MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPNA45

Total Repeats: 691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018594	GAAATG	2	12	327	338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405759924
2	NC_018594	ATTGGA	2	12	4776	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759928
3	NC_018594	TTGCAA	2	12	5065	5076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405759929
4	NC_018594	TGCTTA	2	12	7712	7723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405759929
5	NC_018594	GCTAAC	3	18	7953	7970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405759929
6	NC_018594	TTGATT	2	12	8903	8914	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405759931
7	NC_018594	ACTTTT	2	12	25401	25412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405759939
8	NC_018594	ACAATG	2	12	27093	27104	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405759941
9	NC_018594	TTTTTA	2	12	27652	27663	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405759942
10	NC_018594	TCAAAA	2	12	28961	28972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405759943
11	NC_018594	ATGATA	2	12	31558	31569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405759949
12	NC_018594	CAGTTG	2	12	31984	31995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405759949
13	NC_018594	AGAGAT	2	12	32204	32215	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405759949
14	NC_018594	TCATCT	2	12	38415	38426	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405759961
15	NC_018594	ATCCAG	2	12	40059	40070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405759963
16	NC_018594	TCCTGA	2	12	40663	40674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405759963
17	NC_018594	ACTCTG	2	12	40992	41003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405759964
18	NC_018594	ATGGAA	2	12	44921	44932	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405759970
19	NC_018594	GAATCA	2	12	45010	45021	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405759970
20	NC_018594	ATTACT	2	12	47961	47972	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405759971
21	NC_018594	TTTGGA	2	12	51135	51146	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405759973
22	NC_018594	CACCAG	2	12	52014	52025	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	405759973
23	NC_018594	CACCAG	2	12	53856	53867	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	405759973
24	NC_018594	AGGTTG	2	12	54615	54626	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405759973
25	NC_018594	GATATG	2	12	61444	61455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759982
26	NC_018594	AGGATC	2	12	61898	61909	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405759982
27	NC_018594	GAAGAG	2	12	64084	64095	50 %	0 %	50 %	0 %	405759983
28	NC_018594	AGAGGG	2	12	64467	64478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405759983
29	NC_018594	TTGCTT	2	12	64486	64497	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405759983
30	NC_018594	CTCTAT	2	12	70143	70154	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405759987
31	NC_018594	CAAAAA	2	12	72207	72218	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405759988
32	NC_018594	ATGTTG	2	12	74602	74613	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405759990
33	NC_018594	TATAAA	2	12	77921	77932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405759994
34	NC_018594	TGTAGC	2	12	80780	80791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405759997
35	NC_018594	AAATCA	2	12	81132	81143	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405759997
36	NC_018594	ATTGCT	2	12	84303	84314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405760000
37	NC_018594	GTTTGG	2	12	92337	92348	0 %	50 %	50 %	0 %	405760012
38	NC_018594	CGTTAC	2	12	93367	93378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405760014
39	NC_018594	TGATAA	2	12	94233	94244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405760014
40	NC_018594	TGTCTC	2	12	95617	95628	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	405760015
41	NC_018594	TTGTCG	2	12	96504	96515	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405760017
42	NC_018594	AGGTAA	2	12	98844	98855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405760019
43	NC_018594	CAGATG	2	12	102597	102608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405760022
44	NC_018594	TTGAAA	2	12	102710	102721	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405760022
45	NC_018594	ACATCT	2	12	105547	105558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760023
46	NC_018594	TCAAAG	2	12	105772	105783	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405760023
47	NC_018594	TCTGTT	2	12	109327	109338	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405760026
48	NC_018594	CAGCGT	2	12	113519	113530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405760028
49	NC_018594	CAAAAA	2	12	114498	114509	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405760029
50	NC_018594	GCTTTT	2	12	117679	117690	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405760030
51	NC_018594	GGTGCA	2	12	118550	118561	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405760031
52	NC_018594	TTGTAA	2	12	118811	118822	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405760031
53	NC_018594	CAAAGG	2	12	119429	119440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405760032
54	NC_018594	TAGCAT	2	12	128293	128304	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405760042
55	NC_018594	GCACCT	2	12	129113	129124	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	405760043
56	NC_018594	TTCAGC	2	12	133370	133381	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405760046
57	NC_018594	TTGACC	2	12	133506	133517	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405760046
58	NC_018594	GAACGC	2	12	144333	144344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760054
59	NC_018594	GTCAAC	2	12	155639	155650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405760061
60	NC_018594	TGTGGT	2	12	156348	156359	0 %	50 %	50 %	0 %	405760062
61	NC_018594	AATTAT	2	12	161566	161577	50 %	50 %	0 %	0 %	405760067
62	NC_018594	CACGTT	2	12	168055	168066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405760071
63	NC_018594	CTCAAA	2	12	175078	175089	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405760076
