MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPNA45

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018594	TAAGGA	2	12	16906	16917	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018594	GAAGTG	2	12	19994	20005	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018594	ACTAAT	2	12	20024	20035	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018594	GATAGA	2	12	20613	20624	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018594	TCTTGT	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018594	CATCTC	2	12	21804	21815	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018594	AGTTGA	2	12	21923	21934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018594	TGGCGA	2	12	25665	25676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018594	AAGAAA	2	12	29078	29089	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018594	CTGCTA	2	12	42071	42082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018594	CAAGGA	2	12	42195	42206	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018594	CAGGCT	2	12	58688	58699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018594	AGTTGG	2	12	60992	61003	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018594	AAATTT	2	12	66411	66422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018594	TCATGC	2	12	72271	72282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018594	TTTTAA	2	12	83788	83799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018594	ATCTAT	2	12	101832	101843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018594	AGTTGA	2	12	112480	112491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018594	GGGAAT	2	12	121211	121222	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018594	TAAGGA	2	12	147890	147901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018594	GAAGTG	2	12	150978	150989	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018594	ACTAAT	2	12	151008	151019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018594	TTCGGG	2	12	151886	151897	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018594	TAAAAA	2	12	161705	161716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018594	GATAGA	2	12	211315	211326	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018594	TAAGGA	2	12	220970	220981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018594	GAAGTG	2	12	224058	224069	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018594	ACTAAT	2	12	224088	224099	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018594	AGTTGA	2	12	226086	226097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018594	ATTTTT	2	12	237602	237613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018594	GGTCGC	2	12	246140	246151	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018594	TACCCA	2	12	246313	246324	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018594	AAAATT	2	12	305824	305835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018594	CAGGCT	2	12	332062	332073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018594	GGAAGA	2	12	332878	332889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018594	AGTTGA	2	12	336102	336113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018594	TAAGGA	2	12	342751	342762	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018594	GAAGTG	2	12	345839	345850	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018594	ACTAAT	2	12	345869	345880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018594	AGTTGA	2	12	348527	348538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018594	GAAGGA	2	12	370887	370898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018594	CTTTTG	2	12	371035	371046	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018594	TGATTA	2	12	376620	376631	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018594	GATAAT	2	12	395376	395387	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018594	AAGAGA	2	12	406710	406721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018594	CAATTT	2	12	415778	415789	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018594	GAAAAA	2	12	417492	417503	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018594	CATGTT	2	12	429021	429032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018594	AAATAG	2	12	445684	445695	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018594	ATTTTT	2	12	451103	451114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018594	TTAAAA	2	12	452337	452348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018594	GAAGTG	2	12	469635	469646	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018594	TCTTTT	2	12	480887	480898	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018594	GCCTTT	2	12	481987	481998	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018594	TGATTA	2	12	486982	486993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018594	TCAAAT	2	12	494952	494963	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018594	TCAAGT	2	12	517485	517496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018594	TTTTAA	2	12	552587	552598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018594	AAAATA	2	12	560541	560552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018594	TACTCA	2	12	579400	579411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018594	AAAGAA	2	12	585271	585282	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018594	GGAAGT	2	12	585376	585387	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018594	GACCAT	2	12	587145	587156	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018594	GCAATC	2	12	599049	599060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018594	GATTTT	2	12	613441	613452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018594	AGATTT	2	12	615710	615721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018594	GAAAAT	2	12	661809	661820	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018594	GTCATT	2	12	662546	662557	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018594	ACTTGC	2	12	681638	681649	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018594	AACTGG	2	12	682163	682174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018594	AAATTA	2	12	692089	692100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018594	AGTTGA	2	12	705642	705653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018594	GAAAAG	2	12	707694	707705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018594	AACTTG	2	12	708221	708232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018594	AAATTT	2	12	708293	708304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018594	GAAGCA	2	12	724377	724388	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018594	ATACAA	2	12	724821	724832	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018594	CTTTTA	2	12	767125	767136	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018594	ACTGGG	2	12	772078	772089	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018594	AAAGGA	2	12	775945	775956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018594	CTAATA	2	12	784164	784175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018594	ACCATC	2	12	790886	790897	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018594	TTTCAA	2	12	819689	819700	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018594	TACCTA	2	12	830664	830675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018594	AACAAA	2	12	850076	850087	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018594	TATTTT	2	12	851166	851177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018594	ATTTTT	2	12	871422	871433	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018594	TGATTG	2	12	902473	902484	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018594	AAATAA	2	12	902605	902616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018594	TTTTGG	2	12	921919	921930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018594	AACAAA	2	12	1000519	1000530	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018594	ATATGG	2	12	1002670	1002681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018594	GCATAT	2	12	1002683	1002694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018594	AATATG	2	12	1003301	1003312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018594	AATTGA	2	12	1003591	1003602	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018594	ATGGAA	2	12	1006557	1006568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018594	TAAGAT	2	12	1026680	1026691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018594	AGTATT	2	12	1029653	1029664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018594	AGGAGC	2	12	1029665	1029676	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018594	GATATT	2	12	1040182	1040193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018594	GAAAAA	2	12	1049804	1049815	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018594	AGATTG	2	12	1076043	1076054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018594	CATGTT	2	12	1081132	1081143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018594	TGGTAT	2	12	1081279	1081290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018594	GTTGAT	2	12	1081508	1081519	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018594	TTTTCA	2	12	1117704	1117715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018594	TCTTTA	2	12	1130250	1130261	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018594	GAACAA	2	12	1131815	1131826	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018594	TTTGTT	2	12	1131827	1131838	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018594	AAAAAC	2	12	1145374	1145385	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018594	GATAAA	2	12	1157495	1157506	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018594	TTCGGG	2	12	1168617	1168628	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018594	CATCTC	2	12	1170989	1171000	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018594	AGTTGA	2	12	1171108	1171119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018594	TTTTCA	2	12	1189685	1189696	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018594	GATACG	2	12	1198254	1198265	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018594	ATGATT	2	12	1198882	1198893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018594	TTAAAA	2	12	1203504	1203515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018594	TATAAA	2	12	1206986	1206997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018594	TCTTTG	2	12	1237067	1237078	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018594	AGTTGA	2	12	1237791	1237802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018594	AAAAAG	2	12	1259818	1259829	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018594	AAACAC	2	12	1267200	1267211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018594	TTTTTA	2	12	1279841	1279852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018594	CTATTT	2	12	1291331	1291342	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018594	AAAAAG	2	12	1291380	1291391	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018594	GATAGA	2	12	1300443	1300454	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018594	TTTTCT	2	12	1303327	1303338	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018594	TCACTA	2	12	1312330	1312341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018594	TAAAAA	2	12	1332560	1332571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018594	TGTCAA	2	12	1341946	1341957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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141	NC_018594	AATTTT	2	12	1456714	1456725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.