MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018588	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018588	AAAGA	2	10	14386	14395	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018588	GACTT	2	10	47273	47282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018588	ATGGT	2	10	49527	49536	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018588	TAAAA	2	10	52566	52575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018588	TTATG	2	10	54773	54782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018588	ATAGC	2	10	75679	75688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018588	AGTAG	2	10	77802	77811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018588	AGTAA	2	10	78052	78061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018588	ATTTT	2	10	87874	87883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018588	ATATC	2	10	108213	108222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018588	TACTG	2	10	120479	120488	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018588	AAAGT	2	10	122718	122727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018588	TAACG	2	10	145229	145238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018588	GATAA	2	10	150027	150036	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018588	ATATG	2	10	157008	157017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018588	CTAAA	2	10	167939	167948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018588	ATAGA	2	10	193899	193908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018588	TTGTC	2	10	199424	199433	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018588	ACAAA	2	10	199789	199798	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018588	ATATA	2	10	207527	207536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018588	ACAAA	2	10	215577	215586	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018588	GAGTG	2	10	215656	215665	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018588	AGCCG	2	10	223834	223843	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018588	GAAAA	2	10	231958	231967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018588	GAAAA	2	10	232161	232170	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018588	GAAAA	2	10	232365	232374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018588	GAATA	2	10	235454	235463	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018588	AAATT	2	10	237140	237149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018588	TAATT	2	10	237341	237350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018588	TCGTG	2	10	238500	238509	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018588	AAGGT	2	10	239968	239977	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018588	TAATT	2	10	243363	243372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018588	TCGTG	2	10	244522	244531	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018588	AAGGT	2	10	245990	245999	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018588	GGCAT	2	10	263280	263289	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018588	AGTGA	2	10	280352	280361	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018588	ACTAA	2	10	289059	289068	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018588	AAAGA	2	10	296285	296294	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018588	ATTCG	2	10	318704	318713	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018588	ATTTG	2	10	321332	321341	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018588	TAGAT	2	10	321372	321381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018588	ATTGT	2	10	348525	348534	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018588	AGATT	2	10	358457	358466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018588	ATAGA	2	10	359621	359630	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018588	GTGAT	2	10	382258	382267	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018588	GAAAC	2	10	387358	387367	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018588	AAATT	2	10	405257	405266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018588	CAAAA	2	10	410577	410586	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018588	GAAAG	2	10	428329	428338	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018588	TGAGG	2	10	436180	436189	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018588	GGAAA	2	10	443748	443757	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018588	CACTT	2	10	464509	464518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018588	CTTAT	2	10	465149	465158	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018588	TTTCT	2	10	488478	488487	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018588	TCGAA	2	10	500414	500423	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018588	ATTTT	2	10	500631	500640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018588	AAAAT	2	10	504978	504987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018588	CAAGA	2	10	508032	508041	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018588	ATAGT	2	10	510674	510683	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018588	TTATT	2	10	512380	512389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018588	CTATG	2	10	512546	512555	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018588	CTAAT	2	10	513976	513985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018588	ATACA	2	10	519110	519119	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018588	CAATC	2	10	519616	519625	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_018588	ATAAA	2	10	531271	531280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018588	AAACA	2	10	545974	545983	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018588	TAATT	2	10	551222	551231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018588	TATAG	2	10	555763	555772	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018588	GAAAA	2	10	561365	561374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018588	AAAAC	2	10	583509	583518	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018588	CTATG	2	10	590933	590942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018588	AAAGA	2	10	596387	596396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018588	ATAAA	2	10	611357	611366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018588	AATCA	2	10	615338	615347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018588	ATTGA	2	10	623342	623351	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018588	ATTAA	2	10	636656	636665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018588	TAAAA	2	10	660176	660185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018588	GAAAT	2	10	667786	667795	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018588	ATCAA	2	10	676324	676333	