64	NC_018594	GGGATT	2	12	175642	175653	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405760077
65	NC_018594	CAGTTG	2	12	177637	177648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405760079
66	NC_018594	TGCTAA	2	12	183971	183982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405760087
67	NC_018594	AGAAAA	2	12	186649	186660	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405760090
68	NC_018594	ATGGTA	2	12	186703	186714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760091
69	NC_018594	TTGGAT	2	12	189812	189823	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405760093
70	NC_018594	GGAGAC	2	12	196699	196710	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	405760101
71	NC_018594	TGCTTG	2	12	205754	205765	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405760109
72	NC_018594	GTGGAA	2	12	210735	210746	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	405760114
73	NC_018594	TCCAAC	2	12	213897	213908	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405760116
74	NC_018594	TTGACG	2	12	214088	214099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405760116
75	NC_018594	TAAACC	2	12	218378	218389	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405760120
76	NC_018594	CTTGAC	2	12	228879	228890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405760125
77	NC_018594	TTTTTC	2	12	229410	229421	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405760126
78	NC_018594	GTACAA	2	12	231562	231573	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405760128
79	NC_018594	ATACAC	2	12	239054	239065	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405760136
80	NC_018594	CTAGAA	2	12	240823	240834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405760138
81	NC_018594	TGGTAT	2	12	241637	241648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405760139
82	NC_018594	ATTTGG	2	12	243927	243938	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405760140
83	NC_018594	GGCAAA	2	12	244429	244440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405760141
84	NC_018594	CTCAGG	2	12	247388	247399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405760143
85	NC_018594	ACTCCA	2	12	251273	251284	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405760147
86	NC_018594	TGGTTT	2	12	255973	255984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760152
87	NC_018594	TTGGAA	2	12	257078	257089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760153
88	NC_018594	GTAACT	2	12	261976	261987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405760160
89	NC_018594	ATGGTT	2	12	268427	268438	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405760163
90	NC_018594	CTGGTA	2	12	271466	271477	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405760163
91	NC_018594	TTCAGA	2	12	272096	272107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405760164
92	NC_018594	CTCAGG	2	12	279687	279698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405760172
93	NC_018594	CAGATT	2	12	284651	284662	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405760175
94	NC_018594	GATCCA	2	12	286494	286505	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405760176
95	NC_018594	GGATGT	2	12	286844	286855	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405760176
96	NC_018594	CAAGAT	2	12	291457	291468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405760182
97	NC_018594	CAAAGA	2	12	297368	297379	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405760190
98	NC_018594	GATTTA	2	12	297826	297837	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405760192
99	NC_018594	CGTATC	2	12	303620	303631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405760207
100	NC_018594	GCAGAG	2	12	308102	308113	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	405760216
101	NC_018594	GTAAAA	2	12	314155	314166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405760220
102	NC_018594	GTTGAA	2	12	316573	316584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760226
103	NC_018594	AATGCC	2	12	318067	318078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405760228
104	NC_018594	TGGCGG	2	12	319403	319414	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405760231
105	NC_018594	TTTGGA	2	12	326522	326533	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405760236
106	NC_018594	CACCAG	2	12	327401	327412	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	405760236
107	NC_018594	AGGTTG	2	12	328106	328117	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405760236
108	NC_018594	TAGCAG	2	12	330780	330791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405760241
109	NC_018594	ATCCAT	2	12	331515	331526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760242
110	NC_018594	AATGAA	2	12	332249	332260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405760243
111	NC_018594	AACTGA	2	12	334617	334628	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405760245
112	NC_018594	AACCAG	2	12	335033	335044	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405760245
113	NC_018594	TGTGAA	2	12	338937	338948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760249
114	NC_018594	AATACA	2	12	340188	340199	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405760250
115	NC_018594	CGGCCT	2	12	349725	349736	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	405760251
116	NC_018594	TTAAAA	2	12	353043	353054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760253
117	NC_018594	ATGCCA	2	12	355281	355292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405760255
118	NC_018594	CAAGGC	2	12	362936	362947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760259
119	NC_018594	TCAAGG	2	12	364394	364405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405760260
120	NC_018594	TATTGC	2	12	366678	366689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405760262
121	NC_018594	GTCAAC	2	12	367710	367721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405760263
122	NC_018594	ACTGCG	2	12	376956	376967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405760269
123	NC_018594	CGGATA	2	12	379231	379242	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405760272
124	NC_018594	CATACT	2	12	386204	386215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760281
125	NC_018594	TGTTCA	2	12	390652	390663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405760286
