MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2376

Total Repeats: 1038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018590	CTTGCA	2	12	5003	5014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406488
2	NC_018590	GAAATT	2	12	6230	6241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404406489
3	NC_018590	TCGTAC	2	12	6619	6630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406489
4	NC_018590	TGAAGA	2	12	9548	9559	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406490
5	NC_018590	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404406491
6	NC_018590	ATTTTC	2	12	19878	19889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404406498
7	NC_018590	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404406500
8	NC_018590	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404406500
9	NC_018590	TGAAAG	2	12	23572	23583	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406503
10	NC_018590	ATTGAA	2	12	26918	26929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404406506
11	NC_018590	TCACCA	2	12	34732	34743	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404406516
12	NC_018590	GGAAAC	2	12	36412	36423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404406517
13	NC_018590	GCTGTG	2	12	37193	37204	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404406518
14	NC_018590	CGATTA	2	12	40162	40173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406520
15	NC_018590	ATATTT	2	12	44305	44316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404406523
16	NC_018590	TGGCGG	2	12	45599	45610	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404406525
17	NC_018590	TCAAAA	2	12	45719	45730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404406525
18	NC_018590	AGAAAA	2	12	46634	46645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404406527
19	NC_018590	AAAAAT	2	12	48167	48178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404406530
20	NC_018590	ATAGTG	2	12	48557	48568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404406530
21	NC_018590	GCAGAA	2	12	52092	52103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404406532
22	NC_018590	AGGTAA	2	12	52183	52194	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406533
23	NC_018590	AGATCC	2	12	57978	57989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404406538
24	NC_018590	CAGAAA	2	12	66503	66514	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404406544
25	NC_018590	AGTTTG	2	12	76611	76622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404406553
26	NC_018590	TGTAGA	2	12	80708	80719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404406558
27	NC_018590	AAGATA	2	12	83680	83691	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406558
28	NC_018590	TGAAGA	2	12	86793	86804	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406559
29	NC_018590	GAGGAA	2	12	88547	88558	50 %	0 %	50 %	0 %	404406561
30	NC_018590	GCAATT	2	12	91674	91685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406564
31	NC_018590	AAGATA	2	12	94199	94210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406567
32	NC_018590	ATTCCG	2	12	96625	96636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406567
33	NC_018590	AGAAGT	2	12	98052	98063	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406567
34	NC_018590	TCACAG	2	12	98507	98518	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404406567
35	NC_018590	GTAGAA	2	12	98869	98880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406567
36	NC_018590	TATTAG	2	12	102185	102196	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404406570
37	NC_018590	GCAATT	2	12	102232	102243	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406570
38	NC_018590	TTATTT	2	12	105722	105733	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404406574
39	NC_018590	TAAAAT	2	12	113642	113653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404406582
40	NC_018590	CAAAAT	2	12	113783	113794	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404406582
41	NC_018590	GTTTTA	2	12	120550	120561	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404406591
42	NC_018590	AATTTG	2	12	122547	122558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404406594
43	NC_018590	CCGTTA	2	12	123748	123759	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406595
44	NC_018590	ATCTGT	2	12	124422	124433	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404406595
45	NC_018590	CAACTG	2	12	133494	133505	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404406604
46	NC_018590	TCTGAA	2	12	135394	135405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406606
47	NC_018590	GTTGCA	2	12	141141	141152	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404406613
48	NC_018590	GATTGC	2	12	141203	141214	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404406613
49	NC_018590	TTAAAA	2	12	141877	141888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404406614
50	NC_018590	TTCCTT	2	12	141932	141943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404406614
51	NC_018590	AGGCGG	2	12	146853	146864	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	404406617
52	NC_018590	CGTAAC	2	12	149676	149687	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404406618
53	NC_018590	ATTTTC	2	12	151209	151220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404406619
54	NC_018590	GTAAAA	2	12	153188	153199	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406621
55	NC_018590	TTTTAC	2	12	155236	155247	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404406625
56	NC_018590	TTTTTA	2	12	156273	156284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404406627
57	NC_018590	GCATTA	2	12	156503	156514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406627
58	NC_018590	TTAAAA	2	12	159689	159700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404406629
59	NC_018590	TTGCAC	2	12	160347	160358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406630
60	NC_018590	GGAAGT	2	12	162495	162506	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	404406631
61	NC_018590	CAATCC	2	12	164411	164422	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404406633
62	NC_018590	AAAGAT	2	12	166422	166433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406635
63	NC_018590	AAAAGA	2	12	168297	168308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404406636
64	NC_018590	TGAAGT	2	12	170667	170678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404406636
65	NC_018590	CTCCAA	2	12	175403	175414	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404406639
66	NC_018590	CTTCAT	2	12	176732	176743	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404406640
67	NC_018590	CATTGA	2	12	178789	178800	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406643
68	NC_018590	TAAAAA	2	12	181680	181691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404406646
69	NC_018590	TCCGGT	2	12	182778	182789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404406648
70	NC_018590	AAAGCA	2	12	194883	194894	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404406658
71	NC_018590	TTCTTT	2	12	199681	199692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404406663
72	NC_018590	GAAAAA	2	12	201770	201781	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404406665
73	NC_018590	GAAAAA	2	12	202995	203006	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404406667
