MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372

Total Repeats: 2194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018588	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018588	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	404282432
3	NC_018588	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	404282432
4	NC_018588	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	404282433
5	NC_018588	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	404282433
6	NC_018588	CAAAA	2	10	7073	7082	80 %	0 %	0 %	20 %	404282436
7	NC_018588	TTGAT	2	10	11755	11764	20 %	60 %	20 %	0 %	404282438
8	NC_018588	TTTTA	2	10	12428	12437	20 %	80 %	0 %	0 %	404282439
9	NC_018588	GTATG	2	10	13371	13380	20 %	40 %	40 %	0 %	404282441
10	NC_018588	AAAGA	2	10	14386	14395	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018588	ATGAA	2	10	17249	17258	60 %	20 %	20 %	0 %	404282443
12	NC_018588	GAATG	2	10	18991	19000	40 %	20 %	40 %	0 %	404282444
13	NC_018588	TAATT	2	10	20369	20378	40 %	60 %	0 %	0 %	404282447
14	NC_018588	ATTAA	2	10	21886	21895	60 %	40 %	0 %	0 %	404282448
15	NC_018588	AAATC	2	10	22347	22356	60 %	20 %	0 %	20 %	404282448
16	NC_018588	AACAT	2	10	22508	22517	60 %	20 %	0 %	20 %	404282448
17	NC_018588	TTTTA	2	10	23125	23134	20 %	80 %	0 %	0 %	404282449
18	NC_018588	GACCA	2	10	23209	23218	40 %	0 %	20 %	40 %	404282449
19	NC_018588	TGGAT	2	10	23468	23477	20 %	40 %	40 %	0 %	404282449
20	NC_018588	CAAAA	2	10	24469	24478	80 %	0 %	0 %	20 %	404282450
21	NC_018588	ATTAT	2	10	24954	24963	40 %	60 %	0 %	0 %	404282451
22	NC_018588	TCAGG	2	10	26123	26132	20 %	20 %	40 %	20 %	404282453
23	NC_018588	TTTAC	2	10	27123	27132	20 %	60 %	0 %	20 %	404282454
24	NC_018588	GAAAA	2	10	33064	33073	80 %	0 %	20 %	0 %	404282460
25	NC_018588	TGAAA	2	10	34219	34228	60 %	20 %	20 %	0 %	404282461
26	NC_018588	GAATG	2	10	36090	36099	40 %	20 %	40 %	0 %	404282463
27	NC_018588	AAATT	2	10	36217	36226	60 %	40 %	0 %	0 %	404282463
28	NC_018588	ATGGA	2	10	38338	38347	40 %	20 %	40 %	0 %	404282464
29	NC_018588	AAAAC	2	10	40444	40453	80 %	0 %	0 %	20 %	404282465
30	NC_018588	TTATT	2	10	41933	41942	20 %	80 %	0 %	0 %	404282467
31	NC_018588	AAAAG	2	10	43147	43156	80 %	0 %	20 %	0 %	404282467
32	NC_018588	ATAAA	2	10	43971	43980	80 %	20 %	0 %	0 %	404282468
33	NC_018588	ATTTT	2	10	45776	45785	20 %	80 %	0 %	0 %	404282470
34	NC_018588	GAAAC	2	10	47034	47043	60 %	0 %	20 %	20 %	404282471
35	NC_018588	GACTT	2	10	47273	47282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018588	ATTTT	2	10	47360	47369	20 %	80 %	0 %	0 %	404282472
37	NC_018588	AAATG	2	10	48490	48499	60 %	20 %	20 %	0 %	404282473
38	NC_018588	ATGGT	2	10	49527	49536	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018588	GTAGA	2	10	49576	49585	40 %	20 %	40 %	0 %	404282474
40	NC_018588	TTACT	2	10	50558	50567	20 %	60 %	0 %	20 %	404282476
