MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2479

Total Repeats: 1059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018589	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405756993
2	NC_018589	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405756994
3	NC_018589	TTATTT	2	12	10918	10929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405756995
4	NC_018589	CACATT	2	12	11199	11210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405756995
5	NC_018589	ATTTTC	2	12	19878	19889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405757002
6	NC_018589	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405757004
7	NC_018589	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405757004
8	NC_018589	AGTTGC	2	12	23648	23659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757006
9	NC_018589	TAAAGC	2	12	23701	23712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757006
10	NC_018589	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757007
11	NC_018589	TCGATT	2	12	32437	32448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405757016
12	NC_018589	TCACCA	2	12	32719	32730	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405757017
13	NC_018589	CGATTA	2	12	38149	38160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757021
14	NC_018589	TTATGT	2	12	42635	42646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757024
15	NC_018589	AAAGAT	2	12	46288	46299	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757027
16	NC_018589	TGAAAT	2	12	47125	47136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757028
17	NC_018589	TGGCGG	2	12	50260	50271	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405757032
18	NC_018589	TCAAAA	2	12	50380	50391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405757032
19	NC_018589	ACAGTG	2	12	51964	51975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405757035
20	NC_018589	AAAAAT	2	12	52828	52839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405757037
21	NC_018589	TTTATA	2	12	55306	55317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405757039
22	NC_018589	GCAGAA	2	12	56753	56764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405757039
23	NC_018589	AGGTAA	2	12	56844	56855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405757040
24	NC_018589	TGATCG	2	12	58232	58243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757041
25	NC_018589	TGATTT	2	12	63577	63588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757045
26	NC_018589	TTTTGC	2	12	64182	64193	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405757046
27	NC_018589	GATACA	2	12	75076	75087	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757055
28	NC_018589	TAAATT	2	12	76948	76959	50 %	50 %	0 %	0 %	405757058
29	NC_018589	TGATAT	2	12	85327	85338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405757068
30	NC_018589	ATCACT	2	12	89486	89497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405757072
31	NC_018589	AAACAC	2	12	89919	89930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405757072
32	NC_018589	AAGATA	2	12	92918	92929	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757072
33	NC_018589	TATAAA	2	12	95136	95147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405757073
34	NC_018589	TATTAG	2	12	105367	105378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405757083
35	NC_018589	TAAAAT	2	12	115201	115212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405757094
36	NC_018589	CAAAAT	2	12	115342	115353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405757094
37	NC_018589	GTCCGC	2	12	115474	115485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	405757094
38	NC_018589	GTTTTA	2	12	122110	122121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757102
39	NC_018589	TGATTT	2	12	124124	124135	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757106
40	NC_018589	AAGTAA	2	12	128095	128106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757109
41	NC_018589	ATCTGT	2	12	132277	132288	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405757116
42	NC_018589	TCTATT	2	12	134216	134227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405757117
43	NC_018589	GATATT	2	12	144244	144255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405757129
44	NC_018589	TCTGAA	2	12	145480	145491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757132
45	NC_018589	GTTGCA	2	12	152322	152333	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757141
46	NC_018589	GATTGC	2	12	152384	152395	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757141
47	NC_018589	TTAAAA	2	12	153057	153068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405757142
48	NC_018589	GGCGGT	2	12	158034	158045	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405757145
49	NC_018589	CGAATT	2	12	160952	160963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757146
50	NC_018589	GTAAAA	2	12	164104	164115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757149
51	NC_018589	TTTTAC	2	12	166151	166162	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405757153
52	NC_018589	TTTTTA	2	12	167189	167200	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405757155
53	NC_018589	AAAGTG	2	12	168401	168412	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405757156
54	NC_018589	TACTAG	2	12	173408	173419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757161
55	NC_018589	AAGCGA	2	12	175912	175923	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405757163
56	NC_018589	CAATCC	2	12	179227	179238	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405757166
57	NC_018589	AAAGAT	2	12	181237	181248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757168
58	NC_018589	ATGGCT	2	12	182362	182373	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757169
59	NC_018589	CAGAAA	2	12	183036	183047	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405757169
