MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC7179

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018593	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018593	GCAAAA	2	12	14089	14100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018593	GTGGCT	2	12	84996	85007	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018593	TTGAGT	2	12	123668	123679	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018593	CAGGTT	2	12	138529	138540	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018593	AATAAA	2	12	196489	196500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018593	GAAAAC	2	12	223506	223517	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018593	ATTCAA	2	12	233987	233998	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018593	AAGGAA	2	12	235558	235569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018593	TAGGCG	2	12	237211	237222	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018593	ATTCAA	2	12	240008	240019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018593	AAGGAA	2	12	241579	241590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018593	TAGGCG	2	12	243232	243243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018593	AGTCAA	2	12	245046	245057	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018593	TTATAT	2	12	259830	259841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018593	AACTTT	2	12	284892	284903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018593	AATACA	2	12	293482	293493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018593	TTGGTT	2	12	323449	323460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018593	AGATCA	3	18	330058	330075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018593	CATAGA	2	12	341683	341694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018593	ATGATA	2	12	383011	383022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018593	AGTGCT	2	12	394649	394660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018593	CTATAA	2	12	472957	472968	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018593	GGGGAA	2	12	506038	506049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018593	TTAGGT	2	12	520227	520238	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018593	AGATTT	2	12	534000	534011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018593	ATCATT	2	12	602646	602657	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018593	TTAAGA	2	12	642461	642472	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018593	ATCATT	2	12	644650	644661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018593	GAATAA	2	12	666226	666237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018593	TATAGG	2	12	689138	689149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018593	ATCTCA	2	12	719189	719200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018593	TACAAA	2	12	740477	740488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018593	AGAAAA	2	12	740607	740618	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018593	TTACTT	2	12	815741	815752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018593	TGAAAT	2	12	825608	825619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018593	AAATAG	2	12	852298	852309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018593	GTAATC	2	12	859102	859113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018593	TTACAA	2	12	859120	859131	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018593	ATGAAA	2	12	867715	867726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018593	TTGACT	2	12	991742	991753	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018593	AGGAAG	2	12	1001932	1001943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018593	CTTTTT	2	12	1061669	1061680	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018593	TTATGG	2	12	1106798	1106809	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018593	TTTAGT	2	12	1110804	1110815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018593	TTTTAA	2	12	1145260	1145271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018593	CTTTTT	2	12	1183258	1183269	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018593	GAAAAA	2	12	1213241	1213252	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018593	TATTAA	2	12	1239706	1239717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018593	TATTAA	2	12	1390495	1390506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018593	ATAAAA	2	12	1424674	1424685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018593	TTTCAT	2	12	1433068	1433079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018593	CTCTTC	2	12	1535746	1535757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018593	GGTATA	2	12	1569001	1569012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018593	GGTTGT	2	12	1586398	1586409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018593	GAATAA	2	12	1587954	1587965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018593	GTAAAC	2	12	1589105	1589116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018593	AAAATA	2	12	1602052	1602063	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018593	TAAAAA	2	12	1602962	1602973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018593	TAAAAA	2	12	1629705	1629716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018593	ATGAAA	2	12	1649227	1649238	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018593	TAGATT	2	12	1654005	1654016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018593	CGCCTA	2	12	1689810	1689821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018593	TTTCCT	2	12	1691463	1691474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018593	TTGAAT	2	12	1693035	1693046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018593	CTATAA	2	12	1738720	1738731	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018593	AAAAAC	2	12	1763354	1763365	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018593	CGCCTA	2	12	1793793	1793804	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018593	TTTCCT	2	12	1795445	1795456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018593	TTGAAT	2	12	1797017	1797028	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018593	GTTTTA	2	12	1804938	1804949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018593	AAAAAG	2	12	1888066	1888077	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018593	CTCTAT	2	12	1905786	1905797	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018593	TCATTT	2	12	1906984	1906995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018593	GTTTTC	2	12	1934154	1934165	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018593	CAAAAA	2	12	1951879	1951890	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018593	GAAAAA	2	12	1955740	1955751	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018593	TCTTTT	2	12	2013880	2013891	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018593	ATTCAA	2	12	2107877	2107888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018593	TTATAT	2	12	2170820	2170831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018593	AATTTT	2	12	2223635	2223646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018593	AAATTG	2	12	2229809	2229820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018593	CTCTGT	2	12	2236654	2236665	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018593	TAATAC	2	12	2320401	2320412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018593	CGCCTA	2	12	2341203	2341214	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018593	TTTCCT	2	12	2343106	2343117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018593	TTGAAT	2	12	2344678	2344689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018593	TTCAAA	2	12	2428219	2428230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018593	CTTTTT	2	12	2493448	2493459	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018593	ATCCCA	2	12	2513363	2513374	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018593	AAAAGA	2	12	2519194	2519205	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018593	TTTTTA	2	12	2525190	2525201	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018593	TTTTAA	2	12	2575456	2575467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018593	CGCCTA	2	12	2614409	2614420	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018593	TTTCCT	2	12	2616312	2616323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018593	TTGAAT	2	12	2617884	2617895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018593	CCTCTT	2	12	2661367	2661378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018593	TAAATC	2	12	2682836	2682847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018593	TTTTAT	2	12	2755410	2755421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018593	ATATTT	2	12	2799182	2799193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018593	TATCAA	2	12	2825709	2825720	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018593	AAATGA	2	12	2825723	2825734	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018593	TAAAAA	2	12	2825793	2825804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018593	AAGTAT	2	12	2826659	2826670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.