MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPNA45

Total Repeats: 1163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018594	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	405759924
2	NC_018594	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	405759924
3	NC_018594	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	405759924
4	NC_018594	GTAAA	2	10	2640	2649	60 %	20 %	20 %	0 %	405759925
5	NC_018594	AAAAT	2	10	3027	3036	80 %	20 %	0 %	0 %	405759926
6	NC_018594	GAATT	2	10	5524	5533	40 %	40 %	20 %	0 %	405759929
7	NC_018594	TCAAT	2	10	6056	6065	40 %	40 %	0 %	20 %	405759929
8	NC_018594	TTTTC	2	10	6096	6105	0 %	80 %	0 %	20 %	405759929
9	NC_018594	TAAAT	2	10	6614	6623	60 %	40 %	0 %	0 %	405759929
10	NC_018594	ACTCT	2	10	6695	6704	20 %	40 %	0 %	40 %	405759929
11	NC_018594	AAACG	2	10	7938	7947	60 %	0 %	20 %	20 %	405759929
12	NC_018594	TTGGT	2	10	8173	8182	0 %	60 %	40 %	0 %	405759929
13	NC_018594	CAATT	2	10	8242	8251	40 %	40 %	0 %	20 %	405759929
14	NC_018594	AGGAA	2	10	9268	9277	60 %	0 %	40 %	0 %	405759932
15	NC_018594	ATTGA	2	10	10686	10695	40 %	40 %	20 %	0 %	405759934
16	NC_018594	ATTCT	2	10	12819	12828	20 %	60 %	0 %	20 %	405759936
17	NC_018594	ATGCT	2	10	14047	14056	20 %	40 %	20 %	20 %	405759936
18	NC_018594	ATGGT	2	10	23052	23061	20 %	40 %	40 %	0 %	405759938
19	NC_018594	CTATC	2	10	25715	25724	20 %	40 %	0 %	40 %	405759940
20	NC_018594	GAATG	2	10	35804	35813	40 %	20 %	40 %	0 %	405759957
21	NC_018594	GAAAC	2	10	39598	39607	60 %	0 %	20 %	20 %	405759963
22	NC_018594	TCTAA	2	10	39941	39950	40 %	40 %	0 %	20 %	405759963
23	NC_018594	CTCTT	2	10	40562	40571	0 %	60 %	0 %	40 %	405759963
24	NC_018594	TGATT	2	10	40820	40829	20 %	60 %	20 %	0 %	405759964
25	NC_018594	GGGTG	2	10	42973	42982	0 %	20 %	80 %	0 %	405759965
26	NC_018594	CCTAT	2	10	43294	43303	20 %	40 %	0 %	40 %	405759966
27	NC_018594	ATGAC	2	10	44032	44041	40 %	20 %	20 %	20 %	405759968
28	NC_018594	ACGTC	2	10	44402	44411	20 %	20 %	20 %	40 %	405759969
29	NC_018594	AGCTG	2	10	46784	46793	20 %	20 %	40 %	20 %	405759971
30	NC_018594	GGTCA	2	10	48593	48602	20 %	20 %	40 %	20 %	405759972
31	NC_018594	CTCAA	2	10	54697	54706	40 %	20 %	0 %	40 %	405759973
32	NC_018594	AGAGG	2	10	61615	61624	40 %	0 %	60 %	0 %	405759982
33	NC_018594	TTTGG	2	10	71689	71698	0 %	60 %	40 %	0 %	405759987
34	NC_018594	GTTTT	2	10	74649	74658	0 %	80 %	20 %	0 %	405759990
35	NC_018594	ACTTC	2	10	76306	76315	20 %	40 %	0 %	40 %	405759991
36	NC_018594	AAGAT	2	10	79888	79897	60 %	20 %	20 %	0 %	405759995
37	NC_018594	AGGGA	2	10	79961	79970	40 %	0 %	60 %	0 %	405759995
38	NC_018594	TGACA	2	10	84431	84440	40 %	20 %	20 %	20 %	405760000
