
105	NC_018604	AGC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380786
106	NC_018604	CAG	2	6	6151	6156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380786
107	NC_018604	AGC	3	9	6164	6172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380786
108	NC_018604	TCA	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380786
109	NC_018604	CCG	2	6	6279	6284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434380786
110	NC_018604	AAT	2	6	6419	6424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018604	TAA	2	6	6489	6494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018604	TAT	2	6	6821	6826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
113	NC_018604	TAA	2	6	6827	6832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380787
114	NC_018604	TAT	2	6	6839	6844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
115	NC_018604	TAT	2	6	6908	6913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
116	NC_018604	TGT	2	6	6984	6989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380787
117	NC_018604	ATT	2	6	7008	7013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
118	NC_018604	TTA	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
119	NC_018604	ATA	3	9	7105	7113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380787
120	NC_018604	AAC	2	6	7128	7133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380787
121	NC_018604	ATT	2	6	7214	7219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
122	NC_018604	GGC	3	9	7327	7335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434380787
123	NC_018604	TGT	2	6	7353	7358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380787
124	NC_018604	TTG	2	6	7373	7378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380787
125	NC_018604	CTA	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380787
126	NC_018604	ATT	2	6	7661	7666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
127	NC_018604	TCA	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380787
128	NC_018604	GTT	2	6	7846	7851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380787
129	NC_018604	TAA	2	6	7901	7906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380787
130	NC_018604	TAA	3	9	7913	7921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380787
131	NC_018604	CTA	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380787
132	NC_018604	TGC	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380787
133	NC_018604	GCT	3	9	8095	8103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380787
134	NC_018604	GCT	2	6	8158	8163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380787
135	NC_018604	TGA	2	6	8210	8215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018604	TCT	2	6	8294	8299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380788
137	NC_018604	AGC	2	6	8368	8373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380788
138	NC_018604	TCT	2	6	8504	8509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380788
139	NC_018604	ATC	2	6	8533	8538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380788
140	NC_018604	AGC	2	6	8617	8622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380788
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142	NC_018604	TAA	2	6	8725	8730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380788
143	NC_018604	AAT	2	6	8782	8787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380788
144	NC_018604	ATC	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380788
145	NC_018604	ATA	2	6	8887	8892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018604	ATT	2	6	8942	8947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
147	NC_018604	TTA	2	6	9040	9045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
148	NC_018604	ATC	2	6	9051	9056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380789
149	NC_018604	AAT	2	6	9059	9064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380789
150	NC_018604	TAT	2	6	9071	9076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
151	NC_018604	ATT	2	6	9082	9087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
152	NC_018604	TCA	2	6	9094	9099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380789
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154	NC_018604	TAT	2	6	9119	9124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
155	NC_018604	TAT	2	6	9192	9197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
156	NC_018604	TTC	2	6	9201	9206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380789
157	NC_018604	ATT	2	6	9243	9248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
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159	NC_018604	TTA	3	9	9328	9336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
160	NC_018604	ATC	2	6	9339	9344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380789
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164	NC_018604	ATT	2	6	9501	9506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
165	NC_018604	TTA	2	6	9511	9516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
166	NC_018604	ATC	2	6	9531	9536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380789
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168	NC_018604	TTA	2	6	9661	9666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
169	NC_018604	TCA	2	6	9694	9699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380789
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172	NC_018604	AAT	2	6	9834	9839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380789
173	NC_018604	ATT	2	6	9849	9854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
174	NC_018604	TTA	2	6	9973	9978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
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176	NC_018604	TAT	2	6	10128	10133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
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186	NC_018604	TAC	2	6	10770	10775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380789
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188	NC_018604	ATT	2	6	10810	10815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_018604	AAT	2	6	10847	10852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_018604	TAA	2	6	10923	10928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_018604	ATA	2	6	10931	10936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_018604	AGA	2	6	10989	10994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380790
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202	NC_018604	ATG	2	6	11542	11547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380790
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204	NC_018604	TGA	2	6	11784	11789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380790
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222	NC_018604	TAA	2	6	13076	13081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380791
223	NC_018604	GAT	2	6	13128	13133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380791
224	NC_018604	TAA	2	6	13172	13177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_018604	TTA	2	6	13210	13215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380792
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229	NC_018604	ATC	2	6	13406	13411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380792
230	NC_018604	TAA	2	6	13476	13481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380792
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232	NC_018604	TAA	2	6	13561	13566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380792
233	NC_018604	TAA	2	6	13646	13651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380792
234	NC_018604	TCA	2	6	13743	13748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380792
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236	NC_018604	ACC	2	6	13792	13797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380792
237	NC_018604	TTC	2	6	13838	13843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380792
238	NC_018604	TTA	2	6	13879	13884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380792
239	NC_018604	ATC	2	6	13913	13918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380792
240	NC_018604	CTA	2	6	13990	13995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380792
241	NC_018604	CCA	2	6	14022	14027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380792
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243	NC_018604	TTA	2	6	14149	14154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380792
244	NC_018604	ACC	2	6	14179	14184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380792
245	NC_018604	ATA	2	6	14185	14190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380792
246	NC_018604	CAT	2	6	14191	14196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380792
247	NC_018604	TTA	2	6	14314	14319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_018604	TAT	2	6	14419	14424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380793
249	NC_018604	ATC	3	9	14491	14499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380793
250	NC_018604	TAT	2	6	14526	14531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380793
251	NC_018604	ACA	2	6	14534	14539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380793
252	NC_018604	CTA	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380793
253	NC_018604	GAT	3	9	14807	14815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380793
254	NC_018604	AGA	2	6	14856	14861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380793
255	NC_018604	AAG	2	6	14876	14881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380793
256	NC_018604	GAG	2	6	14954	14959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434380793
257	NC_018604	AGA	2	6	15323	15328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380793
258	NC_018604	AAG	2	6	15334	15339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380793
259	NC_018604	CTG	2	6	15399	15404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380793
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261	NC_018604	AGA	3	9	15475	15483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380793
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