MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC5850

Total Repeats: 361

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018592	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018592	AAAGA	2	10	14387	14396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018592	GACTT	2	10	47275	47284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018592	ATGGT	2	10	49529	49538	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018592	TAAAA	2	10	52567	52576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018592	TTATG	2	10	54774	54783	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018592	TGATT	2	10	80894	80903	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018592	AATAA	2	10	82665	82674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018592	ATTTT	2	10	84683	84692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018592	ATATC	2	10	105023	105032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018592	TACTG	2	10	117288	117297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018592	AAAGT	2	10	119527	119536	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018592	ATAAA	2	10	142635	142644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018592	GATAA	2	10	144819	144828	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018592	ATATG	2	10	151797	151806	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018592	CTAAA	2	10	162446	162455	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018592	ATAGA	2	10	188412	188421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018592	TTGTC	2	10	193937	193946	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018592	ACAAA	2	10	194302	194311	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018592	ATATA	2	10	201554	201563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018592	ACAAA	2	10	209610	209619	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018592	GAGTG	2	10	209689	209698	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018592	AGCCG	2	10	217867	217876	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_018592	GAAAA	2	10	225991	226000	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018592	GAAAA	2	10	226194	226203	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018592	GAAAA	2	10	226397	226406	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018592	AAACA	2	10	226490	226499	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018592	GAATA	2	10	229486	229495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018592	AAATT	2	10	231172	231181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018592	TAATT	2	10	231373	231382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018592	TCGTG	2	10	232532	232541	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018592	AAGGT	2	10	234000	234009	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018592	TAATT	2	10	237395	237404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018592	TCGTG	2	10	238554	238563	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018592	AAGGT	2	10	240022	240031	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018592	AAAGA	2	10	249130	249139	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018592	GGCAT	2	10	257313	257322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018592	AGTGA	2	10	271832	271841	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018592	AAAGA	2	10	289678	289687	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018592	ATAAA	2	10	300970	300979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018592	ATTCG	2	10	314812	314821	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018592	TGTTA	2	10	323647	323656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018592	AGTCT	2	10	337781	337790	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018592	ATTGT	2	10	348410	348419	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018592	AGATT	2	10	358348	358357	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018592	ATAGA	2	10	359512	359521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018592	GTGAT	2	10	382426	382435	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018592	GAAAC	2	10	387526	387535	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018592	AAATT	2	10	405392	405401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018592	CAAAA	2	10	410712	410721	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018592	GAAAG	2	10	428461	428470	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018592	TGAGG	2	10	436309	436318	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018592	TTTGG	2	10	442743	442752	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018592	GGAAA	2	10	443889	443898	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018592	CTTAT	2	10	458355	458364	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018592	TTTCT	2	10	481686	481695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018592	AATTT	2	10	489127	489136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018592	ATAGT	2	10	489162	489171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018592	ATAGT	2	10	491380	491389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018592	CATTC	2	10	492872	492881	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018592	TTATT	2	10	492982	492991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018592	CTATG	2	10	493148	493157	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018592	CTAAT	2	10	494559	494568	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018592	ATACA	2	10	499694	499703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018592	ATAAA	2	10	511853	511862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018592	AAACA	2	10	526944	526953	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018592	TAATT	2	10	532210	532219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018592	TATAG	2	10	536752	536761	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018592	GAAAA	2	10	542354	542363	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018592	AATTA	2	10	557302	557311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018592	AAAAC	2	10	564491	564500	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018592	CTATG	2	10	571915	571924	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018592	AAAGA	2	10	577369	577378	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018592	ATAAA	2	10	592339	592348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018592	TAGTA	2	10	593461	593470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018592	AATCA	2	10	596320	596329	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018592	ATTGA	2	10	604300	604309	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018592	ATTAA	2	10	617615	617624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018592	AAAAT	2	10	619912	619921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018592	TAAAA	2	10	642642	642651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018592	GAAAT	2	10	650250	650259	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018592	ATCAA	2	10	658786	658795	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018592	ATTTT	2	10	658805	658814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018592	TAAAA	2	10	659803	659812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018592	ATGTT	2	10	661421	661430	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018592	TTACT	2	10	684913	684922	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018592	ATTTT	2	10	690873	690882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018592	GGGGA	2	10	700321	700330	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018592	TATTT	2	10	706558	706567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018592	AGAGA	2	10	706709	706718	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018592	CTTTT	2	10	707684	707693	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018592	TCTTT	2	10	758333	758342	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018592	TAAAA	2	10	759014	759023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018592	CTTTT	2	10	765737	765746	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018592	TAGTT	2	10	765750	765759	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018592	TGAAA	2	10	784641	784650	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018592	ATAGA	2	10	786689	786698	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018592	GTATA	2	10	821334	821343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018592	TAATA	2	10	823997	824006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018592	ATTTT	2	10	829335	829344	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018592	AGGAA	2	10	843892	843901	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018592	CAAAT	2	10	845549	845558	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018592	GGAAA	2	10	849651	849660	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018592	ATAGA	2	10	864682	864691	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018592	ATCTT	2	10	865862	865871	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018592	AATGT	2	10	877744	877753	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018592	