39	NC_018594	ATACT	2	10	86909	86918	40 %	40 %	0 %	20 %	405760004
40	NC_018594	TGGTT	2	10	89557	89566	0 %	60 %	40 %	0 %	405760006
41	NC_018594	TACTC	2	10	91918	91927	20 %	40 %	0 %	40 %	405760012
42	NC_018594	TTGGT	2	10	92036	92045	0 %	60 %	40 %	0 %	405760012
43	NC_018594	GGTCT	2	10	92366	92375	0 %	40 %	40 %	20 %	405760012
44	NC_018594	GCTTG	2	10	94221	94230	0 %	40 %	40 %	20 %	405760014
45	NC_018594	TGGTT	2	10	94973	94982	0 %	60 %	40 %	0 %	405760015
46	NC_018594	AAGGA	2	10	99384	99393	60 %	0 %	40 %	0 %	405760020
47	NC_018594	TCTCT	2	10	102150	102159	0 %	60 %	0 %	40 %	405760022
48	NC_018594	CTTGA	2	10	103574	103583	20 %	40 %	20 %	20 %	405760022
49	NC_018594	ACTTT	2	10	104161	104170	20 %	60 %	0 %	20 %	405760023
50	NC_018594	AGAGG	2	10	108242	108251	40 %	0 %	60 %	0 %	405760025
51	NC_018594	AGAGA	2	10	109694	109703	60 %	0 %	40 %	0 %	405760027
52	NC_018594	GAAAT	2	10	110103	110112	60 %	20 %	20 %	0 %	405760027
53	NC_018594	GGGCT	2	10	110388	110397	0 %	20 %	60 %	20 %	405760027
54	NC_018594	GGACG	2	10	114779	114788	20 %	0 %	60 %	20 %	405760029
55	NC_018594	GATTG	2	10	116385	116394	20 %	40 %	40 %	0 %	405760029
56	NC_018594	GCTTT	2	10	116593	116602	0 %	60 %	20 %	20 %	405760029
57	NC_018594	TAGTG	2	10	116609	116618	20 %	40 %	40 %	0 %	405760029
58	NC_018594	GAAAA	2	10	118172	118181	80 %	0 %	20 %	0 %	405760031
59	NC_018594	ATGAA	2	10	120057	120066	60 %	20 %	20 %	0 %	405760032
60	NC_018594	GGATA	2	10	120411	120420	40 %	20 %	40 %	0 %	405760032
61	NC_018594	TTTTA	2	10	121286	121295	20 %	80 %	0 %	0 %	405760035
62	NC_018594	ATTTC	2	10	121495	121504	20 %	60 %	0 %	20 %	405760035
63	NC_018594	ATGAA	2	10	121888	121897	60 %	20 %	20 %	0 %	405760035
64	NC_018594	AAAGG	2	10	124724	124733	60 %	0 %	40 %	0 %	405760038
65	NC_018594	TGGCA	2	10	126175	126184	20 %	20 %	40 %	20 %	405760040
66	NC_018594	AACCA	2	10	132878	132887	60 %	0 %	0 %	40 %	405760046
67	NC_018594	GCAGA	2	10	134869	134878	40 %	0 %	40 %	20 %	405760048
68	NC_018594	ATCCT	2	10	137045	137054	20 %	40 %	0 %	40 %	405760048
69	NC_018594	ACCTT	2	10	137727	137736	20 %	40 %	0 %	40 %	405760049
70	NC_018594	GGGAA	2	10	138558	138567	40 %	0 %	60 %	0 %	405760049
71	NC_018594	CTGAC	2	10	139349	139358	20 %	20 %	20 %	40 %	405760050
72	NC_018594	TCCAG	2	10	139374	139383	20 %	20 %	20 %	40 %	405760050
73	NC_018594	CAGAT	2	10	141402	141411	40 %	20 %	20 %	20 %	405760051
74	NC_018594	TATAA	2	10	145813	145822	60 %	40 %	0 %	0 %	405760055
75	NC_018594	AATAA	2	10	152445	152454	80 %	20 %	0 %	0 %	405760056
76	NC_018594	ATTTC	2	10	152737	152746	20 %	60 %	0 %	20 %	405760056
