MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC7179

Total Repeats: 1027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018593	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412112
2	NC_018593	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404412112
3	NC_018593	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404412113
4	NC_018593	TTATTT	2	12	10918	10929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404412114
5	NC_018593	CACATT	2	12	11199	11210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412114
6	NC_018593	ATTTTC	2	12	19878	19889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404412121
7	NC_018593	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404412123
8	NC_018593	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404412123
9	NC_018593	AGTTGC	2	12	23648	23659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412125
10	NC_018593	TAAAGC	2	12	23701	23712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404412125
11	NC_018593	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412126
12	NC_018593	AATTAT	2	12	35674	35685	50 %	50 %	0 %	0 %	404412140
13	NC_018593	GTTTAA	2	12	35941	35952	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404412140
14	NC_018593	TCGATT	2	12	36539	36550	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404412141
15	NC_018593	TCACCA	2	12	36821	36832	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404412142
16	NC_018593	CGATTA	2	12	42251	42262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412146
17	NC_018593	TTATGT	2	12	46737	46748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412149
18	NC_018593	AAAGAT	2	12	50390	50401	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412152
19	NC_018593	TGAAAT	2	12	51227	51238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412153
20	NC_018593	TGGCGG	2	12	54362	54373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404412157
21	NC_018593	TCAAAA	2	12	54482	54493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404412157
22	NC_018593	ACAGTG	2	12	56065	56076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404412160
23	NC_018593	AAAAAT	2	12	56929	56940	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404412162
24	NC_018593	TTTATA	2	12	59407	59418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412164
25	NC_018593	GCAGAA	2	12	60854	60865	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404412164
26	NC_018593	AGGTAA	2	12	60945	60956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404412165
27	NC_018593	TGATCG	2	12	62333	62344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412166
28	NC_018593	TGATTT	2	12	67678	67689	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412169
29	NC_018593	TTTTGC	2	12	68283	68294	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404412170
30	NC_018593	AAAGAA	2	12	74275	74286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412173
31	NC_018593	GTCTTG	2	12	82570	82581	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404412184
32	NC_018593	ATCACT	2	12	89081	89092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412190
33	NC_018593	AAACAC	2	12	89514	89525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412190
34	NC_018593	AAGATA	2	12	92513	92524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412190
35	NC_018593	TATAAA	2	12	94731	94742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412191
36	NC_018593	TATTAG	2	12	104962	104973	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404412201
37	NC_018593	TAAAAT	2	12	114800	114811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412212
38	NC_018593	CAAAAT	2	12	114941	114952	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404412212
39	NC_018593	GTCCGC	2	12	115073	115084	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	404412212
40	NC_018593	GTTTTA	2	12	121709	121720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412220
41	NC_018593	TGATTT	2	12	123723	123734	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412224
42	NC_018593	AAGTAA	2	12	127694	127705	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412227
43	NC_018593	TCTATT	2	12	133815	133826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404412235
44	NC_018593	GTTGCA	2	12	149857	149868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412255
45	NC_018593	GATTGC	2	12	149919	149930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412255
46	NC_018593	TTAAAA	2	12	150593	150604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412256
47	NC_018593	GGCGGT	2	12	155570	155581	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404412259
48	NC_018593	CGAATT	2	12	157924	157935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412260
49	NC_018593	GTAAAA	2	12	161076	161087	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412263
50	NC_018593	TTTTAC	2	12	163123	163134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404412267
51	NC_018593	TTTTTA	2	12	164162	164173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404412269
52	NC_018593	GCATTA	2	12	164392	164403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412269
53	NC_018593	AAAGTG	2	12	165374	165385	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404412270
54	NC_018593	TACTAG	2	12	170383	170394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412275
55	NC_018593	AAGCGA	2	12	172887	172898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404412277
56	NC_018593	CAATCC	2	12	176201	176212	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404412279
57	NC_018593	AAAGAT	2	12	178212	178223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412281
58	NC_018593	ATGGCT	2	12	179337	179348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412282
59	NC_018593	CAGAAA	2	12	180011	180022	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404412282
60	NC_018593	AAAAGA	2	12	180087	180098	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412282
61	NC_018593	AAAAAC	2	12	180417	180428	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404412282
62	NC_018593	TGAAGT	2	12	182457	182468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412282
63	NC_018593	CATTGA	2	12	190590	190601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412289
64	NC_018593	TGCAGC	2	12	191245	191256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404412290
65	NC_018593	TAAAAA	2	12	193483	193494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404412292
66	NC_018593	TTCTTT	2	12	211495	211506	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404412310
67	NC_018593	GAAAAA	2	12	213584	213595	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412312
68	NC_018593	AGGAAA	2	12	213903	213914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412312
69	NC_018593	GAAAAA	2	12	214809	214820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412314
70	NC_018593	AAGGAG	2	12	218746	218757	50 %	0 %	50 %	0 %	404412315
71	NC_018593	GCAAGT	2	12	220636	220647	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404412317
72	NC_018593	TTAAAG	2	12	222579	222590	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412319
73	NC_018593	TGTCGG	2	12	224555	224566	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404412320
74	NC_018593	GCAGAA	2	12	227584	227595	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404412322
75	NC_018593	TCTCCA	2	12	228422	228433	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	404412323
76	NC_018593	GGTTTT	2	12	229727	229738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404412325
77	NC_018593	ATTGAT	2	12	230674	230685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404412327
78	NC_018593	CAGAAC	2	12	231699	231710	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404412328
79	NC_018593	TTTACC	2	12	245475	245486	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404412330
80	NC_018593	AGTAAA	2	12	252732	252743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412336
81	NC_018593	AAAGGA	2	12	255992	256003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412339
82	NC_018593	ACAGTA	2	12	260159	260170	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404412345
