MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018591	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404285372
2	NC_018591	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404285373
3	NC_018591	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404285373
4	NC_018591	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404285373
5	NC_018591	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404285374
6	NC_018591	ATTTTC	2	12	19878	19889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404285382
7	NC_018591	CTTCAT	2	12	20898	20909	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404285384
8	NC_018591	TTTTGG	2	12	21262	21273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404285384
9	NC_018591	ATTGAA	2	12	24911	24922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404285387
10	NC_018591	CCAAAA	2	12	35062	35073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404285399
11	NC_018591	AATTAT	2	12	35676	35687	50 %	50 %	0 %	0 %	404285400
12	NC_018591	TCACCA	2	12	36823	36834	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404285402
13	NC_018591	CGATTA	2	12	42253	42264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404285406
14	NC_018591	TTATGT	2	12	46744	46755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404285409
15	NC_018591	AAAGAT	2	12	50396	50407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285412
16	NC_018591	TGAAAT	2	12	51233	51244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404285413
17	NC_018591	TGGCGG	2	12	54365	54376	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404285417
18	NC_018591	TCAAAA	2	12	54485	54496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404285417
19	NC_018591	AAAAAT	2	12	56932	56943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404285422
20	NC_018591	GCAGAA	2	12	60857	60868	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404285424
21	NC_018591	AGGTAA	2	12	60948	60959	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404285425
22	NC_018591	TGATTG	2	12	62336	62347	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404285426
23	NC_018591	TGATTT	2	12	67667	67678	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404285431
24	NC_018591	TTTTGC	2	12	68272	68283	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404285432
25	NC_018591	AAGTAA	2	12	74990	75001	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285437
26	NC_018591	CAAACG	2	12	75965	75976	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404285439
27	NC_018591	TTGGAT	2	12	76820	76831	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404285439
28	NC_018591	AAAATA	2	12	80582	80593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404285446
29	NC_018591	CTTTTT	2	12	91374	91385	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404285458
30	NC_018591	ATCACT	2	12	94434	94445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404285461
31	NC_018591	GATATT	2	12	94493	94504	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404285461
32	NC_018591	AACTAT	2	12	100787	100798	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404285462
33	NC_018591	AACCAG	2	12	106025	106036	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404285467
34	NC_018591	TATTAG	2	12	110318	110329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404285472
35	NC_018591	TAGCAG	2	12	110381	110392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404285472
36	NC_018591	ATTACA	2	12	116430	116441	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404285480
37	NC_018591	TAAAAT	2	12	123545	123556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404285488
38	NC_018591	CAAAAT	2	12	123686	123697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404285488
39	NC_018591	CAAGCG	2	12	124687	124698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404285488
40	NC_018591	GTTTTA	2	12	130453	130464	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404285496
41	NC_018591	TGATTT	2	12	132469	132480	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404285500
42	NC_018591	AAGTAA	2	12	136440	136451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285503
43	NC_018591	CCGTTA	2	12	139947	139958	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404285510
44	NC_018591	CAACTG	2	12	149694	149705	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404285519
45	NC_018591	GAATAA	2	12	151786	151797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285521
46	NC_018591	GTTGCA	2	12	156045	156056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404285526
47	NC_018591	GATTGC	2	12	156107	156118	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404285526
48	NC_018591	AGGCGG	2	12	161755	161766	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	404285530
49	NC_018591	CGTAAC	2	12	164591	164602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404285531
50	NC_018591	AGTACC	2	12	164636	164647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404285531
51	NC_018591	GTTTTC	2	12	165612	165623	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404285532
52	NC_018591	GTTGAT	2	12	167228	167239	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404285534
53	NC_018591	GTAAAA	2	12	167591	167602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285534
54	NC_018591	TTTTAC	2	12	169635	169646	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404285538
55	NC_018591	TTTTTA	2	12	170672	170683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404285540
56	NC_018591	GCATTA	2	12	170902	170913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404285540
57	NC_018591	AAAGTA	2	12	171884	171895	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285541
58	NC_018591	TTGCAC	2	12	174778	174789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404285543
59	NC_018591	AGAAGT	2	12	176926	176937	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404285544
60	NC_018591	CAATCC	2	12	178841	178852	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404285546
61	NC_018591	AAAGAT	2	12	180852	180863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285548
62	NC_018591	TGAAGT	2	12	185097	185108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285549