77	NC_018594	AAGAA	2	10	155894	155903	80 %	0 %	20 %	0 %	405760061
78	NC_018594	TCTCT	2	10	157469	157478	0 %	60 %	0 %	40 %	405760063
79	NC_018594	TTTTA	2	10	159426	159435	20 %	80 %	0 %	0 %	405760064
80	NC_018594	GATTT	2	10	160199	160208	20 %	60 %	20 %	0 %	405760065
81	NC_018594	TATTT	2	10	162197	162206	20 %	80 %	0 %	0 %	405760068
82	NC_018594	AATCA	2	10	162316	162325	60 %	20 %	0 %	20 %	405760068
83	NC_018594	GCAGT	2	10	167486	167495	20 %	20 %	40 %	20 %	405760071
84	NC_018594	CAACT	2	10	171644	171653	40 %	20 %	0 %	40 %	405760074
85	NC_018594	AGGAA	2	10	176996	177005	60 %	0 %	40 %	0 %	405760078
86	NC_018594	AATAT	2	10	181595	181604	60 %	40 %	0 %	0 %	405760086
87	NC_018594	TGGGA	2	10	183530	183539	20 %	20 %	60 %	0 %	405760087
88	NC_018594	TGGTT	2	10	185225	185234	0 %	60 %	40 %	0 %	405760088
89	NC_018594	ATAAG	2	10	187753	187762	60 %	20 %	20 %	0 %	405760092
90	NC_018594	TCCTT	2	10	189695	189704	0 %	60 %	0 %	40 %	405760093
91	NC_018594	GGATT	2	10	190803	190812	20 %	40 %	40 %	0 %	405760095
92	NC_018594	AACAA	2	10	194344	194353	80 %	0 %	0 %	20 %	405760099
93	NC_018594	ATCCT	2	10	194715	194724	20 %	40 %	0 %	40 %	405760099
94	NC_018594	TGGCT	2	10	195652	195661	0 %	40 %	40 %	20 %	405760100
95	NC_018594	TATAA	2	10	196125	196134	60 %	40 %	0 %	0 %	405760100
96	NC_018594	TGAAG	2	10	196959	196968	40 %	20 %	40 %	0 %	405760101
97	NC_018594	TCAAG	2	10	197308	197317	40 %	20 %	20 %	20 %	405760101
98	NC_018594	ATTAT	2	10	198914	198923	40 %	60 %	0 %	0 %	405760103
99	NC_018594	AAGAT	2	10	198980	198989	60 %	20 %	20 %	0 %	405760103
100	NC_018594	ATTCA	2	10	201263	201272	40 %	40 %	0 %	20 %	405760105
101	NC_018594	CCATG	2	10	201321	201330	20 %	20 %	20 %	40 %	405760105
102	NC_018594	CCTTT	2	10	206113	206122	0 %	60 %	0 %	40 %	405760109
103	NC_018594	CCAAA	2	10	209189	209198	60 %	0 %	0 %	40 %	405760113
104	NC_018594	TCCCA	2	10	209391	209400	20 %	20 %	0 %	60 %	405760113
105	NC_018594	GCCAA	2	10	210250	210259	40 %	0 %	20 %	40 %	405760114
106	NC_018594	ACCAT	2	10	216529	216538	40 %	20 %	0 %	40 %	405760118
107	NC_018594	TGGCT	2	10	217086	217095	0 %	40 %	40 %	20 %	405760118
108	NC_018594	TCTTT	2	10	227947	227956	0 %	80 %	0 %	20 %	405760124
109	NC_018594	GCTTT	2	10	230125	230134	0 %	60 %	20 %	20 %	405760126
110	NC_018594	CCTGT	2	10	232575	232584	0 %	40 %	20 %	40 %	405760130
111	NC_018594	ATGTG	2	10	235902	235911	20 %	40 %	40 %	0 %	405760133
112	NC_018594	TTGGA	2	10	239798	239807	20 %	40 %	40 %	0 %	405760136
113	NC_018594	AAATC	2	10	240974	240983	60 %	20 %	0 %	20 %	405760138
114	NC_018594	TTTAG	2	10	241221	241230	20 %	60 %	20 %	0 %	405760138
115	NC_018594	TGATG	2	10	241716	241725	20 %	40 %	40 %	0 %	405760139
