MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2479

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018589	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018589	AAAGA	2	10	14386	14395	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018589	GACTT	2	10	47273	47282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018589	ATGGT	2	10	49527	49536	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018589	TAAAA	2	10	52566	52575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018589	TTATG	2	10	54773	54782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018589	ATAGC	2	10	75679	75688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018589	AGTAG	2	10	77802	77811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018589	AGTAA	2	10	78052	78061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018589	ATTTT	2	10	87874	87883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018589	ATATC	2	10	108213	108222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018589	TACTG	2	10	120479	120488	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018589	AAAGT	2	10	122718	122727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018589	TAACG	2	10	145253	145262	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018589	GATAA	2	10	150058	150067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018589	ATATG	2	10	157039	157048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018589	CTAAA	2	10	167955	167964	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018589	ATAGA	2	10	193914	193923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018589	TTGTC	2	10	199439	199448	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018589	ACAAA	2	10	199804	199813	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018589	ATATA	2	10	207541	207550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018589	ACAAA	2	10	215590	215599	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018589	GAGTG	2	10	215669	215678	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018589	AGCCG	2	10	223847	223856	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018589	GAAAA	2	10	231971	231980	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018589	GAAAA	2	10	232174	232183	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018589	GAAAA	2	10	232377	232386	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018589	GAATA	2	10	235466	235475	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018589	AAATT	2	10	237152	237161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018589	TAATT	2	10	237353	237362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018589	TCGTG	2	10	238512	238521	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018589	AAGGT	2	10	239980	239989	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018589	TAATT	2	10	243375	243384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018589	TCGTG	2	10	244534	244543	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018589	AAGGT	2	10	246002	246011	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018589	GGCAT	2	10	263293	263302	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018589	AGTGA	2	10	280365	280374	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018589	ACTAA	2	10	289072	289081	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018589	AAAGA	2	10	296298	296307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018589	ATTCG	2	10	318717	318726	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018589	ATTTG	2	10	321345	321354	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018589	TAGAT	2	10	321385	321394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018589	ATTGT	2	10	348538	348547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018589	AGATT	2	10	358470	358479	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018589	ATAGA	2	10	359634	359643	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018589	GTGAT	2	10	382271	382280	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018589	GAAAC	2	10	387371	387380	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018589	AAATT	2	10	405274	405283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018589	CAAAA	2	10	410594	410603	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018589	GAAAG	2	10	428346	428355	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018589	TGAGG	2	10	436197	436206	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018589	GGAAA	2	10	443765	443774	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018589	CACTT	2	10	464525	464534	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018589	CTTAT	2	10	465165	465174	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018589	TTTCT	2	10	488494	488503	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018589	AAAAT	2	10	504994	505003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018589	CAAGA	2	10	508048	508057	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018589	ATAGT	2	10	510690	510699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018589	TTATT	2	10	512396	512405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018589	CTATG	2	10	512562	512571	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018589	CTAAT	2	10	513992	514001	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018589	ATACA	2	10	519126	519135	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018589	CAATC	2	10	519632	519641	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018589	ATAAA	2	10	531287	531296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018589	AAACA	2	10	545989	545998	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018589	TAATT	2	10	551237	551246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018589	TATAG	2	10	555778	555787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018589	GAAAA	2	10	561380	561389	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018589	AAAAC	2	10	583524	583533	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018589	CTATG	2	10	590948	590957	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018589	AAAGA	2	10	596402	596411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018589	ATAAA	2	10	611372	611381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018589	AATCA	2	10	615353	615362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018589	ATTGA	2	10	623357	623366	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018589	ATTAA	2	10	636671	636680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018589	TAAAA	2	10	660190	660199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018589	GAAAT	2	10	667800	667809	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018589	ATCAA	2	10	676338	676347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018589	ATTTT	2	10	676357	676366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018589	GAATG	2	10	676764	676773	