MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2479

Total Repeats: 2193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018589	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018589	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	405756989
3	NC_018589	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	405756989
4	NC_018589	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	405756990
5	NC_018589	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	405756990
6	NC_018589	CAAAA	2	10	7073	7082	80 %	0 %	0 %	20 %	405756993
7	NC_018589	TTGAT	2	10	11755	11764	20 %	60 %	20 %	0 %	405756995
8	NC_018589	TTTTA	2	10	12428	12437	20 %	80 %	0 %	0 %	405756996
9	NC_018589	GTATG	2	10	13371	13380	20 %	40 %	40 %	0 %	405756998
10	NC_018589	AAAGA	2	10	14386	14395	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018589	ATGAA	2	10	17249	17258	60 %	20 %	20 %	0 %	405757000
12	NC_018589	GAATG	2	10	18991	19000	40 %	20 %	40 %	0 %	405757001
13	NC_018589	TAATT	2	10	20369	20378	40 %	60 %	0 %	0 %	405757004
14	NC_018589	ATTAA	2	10	21886	21895	60 %	40 %	0 %	0 %	405757005
15	NC_018589	AAATC	2	10	22347	22356	60 %	20 %	0 %	20 %	405757005
16	NC_018589	AACAT	2	10	22508	22517	60 %	20 %	0 %	20 %	405757005
17	NC_018589	TTTTA	2	10	23125	23134	20 %	80 %	0 %	0 %	405757006
18	NC_018589	GACCA	2	10	23209	23218	40 %	0 %	20 %	40 %	405757006
19	NC_018589	TGGAT	2	10	23468	23477	20 %	40 %	40 %	0 %	405757006
20	NC_018589	CAAAA	2	10	24469	24478	80 %	0 %	0 %	20 %	405757007
21	NC_018589	ATTAT	2	10	24954	24963	40 %	60 %	0 %	0 %	405757008
22	NC_018589	TCAGG	2	10	26123	26132	20 %	20 %	40 %	20 %	405757010
23	NC_018589	TTTAC	2	10	27123	27132	20 %	60 %	0 %	20 %	405757011
24	NC_018589	GAAAA	2	10	33064	33073	80 %	0 %	20 %	0 %	405757017
25	NC_018589	TGAAA	2	10	34219	34228	60 %	20 %	20 %	0 %	405757018
26	NC_018589	GAATG	2	10	36090	36099	40 %	20 %	40 %	0 %	405757020
27	NC_018589	AAATT	2	10	36217	36226	60 %	40 %	0 %	0 %	405757020
28	NC_018589	ATGGA	2	10	38338	38347	40 %	20 %	40 %	0 %	405757021
29	NC_018589	AAAAC	2	10	40444	40453	80 %	0 %	0 %	20 %	405757022
30	NC_018589	TTATT	2	10	41933	41942	20 %	80 %	0 %	0 %	405757024
31	NC_018589	AAAAG	2	10	43147	43156	80 %	0 %	20 %	0 %	405757024
32	NC_018589	ATAAA	2	10	43971	43980	80 %	20 %	0 %	0 %	405757025
33	NC_018589	ATTTT	2	10	45776	45785	20 %	80 %	0 %	0 %	405757027
34	NC_018589	GAAAC	2	10	47034	47043	60 %	0 %	20 %	20 %	405757028
35	NC_018589	GACTT	2	10	47273	47282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018589	ATTTT	2	10	47360	47369	20 %	80 %	0 %	0 %	405757029
37	NC_018589	AAATG	2	10	48490	48499	60 %	20 %	20 %	0 %	405757030
38	NC_018589	ATGGT	2	10	49527	49536	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018589	GTAGA	2	10	49576	49585	40 %	20 %	40 %	0 %	405757031
40	NC_018589	TTACT	2	10	50558	50567	20 %	60 %	0 %	20 %	405757033
41	NC_018589	GAAAT	2	10	51216	51225	60 %	20 %	20 %	0 %	405757034
42	NC_018589	CTTAG	2	10	51315	51324	20 %	40 %	20 %	20 %	405757034
43	NC_018589	TAAAA	2	10	52566	52575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018589	TGCTA	2	10	52740	52749	20 %	40 %	20 %	20 %	405757037
45	NC_018589	TTTTA	2	10	52908	52917	20 %	80 %	0 %	0 %	405757037
46	NC_018589	AGTTA	2	10	54224	54233	40 %	40 %	20 %	0 %	405757038
47	NC_018589	TTATG	2	10	54773	54782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018589	CGCAA	2	10	57737	57746	40 %	0 %	20 %	40 %	405757041
