MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2376

Total Repeats: 1134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018590	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018590	CTTGCA	2	12	5003	5014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406488
3	NC_018590	GAAATT	2	12	6230	6241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404406489
4	NC_018590	TCGTAC	2	12	6619	6630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406489
5	NC_018590	TGAAGA	2	12	9548	9559	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406490
6	NC_018590	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404406491
7	NC_018590	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018590	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018590	ATTTTC	2	12	19878	19889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404406498
10	NC_018590	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404406500
11	NC_018590	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404406500
12	NC_018590	TGAAAG	2	12	23572	23583	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406503
13	NC_018590	ATTGAA	2	12	26918	26929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404406506
14	NC_018590	TCACCA	2	12	34732	34743	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404406516
15	NC_018590	GGAAAC	2	12	36412	36423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404406517
16	NC_018590	GCTGTG	2	12	37193	37204	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404406518
17	NC_018590	CGATTA	2	12	40162	40173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406520
18	NC_018590	ATATTT	2	12	44305	44316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404406523
19	NC_018590	TGGCGG	2	12	45599	45610	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404406525
20	NC_018590	TCAAAA	2	12	45719	45730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404406525
21	NC_018590	AGAAAA	2	12	46634	46645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404406527
22	NC_018590	AAAAAT	2	12	48167	48178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404406530
23	NC_018590	ATAGTG	2	12	48557	48568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404406530
24	NC_018590	GCAGAA	2	12	52092	52103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404406532
25	NC_018590	AGGTAA	2	12	52183	52194	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406533
26	NC_018590	AGATCC	2	12	57978	57989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404406538
27	NC_018590	CAGAAA	2	12	66503	66514	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404406544
28	NC_018590	GTGGCT	2	12	73688	73699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018590	AGTTTG	2	12	76611	76622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404406553
30	NC_018590	TGTAGA	2	12	80708	80719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404406558
31	NC_018590	AAGATA	2	12	83680	83691	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406558
32	NC_018590	TGAAGA	2	12	86793	86804	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406559
33	NC_018590	GAGGAA	2	12	88547	88558	50 %	0 %	50 %	0 %	404406561
34	NC_018590	GCAATT	2	12	91674	91685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406564
35	NC_018590	AAGATA	2	12	94199	94210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406567
36	NC_018590	ATTCCG	2	12	96625	96636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406567
37	NC_018590	AGAAGT	2	12	98052	98063	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406567
38	NC_018590	TCACAG	2	12	98507	98518	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404406567
39	NC_018590	GTAGAA	2	12	98869	98880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406567
40	NC_018590	TATTAG	2	12	102185	102196	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404406570
41	NC_018590	GCAATT	2	12	102232	102243	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406570
42	NC_018590	TTATTT	2	12	105722	105733	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404406574
43	NC_018590	TAAAAT	2	12	113642	113653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404406582
44	NC_018590	CAAAAT	2	12	113783	113794	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404406582
45	NC_018590	GTTTTA	2	12	120550	120561	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404406591
46	NC_018590	AATTTG	2	12	122547	122558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404406594
47	NC_018590	CCGTTA	2	12	123748	123759	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406595
48	NC_018590	ATCTGT	2	12	124422	124433	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404406595
49	NC_018590	CAGGTT	2	12	131074	131085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018590	CAACTG	2	12	133494	133505	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404406604
51	NC_018590	TCTGAA	2	12	135394	135405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406606
52	NC_018590	GTTGCA	2	12	141141	141152	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404406613
53	NC_018590	GATTGC	2	12	141203	141214	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404406613
54	NC_018590	TTAAAA	2	12	141877	141888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404406614
55	NC_018590	TTCCTT	2	12	141932	141943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404406614
56	NC_018590	ATGGAA	2	12	145670	145681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018590	AGGCGG	2	12	146853	146864	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	404406617
58	NC_018590	CGTAAC	2	12	149676	149687	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404406618
59	NC_018590	ATTTTC	2	12	151209	151220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404406619
60	NC_018590	GTAAAA	2	12	153188	153199	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406621
61	NC_018590	TTTTAC	2	12	155236	155247	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404406625
62	NC_018590	TTTTTA	2	12	156273	156284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404406627
63	NC_018590	GCATTA	2	12	156503	156514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406627
