MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018588	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018588	GCAAAA	2	12	14089	14100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018588	ATTTAT	2	12	77122	77133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018588	GTGGCT	2	12	82642	82653	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018588	AATAAA	2	12	199499	199510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018588	GAAAAC	2	12	226515	226526	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018588	ATTCAA	2	12	237403	237414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018588	AAGGAA	2	12	238974	238985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018588	TAGGCG	2	12	240627	240638	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018588	ATTCAA	2	12	243425	243436	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018588	AAGGAA	2	12	244996	245007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018588	TAGGCG	2	12	246649	246660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018588	AGTCAA	2	12	248462	248473	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018588	TTATAT	2	12	263246	263257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018588	AACTTT	2	12	288950	288961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018588	AATACA	2	12	297540	297551	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018588	TTGGTT	2	12	327512	327523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018588	AAATGA	2	12	388443	388454	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018588	ATGATA	2	12	390263	390274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018588	AGTGCT	2	12	401901	401912	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018588	TTGTTT	2	12	410605	410616	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018588	ACAAAA	2	12	472554	472565	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018588	ACACGG	2	12	505983	505994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018588	CTATAA	2	12	510343	510354	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018588	GGGGAA	2	12	542963	542974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018588	TTTAGT	2	12	543153	543164	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018588	AGATTT	2	12	569575	569586	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018588	ATCATT	2	12	638233	638244	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018588	TTAAGA	2	12	678048	678059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018588	ATCATT	2	12	680237	680248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018588	TATAGG	2	12	724729	724740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018588	TACAAA	2	12	776064	776075	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018588	AGAAAA	2	12	776194	776205	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018588	TTACTT	2	12	851358	851369	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018588	TGAAAT	2	12	862492	862503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018588	AAATAG	2	12	889153	889164	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018588	GTAATC	2	12	895956	895967	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018588	TTACAA	2	12	895974	895985	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018588	ATGAAA	2	12	904569	904580	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018588	TTGACT	2	12	1027829	1027840	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018588	AGGAAG	2	12	1038022	1038033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018588	CTTTTT	2	12	1097736	1097747	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018588	TTATGG	2	12	1137446	1137457	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018588	TTTAGT	2	12	1141454	1141465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018588	CTTTTT	2	12	1214025	1214036	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018588	GAAAAA	2	12	1244001	1244012	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018588	TATATT	2	12	1286313	1286324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018588	TATTAA	2	12	1313438	1313449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018588	TATTAA	2	12	1464232	1464243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018588	ATAAAA	2	12	1498413	1498424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018588	TTTCAT	2	12	1506807	1506818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018588	CTCTTC	2	12	1609488	1609499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018588	GGTTGT	2	12	1660142	1660153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018588	GGTTGT	2	12	1661603	1661614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018588	GAATAA	2	12	1663157	1663168	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018588	GTAAAC	2	12	1664307	1664318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018588	ACAAAA	2	12	1672931	1672942	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018588	AAAATA	2	12	1677248	1677259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018588	TAAAAA	2	12	1678157	1678168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018588	TAAAAA	2	12	1704902	1704913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018588	ATGAAA	2	12	1724404	1724415	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018588	TAGATT	2	12	1729182	1729193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018588	CGCCTA	2	12	1764990	1765001	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018588	TTTCCT	2	12	1766643	1766654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018588	TTGAAT	2	12	1768215	1768226	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018588	CTATAA	2	12	1815845	1815856	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018588	AAAAAC	2	12	1840478	1840489	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018588	CGCCTA	2	12	1870914	1870925	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018588	TTTCCT	2	12	1872566	1872577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018588	TTGAAT	2	12	1874138	1874149	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018588	GTTTTA	2	12	1882058	1882069	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018588	AAAAAG	2	12	1965132	1965143	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018588	CTCTAT	2	12	1982851	1982862	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018588	TCATTT	2	12	1984049	1984060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018588	GTTTTC	2	12	2011220	2011231	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018588	CAAAAA	2	12	2028944	2028955	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018588	GAAAAA	2	12	2032805	2032816	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018588	TTTTAT	2	12	2128504	2128515	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018588	ATTCAA	2	12	2186171	2186182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018588	TTATAT	2	12	2247643	2247654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018588	AATTTT	2	12	2300456	2300467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018588	AAATTG	2	12	2306631	2306642	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018588	CTCTGT	2	12	2313477	2313488	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018588	TAATGC	2	12	2410923	2410934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018588	TAATAC	2	12	2436269	2436280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018588	CGCCTA	2	12	2457071	2457082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018588	TTTCCT	2	12	2458974	2458985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018588	TTGAAT	2	12	2460546	2460557	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018588	TTCAAA	2	12	2545095	2545106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018588	CTTTTT	2	12	2610324	2610335	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018588	ATCCCA	2	12	2630238	2630249	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018588	AAAAGA	2	12	2636069	2636080	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018588	TTTTTA	2	12	2642065	2642076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018588	CGCCTA	2	12	2692078	2692089	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018588	TTTCCT	2	12	2693981	2693992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018588	TTGAAT	2	12	2695553	2695564	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018588	CCTCTT	2	12	2739040	2739051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018588	TAAATC	2	12	2760510	2760521	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018588	TTTTAT	2	12	2842217	2842228	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018588	ATATTT	2	12	2889128	2889139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018588	TTAACT	2	12	2889435	2889446	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018588	TATCAA	2	12	2915656	2915667	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018588	AAATGA	2	12	2915670	2915681	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018588	TAAAAA	2	12	2915740	2915751	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018588	AAGTAT	2	12	2916607	2916618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.