MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2479

Total Repeats: 3896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018589	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018589	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018589	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018589	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018589	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018589	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018589	AGT	2	6	13930	13935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018589	AAT	2	6	14017	14022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018589	GGA	2	6	14070	14075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018589	GCA	2	6	14128	14133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018589	CTG	3	9	14462	14470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018589	GAA	2	6	14482	14487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018589	TCA	2	6	14516	14521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018589	ACA	2	6	14566	14571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018589	GCC	2	6	14583	14588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018589	AAT	2	6	14619	14624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018589	AGT	2	6	15881	15886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018589	CTT	2	6	16139	16144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018589	CTC	2	6	21432	21437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018589	ATT	2	6	21574	21579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018589	GAG	2	6	21636	21641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018589	TCA	2	6	23106	23111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018589	AAG	2	6	25845	25850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018589	GGA	2	6	27480	27485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018589	TCA	2	6	28962	28967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018589	GTC	2	6	29091	29096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018589	CAA	2	6	34606	34611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018589	AGG	2	6	40502	40507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018589	TCT	2	6	40518	40523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018589	AAT	2	6	40610	40615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018589	ATG	2	6	40628	40633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018589	AGG	2	6	41743	41748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018589	AGA	2	6	41749	41754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018589	AGG	2	6	45310	45315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018589	TGA	2	6	48072	48077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018589	TTG	2	6	49357	49362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018589	ATA	2	6	49440	49445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018589	ATT	2	6	49467	49472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018589	AGG	2	6	49569	49574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018589	GAG	2	6	49917	49922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018589	AGG	2	6	50500	50505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018589	AAG	2	6	50834	50839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018589	TAT	2	6	51614	51619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018589	TTA	2	6	51729	51734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018589	GGA	2	6	52619	52624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018589	TGA	2	6	54720	54725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018589	ATA	2	6	54746	54751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018589	TGA	2	6	54753	54758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018589	AAT	2	6	60193	60198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018589	TGT	2	6	60368	60373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018589	ATA	2	6	60484	60489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018589	CAA	2	6	60803	60808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018589	CAA	2	6	75700	75705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018589	AAC	2	6	75732	75737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018589	GTA	2	6	75745	75750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018589	ATA	2	6	76194	76199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018589	ATC	2	6	76989	76994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018589	GTA	2	6	77039	77044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018589	GAT	2	6	77462	77467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018589	ATT	2	6	77553	77558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018589	CCA	2	6	77701	77706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018589	GCA	2	6	77841	77846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018589	AAC	2	6	77849	77854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018589	ATT	2	6	77885	77890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018589	ATG	2	6	77894	77899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018589	AAG	2	6	77929	77934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018589	TAT	2	6	77998	78003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018589	ATA	2	6	78032	78037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018589	GGA	2	6	78078	78083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018589	ACT	2	6	78883	78888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018589	GAG	2	6	81647	81652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018589	GTT	2	6	82707	82712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018589	AGC	2	6	82727	82732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018589	TAA	2	6	82842	82847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018589	AAT	2	6	82852	82857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018589	ATT	2	6	82875	82880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018589	TAA	2	6	82920	82925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018589	TAC	2	6	82928	82933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018589	GTT	2	6	82950	82955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018589	CTT	2	6	84858	84863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018589	AAT	2	6	84923	84928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018589	TAA	2	6	84943	84948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018589	ATA	2	6	84961	84966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018589	AAT	2	6	84984	84989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018589	AGG	2	6	85009	85014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018589	CTA	2	6	85649	85654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018589	TAA	2	6	85674	85679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018589	CAA	2	6	85766	85771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018589	ATT	2	6	85931	85936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018589	GAA	2	6	86075	86080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018589	TAA	3	9	86143	86151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018589	TCC	2	6	86155	86160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018589	TAA	2	6	86173	86178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018589	TCT	2	6	86185	86190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018589	TGT	2	6	86314	86319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018589	TAA	2	6	86734	86739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018589	TGT	2	6	87779	87784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018589	TAA	2	6	87856	87861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018589	GAT	2	6	87866	87871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018589	TAG	2	6	87910	87915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018589	TAG	2	6	87962	87967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018589	ATA	2	6	88077	88082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018589	ACA	2	6	97094	97099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018589	ACA	2	6	103935	103940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018589	AAT	2	6	103957	103962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018589	AGG	2	6	104121	104126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018589	AGG	2	6	105111	105116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018589	GGA	2	6	105938	105943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018589	TAA	2	6	106948	106953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018589	ATA	2	6	107436	107441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018589	AGG	2	6	107484	107489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018589	CCT	2	6	107862	107867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018589	TGC	2	6	108251	108256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018589	TAT	2	6	108264	108269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018589	AAT	2	6	108281	108286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018589	GTT	2	6	108309	108314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018589	AAG	2	6	109798	109803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018589	CCG	2	6	109814	109819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018589	AGG	2	6	116959	116964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018589	AAT	2	6	118959	118964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018589	GAT	2	6	119059	119064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018589	CAA	2	6	120559	120564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018589	TTC	2	6	120597	120602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018589	TCC	2	6	121456	121461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_018589	ACT	2	6	121627	121632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018589	CAT	2	6	122545	122550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018589	ATA	2	6	122638	122643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018589	ATG	2	6	122645	122650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018589	GGA	2	6	122730	122735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018589	ATT	2	6	122740	122745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018589	AGG	2	6	123747	123752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018589	GAA	2	6	124098	124103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018589	AGG	2	6	129204	129209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018589	AGG	2	6	130237	130242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018589	GCT	2	6	131401	131406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018589	AGG	2	6	133949	133954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018589	CTT	2	6	136302	136307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018589	TAT	2	6	136338	136343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018589	TGA	2	6	136416	136421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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