MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755

Total Repeats: 1186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018587	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018587	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404279557
3	NC_018587	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404279558
4	NC_018587	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279558
5	NC_018587	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404279558
6	NC_018587	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404279559
7	NC_018587	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018587	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018587	ATTTTC	2	12	19877	19888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404279567
10	NC_018587	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404279569
11	NC_018587	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404279569
12	NC_018587	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404279572
13	NC_018587	CCAAAA	2	12	35059	35070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404279584
14	NC_018587	AATTAT	2	12	35673	35684	50 %	50 %	0 %	0 %	404279585
15	NC_018587	TCACCA	2	12	36820	36831	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404279587
16	NC_018587	CGATTA	2	12	42250	42261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279591
17	NC_018587	TTATGT	2	12	46741	46752	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279594
18	NC_018587	AAAGAT	2	12	50393	50404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279597
19	NC_018587	TGAAAT	2	12	51230	51241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404279598
20	NC_018587	TGGCGG	2	12	54362	54373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404279602
21	NC_018587	TCAAAA	2	12	54482	54493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404279602
22	NC_018587	AAAAAT	2	12	56929	56940	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404279607
23	NC_018587	GCAGAA	2	12	60854	60865	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404279609
24	NC_018587	AGGTAA	2	12	60945	60956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404279610
25	NC_018587	TGATTG	2	12	62333	62344	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404279611
26	NC_018587	TGATTT	2	12	67664	67675	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279616
27	NC_018587	TTTTGC	2	12	68269	68280	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404279617
28	NC_018587	AAGTAA	2	12	74988	74999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279621
29	NC_018587	CAAACG	2	12	75963	75974	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404279623
30	NC_018587	TTGGAT	2	12	76818	76829	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404279623
31	NC_018587	AAAATA	2	12	80581	80592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404279630
32	NC_018587	CTTTTT	2	12	91373	91384	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404279642
33	NC_018587	ATCACT	2	12	94433	94444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404279645
34	NC_018587	GATATT	2	12	94492	94503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404279645
35	NC_018587	CAGATT	2	12	98009	98020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279645
36	NC_018587	AACTAT	2	12	100785	100796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404279646
37	NC_018587	AACCAG	2	12	106023	106034	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404279651
38	NC_018587	TATTAG	2	12	110316	110327	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404279656
39	NC_018587	TAGCAG	2	12	110379	110390	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404279656
40	NC_018587	ATTACA	2	12	116428	116439	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	404279664
41	NC_018587	TAAAAT	2	12	123543	123554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404279672
42	NC_018587	CAAAAT	2	12	123684	123695	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404279672
43	NC_018587	CAAGCG	2	12	124685	124696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404279672
44	NC_018587	GTTTTA	2	12	130451	130462	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279680
45	NC_018587	TGATTT	2	12	132467	132478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404279684
46	NC_018587	AAGTAA	2	12	136438	136449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279687
47	NC_018587	CCGTTA	2	12	139945	139956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404279694
48	NC_018587	CAGGTT	2	12	147271	147282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018587	CAACTG	2	12	149692	149703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404279703
50	NC_018587	GAATAA	2	12	151784	151795	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279705
51	NC_018587	GTTGCA	2	12	156043	156054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404279710
52	NC_018587	GATTGC	2	12	156105	156116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404279710
53	NC_018587	AGGCGG	2	12	161753	161764	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	404279714
54	NC_018587	CGTAAC	2	12	164589	164600	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404279715
55	NC_018587	AGTACC	2	12	164634	164645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404279715
56	NC_018587	GTTTTC	2	12	165610	165621	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404279716
57	NC_018587	GTTGAT	2	12	167226	167237	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	404279718
58	NC_018587	GTAAAA	2	12	167589	167600	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279718
59	NC_018587	TTTTAC	2	12	169633	169644	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404279722
60	NC_018587	TTTTTA	2	12	170670	170681	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404279724
61	NC_018587	GCATTA	2	12	170900	170911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279724
62	NC_018587	AAAGTA	2	12	171882	171893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279725
63	NC_018587	ACACTT	2	12	172799	172810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018587	TTGCAC	2	12	174776	174787	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404279727
65	NC_018587	AGAAGT	2	12	176924	176935	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404279728
66	NC_018587	CAATCC	2	12	178839	178850	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404279730