74	NC_018590	AGCAGA	2	12	206715	206726	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404406668
75	NC_018590	AAGGAG	2	12	206933	206944	50 %	0 %	50 %	0 %	404406668
76	NC_018590	GCAAGT	2	12	208823	208834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404406670
77	NC_018590	TGTCGG	2	12	212743	212754	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404406673
78	NC_018590	AAAAAC	2	12	214225	214236	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404406674
79	NC_018590	GCAGAA	2	12	215769	215780	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404406675
80	NC_018590	TAAAAT	2	12	218874	218885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404406679
81	NC_018590	ATTGAT	2	12	219064	219075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404406679
82	NC_018590	GAACCA	2	12	220090	220101	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404406680
83	NC_018590	CGGTGG	2	12	233636	233647	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404406682
84	NC_018590	TTTACC	2	12	233840	233851	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404406682
85	NC_018590	TCGGAA	2	12	234048	234059	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404406683
86	NC_018590	TATATG	2	12	238548	238559	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404406686
87	NC_018590	AAAGGT	2	12	243230	243241	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404406690
88	NC_018590	ACAGTA	2	12	248533	248544	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404406697
89	NC_018590	AAAACA	2	12	248907	248918	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404406698
90	NC_018590	GCATGG	2	12	249088	249099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404406698
91	NC_018590	TAAAAA	2	12	249755	249766	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404406699
92	NC_018590	CTGTAG	2	12	252030	252041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404406703
93	NC_018590	GACAAT	2	12	256421	256432	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404406709
94	NC_018590	GTCATC	2	12	257648	257659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404406710
95	NC_018590	TTCGTG	2	12	265349	265360	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404406712
96	NC_018590	CCAAAT	2	12	271333	271344	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404406716
97	NC_018590	AGAACT	2	12	273930	273941	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404406718
98	NC_018590	AGTTTG	2	12	277254	277265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404406720
99	NC_018590	TACAAG	2	12	279865	279876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404406723
100	NC_018590	CGAAAT	2	12	279919	279930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404406723
101	NC_018590	CATTAT	2	12	283650	283661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404406726
102	NC_018590	TCTTTT	2	12	284111	284122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404406726
103	NC_018590	TTTGCC	2	12	285511	285522	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	404406727
104	NC_018590	TAAAAG	2	12	287923	287934	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406728
105	NC_018590	ATTTCT	2	12	288926	288937	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404406728
106	NC_018590	AGTTCA	2	12	290027	290038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406729
107	NC_018590	ATCAAT	2	12	290170	290181	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404406729
108	NC_018590	ATGAAA	2	12	290528	290539	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404406730
109	NC_018590	AGCGAA	2	12	291212	291223	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404406731
110	NC_018590	ACGTTG	2	12	295267	295278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404406735
111	NC_018590	TTTATT	2	12	298919	298930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404406738
112	NC_018590	TAACAA	2	12	299232	299243	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404406738
113	NC_018590	TTTTGA	2	12	305170	305181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404406746
114	NC_018590	GTTGCG	2	12	306790	306801	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404406747
115	NC_018590	TAAAGT	2	12	308726	308737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404406749
116	NC_018590	AGAACC	2	12	313300	313311	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404406753
117	NC_018590	GATTCA	2	12	313907	313918	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406753
118	NC_018590	GCAATT	2	12	313937	313948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406753
119	NC_018590	TAATGA	2	12	316123	316134	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404406755
120	NC_018590	GAGGTT	2	12	316289	316300	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	404406755
121	NC_018590	TTTTCA	2	12	317418	317429	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404406756
122	NC_018590	GAACCA	2	12	321951	321962	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404406760
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125	NC_018590	TATAAT	2	12	325667	325678	50 %	50 %	0 %	0 %	404406765
126	NC_018590	TTCTAT	2	12	325808	325819	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404406765
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129	NC_018590	TGAATC	2	12	328694	328705	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404406766
130	NC_018590	GTAGAT	2	12	331561	331572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404406769
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229	NC_018590	GCACTT	2	12	604407	604418	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404407044
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231	NC_018590	ATTTGT	2	12	604529	604540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404407044
232	NC_018590	GGTGCA	2	12	604545	604556	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404407044
233	NC_018590	TGTATT	2	12	604637	604648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404407044
234	NC_018590	AAAGAT	2	12	606786	606797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404407045
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457	NC_018590	ATTAAT	2	12	1315409	1315420	50 %	50 %	0 %	0 %	404407776
458	NC_018590	ATTTAG	2	12	1324959	1324970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404407788
459	NC_018590	GAACAT	2	12	1335006	1335017	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404407801
460	NC_018590	TACTTC	2	12	1335493	1335504	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404407802
461	NC_018590	ATGATA	2	12	1335909	1335920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404407802
462	NC_018590	TTTGAT	2	12	1337527	1337538	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404407803
463	NC_018590	TGGAAA	2	12	1338613	1338624	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404407804
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480	NC_018590	TGGCCG	2	12	1384233	1384244	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404407844
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484	NC_018590	AATTAA	2	12	1396214	1396225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404407856
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487	NC_018590	GCTTCT	2	12	1403725	1403736	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	404407862
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