MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2376

Total Repeats: 2051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018590	TACAT	2	10	290	299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018590	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	404406485
3	NC_018590	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	404406485
4	NC_018590	TTTAT	2	10	4205	4214	20 %	80 %	0 %	0 %	404406486
5	NC_018590	TCATT	2	10	6861	6870	20 %	60 %	0 %	20 %	404406489
6	NC_018590	TTGAT	2	10	11754	11763	20 %	60 %	20 %	0 %	404406491
7	NC_018590	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	404406492
8	NC_018590	GTATG	2	10	13370	13379	20 %	40 %	40 %	0 %	404406494
9	NC_018590	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018590	ATGAA	2	10	17249	17258	60 %	20 %	20 %	0 %	404406496
11	NC_018590	GAATG	2	10	18991	19000	40 %	20 %	40 %	0 %	404406497
12	NC_018590	TAATT	2	10	20369	20378	40 %	60 %	0 %	0 %	404406500
13	NC_018590	ATTAA	2	10	21886	21895	60 %	40 %	0 %	0 %	404406501
14	NC_018590	AAATC	2	10	22347	22356	60 %	20 %	0 %	20 %	404406501
15	NC_018590	GACCA	2	10	25219	25228	40 %	0 %	20 %	40 %	404406505
16	NC_018590	TTGGA	2	10	25477	25486	20 %	40 %	40 %	0 %	404406505
17	NC_018590	AAATG	2	10	26034	26043	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018590	CAAAA	2	10	26479	26488	80 %	0 %	0 %	20 %	404406506
19	NC_018590	ATGGA	2	10	30838	30847	40 %	20 %	40 %	0 %	404406512
20	NC_018590	GAAAA	2	10	35077	35086	80 %	0 %	20 %	0 %	404406516
21	NC_018590	TGAAA	2	10	36232	36241	60 %	20 %	20 %	0 %	404406517
22	NC_018590	AACCC	2	10	36943	36952	40 %	0 %	0 %	60 %	404406518
23	NC_018590	GAATG	2	10	38103	38112	40 %	20 %	40 %	0 %	404406519
24	NC_018590	AAATT	2	10	38230	38239	60 %	40 %	0 %	0 %	404406519
25	NC_018590	ATTTT	2	10	38584	38593	20 %	80 %	0 %	0 %	404406519
26	NC_018590	ATTTT	2	10	38836	38845	20 %	80 %	0 %	0 %	404406519
27	NC_018590	TGGCG	2	10	42443	42452	0 %	20 %	60 %	20 %	404406521
28	NC_018590	AAAAC	2	10	42462	42471	80 %	0 %	0 %	20 %	404406521
29	NC_018590	AAATG	2	10	43829	43838	60 %	20 %	20 %	0 %	404406523
30	NC_018590	GTAGA	2	10	44915	44924	40 %	20 %	40 %	0 %	404406524
31	NC_018590	TTACT	2	10	45897	45906	20 %	60 %	0 %	20 %	404406526
32	NC_018590	CAAAA	2	10	46404	46413	80 %	0 %	0 %	20 %	404406527
33	NC_018590	AAATA	2	10	46923	46932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018590	TAAAA	2	10	47905	47914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018590	TGCTA	2	10	48079	48088	20 %	40 %	20 %	20 %	404406530
36	NC_018590	TTTTA	2	10	48247	48256	20 %	80 %	0 %	0 %	404406530
37	NC_018590	CCATG	2	10	50041	50050	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018590	AGTCT	2	10	51028	51037	20 %	40 %	20 %	20 %	404406532
39	NC_018590	TTTTA	2	10	54024	54033	20 %	80 %	0 %	0 %	404406535
40	NC_018590	TTTTG	2	10	55758	55767	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018590	TCAAC	2	10	59202	59211	40 %	20 %	0 %	40 %	404406538
42	NC_018590	ATTAT	2	10	59378	59387	40 %	60 %	0 %	0 %	404406538
43	NC_018590	CGAAA	2	10	59899	59908	60 %	0 %	20 %	20 %	404406539
44	NC_018590	ACAAA	2	10	59912	59921	80 %	0 %	0 %	20 %	404406539
45	NC_018590	TTACT	2	10	61236	61245	20 %	60 %	0 %	20 %	404406541