49	NC_018589	TTTTA	2	10	58685	58694	20 %	80 %	0 %	0 %	405757042
50	NC_018589	AAACG	2	10	63068	63077	60 %	0 %	20 %	20 %	405757045
51	NC_018589	ATTAT	2	10	64036	64045	40 %	60 %	0 %	0 %	405757045
52	NC_018589	CGAAA	2	10	64554	64563	60 %	0 %	20 %	20 %	405757046
53	NC_018589	AAAAC	2	10	64564	64573	80 %	0 %	0 %	20 %	405757046
54	NC_018589	AACAA	2	10	65987	65996	80 %	0 %	0 %	20 %	405757048
55	NC_018589	GAGAG	2	10	71046	71055	40 %	0 %	60 %	0 %	405757050
56	NC_018589	GCAAA	2	10	72228	72237	60 %	0 %	20 %	20 %	405757053
57	NC_018589	CAATA	2	10	72293	72302	60 %	20 %	0 %	20 %	405757053
58	NC_018589	GCCTT	2	10	73093	73102	0 %	40 %	20 %	40 %	405757054
59	NC_018589	CAAAA	2	10	73470	73479	80 %	0 %	0 %	20 %	405757054
60	NC_018589	GAAAT	2	10	75659	75668	60 %	20 %	20 %	0 %	405757056
61	NC_018589	ATAGC	2	10	75679	75688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018589	GCTTT	2	10	76457	76466	0 %	60 %	20 %	20 %	405757058
63	NC_018589	AGTAG	2	10	77802	77811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018589	AGTAA	2	10	78052	78061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018589	TTATA	2	10	78301	78310	40 %	60 %	0 %	0 %	405757060
66	NC_018589	TATTT	2	10	78396	78405	20 %	80 %	0 %	0 %	405757061
67	NC_018589	GCTTG	2	10	80375	80384	0 %	40 %	40 %	20 %	405757063
68	NC_018589	AAACT	2	10	80385	80394	60 %	20 %	0 %	20 %	405757063
69	NC_018589	GCGCT	2	10	82430	82439	0 %	20 %	40 %	40 %	405757065
70	NC_018589	TAAAG	2	10	84430	84439	60 %	20 %	20 %	0 %	405757066
71	NC_018589	TCATT	2	10	87622	87631	20 %	60 %	0 %	20 %	405757070
72	NC_018589	ATTTT	2	10	87874	87883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018589	CTAAA	2	10	89987	89996	60 %	20 %	0 %	20 %	405757072
74	NC_018589	AAGTT	2	10	90413	90422	40 %	40 %	20 %	0 %	405757072
75	NC_018589	GAAAA	2	10	91330	91339	80 %	0 %	20 %	0 %	405757072
76	NC_018589	TGAAA	2	10	91572	91581	60 %	20 %	20 %	0 %	405757072
77	NC_018589	AAATT	2	10	91916	91925	60 %	40 %	0 %	0 %	405757072
78	NC_018589	AGCGG	2	10	92500	92509	20 %	0 %	60 %	20 %	405757072
79	NC_018589	AGTTA	2	10	93909	93918	40 %	40 %	20 %	0 %	405757072
80	NC_018589	GAAAT	2	10	94996	95005	60 %	20 %	20 %	0 %	405757073
81	NC_018589	AAAAG	2	10	95308	95317	80 %	0 %	20 %	0 %	405757073
82	NC_018589	TGAAA	2	10	96305	96314	60 %	20 %	20 %	0 %	405757073
83	NC_018589	TGCAT	2	10	98965	98974	20 %	40 %	20 %	20 %	405757076
84	NC_018589	TTACT	2	10	99211	99220	20 %	60 %	0 %	20 %	405757076
85	NC_018589	GTTTT	2	10	100809	100818	0 %	80 %	20 %	0 %	405757078
86	NC_018589	GAAGT	2	10	101090	101099	40 %	20 %	40 %	0 %	405757078
87	NC_018589	AGCGG	2	10	102409	102418	20 %	0 %	60 %	20 %	405757079
88	NC_018589	ATATC	2	10	108213	108222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018589	TTCCA	2	10	108998	109007	20 %	40 %	0 %	40 %	405757089
90	NC_018589	AAAAG	2	10	110900	110909	80 %	0 %	20 %	0 %	405757091
91	NC_018589	ACGGT	2	10	112444	112453	20 %	20 %	40 %	20 %	405757092
92	NC_018589	GAAAT	2	10	113683	113692	60 %	20 %	20 %	0 %	405757093
93	NC_018589	GAATT	2	10	114324	114333	40 %	40 %	20 %	0 %	405757093
94	NC_018589	AACCA	2	10	118200	118209	60 %	0 %	0 %	40 %	405757096
95	NC_018589	CTTTA	2	10	118529	118538	20 %	60 %	0 %	20 %	405757096
96	NC_018589	CTCGA	2	10	119880	119889	20 %	20 %	20 %	40 %	405757098
97	NC_018589	TTCCA	2	10	120214	120223	20 %	40 %	0 %	40 %	405757098
98	NC_018589	TACTG	2	10	120479	120488	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018589	TCTCT	2	10	121052	121061	0 %	60 %	0 %	40 %	405757099
