MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC7179

Total Repeats: 1131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018593	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018593	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412112
3	NC_018593	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404412112
4	NC_018593	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404412113
5	NC_018593	TTATTT	2	12	10918	10929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404412114
6	NC_018593	CACATT	2	12	11199	11210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412114
7	NC_018593	GCAAAA	2	12	14089	14100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018593	ATTTTC	2	12	19878	19889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404412121
9	NC_018593	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404412123
10	NC_018593	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404412123
11	NC_018593	AGTTGC	2	12	23648	23659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412125
12	NC_018593	TAAAGC	2	12	23701	23712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404412125
13	NC_018593	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412126
14	NC_018593	AATTAT	2	12	35674	35685	50 %	50 %	0 %	0 %	404412140
15	NC_018593	GTTTAA	2	12	35941	35952	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404412140
16	NC_018593	TCGATT	2	12	36539	36550	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404412141
17	NC_018593	TCACCA	2	12	36821	36832	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404412142
18	NC_018593	CGATTA	2	12	42251	42262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412146
19	NC_018593	TTATGT	2	12	46737	46748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412149
20	NC_018593	AAAGAT	2	12	50390	50401	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412152
21	NC_018593	TGAAAT	2	12	51227	51238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412153
22	NC_018593	TGGCGG	2	12	54362	54373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404412157
23	NC_018593	TCAAAA	2	12	54482	54493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404412157
24	NC_018593	ACAGTG	2	12	56065	56076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404412160
25	NC_018593	AAAAAT	2	12	56929	56940	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404412162
26	NC_018593	TTTATA	2	12	59407	59418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412164
27	NC_018593	GCAGAA	2	12	60854	60865	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404412164
28	NC_018593	AGGTAA	2	12	60945	60956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404412165
29	NC_018593	TGATCG	2	12	62333	62344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412166
30	NC_018593	TGATTT	2	12	67678	67689	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412169
31	NC_018593	TTTTGC	2	12	68283	68294	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404412170
32	NC_018593	AAAGAA	2	12	74275	74286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412173
33	NC_018593	GTCTTG	2	12	82570	82581	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404412184
34	NC_018593	GTGGCT	2	12	84996	85007	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018593	ATCACT	2	12	89081	89092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412190
36	NC_018593	AAACAC	2	12	89514	89525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412190
37	NC_018593	AAGATA	2	12	92513	92524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412190
38	NC_018593	TATAAA	2	12	94731	94742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412191
39	NC_018593	TATTAG	2	12	104962	104973	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404412201
40	NC_018593	TAAAAT	2	12	114800	114811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412212
41	NC_018593	CAAAAT	2	12	114941	114952	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404412212
42	NC_018593	GTCCGC	2	12	115073	115084	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	404412212
43	NC_018593	GTTTTA	2	12	121709	121720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412220
44	NC_018593	TTGAGT	2	12	123668	123679	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018593	TGATTT	2	12	123723	123734	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412224
46	NC_018593	AAGTAA	2	12	127694	127705	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412227
47	NC_018593	TCTATT	2	12	133815	133826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404412235
48	NC_018593	CAGGTT	2	12	138529	138540	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018593	GTTGCA	2	12	149857	149868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412255
50	NC_018593	GATTGC	2	12	149919	149930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412255
51	NC_018593	TTAAAA	2	12	150593	150604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412256
52	NC_018593	GGCGGT	2	12	155570	155581	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404412259
53	NC_018593	CGAATT	2	12	157924	157935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412260
54	NC_018593	GTAAAA	2	12	161076	161087	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412263
55	NC_018593	TTTTAC	2	12	163123	163134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404412267
56	NC_018593	TTTTTA	2	12	164162	164173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404412269
57	NC_018593	GCATTA	2	12	164392	164403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412269
58	NC_018593	AAAGTG	2	12	165374	165385	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404412270
59	NC_018593	TACTAG	2	12	170383	170394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412275
60	NC_018593	AAGCGA	2	12	172887	172898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404412277
61	NC_018593	CAATCC	2	12	176201	176212	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404412279
62	NC_018593	AAAGAT	2	12	178212	178223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412281
63	NC_018593	ATGGCT	2	12	179337	179348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412282
