MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 44376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018604	TAA	2	6	524	529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
2	NC_018604	TAA	2	6	554	559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
3	NC_018604	ATA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
4	NC_018604	TAT	2	6	677	682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
5	NC_018604	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
6	NC_018604	TAG	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380779
7	NC_018604	TAA	2	6	946	951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
8	NC_018604	TTA	2	6	1035	1040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
9	NC_018604	TAA	2	6	1085	1090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
10	NC_018604	TAA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
11	NC_018604	TAA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
12	NC_018604	TTA	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
13	NC_018604	TAT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
14	NC_018604	AGT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380779
15	NC_018604	ATT	2	6	1295	1300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
16	NC_018604	TTA	2	6	1318	1323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
17	NC_018604	TAT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
18	NC_018604	ATA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
19	NC_018604	TAA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
20	NC_018604	CTT	2	6	1478	1483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380780
21	NC_018604	TAA	2	6	1491	1496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
22	NC_018604	TAG	3	9	1730	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380780
23	NC_018604	AGA	2	6	1761	1766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380780
24	NC_018604	TAA	2	6	1802	1807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
25	NC_018604	TGG	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434380780
26	NC_018604	TGT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380780
27	NC_018604	TAA	3	9	1968	1976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
28	NC_018604	ATA	3	9	2018	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
29	NC_018604	AGA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380780
30	NC_018604	TAA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
31	NC_018604	TAA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
32	NC_018604	TAA	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
33	NC_018604	TAT	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380781
34	NC_018604	CTT	2	6	2377	2382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380781
35	NC_018604	TCT	2	6	2442	2447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380781
36	NC_018604	ATA	2	6	2636	2641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
37	NC_018604	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
38	NC_018604	AAT	2	6	2685	2690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
39	NC_018604	TAT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
40	NC_018604	TAA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
41	NC_018604	TCT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380782
42	NC_018604	ATA	2	6	2876	2881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
43	NC_018604	AGT	2	6	3000	3005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380782
44	NC_018604	AAT	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
45	NC_018604	ATT	2	6	3042	3047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
46	NC_018604	ATA	2	6	3136	3141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
47	NC_018604	TCA	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380782
48	NC_018604	TCT	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380782
49	NC_018604	CCA	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380782
50	NC_018604	ATA	2	6	3681	3686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
51	NC_018604	ATA	2	6	3714	3719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
52	NC_018604	ATA	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
53	NC_018604	GAA	2	6	3788	3793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
54	NC_018604	AGA	3	9	3832	3840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
55	NC_018604	AGT	2	6	3841	3846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380783
56	NC_018604	AGA	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
57	NC_018604	AGA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
58	NC_018604	TTA	2	6	3935	3940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380783
59	NC_018604	TCT	2	6	3968	3973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380784
60	NC_018604	TAT	2	6	4069	4074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380784
61	NC_018604	TCA	2	6	4142	4147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380784
62	NC_018604	ATA	2	6	4153	4158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
63	NC_018604	TAT	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380784
64	NC_018604	ATA	2	6	4261	4266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
65	NC_018604	ATA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
66	NC_018604	TAA	2	6	4760	4765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
67	NC_018604	TCA	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
68	NC_018604	AAT	2	6	4848	4853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
69	NC_018604	AGC	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380785
70	NC_018604	CAT	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
71	NC_018604	TAA	2	6	4946	4951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
72	NC_018604	GTT	2	6	5001	5006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380785
73	NC_018604	ATC	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
74	NC_018604	ATT	2	6	5033	5038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
75	NC_018604	GCA	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380785
76	NC_018604	ATT	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
77	NC_018604	TAT	2	6	5075	5080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
78	NC_018604	AAG	3	9	5207	5215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380785
79	NC_018604	TTA	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
80	NC_018604	AAT	2	6	5310	5315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
81	NC_018604	TAT	3	9	5332	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
82	NC_018604	TAT	2	6	5408	5413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
83	NC_018604	ATT	2	6	5462	5467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
84	NC_018604	ATT	2	6	5486	5491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
85	NC_018604	ATA	3	9	5530	5538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
86	NC_018604	AAT	2	6	5541	5546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
87	NC_018604	TCA	2	6	5557	5562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380785
88	NC_018604	TTA	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380786
89	NC_018604	ATC	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380786
90	NC_018604	AGC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380786
91	NC_018604	CAG	2	6	6151	6156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380786
92	NC_018604	AGC	3	9	6164	6172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380786
93	NC_018604	TCA	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380786
94	NC_018604	CCG	2	6	6279	6284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434380786
95	NC_018604	TAT	2	6	6821	6826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
96	NC_018604	TAA	2	6	6827	6832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380787
97	NC_018604	TAT	2	6	6839	6844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
98	NC_018604	TAT	2	6	6908	6913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
99	NC_018604	TGT	2	6	6984	6989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380787
100	NC_018604	ATT	2	6	7008	7013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
101	NC_018604	TTA	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
102	NC_018604	ATA	3	9	7105	7113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380787
103	NC_018604	AAC	2	6	7128	7133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380787
104	NC_018604	ATT	2	6	7214	7219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
105	NC_018604	GGC	3	9	7327	7335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434380787
106	NC_018604	TGT	2	6	7353	7358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380787
107	NC_018604	TTG	2	6	7373	7378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380787
108	NC_018604	CTA	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380787
109	NC_018604	ATT	2	6	7661	7666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380787
110	NC_018604	TCA	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380787
111	NC_018604	GTT	2	6	7846	7851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380787
112	NC_018604	TAA	2	6	7901	7906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380787
113	NC_018604	TAA	3	9	7913	7921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380787
114	NC_018604	CTA	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380787
115	NC_018604	TGC	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380787
116	NC_018604	GCT	3	9	8095	8103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380787
117	NC_018604	GCT	2	6	8158	8163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380787
118	NC_018604	TCT	2	6	8294	8299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380788
119	NC_018604	AGC	2	6	8368	8373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380788
120	NC_018604	TCT	2	6	8504	8509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380788
121	NC_018604	ATC	2	6	8533	8538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380788
122	NC_018604	AGC	2	6	8617	8622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380788
123	NC_018604	ATT	2	6	8665	8670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380788
124	NC_018604	TAA	2	6	8725	8730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380788
125	NC_018604	AAT	2	6	8782	8787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380788
126	NC_018604	ATC	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380788
127	NC_018604	ATT	2	6	8942	8947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
128	NC_018604	TTA	2	6	9040	9045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
129	NC_018604	ATC	2	6	9051	9056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380789
130	NC_018604	AAT	2	6	9059	9064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380789
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132	NC_018604	ATT	2	6	9082	9087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380789
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