116	NC_018594	ACAGG	2	10	243037	243046	40 %	0 %	40 %	20 %	405760139
117	NC_018594	CAGCC	2	10	245195	245204	20 %	0 %	20 %	60 %	405760142
118	NC_018594	AGACA	2	10	248050	248059	60 %	0 %	20 %	20 %	405760144
119	NC_018594	AATCA	2	10	249056	249065	60 %	20 %	0 %	20 %	405760145
120	NC_018594	CCAGA	2	10	249609	249618	40 %	0 %	20 %	40 %	405760145
121	NC_018594	GTCAT	2	10	249736	249745	20 %	40 %	20 %	20 %	405760145
122	NC_018594	AGTCC	2	10	249777	249786	20 %	20 %	20 %	40 %	405760145
123	NC_018594	GAAAT	2	10	250211	250220	60 %	20 %	20 %	0 %	405760146
124	NC_018594	TGTGG	2	10	251315	251324	0 %	40 %	60 %	0 %	405760147
125	NC_018594	GGTCA	2	10	251897	251906	20 %	20 %	40 %	20 %	405760147
126	NC_018594	GTGAA	2	10	253689	253698	40 %	20 %	40 %	0 %	405760149
127	NC_018594	TTTAC	2	10	255719	255728	20 %	60 %	0 %	20 %	405760152
128	NC_018594	CTTCT	2	10	255813	255822	0 %	60 %	0 %	40 %	405760152
129	NC_018594	TCGCC	2	10	256019	256028	0 %	20 %	20 %	60 %	405760152
130	NC_018594	CTTGG	2	10	262564	262573	0 %	40 %	40 %	20 %	405760161
131	NC_018594	AACCA	2	10	265172	265181	60 %	0 %	0 %	40 %	405760162
132	NC_018594	ACGTG	2	10	265819	265828	20 %	20 %	40 %	20 %	405760162
133	NC_018594	TCCCA	2	10	273539	273548	20 %	20 %	0 %	60 %	405760166
134	NC_018594	TGCTA	2	10	277044	277053	20 %	40 %	20 %	20 %	405760168
135	NC_018594	AAATC	2	10	280120	280129	60 %	20 %	0 %	20 %	405760172
136	NC_018594	TGGTG	2	10	280399	280408	0 %	40 %	60 %	0 %	405760172
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138	NC_018594	AGGAG	2	10	285501	285510	40 %	0 %	60 %	0 %	405760175
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142	NC_018594	TGGAT	2	10	296859	296868	20 %	40 %	40 %	0 %	405760189
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147	NC_018594	AAATG	2	10	301534	301543	60 %	20 %	20 %	0 %	405760201
148	NC_018594	GATTT	2	10	304389	304398	20 %	60 %	20 %	0 %	405760207
149	NC_018594	CAGTA	2	10	310542	310551	40 %	20 %	20 %	20 %	405760218
150	NC_018594	CTTGT	2	10	312168	312177	0 %	60 %	20 %	20 %	405760219
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157	NC_018594	TTGGT	2	10	323091	323100	0 %	60 %	40 %	0 %	405760234
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159	NC_018594	AAGGA	2	10	324256	324265	60 %	0 %	40 %	0 %	405760236
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260	NC_018594	ATGGT	2	10	491752	491761	20 %	40 %	40 %	0 %	405760392
261	NC_018594	GACTT	2	10	493237	493246	20 %	40 %	20 %	20 %	405760395
262	NC_018594	AGGTC	2	10	494753	494762	20 %	20 %	40 %	20 %	405760396
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