64	NC_018590	TAAAAA	2	12	158391	158402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018590	TTAAAA	2	12	159689	159700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404406629
66	NC_018590	TTGCAC	2	12	160347	160358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406630
67	NC_018590	GGAAGT	2	12	162495	162506	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	404406631
68	NC_018590	CAATCC	2	12	164411	164422	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404406633
69	NC_018590	AAAGAT	2	12	166422	166433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406635
70	NC_018590	AAAAGA	2	12	168297	168308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404406636
71	NC_018590	TGAAGT	2	12	170667	170678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404406636
72	NC_018590	CTCCAA	2	12	175403	175414	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404406639
73	NC_018590	CTTCAT	2	12	176732	176743	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404406640
74	NC_018590	CATTGA	2	12	178789	178800	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406643
75	NC_018590	TAAAAA	2	12	181680	181691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404406646
76	NC_018590	TTTTTC	2	12	181778	181789	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018590	TCCGGT	2	12	182778	182789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404406648
78	NC_018590	AAAGCA	2	12	194883	194894	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404406658
79	NC_018590	TTCTTT	2	12	199681	199692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404406663
80	NC_018590	GAAAAA	2	12	201770	201781	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404406665
81	NC_018590	GAAAAA	2	12	202995	203006	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404406667
82	NC_018590	AGCAGA	2	12	206715	206726	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404406668
83	NC_018590	AAGGAG	2	12	206933	206944	50 %	0 %	50 %	0 %	404406668
84	NC_018590	GCAAGT	2	12	208823	208834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404406670
85	NC_018590	GAAAAC	2	12	211693	211704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018590	TGTCGG	2	12	212743	212754	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404406673
87	NC_018590	AAAAAC	2	12	214225	214236	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404406674
88	NC_018590	GCAGAA	2	12	215769	215780	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404406675
89	NC_018590	TAAAAT	2	12	218874	218885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404406679
90	NC_018590	ATTGAT	2	12	219064	219075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404406679
91	NC_018590	GAACCA	2	12	220090	220101	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404406680
92	NC_018590	ATTCAA	2	12	222375	222386	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018590	AAGGAA	2	12	223946	223957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018590	TAGGCG	2	12	225599	225610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018590	ATTCAA	2	12	228372	228383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018590	AAGGAA	2	12	229943	229954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018590	TAGGCG	2	12	231596	231607	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018590	CGGTGG	2	12	233636	233647	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404406682
99	NC_018590	TTTACC	2	12	233840	233851	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404406682
100	NC_018590	TCGGAA	2	12	234048	234059	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404406683
101	NC_018590	TATATG	2	12	238548	238559	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404406686
102	NC_018590	AAAGGT	2	12	243230	243241	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406690
103	NC_018590	TTATAT	2	12	248204	248215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018590	ACAGTA	2	12	248533	248544	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404406697
105	NC_018590	AAAACA	2	12	248907	248918	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404406698
106	NC_018590	GCATGG	2	12	249088	249099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404406698
107	NC_018590	TAAAAA	2	12	249755	249766	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404406699
108	NC_018590	CTGTAG	2	12	252030	252041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404406703
109	NC_018590	GACAAT	2	12	256421	256432	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404406709
110	NC_018590	GTCATC	2	12	257648	257659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406710
111	NC_018590	TTCGTG	2	12	265349	265360	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404406712
112	NC_018590	CCAAAT	2	12	271333	271344	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404406716
113	NC_018590	AGAACT	2	12	273930	273941	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404406718
114	NC_018590	AGTTTG	2	12	277254	277265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404406720
115	NC_018590	TACAAG	2	12	279865	279876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404406723
116	NC_018590	CGAAAT	2	12	279919	279930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404406723
117	NC_018590	CATTAT	2	12	283650	283661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404406726
118	NC_018590	TCTTTT	2	12	284111	284122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404406726
119	NC_018590	TTTGCC	2	12	285511	285522	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	404406727
120	NC_018590	TAAAAG	2	12	287923	287934	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406728
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122	NC_018590	AGTTCA	2	12	290027	290038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406729
123	NC_018590	ATCAAT	2	12	290170	290181	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404406729
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234	NC_018590	GGAAAA	2	12	551283	551294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404406991
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236	NC_018590	ATATCC	2	12	553577	553588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404406992
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