41	NC_018588	GAAAT	2	10	51216	51225	60 %	20 %	20 %	0 %	404282477
42	NC_018588	CTTAG	2	10	51315	51324	20 %	40 %	20 %	20 %	404282477
43	NC_018588	TAAAA	2	10	52566	52575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018588	TGCTA	2	10	52740	52749	20 %	40 %	20 %	20 %	404282480
45	NC_018588	TTTTA	2	10	52908	52917	20 %	80 %	0 %	0 %	404282480
46	NC_018588	AGTTA	2	10	54224	54233	40 %	40 %	20 %	0 %	404282481
47	NC_018588	TTATG	2	10	54773	54782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018588	CGCAA	2	10	57737	57746	40 %	0 %	20 %	40 %	404282484
49	NC_018588	TTTTA	2	10	58685	58694	20 %	80 %	0 %	0 %	404282485
50	NC_018588	AAACG	2	10	63068	63077	60 %	0 %	20 %	20 %	404282488
51	NC_018588	ATTAT	2	10	64036	64045	40 %	60 %	0 %	0 %	404282488
52	NC_018588	CGAAA	2	10	64554	64563	60 %	0 %	20 %	20 %	404282489
53	NC_018588	AAAAC	2	10	64564	64573	80 %	0 %	0 %	20 %	404282489
54	NC_018588	AACAA	2	10	65987	65996	80 %	0 %	0 %	20 %	404282491
55	NC_018588	GAGAG	2	10	71046	71055	40 %	0 %	60 %	0 %	404282493
56	NC_018588	GCAAA	2	10	72228	72237	60 %	0 %	20 %	20 %	404282496
57	NC_018588	CAATA	2	10	72293	72302	60 %	20 %	0 %	20 %	404282496
58	NC_018588	GCCTT	2	10	73093	73102	0 %	40 %	20 %	40 %	404282497
59	NC_018588	CAAAA	2	10	73470	73479	80 %	0 %	0 %	20 %	404282497
60	NC_018588	GAAAT	2	10	75659	75668	60 %	20 %	20 %	0 %	404282499
61	NC_018588	ATAGC	2	10	75679	75688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018588	GCTTT	2	10	76457	76466	0 %	60 %	20 %	20 %	404282501
63	NC_018588	AGTAG	2	10	77802	77811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018588	AGTAA	2	10	78052	78061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018588	TTATA	2	10	78301	78310	40 %	60 %	0 %	0 %	404282503
66	NC_018588	TATTT	2	10	78396	78405	20 %	80 %	0 %	0 %	404282504
67	NC_018588	GCTTG	2	10	80375	80384	0 %	40 %	40 %	20 %	404282506
68	NC_018588	AAACT	2	10	80385	80394	60 %	20 %	0 %	20 %	404282506
69	NC_018588	GCGCT	2	10	82430	82439	0 %	20 %	40 %	40 %	404282508
70	NC_018588	TAAAG	2	10	84430	84439	60 %	20 %	20 %	0 %	404282509
71	NC_018588	TCATT	2	10	87622	87631	20 %	60 %	0 %	20 %	404282513
72	NC_018588	ATTTT	2	10	87874	87883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018588	CTAAA	2	10	89987	89996	60 %	20 %	0 %	20 %	404282515
74	NC_018588	AAGTT	2	10	90413	90422	40 %	40 %	20 %	0 %	404282515
75	NC_018588	GAAAA	2	10	91330	91339	80 %	0 %	20 %	0 %	404282515
76	NC_018588	TGAAA	2	10	91572	91581	60 %	20 %	20 %	0 %	404282515
77	NC_018588	AAATT	2	10	91916	91925	60 %	40 %	0 %	0 %	404282515
78	NC_018588	AGCGG	2	10	92500	92509	20 %	0 %	60 %	20 %	404282515
79	NC_018588	AGTTA	2	10	93909	93918	40 %	40 %	20 %	0 %	404282515
80	NC_018588	GAAAT	2	10	94996	95005	60 %	20 %	20 %	0 %	404282516
81	NC_018588	AAAAG	2	10	95308	95317	80 %	0 %	20 %	0 %	404282516
82	NC_018588	TGAAA	2	10	96305	96314	60 %	20 %	20 %	0 %	404282516