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018588	ATTTT	2	10	676343	676352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018588	GAATG	2	10	676749	676758	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018588	TTACT	2	10	701780	701789	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018588	ATTTT	2	10	707738	707747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018588	GGGGA	2	10	717186	717195	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018588	TATTT	2	10	723423	723432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018588	AGAGA	2	10	723574	723583	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018588	CTTTT	2	10	724549	724558	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018588	TAAAA	2	10	775840	775849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018588	CTTTT	2	10	782563	782572	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018588	TAGTT	2	10	782576	782585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018588	TGAAA	2	10	801466	801475	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018588	ATAGA	2	10	803515	803524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018588	GTATA	2	10	838204	838213	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018588	AATTA	2	10	838825	838834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018588	TAATA	2	10	840867	840876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018588	AATAA	2	10	842619	842628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018588	ATTTT	2	10	846205	846214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018588	TTTTG	2	10	853482	853491	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018588	AGGAA	2	10	862028	862037	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018588	CAAAT	2	10	863685	863694	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018588	ATAGA	2	10	882876	882885	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018588	ATCTT	2	10	884056	884065	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018588	TTATA	2	10	919687	919696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018588	GAAAG	2	10	935927	935936	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018588	TTTTA	2	10	936379	936388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018588	ATAGA	2	10	940291	940300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018588	GAAAA	2	10	947397	947406	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018588	TATAA	2	10	954551	954560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018588	TGGAA	2	10	964207	964216	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018588	TTTAT	2	10	969741	969750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018588	ATGAG	2	10	990515	990524	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018588	TTTTA	2	10	997642	997651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018588	TAAAA	2	10	997707	997716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018588	TATAA	2	10	1012175	1012184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018588	TGACG	2	10	1013853	1013862	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018588	AGATA	2	10	1028644	1028653	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018588	GAGAG	2	10	1037591	1037600	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018588	TTCTA	2	10	1042262	1042271	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018588	TTTTC	2	10	1046148	1046157	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018588	GTTTT	2	10	1056020	1056029	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018588	TTTAG	2	10	1058425	1058434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018588	ATAAA	2	10	1058444	1058453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018588	TAAAA	2	10	1058455	1058464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018588	ACTAA	2	10	1058566	1058575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018588	TAGGA	2	10	1073024	1073033	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018588	GTTTT	2	10	1073034	1073043	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018588	TAAAC	2	10	1077047	1077056	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018588	CTTTT	2	10	1077532	1077541	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018588	AAAGC	2	10	1083463	1083472	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018588	TTATT	2	10	1083506	1083515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018588	TTTAT	2	10	1085454	1085463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018588	AAGTT	2	10	1091630	1091639	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018588	ATAAA	2	10	1091684	1091693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018588	GCTAT	2	10	1092556	1092565	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018588	TATAT	2	10	1094660	1094669	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018588	TTAAT	2	10	1125330	1125339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018588	TTTTA	2	10	1132056	1132065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018588	TAATT	2	10	1134728	1134737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018588	ATAAC	2	10	1134738	1134747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018588	TTATT	2	10	1134960	1134969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018588	ATTTT	2	10	1134980	1134989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018588	AAATA	2	10	1175935	1175944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018588	TAAAC	2	10	1190986	1190995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018588	TAAAA	2	10	1211273	1211282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018588	ATTTA	2	10	1211301	1211310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_018588	AGAAA	2	10	2415248	2415257	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018588	CTTTT	2	10	2417428	2417437	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_018588	ATTGA	2	10	2417920	2417929	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018588	TCACT	2	10	2420775	2420784	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
290	NC_018588	CTATA	2	10	2436209	2436218	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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312	NC_018588	TACCA	2	10	2599358	2599367	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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322	NC_018588	AAAAG	2	10	2658145	2658154	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_018588	AATTA	2	10	2695617	2695626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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350	NC_018588	CTTTT	2	10	2813051	2813060	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
351	NC_018588	GGGCT	2	10	2814659	2814668	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.