MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2376

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018590	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018590	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018590	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018590	GTGGCT	2	12	73688	73699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018590	CAGGTT	2	12	131074	131085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018590	ATGGAA	2	12	145670	145681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018590	TAAAAA	2	12	158391	158402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018590	TTTTTC	2	12	181778	181789	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018590	GAAAAC	2	12	211693	211704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018590	ATTCAA	2	12	222375	222386	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018590	AAGGAA	2	12	223946	223957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018590	TAGGCG	2	12	225599	225610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018590	ATTCAA	2	12	228372	228383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018590	AAGGAA	2	12	229943	229954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018590	TAGGCG	2	12	231596	231607	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018590	TTATAT	2	12	248204	248215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018590	ATTAAA	2	12	337225	337236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018590	CATAGA	2	12	345777	345788	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018590	ATGTTA	2	12	355330	355341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018590	TTGTTT	2	12	413358	413369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018590	TTATAT	2	12	448279	448290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018590	ACAAAA	2	12	480528	480539	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018590	CAAAAA	2	12	530778	530789	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018590	AAATGT	2	12	547887	547898	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018590	AGATTT	2	12	556019	556030	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018590	AAATAA	2	12	596283	596294	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018590	ATCATT	2	12	626080	626091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018590	ATCATT	2	12	662068	662079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018590	GAATAA	2	12	686484	686495	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018590	ACTTTT	2	12	693740	693751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018590	TATAGG	2	12	712300	712311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018590	AATTAG	2	12	740205	740216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018590	AAATAG	2	12	858286	858297	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018590	GTAATC	2	12	865090	865101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018590	TTACAA	2	12	865108	865119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018590	ATGAAA	2	12	873713	873724	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018590	TTTTTC	2	12	978628	978639	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018590	TTGACT	2	12	998718	998729	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018590	AGGAAG	2	12	1008895	1008906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018590	AGGTTT	2	12	1046535	1046546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018590	CTTTTT	2	12	1064202	1064213	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018590	TTTAGT	2	12	1109888	1109899	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018590	CTTTTT	2	12	1149272	1149283	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018590	CTTTTT	2	12	1181070	1181081	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018590	GAAAAA	2	12	1211051	1211062	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018590	AGGTGA	2	12	1231282	1231293	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018590	TATTAA	2	12	1236452	1236463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018590	ACAATT	2	12	1259181	1259192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018590	TTTTAA	2	12	1383571	1383582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018590	TACCAA	2	12	1408995	1409006	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018590	AAAGCC	2	12	1452027	1452038	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018590	CTCTTC	2	12	1535894	1535905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018590	GGTTGT	2	12	1586543	1586554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018590	GAATAA	2	12	1588099	1588110	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018590	GTAAAC	2	12	1589250	1589261	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018590	AAAATA	2	12	1602194	1602205	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018590	CGCCTA	2	12	1686409	1686420	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018590	TTTCCT	2	12	1688061	1688072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018590	TTGAAT	2	12	1689633	1689644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018590	CGCCTA	2	12	1790432	1790443	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018590	TTTCCT	2	12	1792084	1792095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018590	TTGAAT	2	12	1793656	1793667	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018590	TTATTT	2	12	1799974	1799985	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018590	TTTGTA	2	12	1825241	1825252	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018590	CTCTAT	2	12	1904301	1904312	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018590	TCATTT	2	12	1905499	1905510	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018590	GTTTTC	2	12	1932665	1932676	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018590	CAAAAA	2	12	1950396	1950407	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018590	GAAAAA	2	12	1954258	1954269	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018590	AGAAAA	2	12	1961092	1961103	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018590	TCCTGC	2	12	2143623	2143634	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018590	TATATT	2	12	2158383	2158394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018590	AAACAA	2	12	2204974	2204985	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018590	AATTTT	2	12	2216786	2216797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018590	AAATTG	2	12	2222962	2222973	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018590	CTCTGT	2	12	2229809	2229820	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018590	TAATAC	2	12	2313564	2313575	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018590	CGCCTA	2	12	2335870	2335881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018590	TTTCCT	2	12	2337774	2337785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018590	TTGAAT	2	12	2339346	2339357	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018590	TAAAAT	2	12	2413697	2413708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018590	CTTTTT	2	12	2488145	2488156	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018590	ATTTAA	2	12	2500549	2500560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018590	ATCCCA	2	12	2508046	2508057	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018590	CTAATA	2	12	2508150	2508161	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018590	TTTTTA	2	12	2519876	2519887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018590	GAAAAA	2	12	2529270	2529281	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018590	CGCCTA	2	12	2572416	2572427	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018590	TTTCCT	2	12	2574320	2574331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018590	TTGAAT	2	12	2575892	2575903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018590	CCTCTT	2	12	2619329	2619340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018590	TAAATC	2	12	2640801	2640812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018590	TTTCAT	2	12	2725180	2725191	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018590	ATATTT	2	12	2755811	2755822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018590	TAAAAA	2	12	2783890	2783901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018590	AAGTAT	2	12	2784764	2784775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.