126	NC_018594	TTTGAT	2	12	392458	392469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405760288
127	NC_018594	CCAGAA	2	12	392657	392668	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405760288
128	NC_018594	TTTATG	2	12	399532	399543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405760294
129	NC_018594	AGTTGG	2	12	404855	404866	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405760299
130	NC_018594	ATTGTC	2	12	413807	413818	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405760306
131	NC_018594	AGATAA	2	12	423127	423138	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405760313
132	NC_018594	TCCTGG	2	12	431595	431606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760321
133	NC_018594	TTGGAG	2	12	434445	434456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405760325
134	NC_018594	GCAACT	2	12	434724	434735	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405760325
135	NC_018594	CAGATA	2	12	436007	436018	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405760326
136	NC_018594	ATTAGG	2	12	438881	438892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760329
137	NC_018594	ATATCA	2	12	440314	440325	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405760331
138	NC_018594	ATGAAA	2	12	447452	447463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405760333
139	NC_018594	GTGTTT	2	12	451051	451062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760340
140	NC_018594	TTTAAT	2	12	451583	451594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760342
141	NC_018594	CAATTT	2	12	452944	452955	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405760344
142	NC_018594	GAATTA	2	12	453865	453876	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405760344
143	NC_018594	AAATGG	2	12	458041	458052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405760348
144	NC_018594	AGAAAT	2	12	466000	466011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405760357
145	NC_018594	CTTTGA	2	12	471325	471336	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405760365
146	NC_018594	GAATTT	2	12	471996	472007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405760366
147	NC_018594	TTGGAC	2	12	476038	476049	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405760371
148	NC_018594	ATTGAG	2	12	478031	478042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760373
149	NC_018594	TTAAAA	2	12	478301	478312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760373
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151	NC_018594	GATTTG	2	12	491784	491795	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405760392
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153	NC_018594	AGCGAA	2	12	505442	505453	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405760404
154	NC_018594	GAATTG	2	12	511133	511144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760410
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168	NC_018594	AAAGGG	2	12	548517	548528	50 %	0 %	50 %	0 %	405760443
169	NC_018594	TTGATT	2	12	549054	549065	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405760443
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179	NC_018594	ATTCGA	2	12	581359	581370	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405760472
180	NC_018594	CCTTGA	2	12	590507	590518	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405760478
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227	NC_018594	TTATGC	2	12	765501	765512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405760634
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229	NC_018594	TCATAA	2	12	767737	767748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405760635
230	NC_018594	TATAAA	2	12	768366	768377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760635
231	NC_018594	GATGCT	2	12	769121	769132	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405760637
232	NC_018594	GCAATT	2	12	769175	769186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405760637
233	NC_018594	ATAAAA	2	12	769773	769784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405760637
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333	NC_018594	ATGCAG	2	12	1070599	1070610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405760915
334	NC_018594	AGCTAA	2	12	1072003	1072014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405760917
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336	NC_018594	TTGGTA	2	12	1074278	1074289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405760919
337	NC_018594	GATTGC	2	12	1078584	1078595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405760924
338	NC_018594	AAAAAG	2	12	1084431	1084442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405760926
339	NC_018594	GAGCCT	2	12	1087707	1087718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405760929
340	NC_018594	GTGGGA	2	12	1091366	1091377	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	405760933
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342	NC_018594	TGGATG	2	12	1093159	1093170	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405760934
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444	NC_018594	ATTATA	2	12	1361514	1361525	50 %	50 %	0 %	0 %	405761177
445	NC_018594	TGTCTT	2	12	1364534	1364545	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405761181
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447	NC_018594	GATACA	2	12	1372742	1372753	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405761186
448	NC_018594	GAAAAT	2	12	1381959	1381970	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405761197
449	NC_018594	AAATTC	2	12	1393425	1393436	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405761208
450	NC_018594	AAGTTG	2	12	1399793	1399804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405761213
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452	NC_018594	AAAATC	2	12	1411732	1411743	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405761225
453	NC_018594	AGGCTC	2	12	1415270	1415281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405761226
454	NC_018594	CTGGAG	2	12	1415585	1415596	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405761226
455	NC_018594	AGGAGC	2	12	1423192	1423203	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	405761232
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