TTATA	2	10	901502	901511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018592	GAAAG	2	10	918510	918519	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018592	ATAGA	2	10	922874	922883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018592	GAAAA	2	10	929980	929989	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018592	TATAA	2	10	937134	937143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018592	TGAAA	2	10	946624	946633	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018592	TGGAA	2	10	946790	946799	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018592	TTTAT	2	10	952323	952332	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018592	ATGAG	2	10	973098	973107	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018592	CAAGA	2	10	978611	978620	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018592	TTTTA	2	10	980224	980233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018592	TAAAA	2	10	980289	980298	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018592	TATAA	2	10	994760	994769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018592	TGACG	2	10	996438	996447	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018592	AGATA	2	10	1011227	1011236	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018592	GAGAG	2	10	1020174	1020183	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018592	TTCTA	2	10	1024845	1024854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018592	CAAAC	2	10	1025012	1025021	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_018592	TTTTC	2	10	1028732	1028741	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018592	GTTTT	2	10	1038628	1038637	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018592	TTTAG	2	10	1041033	1041042	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018592	ATAAA	2	10	1041052	1041061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018592	TAAAA	2	10	1041063	1041072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018592	ACTAA	2	10	1041174	1041183	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018592	TAGGA	2	10	1055632	1055641	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018592	GTTTT	2	10	1055642	1055651	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018592	TAAAC	2	10	1059655	1059664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018592	CTTTT	2	10	1060139	1060148	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018592	AAAGC	2	10	1066071	1066080	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018592	TTATT	2	10	1066114	1066123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018592	TTTAT	2	10	1068062	1068071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018592	AAGTT	2	10	1074239	1074248	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018592	ATAAA	2	10	1074294	1074303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018592	GCTAT	2	10	1075166	1075175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018592	TATAT	2	10	1077270	1077279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018592	TTAAT	2	10	1107940	1107949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018592	AAATA	2	10	1156990	1156999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018592	TAAAC	2	10	1172039	1172048	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018592	TATTT	2	10	1174168	1174177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018592	TAAAA	2	10	1192323	1192332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018592	ATTTA	2	10	1192351	1192360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_018592	TTATG	2	10	2308639	2308648	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018592	GGAGA	2	10	2326407	2326416	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018592	AGGCG	2	10	2343031	2343040	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
289	NC_018592	TAACA	2	10	2352542	2352551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_018592	TCACT	2	10	2362674	2362683	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
291	NC_018592	CTATA	2	10	2378110	2378119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_018592	TTACC	2	10	2399574	2399583	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
293	NC_018592	CACGA	2	10	2401295	2401304	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
294	NC_018592	AATTA	2	10	2402454	2402463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_018592	AAGTT	2	10	2413810	2413819	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_018592	AACAC	2	10	2427978	2427987	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
297	NC_018592	AATTT	2	10	2430475	2430484	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_018592	AAACA	2	10	2438022	2438031	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
299	NC_018592	TATTT	2	10	2445540	2445549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_018592	TCCTC	2	10	2449939	2449948	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
301	NC_018592	ATAAG	2	10	2459987	2459996	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
302	NC_018592	GTTTT	2	10	2468572	2468581	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
303	NC_018592	TTCTT	2	10	2498193	2498202	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
304	NC_018592	TTTTA	2	10	2498829	2498838	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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310	NC_018592	TATCA	2	10	2538842	2538851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
311	NC_018592	TACCA	2	10	2540291	2540300	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
312	NC_018592	AAACA	2	10	2551311	2551320	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
313	NC_018592	GCTTT	2	10	2553310	2553319	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
314	NC_018592	ATAAA	2	10	2553323	2553332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_018592	TTTAT	2	10	2598287	2598296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_018592	AAAAG	2	10	2599078	2599087	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
321	NC_018592	ATTAT	2	10	2601447	2601456	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_018592	ATCAT	2	10	2610616	2610625	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
323	NC_018592	TGGAA	2	10	2611651	2611660	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
324	NC_018592	ATTAG	2	10	2616448	2616457	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
325	NC_018592	TTATA	2	10	2627156	2627165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_018592	TTTTA	2	10	2627572	2627581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_018592	CACGA	2	10	2635393	2635402	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
330	NC_018592	AATTA	2	10	2636552	2636561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_018592	TCGTT	2	10	2640936	2640945	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
332	NC_018592	CAAGG	2	10	2640982	2640991	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
333	NC_018592	GAAAA	2	10	2641013	2641022	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
334	NC_018592	AATAT	2	10	2650383	2650392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_018592	CAGGT	2	10	2661591	2661600	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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337	NC_018592	TTAAT	2	10	2672714	2672723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
338	NC_018592	TACAA	2	10	2677496	2677505	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
339	NC_018592	TTAGA	2	10	2677717	2677726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
340	NC_018592	ATTTT	2	10	2677812	2677821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_018592	TAAAA	2	10	2697418	2697427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_018592	TATAA	2	10	2699521	2699530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_018592	ATAAA	2	10	2724278	2724287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_018592	GTTTC	2	10	2727690	2727699	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
345	NC_018592	ATTAA	2	10	2735775	2735784	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_018592	TTTCC	2	10	2737002	2737011	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
347	NC_018592	TAAAA	2	10	2743476	2743485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
348	NC_018592	CTTTT	2	10	2751218	2751227	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
349	NC_018592	GGGCT	2	10	2752826	2752835	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
350	NC_018592	TTGGA	2	10	2761722	2761731	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
351	NC_018592	TATAG	2	10	2767911	2767920	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
352	NC_018592	GAATA	2	10	2768951	2768960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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359	NC_018592	GTTCT	2	10	2876415	2876424	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
360	NC_018592	GAACC	2	10	2904135	2904144	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
361	NC_018592	TATCA	2	10	2906441	2906450	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.