46	NC_018590	AACAA	2	10	61331	61340	80 %	0 %	0 %	20 %	404406541
47	NC_018590	ATGAA	2	10	66227	66236	60 %	20 %	20 %	0 %	404406543
48	NC_018590	GAAGA	2	10	66346	66355	60 %	0 %	40 %	0 %	404406544
49	NC_018590	AGATA	2	10	66996	67005	60 %	20 %	20 %	0 %	404406545
50	NC_018590	AACGT	2	10	67693	67702	40 %	20 %	20 %	20 %	404406545
51	NC_018590	AAACA	2	10	68141	68150	80 %	0 %	0 %	20 %	404406545
52	NC_018590	AAGAT	2	10	69455	69464	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018590	CGGCG	2	10	71200	71209	0 %	0 %	60 %	40 %	404406548
54	NC_018590	GCTTG	2	10	71421	71430	0 %	40 %	40 %	20 %	404406548
55	NC_018590	AAACT	2	10	71431	71440	60 %	20 %	0 %	20 %	404406548
56	NC_018590	GCGCT	2	10	73476	73485	0 %	20 %	40 %	40 %	404406550
57	NC_018590	TTTGC	2	10	75343	75352	0 %	60 %	20 %	20 %	404406551
58	NC_018590	ATTTG	2	10	75456	75465	20 %	60 %	20 %	0 %	404406551
59	NC_018590	TAAAA	2	10	75866	75875	80 %	20 %	0 %	0 %	404406552
60	NC_018590	TCATT	2	10	78345	78354	20 %	60 %	0 %	20 %	404406555
61	NC_018590	TCAAA	2	10	82619	82628	60 %	20 %	0 %	20 %	404406558
62	NC_018590	AGTGA	2	10	82674	82683	40 %	20 %	40 %	0 %	404406558
63	NC_018590	AGTCA	2	10	83762	83771	40 %	20 %	20 %	20 %	404406558
64	NC_018590	AATTT	2	10	84160	84169	40 %	60 %	0 %	0 %	404406558
65	NC_018590	TAGTT	2	10	84776	84785	20 %	60 %	20 %	0 %	404406558
66	NC_018590	AAAAC	2	10	85308	85317	80 %	0 %	0 %	20 %	404406558
67	NC_018590	AAAAG	2	10	86070	86079	80 %	0 %	20 %	0 %	404406559
68	NC_018590	CAGAA	2	10	88341	88350	60 %	0 %	20 %	20 %	404406561
69	NC_018590	TCTAT	2	10	88840	88849	20 %	60 %	0 %	20 %	404406561
70	NC_018590	GTTTT	2	10	91546	91555	0 %	80 %	20 %	0 %	404406564
71	NC_018590	TGAGT	2	10	92657	92666	20 %	40 %	40 %	0 %	404406564
72	NC_018590	CAAAT	2	10	95468	95477	60 %	20 %	0 %	20 %	404406567
73	NC_018590	CAAAT	2	10	95482	95491	60 %	20 %	0 %	20 %	404406567
74	NC_018590	GGTAG	2	10	99886	99895	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018590	ATATC	2	10	106651	106660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018590	GCAAT	2	10	107491	107500	40 %	20 %	20 %	20 %	404406577
77	NC_018590	AAAAG	2	10	109341	109350	80 %	0 %	20 %	0 %	404406579
78	NC_018590	ACGGT	2	10	110885	110894	20 %	20 %	40 %	20 %	404406580
79	NC_018590	GAAAT	2	10	112124	112133	60 %	20 %	20 %	0 %	404406581
80	NC_018590	GAATT	2	10	112765	112774	40 %	40 %	20 %	0 %	404406581
81	NC_018590	TTGCG	2	10	112940	112949	0 %	40 %	40 %	20 %	404406581
82	NC_018590	AACCA	2	10	116640	116649	60 %	0 %	0 %	40 %	404406584
83	NC_018590	TACTG	2	10	118921	118930	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018590	TCTCT	2	10	119492	119501	0 %	60 %	0 %	40 %	404406588
85	NC_018590	TTTTA	2	10	119852	119861	20 %	80 %	0 %	0 %	404406589
86	NC_018590	AAAAG	2	10	120121	120130	80 %	0 %	20 %	0 %	404406590
87	NC_018590	AAAGT	2	10	121159	121168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018590	AATTT	2	10	121630	121639	40 %	60 %	0 %	0 %	404406592
89	NC_018590	TTTAC	2	10	122666	122675	20 %	60 %	0 %	20 %	404406594
90	NC_018590	TTGTT	2	10	125115	125124	0 %	80 %	20 %	0 %	404406595
91	NC_018590	ATTTT	2	10	126917	126926	20 %	80 %	0 %	0 %	404406597
92	NC_018590	AAAAT	2	10	128419	128428	80 %	20 %	0 %	0 %	404406597