60	NC_018589	AAAAGA	2	12	183112	183123	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405757169
61	NC_018589	AAAAAC	2	12	183442	183453	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405757169
62	NC_018589	TGAAGT	2	12	185482	185493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405757169
63	NC_018589	CATTGA	2	12	193615	193626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757176
64	NC_018589	TGCAGC	2	12	194270	194281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405757177
65	NC_018589	TAAAAA	2	12	196508	196519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405757179
66	NC_018589	TTCTTT	2	12	214517	214528	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405757197
67	NC_018589	GAAAAA	2	12	216606	216617	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405757199
68	NC_018589	AGGAAA	2	12	216925	216936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405757199
69	NC_018589	GAAAAA	2	12	217831	217842	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405757201
70	NC_018589	AAGGAG	2	12	221768	221779	50 %	0 %	50 %	0 %	405757202
71	NC_018589	GCAAGT	2	12	223658	223669	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405757204
72	NC_018589	TTAAAG	2	12	225601	225612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757206
73	NC_018589	TGTCGG	2	12	227577	227588	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	405757207
74	NC_018589	TCTCCA	2	12	231444	231455	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	405757210
75	NC_018589	GGTTTT	2	12	233155	233166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405757212
76	NC_018589	ATTGAT	2	12	234102	234113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405757214
77	NC_018589	AGAACC	2	12	235128	235139	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405757215
78	NC_018589	TTTACC	2	12	248904	248915	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405757217
79	NC_018589	AGTAAA	2	12	256161	256172	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757223
80	NC_018589	AAAGGT	2	12	258287	258298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405757225
81	NC_018589	ACAGTA	2	12	263588	263599	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757232
82	NC_018589	AAAACA	2	12	263963	263974	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405757233
83	NC_018589	GCATGG	2	12	264144	264155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405757233
84	NC_018589	CTGTAG	2	12	267088	267099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757238
85	NC_018589	GACAAT	2	12	271457	271468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757244
86	NC_018589	AAGAAA	2	12	274041	274052	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405757245
87	NC_018589	TACACT	2	12	278285	278296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405757246
88	NC_018589	TTCGTG	2	12	279797	279808	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405757246
89	NC_018589	GAATTA	2	12	286482	286493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757251
90	NC_018589	CGAAAT	2	12	290781	290792	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757255
91	NC_018589	TCTTTT	2	12	293744	293755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405757257
92	NC_018589	ATCAAT	2	12	296151	296162	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405757259
93	NC_018589	ATGAAA	2	12	296509	296520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757260
94	NC_018589	CTTTTA	2	12	298382	298393	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405757262
95	NC_018589	TAGAAA	2	12	299328	299339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757263
96	NC_018589	ACGTTG	2	12	301259	301270	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757265
97	NC_018589	GAAAAC	2	12	303166	303177	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405757266
98	NC_018589	GCTGCG	2	12	308539	308550	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	405757273
99	NC_018589	TTTTGA	2	12	308939	308950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757273
100	NC_018589	AAATAA	2	12	312246	312257	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405757276
101	NC_018589	GAAGGG	2	12	314043	314054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405757277
102	NC_018589	GATTCA	2	12	317686	317697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757280
103	NC_018589	GCAATT	2	12	317716	317727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757280
104	NC_018589	GAACCA	2	12	324507	324518	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405757286
105	NC_018589	TCCATT	2	12	327115	327126	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405757289
106	NC_018589	CTTTTT	2	12	331374	331385	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405757294
107	NC_018589	GTAGAT	2	12	332281	332292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405757295
108	NC_018589	TATCTG	2	12	337315	337326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405757300
109	NC_018589	ATATGA	2	12	338466	338477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757301
110	NC_018589	TGCGGG	2	12	339973	339984	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405757302
111	NC_018589	GGACAT	2	12	343829	343840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405757307
112	NC_018589	TATATT	2	12	348847	348858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405757312
113	NC_018589	AGAAAA	2	12	350183	350194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405757313
114	NC_018589	TGAAAC	2	12	351581	351592	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757315
115	NC_018589	CAAGAA	2	12	355994	356005	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405757316
116	NC_018589	TAGATT	2	12	357953	357964	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405757317
117	NC_018589	TGCAGA	2	12	362256	362267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405757319
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