MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC7179

Total Repeats: 351

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018593	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018593	AAAGA	2	10	14386	14395	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018593	AAAGG	2	10	35584	35593	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018593	GACTT	2	10	51375	51384	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018593	ATGGT	2	10	53629	53638	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018593	TAAAA	2	10	56667	56676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018593	TTATG	2	10	58874	58883	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018593	TTTTA	2	10	62786	62795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018593	TGAAG	2	10	78909	78918	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018593	AAATA	2	10	79087	79096	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018593	AACAA	2	10	85233	85242	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018593	ATTTT	2	10	87469	87478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018593	ATATC	2	10	107809	107818	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018593	TACTG	2	10	120078	120087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018593	AAAGT	2	10	122317	122326	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018593	ATAAA	2	10	145409	145418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018593	GATAA	2	10	147593	147602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018593	ATATG	2	10	154575	154584	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018593	CTAAA	2	10	164928	164937	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018593	ATAGA	2	10	190889	190898	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018593	TTGTC	2	10	196414	196423	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018593	ACAAA	2	10	196779	196788	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018593	TGGTT	2	10	202271	202280	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018593	ATCGT	2	10	202311	202320	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018593	ATAAA	2	10	202465	202474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018593	ATATA	2	10	204518	204527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018593	ACAAA	2	10	212568	212577	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018593	GAGTG	2	10	212647	212656	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018593	AGCCG	2	10	220825	220834	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_018593	GAAAA	2	10	228949	228958	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018593	GAATA	2	10	232038	232047	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018593	AAATT	2	10	233724	233733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018593	TAATT	2	10	233925	233934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018593	TCGTG	2	10	235084	235093	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018593	AAGGT	2	10	236552	236561	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018593	TAATT	2	10	239946	239955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018593	TCGTG	2	10	241105	241114	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018593	AAGGT	2	10	242573	242582	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018593	GGCAT	2	10	259864	259873	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018593	AGTGA	2	10	274384	274393	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018593	TTTAA	2	10	278320	278329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018593	ACTAA	2	10	285001	285010	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018593	AAAGA	2	10	292227	292236	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018593	ATTCG	2	10	314641	314650	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018593	ATTTG	2	10	317269	317278	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018593	TAGAT	2	10	317309	317318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018593	TAATT	2	10	331648	331657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018593	ATTGT	2	10	340973	340982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018593	TGAAA	2	10	341713	341722	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018593	AGATT	2	10	350910	350919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018593	ATAGA	2	10	352074	352083	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018593	GTGAT	2	10	375006	375015	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018593	GAAAC	2	10	380106	380115	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018593	AAATT	2	10	398006	398015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018593	GAAAG	2	10	421080	421089	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018593	TGAGG	2	10	428931	428940	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018593	GGAAA	2	10	436499	436508	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018593	CTTAT	2	10	450965	450974	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018593	TTTCT	2	10	465626	465635	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018593	ATAGT	2	10	473288	473297	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018593	CATTC	2	10	474779	474788	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_018593	CTATG	2	10	475055	475064	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018593	CTAAT	2	10	476476	476485	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018593	ATACA	2	10	482188	482197	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018593	AAACA	2	10	510385	510394	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018593	TAATT	2	10	515645	515654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018593	TATAG	2	10	520187	520196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018593	GAAAA	2	10	525790	525799	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018593	AATTA	2	10	540738	540747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018593	AAAAC	2	10	547927	547936	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018593	CTATG	2	10	555351	555360	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018593	AAAGA	2	10	560805	560814	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018593	ATAAA	2	10	575775	575784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018593	TAGTA	2	10	576897	576906	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018593	AATCA	2	10	579756	579765	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018593	ATTGA	2	10	587754	587763	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018593	ATTAA	2	10	601069	601078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018593	TAAAA	2	10	624589	624598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018593	GAAAT	2	10	632199	632208	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018593	ATCAA	2	10	640737	640746	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018593	ATTTT	2	10	640756	640765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018593	GAATG	2	10	641162	641171	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018593	TTACT	2	10	666188	666197	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018593	ATTTT	2	10	672147	672156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018593	GGGGA	2	10	681594	681603	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018593	TATTT	2	10	687831	687840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018593	AGAGA	2	10	687983	687992	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018593	CTTTT	2	10	688958	688967	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018593	TCTTT	2	10	739568	739577	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018593	TAAAA	2	10	740253	740262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018593	CTTTT	2	10	746976	746985	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018593	TAGTT	2	10	746989	746998	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018593	TGAAA	2	10	765879	765888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018593	ATAGA	2	10	767908	767917	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018593	GTATA	2	10	802592	802601	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018593	ATTTT	2	10	810588	810597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018593	AGGAA	2	10	825144	825153	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018593	GGAAA	2	10	830919	830928	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018593	ATAGA	2	10	846021	846030	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018593	ATCTT	2	10	847201	847210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018593	ATTTT	2	10	851680	