67	NC_018587	AAAGAT	2	12	180850	180861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279732
68	NC_018587	TGAAGT	2	12	185095	185106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404279733
69	NC_018587	CATTGA	2	12	193216	193227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279740
70	NC_018587	TGCAGC	2	12	193871	193882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404279741
71	NC_018587	TAAAAA	2	12	196109	196120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404279743
72	NC_018587	AATAAA	2	12	199116	199127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018587	AAAGCA	2	12	209325	209336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	404279755
74	NC_018587	TTCTTT	2	12	214129	214140	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	404279760
75	NC_018587	GAAAAA	2	12	216218	216229	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404279762
76	NC_018587	GAAAAA	2	12	217442	217453	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404279764
77	NC_018587	GCAAGT	2	12	223269	223280	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404279767
78	NC_018587	GAAAAC	2	12	226139	226150	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018587	TGTCGG	2	12	227189	227200	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404279770
80	NC_018587	AAAAAC	2	12	228674	228685	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404279771
81	NC_018587	GCAGAA	2	12	230218	230229	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404279772
82	NC_018587	TAAAAT	2	12	233530	233541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404279776
83	NC_018587	CCAGAA	2	12	234743	234754	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404279777
84	NC_018587	ATTCAA	2	12	237031	237042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018587	AAGGAA	2	12	238602	238613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018587	TAGGCG	2	12	240255	240266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018587	ATTCAA	2	12	243050	243061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018587	AAGGAA	2	12	244621	244632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018587	TAGGCG	2	12	246274	246285	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018587	AGTCAA	2	12	248088	248099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018587	TTTACC	2	12	248517	248528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	404279779
92	NC_018587	AGTAAA	2	12	255774	255785	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	404279785
93	NC_018587	GTACGT	2	12	256580	256591	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404279787
94	NC_018587	AAGTCG	2	12	261849	261860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404279792
95	NC_018587	TTATAT	2	12	262873	262884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018587	ACAGTA	2	12	263202	263213	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404279794
97	NC_018587	AAAACA	2	12	263577	263588	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	404279795
98	NC_018587	GCATGG	2	12	263758	263769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404279795
99	NC_018587	CTGTAG	2	12	266702	266713	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404279800
100	NC_018587	GACAAT	2	12	268214	268225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404279802
101	NC_018587	GTGAGC	2	12	268669	268680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404279802
102	NC_018587	ATTGAT	2	12	268863	268874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	404279802
103	NC_018587	TAAAAA	2	12	269932	269943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404279803
104	NC_018587	TGAATC	2	12	270717	270728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404279804
105	NC_018587	GCTACT	2	12	272409	272420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404279805
106	NC_018587	TTCTGA	2	12	275483	275494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404279807
107	NC_018587	AAGAAA	2	12	278699	278710	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	404279810
108	NC_018587	TTCGTG	2	12	284455	284466	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404279811
109	NC_018587	TAACAA	2	12	287761	287772	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	404279814
110	NC_018587	TTTAAC	2	12	288834	288845	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404279815
111	NC_018587	GTTGAG	2	12	290688	290699	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	404279816
112	NC_018587	ATTTTT	2	12	290961	290972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404279816
113	NC_018587	TTTATA	2	12	291504	291515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404279817
114	NC_018587	CCAAAT	2	12	293493	293504	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404279818
115	NC_018587	AGAACT	2	12	296103	296114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404279820
116	NC_018587	AACTTT	2	12	298583	298594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018587	TACAAG	2	12	300347	300358	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404279824
118	NC_018587	CGAAAT	2	12	300401	300412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404279824
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233	NC_018587	TTTGGT	2	12	599801	599812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404280114
234	NC_018587	TACGTT	2	12	603131	603142	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404280117
235	NC_018587	CGCAAC	2	12	613822	613833	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	404280130
236	NC_018587	AAATAA	2	12	614838	614849	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_018587	AGAATG	2	12	620677	620688	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	404280138
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239	NC_018587	GCACTT	2	12	622988	622999	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404280140
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244	NC_018587	CTGGAA	2	12	628584	628595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404280143
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251	NC_018587	AATTTC	2	12	643775	643786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404280156
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271	NC_018587	TTATTT	2	12	687717	687728	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	404280202
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