64	NC_018593	CAGAAA	2	12	180011	180022	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404412282
65	NC_018593	AAAAGA	2	12	180087	180098	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412282
66	NC_018593	AAAAAC	2	12	180417	180428	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404412282
67	NC_018593	TGAAGT	2	12	182457	182468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412282
68	NC_018593	CATTGA	2	12	190590	190601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412289
69	NC_018593	TGCAGC	2	12	191245	191256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404412290
70	NC_018593	TAAAAA	2	12	193483	193494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404412292
71	NC_018593	AATAAA	2	12	196489	196500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018593	TTCTTT	2	12	211495	211506	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404412310
73	NC_018593	GAAAAA	2	12	213584	213595	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412312
74	NC_018593	AGGAAA	2	12	213903	213914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412312
75	NC_018593	GAAAAA	2	12	214809	214820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412314
76	NC_018593	AAGGAG	2	12	218746	218757	50 %	0 %	50 %	0 %	404412315
77	NC_018593	GCAAGT	2	12	220636	220647	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404412317
78	NC_018593	TTAAAG	2	12	222579	222590	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412319
79	NC_018593	GAAAAC	2	12	223506	223517	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018593	TGTCGG	2	12	224555	224566	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404412320
81	NC_018593	GCAGAA	2	12	227584	227595	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404412322
82	NC_018593	TCTCCA	2	12	228422	228433	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	404412323
83	NC_018593	GGTTTT	2	12	229727	229738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404412325
84	NC_018593	ATTGAT	2	12	230674	230685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404412327
85	NC_018593	CAGAAC	2	12	231699	231710	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404412328
86	NC_018593	ATTCAA	2	12	233987	233998	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018593	AAGGAA	2	12	235558	235569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018593	TAGGCG	2	12	237211	237222	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018593	ATTCAA	2	12	240008	240019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018593	AAGGAA	2	12	241579	241590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018593	TAGGCG	2	12	243232	243243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018593	AGTCAA	2	12	245046	245057	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018593	TTTACC	2	12	245475	245486	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404412330
94	NC_018593	AGTAAA	2	12	252732	252743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412336
95	NC_018593	AAAGGA	2	12	255992	256003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412339
96	NC_018593	TTATAT	2	12	259830	259841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018593	ACAGTA	2	12	260159	260170	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404412345
98	NC_018593	AAAACA	2	12	260534	260545	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404412346
99	NC_018593	GCATGG	2	12	260715	260726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404412346
100	NC_018593	CTGTAG	2	12	263659	263670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412351
101	NC_018593	GACAAT	2	12	265477	265488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404412354
102	NC_018593	AAGAAA	2	12	268061	268072	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412355
103	NC_018593	TACACT	2	12	272305	272316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412356
104	NC_018593	TTCGTG	2	12	273817	273828	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404412356
105	NC_018593	CCAAAT	2	12	279802	279813	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404412360
106	NC_018593	GAATTA	2	12	282411	282422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412362
107	NC_018593	AACTTT	2	12	284892	284903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018593	CGAAAT	2	12	286710	286721	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404412366
109	NC_018593	TCTTTT	2	12	289673	289684	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404412368
110	NC_018593	AGTTCA	2	12	291937	291948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412370
111	NC_018593	ATCAAT	2	12	292080	292091	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404412370
112	NC_018593	ATGAAA	2	12	292438	292449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412371
113	NC_018593	AATACA	2	12	293482	293493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018593	CTTTTA	2	12	294311	294322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404412373
115	NC_018593	TAGAAA	2	12	295257	295268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412374
116	NC_018593	ACGTTG	2	12	297187	297198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412376
117	NC_018593	GAAAAC	2	12	299094	299105	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404412377
118	NC_018593	GCTGCG	2	12	304467	304478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404412384
119	NC_018593	TTTTGA	2	12	304867	304878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412384
120	NC_018593	AAATAA	2	12	308172	308183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404412387
121	NC_018593	GAAGGG	2	12	309969	309980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404412388
122	NC_018593	GATTCA	2	12	313610	313621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412391
123	NC_018593	GCAATT	2	12	313640	313651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412391
124	NC_018593	GAACCA	2	12	320431	320442	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404412397
125	NC_018593	TCCATT	2	12	323039	323050	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404412400