851689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018593	AATGT	2	10	859086	859095	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018593	TTATA	2	10	882834	882843	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018593	GAAAG	2	10	899842	899851	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018593	TTTTA	2	10	900293	900302	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018593	ATAGA	2	10	904205	904214	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018593	GAAAA	2	10	911310	911319	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018593	TATAA	2	10	918463	918472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018593	TGGAA	2	10	928119	928128	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018593	TTTAT	2	10	933653	933662	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018593	ATGAG	2	10	954427	954436	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018593	TTTTA	2	10	961554	961563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018593	TAAAA	2	10	961619	961628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018593	TATAA	2	10	976090	976099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018593	TGACG	2	10	977768	977777	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018593	AGATA	2	10	992555	992564	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018593	GAGAG	2	10	1001501	1001510	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018593	TTCTA	2	10	1006172	1006181	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018593	TTTTC	2	10	1010058	1010067	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018593	GTTTT	2	10	1019954	1019963	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018593	TTTAG	2	10	1022359	1022368	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018593	ATAAA	2	10	1022378	1022387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018593	TAAAA	2	10	1022389	1022398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018593	ACTAA	2	10	1022500	1022509	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018593	TAGGA	2	10	1036958	1036967	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018593	GTTTT	2	10	1036968	1036977	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018593	TAAAC	2	10	1040981	1040990	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018593	CTTTT	2	10	1041465	1041474	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018593	AAAGC	2	10	1047396	1047405	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018593	TTATT	2	10	1047439	1047448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018593	AAGTT	2	10	1055564	1055573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018593	ATAAA	2	10	1055618	1055627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018593	GCTAT	2	10	1056490	1056499	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018593	TATAT	2	10	1058594	1058603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018593	TTAAT	2	10	1089265	1089274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018593	TTGGT	2	10	1094737	1094746	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018593	TTTAT	2	10	1100534	1100543	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018593	ATAAA	2	10	1100554	1100563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018593	AAATA	2	10	1145169	1145178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018593	TAAAC	2	10	1160219	1160228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018593	TAAAA	2	10	1180505	1180514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018593	ATTTA	2	10	1180533	1180542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018593	TAGTT	2	10	1191202	1191211	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018593	ATAAA	2	10	1203781	1203790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018593	ACTTG	2	10	1216420	1216429	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018593	AGATA	2	10	1216455	1216464	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018593	AAAGA	2	10	1218915	1218924	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018593	TACTA	2	10	1227900	1227909	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018593	TGTTA	2	10	1248161	1248170	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018593	TTTTA	2	10	1260010	1260019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018593	TTATT	2	10	1278046	1278055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018593	TTTAT	2	10	1285998	1286007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018593	GAATA	2	10	1286205	1286214	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_018593	AAATA	2	10	1361546	1361555	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018593	TAAAA	2	10	1382047	1382056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018593	TTAAA	2	10	1382116	1382125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_018593	TGTAT	2	10	1391762	1391771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018593	AAATA	2	10	1391807	1391816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018593	TTTAT	2	10	1398288	1398297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018593	CCTTA	2	10	1451938	1451947	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_018593	TAAAA	2	10	1460428	1460437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_018593	TCATT	2	10	1477176	1477185	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_018593	CTTTT	2	10	1543802	1543811	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_018593	TGCAA	2	10	1650869	1650878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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193	NC_018593	TATCA	2	10	1660362	1660371	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_018593	TGTTA	2	10	2202725	2202734	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_018593	TAAAA	2	10	2215788	2215797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_018593	TAACA	2	10	2294774	2294783	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_018593	TCACT	2	10	2304906	2304915	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
273	NC_018593	CTATA	2	10	2320341	2320350	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_018593	AAGTT	2	10	2356090	2356099	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_018593	TTATT	2	10	2380681	2380690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_018593	TATTT	2	10	2386133	2386142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018593	TCCTC	2	10	2390532	2390541	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
283	NC_018593	ATAAG	2	10	2400580	2400589	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_018593	GTTTT	2	10	2410762	2410771	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_018593	TTTTA	2	10	2441021	2441030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018593	CTTTT	2	10	2447167	2447176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_018593	AGCAA	2	10	2468163	2468172	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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301	NC_018593	CTTTT	2	10	2527024	2527033	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
302	NC_018593	AAATA	2	10	2540440	2540449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_018593	TTAGA	2	10	2650584	2650593	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
332	NC_018593	ATTTT	2	10	2650679	2650688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_018593	TAAAA	2	10	2670285	2670294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_018593	TATAA	2	10	2672387	2672396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_018593	GGGCT	2	10	2727853	2727862	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
341	NC_018593	TTGGA	2	10	2736750	2736759	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
342	NC_018593	TATAG	2	10	2742939	2742948	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
343	NC_018593	TATAT	2	10	2761020	2761029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_018593	TAGAA	2	10	2771720	2771729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
345	NC_018593	CTTAA	2	10	2799488	2799497	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
346	NC_018593	TAAAA	2	10	2817279	2817288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
347	NC_018593	AAATC	2	10	2818165	2818174	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
348	NC_018593	CACTC	2	10	2838219	2838228	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
349	NC_018593	GTTCT	2	10	2851505	2851514	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
350	NC_018593	GAACC	2	10	2879226	2879235	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
351	NC_018593	TATCA	2	10	2881533	2881542	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.