93	NC_018590	AACTT	2	10	129729	129738	40 %	40 %	0 %	20 %	404406600
94	NC_018590	ACAAA	2	10	129831	129840	80 %	0 %	0 %	20 %	404406600
95	NC_018590	ACTTG	2	10	130625	130634	20 %	40 %	20 %	20 %	404406600
96	NC_018590	CCACA	2	10	130966	130975	40 %	0 %	0 %	60 %	404406600
97	NC_018590	TTGGT	2	10	131421	131430	0 %	60 %	40 %	0 %	404406601
98	NC_018590	TTGGT	2	10	131472	131481	0 %	60 %	40 %	0 %	404406601
99	NC_018590	TATGA	2	10	134399	134408	40 %	40 %	20 %	0 %	404406605
100	NC_018590	TCTGG	2	10	134889	134898	0 %	40 %	40 %	20 %	404406605
101	NC_018590	TAACG	2	10	135166	135175	40 %	20 %	20 %	20 %	404406605
102	NC_018590	AGTAG	2	10	135488	135497	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018590	GAGAA	2	10	135899	135908	60 %	0 %	40 %	0 %	404406607
104	NC_018590	ATAAA	2	10	136700	136709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018590	CGGCG	2	10	138453	138462	0 %	0 %	60 %	40 %	404406610
106	NC_018590	TTTAA	2	10	138524	138533	40 %	60 %	0 %	0 %	404406610
107	NC_018590	AATTT	2	10	138710	138719	40 %	60 %	0 %	0 %	404406610
108	NC_018590	GATAA	2	10	138877	138886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018590	AATAA	2	10	139983	139992	80 %	20 %	0 %	0 %	404406611
110	NC_018590	GAATA	2	10	141944	141953	60 %	20 %	20 %	0 %	404406614
111	NC_018590	AGATG	2	10	143191	143200	40 %	20 %	40 %	0 %	404406615
112	NC_018590	GCCAA	2	10	146172	146181	40 %	0 %	20 %	40 %	404406617
113	NC_018590	TCTAA	2	10	148195	148204	40 %	40 %	0 %	20 %	404406618
114	NC_018590	AAGAT	2	10	152260	152269	60 %	20 %	20 %	0 %	404406620
115	NC_018590	GAATT	2	10	152631	152640	40 %	40 %	20 %	0 %	404406621
116	NC_018590	AAATA	2	10	155687	155696	80 %	20 %	0 %	0 %	404406625
117	NC_018590	CAAAC	2	10	155866	155875	60 %	0 %	0 %	40 %	404406626
118	NC_018590	TTGTA	2	10	158415	158424	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018590	ACTTT	2	10	159341	159350	20 %	60 %	0 %	20 %	404406629
120	NC_018590	AAAAG	2	10	160747	160756	80 %	0 %	20 %	0 %	404406630
121	NC_018590	ATGAA	2	10	162521	162530	60 %	20 %	20 %	0 %	404406631
122	NC_018590	TTTAC	2	10	165548	165557	20 %	60 %	0 %	20 %	404406634
123	NC_018590	AGTGA	2	10	168133	168142	40 %	20 %	40 %	0 %	404406636
124	NC_018590	CCGTA	2	10	169546	169555	20 %	20 %	20 %	40 %	404406636
125	NC_018590	GGAAC	2	10	170372	170381	40 %	0 %	40 %	20 %	404406636
126	NC_018590	ATGTA	2	10	170466	170475	40 %	40 %	20 %	0 %	404406636
127	NC_018590	TCAGT	2	10	170855	170864	20 %	40 %	20 %	20 %	404406637
128	NC_018590	TACAT	2	10	171604	171613	40 %	40 %	0 %	20 %	404406637
129	NC_018590	GCGTT	2	10	172228	172237	0 %	40 %	40 %	20 %	404406637
130	NC_018590	CAAAA	2	10	172871	172880	80 %	0 %	0 %	20 %	404406637
131	NC_018590	ATCAA	2	10	174667	174676	60 %	20 %	0 %	20 %	404406638
132	NC_018590	TAAAA	2	10	175536	175545	80 %	20 %	0 %	0 %	404406639
133	NC_018590	AGAAA	2	10	176487	176496	80 %	0 %	20 %	0 %	404406640
134	NC_018590	ACTAG	2	10	177651	177660	40 %	20 %	20 %	20 %	404406641
135	NC_018590	ATAGA	2	10	179088	179097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018590	AATTT	2	10	179325	179334	40 %	60 %	0 %	0 %	404406644
137	NC_018590	GAACC	2	10	181208	181217	40 %	0 %	20 %	40 %	404406646
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