126	NC_018593	TTGGTT	2	12	323449	323460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018593	CAAAAA	2	12	324752	324763	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404412402
128	NC_018593	TGAATC	2	12	327173	327184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412403
129	NC_018593	AGATCA	3	18	330058	330075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_018593	TAAAAA	2	12	331012	331023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404412406
131	NC_018593	CTGGTT	2	12	333931	333942	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404412409
132	NC_018593	GAAAAT	2	12	335283	335294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412411
133	NC_018593	CATAGA	2	12	341683	341694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_018593	AGAAAA	2	12	342618	342629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412418
135	NC_018593	GATTGT	2	12	343473	343484	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404412419
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138	NC_018593	TGCAGA	2	12	354696	354707	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404412424
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142	NC_018593	CATTAA	2	12	365492	365503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404412436
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147	NC_018593	CTGACT	2	12	377305	377316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404412451
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150	NC_018593	ATGATA	2	12	383011	383022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018593	AAAAGC	2	12	385089	385100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404412459
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153	NC_018593	TGAAAT	2	12	388717	388728	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412463
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155	NC_018593	TATAAA	2	12	393015	393026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412468
156	NC_018593	AGTGCT	2	12	394649	394660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_018593	GAAATG	2	12	396206	396217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404412474
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160	NC_018593	TTGATT	2	12	403753	403764	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412481
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209	NC_018593	CGGTTG	2	12	521849	521860	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404412605
210	NC_018593	TACGCG	2	12	527936	527947	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404412609
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215	NC_018593	GACGGC	2	12	534445	534456	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	404412615
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217	NC_018593	AATCAC	2	12	548192	548203	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404412629
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219	NC_018593	AGAATT	2	12	554022	554033	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412634
220	NC_018593	TGCGTT	2	12	562576	562587	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404412642
221	NC_018593	GGAGGT	2	12	566802	566813	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	404412648
222	NC_018593	TCTTTT	2	12	567338	567349	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404412649
223	NC_018593	TTTGCT	2	12	568274	568285	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404412649
224	NC_018593	TCGCTG	2	12	569698	569709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404412651
225	NC_018593	CCAATC	2	12	569928	569939	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404412651
226	NC_018593	GTACTT	2	12	575969	575980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404412657
227	NC_018593	ACTGTA	2	12	577589	577600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412658
228	NC_018593	AGAATG	2	12	580099	580110	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404412662
229	NC_018593	ACTTTT	2	12	581954	581965	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404412663
230	NC_018593	GCACTT	2	12	582410	582421	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404412664
231	NC_018593	ATTTGT	5	30	582541	582570	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412664
232	NC_018593	ATAAAG	2	12	584823	584834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412665
233	NC_018593	ACTTGA	2	12	586234	586245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412665
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349	NC_018593	TATCGT	2	12	924996	925007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404413010
350	NC_018593	ATTGTA	2	12	925979	925990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404413012
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370	NC_018593	TTGGTA	2	12	995736	995747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404413089
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374	NC_018593	AGGAAG	2	12	1001932	1001943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
375	NC_018593	TTTTAG	2	12	1004248	1004259	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404413099
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448	NC_018593	TATTAA	2	12	1239706	1239717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_018593	GCAAAA	2	12	1244505	1244516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404413351
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455	NC_018593	CAACAC	2	12	1263969	1263980	50 %	0 %	0 %	50 %	404413366
456	NC_018593	CGTAAC	2	12	1267873	1267884	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404413369
457	NC_018593	GTCATC	2	12	1269064	1269075	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404413370
458	NC_018593	TATGAT	2	12	1269379	1269390	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404413370
459	NC_018593	CGAAGC	2	12	1269918	1269929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404413370
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