MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2479

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018589	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018589	GCAAAA	2	12	14089	14100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018589	ATTTAT	2	12	77122	77133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018589	GTGGCT	2	12	82642	82653	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018589	AATAAA	2	12	199514	199525	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018589	GAAAAC	2	12	226528	226539	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018589	ATTCAA	2	12	237415	237426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018589	AAGGAA	2	12	238986	238997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018589	TAGGCG	2	12	240639	240650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018589	ATTCAA	2	12	243437	243448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018589	AAGGAA	2	12	245008	245019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018589	TAGGCG	2	12	246661	246672	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018589	AGTCAA	2	12	248475	248486	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018589	TTATAT	2	12	263259	263270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018589	AACTTT	2	12	288963	288974	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018589	AATACA	2	12	297553	297564	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018589	TTGGTT	2	12	327525	327536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018589	AAATGA	2	12	388456	388467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018589	ATGATA	2	12	390276	390287	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018589	AGTGCT	2	12	401918	401929	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018589	TTGTTT	2	12	410622	410633	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018589	ACAAAA	2	12	472570	472581	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018589	ACACGG	2	12	505999	506010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018589	CTATAA	2	12	510359	510370	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018589	GGGGAA	2	12	542978	542989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018589	TTTAGT	2	12	543168	543179	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018589	AGATTT	2	12	569590	569601	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018589	ATCATT	2	12	638248	638259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018589	TTAAGA	2	12	678063	678074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018589	ATCATT	2	12	680252	680263	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018589	TATAGG	2	12	724635	724646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018589	TACAAA	2	12	775970	775981	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018589	AGAAAA	2	12	776100	776111	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018589	TTACTT	2	12	851264	851275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018589	TGAAAT	2	12	862399	862410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018589	AAATAG	2	12	889060	889071	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018589	GTAATC	2	12	895863	895874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018589	TTACAA	2	12	895881	895892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018589	ATGAAA	2	12	904476	904487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018589	TTGACT	2	12	1027633	1027644	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018589	AGGAAG	2	12	1037826	1037837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018589	CTTTTT	2	12	1097564	1097575	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018589	TTATGG	2	12	1137270	1137281	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018589	TTTAGT	2	12	1141278	1141289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018589	CTTTTT	2	12	1213847	1213858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018589	GAAAAA	2	12	1243823	1243834	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018589	TATATT	2	12	1285974	1285985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018589	TATTAA	2	12	1313099	1313110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018589	TATTAA	2	12	1463892	1463903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018589	ATAAAA	2	12	1498073	1498084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018589	TTTCAT	2	12	1506467	1506478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018589	CTCTTC	2	12	1609145	1609156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018589	GGTTGT	2	12	1659796	1659807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018589	GGTTGT	2	12	1661257	1661268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018589	GAATAA	2	12	1662811	1662822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018589	GTAAAC	2	12	1663961	1663972	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018589	ACAAAA	2	12	1672587	1672598	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018589	AAAATA	2	12	1676904	1676915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018589	TAAAAA	2	12	1677813	1677824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018589	TAAAAA	2	12	1704556	1704567	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018589	ATGAAA	2	12	1724058	1724069	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018589	TAGATT	2	12	1728836	1728847	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018589	CGCCTA	2	12	1764641	1764652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018589	TTTCCT	2	12	1766294	1766305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018589	TTGAAT	2	12	1767866	1767877	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018589	CTATAA	2	12	1815497	1815508	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018589	AAAAAC	2	12	1840130	1840141	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018589	CGCCTA	2	12	1870565	1870576	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018589	TTTCCT	2	12	1872217	1872228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018589	TTGAAT	2	12	1873789	1873800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018589	GTTTTA	2	12	1881709	1881720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018589	AAAAAG	2	12	1964746	1964757	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018589	CTCTAT	2	12	1982465	1982476	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018589	TCATTT	2	12	1983663	1983674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018589	GTTTTC	2	12	2010832	2010843	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018589	CAAAAA	2	12	2028556	2028567	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018589	GAAAAA	2	12	2032417	2032428	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018589	TTTTAT	2	12	2128116	2128127	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018589	ATTCAA	2	12	2185781	2185792	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018589	TTATAT	2	12	2247253	2247264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018589	AATTTT	2	12	2300066	2300077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018589	AAATTG	2	12	2306241	2306252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018589	CTCTGT	2	12	2313087	2313098	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018589	TAATGC	2	12	2410533	2410544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018589	TAATAC	2	12	2435879	2435890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018589	CGCCTA	2	12	2456681	2456692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018589	TTTCCT	2	12	2458584	2458595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018589	TTGAAT	2	12	2460156	2460167	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018589	TTCAAA	2	12	2544707	2544718	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018589	CTTTTT	2	12	2609936	2609947	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018589	ATCCCA	2	12	2629850	2629861	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018589	AAAAGA	2	12	2635681	2635692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018589	TTTTTA	2	12	2641677	2641688	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018589	CGCCTA	2	12	2691690	2691701	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018589	TTTCCT	2	12	2693342	2693353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018589	TTGAAT	2	12	2694914	2694925	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018589	CCTCTT	2	12	2738402	2738413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018589	TAAATC	2	12	2759872	2759883	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018589	TTTTAT	2	12	2841579	2841590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018589	ATATTT	2	12	2888490	2888501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018589	TTAACT	2	12	2888797	2888808	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018589	TATCAA	2	12	2915018	2915029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018589	AAATGA	2	12	2915032	2915043	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018589	TAAAAA	2	12	2915102	2915113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018589	AAGTAT	2	12	2915969	2915980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.