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018589	TTACT	2	10	701794	701803	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018589	ATTTT	2	10	707644	707653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018589	GGGGA	2	10	717092	717101	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018589	TATTT	2	10	723329	723338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018589	AGAGA	2	10	723480	723489	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018589	CTTTT	2	10	724455	724464	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018589	TAAAA	2	10	775746	775755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018589	CTTTT	2	10	782469	782478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018589	TAGTT	2	10	782482	782491	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018589	TGAAA	2	10	801372	801381	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018589	ATAGA	2	10	803421	803430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018589	GTATA	2	10	838109	838118	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018589	AATTA	2	10	838730	838739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018589	TAATA	2	10	840772	840781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018589	AATAA	2	10	842525	842534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018589	ATTTT	2	10	846111	846120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018589	AGGAA	2	10	861935	861944	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018589	ATAGA	2	10	882783	882792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018589	ATCTT	2	10	883963	883972	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018589	TTATA	2	10	919594	919603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018589	GAAAG	2	10	935844	935853	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018589	TTTTA	2	10	936296	936305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018589	ATAGA	2	10	940208	940217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018589	GAAAA	2	10	947314	947323	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018589	TATAA	2	10	954468	954477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018589	TGGAA	2	10	964124	964133	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018589	TTTAT	2	10	969657	969666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018589	ATGAG	2	10	990322	990331	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018589	TTTTA	2	10	997449	997458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018589	TAAAA	2	10	997514	997523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018589	TATAA	2	10	1011982	1011991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018589	TGACG	2	10	1013660	1013669	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018589	AGATA	2	10	1028448	1028457	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018589	GAGAG	2	10	1037395	1037404	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018589	TTCTA	2	10	1042066	1042075	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018589	TTTTC	2	10	1045952	1045961	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018589	GTTTT	2	10	1055848	1055857	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018589	TTTAG	2	10	1058253	1058262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018589	ATAAA	2	10	1058272	1058281	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018589	TAAAA	2	10	1058283	1058292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018589	ACTAA	2	10	1058394	1058403	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018589	TAGGA	2	10	1072852	1072861	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018589	GTTTT	2	10	1072862	1072871	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018589	TAAAC	2	10	1076875	1076884	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018589	CTTTT	2	10	1077360	1077369	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018589	AAAGC	2	10	1083291	1083300	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018589	TTATT	2	10	1083334	1083343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018589	TTTAT	2	10	1085282	1085291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018589	AAGTT	2	10	1091458	1091467	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018589	ATAAA	2	10	1091512	1091521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018589	GCTAT	2	10	1092384	1092393	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018589	TATAT	2	10	1094488	1094497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018589	TTAAT	2	10	1125158	1125167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018589	TTTTA	2	10	1131884	1131893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018589	TAATT	2	10	1134552	1134561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018589	ATAAC	2	10	1134562	1134571	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018589	TTATT	2	10	1134784	1134793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018589	ATTTT	2	10	1134804	1134813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018589	AAATA	2	10	1175759	1175768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018589	TAAAC	2	10	1190809	1190818	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018589	TAAAA	2	10	1211095	1211104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018589	ATTTA	2	10	1211123	1211132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018589	TAGTT	2	10	1221791	1221800	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018589	TGTTT	2	10	1249013	1249022	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018589	TAGAC	2	10	1254026	1254035	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018589	CGTAT	2	10	1254149	1254158	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_018589	TACTA	2	10	1301292	1301301	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_018589	CCTCT	2	10	1646649	1646658	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
182	NC_018589	TTTTA	2	10	1658304	1658313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018589	TCTAT	2	10	1658371	1658380	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_018589	TCACT	2	10	2420385	2420394	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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344	NC_018589	TTGGA	2	10	2822918	2822927	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
345	NC_018589	TATAG	2	10	2829107	2829116	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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351	NC_018589	CACTC	2	10	2928158	2928167	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
352	NC_018589	GTTCT	2	10	2941444	2941453	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
353	NC_018589	GAACC	2	10	2969164	2969173	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
354	NC_018589	TATCA	2	10	2971471	2971480	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.