63	NC_018591	CATTGA	2	12	193221	193232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404285556
64	NC_018591	TGCAGC	2	12	193876	193887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404285557
65	NC_018591	TAAAAA	2	12	196114	196125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404285559
66	NC_018591	AAAGCA	2	12	209331	209342	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404285571
67	NC_018591	TTCTTT	2	12	214136	214147	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404285577
68	NC_018591	GAAAAA	2	12	216225	216236	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404285579
69	NC_018591	GAAAAA	2	12	217449	217460	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404285581
70	NC_018591	GCAAGT	2	12	223276	223287	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404285584
71	NC_018591	TGTCGG	2	12	227196	227207	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404285587
72	NC_018591	AAAAAC	2	12	228681	228692	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404285588
73	NC_018591	GCAGAA	2	12	230225	230236	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404285589
74	NC_018591	TAAAAT	2	12	233129	233140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404285593
75	NC_018591	CCAGAA	2	12	234342	234353	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404285594
76	NC_018591	TTTACC	2	12	248116	248127	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404285596
77	NC_018591	AGTAAA	2	12	255373	255384	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285602
78	NC_018591	GTACGT	2	12	256179	256190	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404285604
79	NC_018591	AAGTCG	2	12	261448	261459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404285609
80	NC_018591	ACAGTA	2	12	262801	262812	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404285611
81	NC_018591	AAAACA	2	12	263176	263187	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404285612
82	NC_018591	GCATGG	2	12	263357	263368	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404285612
83	NC_018591	CTGTAG	2	12	266301	266312	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404285617
84	NC_018591	GACAAT	2	12	267813	267824	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404285619
85	NC_018591	GTGAGC	2	12	268268	268279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404285619
86	NC_018591	ATTGAT	2	12	268462	268473	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404285619
87	NC_018591	TAAAAA	2	12	269531	269542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404285620
88	NC_018591	TGAATC	2	12	270316	270327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404285621
89	NC_018591	GCTACT	2	12	272008	272019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404285622
90	NC_018591	TTCTGA	2	12	275082	275093	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404285624
91	NC_018591	AAGAAA	2	12	278298	278309	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404285628
92	NC_018591	TTCGTG	2	12	284054	284065	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404285629
93	NC_018591	TAACAA	2	12	287360	287371	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404285632
94	NC_018591	TTTAAC	2	12	288433	288444	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404285633
95	NC_018591	GTTGAG	2	12	290287	290298	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	404285634
96	NC_018591	ATTTTT	2	12	290560	290571	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404285634
97	NC_018591	CCAAAT	2	12	293092	293103	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404285635
98	NC_018591	AGAACT	2	12	295702	295713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404285637
99	NC_018591	TACAAG	2	12	299946	299957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404285641
100	NC_018591	CGAAAT	2	12	300000	300011	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404285641
101	NC_018591	CATTAT	2	12	303732	303743	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404285644
102	NC_018591	TCTTTT	2	12	304193	304204	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404285644
103	NC_018591	ATCAAT	2	12	306600	306611	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404285646
104	NC_018591	ATGAAA	2	12	306958	306969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285647
105	NC_018591	GCTTTT	2	12	308301	308312	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404285649
106	NC_018591	CTTTTA	2	12	308830	308841	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404285649
107	NC_018591	TAGAAA	2	12	309776	309787	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285650
108	NC_018591	ACGTTG	2	12	311705	311716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404285652
109	NC_018591	GAAAAC	2	12	313612	313623	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404285653
110	NC_018591	TTTTGA	2	12	319274	319285	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404285660
111	NC_018591	GAAGGG	2	12	324376	324387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404285664
112	NC_018591	AGAACC	2	12	327410	327421	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404285667
113	NC_018591	GATTCA	2	12	328017	328028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404285667
114	NC_018591	GCAATT	2	12	328047	328058	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404285667
115	NC_018591	AATTAT	2	12	333328	333339	50 %	50 %	0 %	0 %	404285672
116	NC_018591	AAATAG	2	12	333881	333892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404285673
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228	NC_018591	ACAAGC	2	12	662610	662621	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404285989
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345	NC_018591	ATTGTA	2	12	999096	999107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404286339
346	NC_018591	GCAGAT	2	12	1000006	1000017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404286339
347	NC_018591	ATTTGG	2	12	1000304	1000315	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404286339
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