83	NC_018588	TGCAT	2	10	98965	98974	20 %	40 %	20 %	20 %	404282519
84	NC_018588	TTACT	2	10	99211	99220	20 %	60 %	0 %	20 %	404282519
85	NC_018588	GTTTT	2	10	100809	100818	0 %	80 %	20 %	0 %	404282521
86	NC_018588	GAAGT	2	10	101090	101099	40 %	20 %	40 %	0 %	404282521
87	NC_018588	AGCGG	2	10	102409	102418	20 %	0 %	60 %	20 %	404282522
88	NC_018588	ATATC	2	10	108213	108222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018588	TTCCA	2	10	108998	109007	20 %	40 %	0 %	40 %	404282532
90	NC_018588	AAAAG	2	10	110900	110909	80 %	0 %	20 %	0 %	404282534
91	NC_018588	ACGGT	2	10	112444	112453	20 %	20 %	40 %	20 %	404282535
92	NC_018588	GAAAT	2	10	113683	113692	60 %	20 %	20 %	0 %	404282536
93	NC_018588	GAATT	2	10	114324	114333	40 %	40 %	20 %	0 %	404282536
94	NC_018588	AACCA	2	10	118200	118209	60 %	0 %	0 %	40 %	404282539
95	NC_018588	CTTTA	2	10	118529	118538	20 %	60 %	0 %	20 %	404282539
96	NC_018588	CTCGA	2	10	119880	119889	20 %	20 %	20 %	40 %	404282541
97	NC_018588	TTCCA	2	10	120214	120223	20 %	40 %	0 %	40 %	404282541
98	NC_018588	TACTG	2	10	120479	120488	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018588	TCTCT	2	10	121052	121061	0 %	60 %	0 %	40 %	404282542
100	NC_018588	TTTTA	2	10	121412	121421	20 %	80 %	0 %	0 %	404282543
101	NC_018588	AAAAG	2	10	121681	121690	80 %	0 %	20 %	0 %	404282544
102	NC_018588	AAAGT	2	10	122718	122727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018588	TTAGT	2	10	123839	123848	20 %	60 %	20 %	0 %	404282548
104	NC_018588	TTTAT	2	10	126839	126848	20 %	80 %	0 %	0 %	404282551
105	NC_018588	AAGTG	2	10	128861	128870	40 %	20 %	40 %	0 %	404282554
106	NC_018588	GTCAG	2	10	129322	129331	20 %	20 %	40 %	20 %	404282555
107	NC_018588	AATTT	2	10	130603	130612	40 %	60 %	0 %	0 %	404282557
108	NC_018588	TTGTT	2	10	132946	132955	0 %	80 %	20 %	0 %	404282559
109	NC_018588	ATTTT	2	10	134750	134759	20 %	80 %	0 %	0 %	404282562
110	NC_018588	AAAAT	2	10	136252	136261	80 %	20 %	0 %	0 %	404282562
111	NC_018588	AACTT	2	10	137578	137587	40 %	40 %	0 %	20 %	404282565
112	NC_018588	ACAAA	2	10	137680	137689	80 %	0 %	0 %	20 %	404282565
113	NC_018588	ACTTG	2	10	138474	138483	20 %	40 %	20 %	20 %	404282565
114	NC_018588	TTGGT	2	10	139270	139279	0 %	60 %	40 %	0 %	404282566
115	NC_018588	TGTTT	2	10	139613	139622	0 %	80 %	20 %	0 %	404282566
116	NC_018588	AGCCA	2	10	141139	141148	40 %	0 %	20 %	40 %	404282568
117	NC_018588	TATGA	2	10	142248	142257	40 %	40 %	20 %	0 %	404282570
118	NC_018588	TAACG	2	10	145229	145238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018588	TTTAT	2	10	145888	145897	20 %	80 %	0 %	0 %	404282577
120	NC_018588	ACTTT	2	10	147678	147687	20 %	60 %	0 %	20 %	404282581
121	NC_018588	ACGGC	2	10	149602	149611	20 %	0 %	40 %	40 %	404282583
122	NC_018588	TTTAA	2	10	149674	149683	40 %	60 %	0 %	0 %	404282583