100	NC_018589	TTTTA	2	10	121412	121421	20 %	80 %	0 %	0 %	405757100
101	NC_018589	AAAAG	2	10	121681	121690	80 %	0 %	20 %	0 %	405757101
102	NC_018589	AAAGT	2	10	122718	122727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018589	TTAGT	2	10	123839	123848	20 %	60 %	20 %	0 %	405757105
104	NC_018589	TTTAT	2	10	126839	126848	20 %	80 %	0 %	0 %	405757108
105	NC_018589	AAGTG	2	10	128861	128870	40 %	20 %	40 %	0 %	405757111
106	NC_018589	GTCAG	2	10	129322	129331	20 %	20 %	40 %	20 %	405757112
107	NC_018589	AATTT	2	10	130603	130612	40 %	60 %	0 %	0 %	405757114
108	NC_018589	TTGTT	2	10	132970	132979	0 %	80 %	20 %	0 %	405757116
109	NC_018589	ATTTT	2	10	134774	134783	20 %	80 %	0 %	0 %	405757118
110	NC_018589	AAAAT	2	10	136276	136285	80 %	20 %	0 %	0 %	405757118
111	NC_018589	AACTT	2	10	137602	137611	40 %	40 %	0 %	20 %	405757121
112	NC_018589	ACAAA	2	10	137704	137713	80 %	0 %	0 %	20 %	405757121
113	NC_018589	ACTTG	2	10	138498	138507	20 %	40 %	20 %	20 %	405757121
114	NC_018589	TTGGT	2	10	139294	139303	0 %	60 %	40 %	0 %	405757122
115	NC_018589	TGTTT	2	10	139637	139646	0 %	80 %	20 %	0 %	405757122
116	NC_018589	AGCCA	2	10	141163	141172	40 %	0 %	20 %	40 %	405757124
117	NC_018589	TATGA	2	10	142272	142281	40 %	40 %	20 %	0 %	405757126
118	NC_018589	TAACG	2	10	145253	145262	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018589	TTTAT	2	10	145912	145921	20 %	80 %	0 %	0 %	405757133
120	NC_018589	ACTTT	2	10	147709	147718	20 %	60 %	0 %	20 %	405757136
121	NC_018589	ACGGC	2	10	149633	149642	20 %	0 %	40 %	40 %	405757138
122	NC_018589	TTTAA	2	10	149705	149714	40 %	60 %	0 %	0 %	405757138
123	NC_018589	AATTT	2	10	149891	149900	40 %	60 %	0 %	0 %	405757138
124	NC_018589	GATAA	2	10	150058	150067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018589	AATAA	2	10	151164	151173	80 %	20 %	0 %	0 %	405757139
126	NC_018589	GAATA	2	10	153124	153133	60 %	20 %	20 %	0 %	405757142
127	NC_018589	TTTAC	2	10	154323	154332	20 %	60 %	0 %	20 %	405757143
128	NC_018589	AGATG	2	10	154372	154381	40 %	20 %	40 %	0 %	405757143
129	NC_018589	ATATG	2	10	157039	157048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018589	TCTAA	2	10	159657	159666	40 %	40 %	0 %	20 %	405757146
131	NC_018589	AAATC	2	10	160172	160181	60 %	20 %	0 %	20 %	405757146
132	NC_018589	GGCTG	2	10	160209	160218	0 %	20 %	60 %	20 %	405757146
133	NC_018589	CGAAA	2	10	160787	160796	60 %	0 %	20 %	20 %	405757146
134	NC_018589	AAGAT	2	10	163176	163185	60 %	20 %	20 %	0 %	405757148
135	NC_018589	TGCGC	2	10	163297	163306	0 %	20 %	40 %	40 %	405757148
136	NC_018589	GAATT	2	10	163547	163556	40 %	40 %	20 %	0 %	405757149
137	NC_018589	AAATA	2	10	166602	166611	80 %	20 %	0 %	0 %	405757153
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193	NC_018589	GAAAA	2	10	232377	232386	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_018589	AAATA	2	10	336406	336415	80 %	20 %	0 %	0 %	405757298
262	NC_018589	GATAT	2	10	337882	337891	40 %	40 %	20 %	0 %	405757300
263	NC_018589	ACGAA	2	10	337915	337924	60 %	0 %	20 %	20 %	405757300
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265	NC_018589	GAAAT	2	10	343720	343729	60 %	20 %	20 %	0 %	405757307
266	NC_018589	AAGTG	2	10	344218	344227	40 %	20 %	40 %	0 %	405757307
267	NC_018589	TTTGA	2	10	347456	347465	20 %	60 %	20 %	0 %	405757310
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