83	NC_018593	AAAACA	2	12	260534	260545	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404412346
84	NC_018593	GCATGG	2	12	260715	260726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404412346
85	NC_018593	CTGTAG	2	12	263659	263670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412351
86	NC_018593	GACAAT	2	12	265477	265488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404412354
87	NC_018593	AAGAAA	2	12	268061	268072	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412355
88	NC_018593	TACACT	2	12	272305	272316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412356
89	NC_018593	TTCGTG	2	12	273817	273828	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404412356
90	NC_018593	CCAAAT	2	12	279802	279813	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404412360
91	NC_018593	GAATTA	2	12	282411	282422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412362
92	NC_018593	CGAAAT	2	12	286710	286721	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404412366
93	NC_018593	TCTTTT	2	12	289673	289684	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404412368
94	NC_018593	AGTTCA	2	12	291937	291948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412370
95	NC_018593	ATCAAT	2	12	292080	292091	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404412370
96	NC_018593	ATGAAA	2	12	292438	292449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412371
97	NC_018593	CTTTTA	2	12	294311	294322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404412373
98	NC_018593	TAGAAA	2	12	295257	295268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412374
99	NC_018593	ACGTTG	2	12	297187	297198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404412376
100	NC_018593	GAAAAC	2	12	299094	299105	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404412377
101	NC_018593	GCTGCG	2	12	304467	304478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404412384
102	NC_018593	TTTTGA	2	12	304867	304878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404412384
103	NC_018593	AAATAA	2	12	308172	308183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404412387
104	NC_018593	GAAGGG	2	12	309969	309980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404412388
105	NC_018593	GATTCA	2	12	313610	313621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412391
106	NC_018593	GCAATT	2	12	313640	313651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412391
107	NC_018593	GAACCA	2	12	320431	320442	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404412397
108	NC_018593	TCCATT	2	12	323039	323050	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404412400
109	NC_018593	CAAAAA	2	12	324752	324763	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404412402
110	NC_018593	TGAATC	2	12	327173	327184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404412403
111	NC_018593	TAAAAA	2	12	331012	331023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404412406
112	NC_018593	CTGGTT	2	12	333931	333942	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404412409
113	NC_018593	GAAAAT	2	12	335283	335294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412411
114	NC_018593	AGAAAA	2	12	342618	342629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404412418
115	NC_018593	GATTGT	2	12	343473	343484	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404412419
116	NC_018593	TGAAAC	2	12	344021	344032	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404412420
117	NC_018593	TAGATT	2	12	350393	350404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404412422
118	NC_018593	TGCAGA	2	12	354696	354707	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404412424
119	NC_018593	GAGAAA	2	12	355384	355395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412424
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121	NC_018593	GCCATC	2	12	364193	364204	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404412434
122	NC_018593	CATTAA	2	12	365492	365503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404412436
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144	NC_018593	TGGTAT	2	12	418297	418308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404412498
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146	NC_018593	TATGAT	2	12	418409	418420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404412498
147	NC_018593	TTTATT	2	12	426405	426416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404412506
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220	NC_018593	TTCTTT	2	12	618210	618221	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404412698
221	NC_018593	CTGTTT	2	12	620268	620279	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404412699
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224	NC_018593	GGTTGC	2	12	627417	627428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404412709
225	NC_018593	AAGATG	2	12	629234	629245	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404412709
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227	NC_018593	GTAAAA	2	12	631921	631932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404412709
228	NC_018593	TTAGAT	2	12	640149	640160	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404412719
229	NC_018593	CATCTA	2	12	641721	641732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412720
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231	NC_018593	TTATTT	2	12	644947	644958	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404412723
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342	NC_018593	TTAGGT	2	12	1026735	1026746	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404413121
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456	NC_018593	ATTGGC	2	12	1391939	1391950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404413493
457	NC_018593	GGAGCT	2	12	1392296	1392307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404413493
458	NC_018593	ATACCA	2	12	1395977	1395988	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404413496
459	NC_018593	GATATT	2	12	1400293	1400304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404413500
460	NC_018593	GCTTCT	2	12	1401640	1401651	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	404413501
461	NC_018593	TAAAAT	2	12	1402452	1402463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404413502
462	NC_018593	TTTATC	2	12	1405837	1405848	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404413506
463	NC_018593	CATAAA	2	12	1405917	1405928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404413506
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469	NC_018593	GTATCT	2	12	1427769	1427780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404413526
470	NC_018593	TACGTT	2	12	1429188	1429199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404413528
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475	NC_018593	TCTGTT	2	12	1453315	1453326	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404413552
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481	NC_018593	TTTTTC	2	12	1463946	1463957	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404413561
482	NC_018593	ATCAAA	2	12	1469869	1469880	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404413570
483	NC_018593	TACATC	2	12	1473036	1473047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404413573
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485	NC_018593	CTTCGT	2	12	1478046	1478057	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	404413580
486	NC_018593	GATTTC	2	12	1478170	1478181	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404413580
487	NC_018593	CTTGCA	2	12	1480437	1480448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404413583
488	NC_018593	ACGAGC	2	12	1480474	1480485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404413583
489	NC_018593	TTTCGT	2	12	1490036	1490047	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404413590
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499	NC_018593	CATCTT	2	12	1534146	1534157	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404413632
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