123	NC_018588	AATTT	2	10	149860	149869	40 %	60 %	0 %	0 %	404282583
124	NC_018588	GATAA	2	10	150027	150036	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018588	AATAA	2	10	151133	151142	80 %	20 %	0 %	0 %	404282584
126	NC_018588	GAATA	2	10	153093	153102	60 %	20 %	20 %	0 %	404282587
127	NC_018588	TTTAC	2	10	154292	154301	20 %	60 %	0 %	20 %	404282588
128	NC_018588	AGATG	2	10	154341	154350	40 %	20 %	40 %	0 %	404282588
129	NC_018588	ATATG	2	10	157008	157017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018588	TCTAA	2	10	159641	159650	40 %	40 %	0 %	20 %	404282591
131	NC_018588	AAATC	2	10	160156	160165	60 %	20 %	0 %	20 %	404282591
132	NC_018588	GGCTG	2	10	160193	160202	0 %	20 %	60 %	20 %	404282591
133	NC_018588	CGAAA	2	10	160771	160780	60 %	0 %	20 %	20 %	404282591
134	NC_018588	AAGAT	2	10	163160	163169	60 %	20 %	20 %	0 %	404282593
135	NC_018588	TGCGC	2	10	163281	163290	0 %	20 %	40 %	40 %	404282593
136	NC_018588	GAATT	2	10	163531	163540	40 %	40 %	20 %	0 %	404282594
137	NC_018588	AAATA	2	10	166586	166595	80 %	20 %	0 %	0 %	404282598
138	NC_018588	TTCTT	2	10	167791	167800	0 %	80 %	0 %	20 %	404282600
139	NC_018588	CTAAA	2	10	167939	167948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_018588	GAAAA	2	10	232161	232170	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_018588	GAAAA	2	10	232365	232374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_018588	ATTTG	2	10	321332	321341	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
249	NC_018588	TAGAT	2	10	321372	321381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
250	NC_018588	TTTGA	2	10	322491	322500	20 %	60 %	20 %	0 %	404282729
251	NC_018588	GTTTT	2	10	322502	322511	0 %	80 %	20 %	0 %	404282729
252	NC_018588	TCGTT	2	10	326096	326105	0 %	60 %	20 %	20 %	404282732
253	NC_018588	ACTTT	2	10	326146	326155	20 %	60 %	0 %	20 %	404282732
254	NC_018588	TTTCG	2	10	326412	326421	0 %	60 %	20 %	20 %	404282732
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256	NC_018588	TATTT	2	10	331038	331047	20 %	80 %	0 %	0 %	404282738
257	NC_018588	ATGAA	2	10	332539	332548	60 %	20 %	20 %	0 %	404282739
258	NC_018588	AGGAA	2	10	335582	335591	60 %	0 %	40 %	0 %	404282742
259	NC_018588	ATATT	2	10	335705	335714	40 %	60 %	0 %	0 %	404282742
260	NC_018588	AAGAT	2	10	336376	336385	60 %	20 %	20 %	0 %	404282742
261	NC_018588	AAATA	2	10	336393	336402	80 %	20 %	0 %	0 %	404282742
262	NC_018588	GATAT	2	10	337869	337878	40 %	40 %	20 %	0 %	404282744
263	NC_018588	ACGAA	2	10	337902	337911	60 %	0 %	20 %	20 %	404282744
264	NC_018588	TGCGA	2	10	341912	341921	20 %	20 %	40 %	20 %	404282749
265	NC_018588	GAAAT	2	10	343707	343716	60 %	20 %	20 %	0 %	404282751
266	NC_018588	AAGTG	2	10	344205	344214	40 %	20 %	40 %	0 %	404282751
267	NC_018588	TTTGA	2	10	347443	347452	20 %	60 %	20 %	0 %	404282754
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