MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2540

Total Repeats: 1178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018586	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018586	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754084
3	NC_018586	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405754085
4	NC_018586	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405754085
5	NC_018586	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754085
6	NC_018586	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405754086
7	NC_018586	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018586	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018586	ATTTTC	2	12	19877	19888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405754094
10	NC_018586	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405754096
11	NC_018586	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405754096
12	NC_018586	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405754099
13	NC_018586	CCAAAA	2	12	35061	35072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754112
14	NC_018586	AATTAT	2	12	35675	35686	50 %	50 %	0 %	0 %	405754113
15	NC_018586	TCACCA	2	12	36822	36833	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405754115
16	NC_018586	CGATTA	2	12	42252	42263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754119
17	NC_018586	TTATGT	2	12	46744	46755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405754122
18	NC_018586	AAAGAT	2	12	50396	50407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754125
19	NC_018586	TGAAAT	2	12	51233	51244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405754126
20	NC_018586	TGGCGG	2	12	54365	54376	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405754130
21	NC_018586	TCAAAA	2	12	54485	54496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405754130
22	NC_018586	AAAAAT	2	12	56947	56958	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405754135
23	NC_018586	GCAGAA	2	12	60872	60883	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405754137
24	NC_018586	AGGTAA	2	12	60963	60974	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405754138
25	NC_018586	TGATTG	2	12	62351	62362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405754139
26	NC_018586	TGATTT	2	12	67682	67693	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405754144
27	NC_018586	TTTTGC	2	12	68287	68298	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405754145
28	NC_018586	AAATAA	2	12	78235	78246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405754154
29	NC_018586	TAAATT	2	12	81387	81398	50 %	50 %	0 %	0 %	405754158
30	NC_018586	ATTTAT	2	12	81561	81572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018586	GCTGTG	2	12	87086	87097	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018586	TGATAT	2	12	89768	89779	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405754169
33	NC_018586	CTTTTT	2	12	90866	90877	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405754170
34	NC_018586	ATCACT	2	12	93926	93937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405754173
35	NC_018586	GATATT	2	12	93985	93996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405754173
36	NC_018586	CAGATT	2	12	97502	97513	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754173
37	NC_018586	AACTAT	2	12	100278	100289	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405754174
38	NC_018586	AACCAG	2	12	105516	105527	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405754179
39	NC_018586	TATTAG	2	12	109809	109820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405754184
40	NC_018586	TAGCAG	2	12	109872	109883	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405754184
41	NC_018586	ATTACA	2	12	115933	115944	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405754192
42	NC_018586	TAAAAT	2	12	119657	119668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405754195
43	NC_018586	CAAAAT	2	12	119798	119809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405754195
44	NC_018586	CAAGCG	2	12	120799	120810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405754195
45	NC_018586	TGATTT	2	12	128581	128592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405754207
46	NC_018586	AAGTAA	2	12	132552	132563	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754210
47	NC_018586	CCGTTA	2	12	136059	136070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754217
48	NC_018586	CAGGTT	2	12	143384	143395	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018586	CAACTG	2	12	145806	145817	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405754227
50	NC_018586	TCTGAA	2	12	148788	148799	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754232
51	NC_018586	GTTGCA	2	12	154535	154546	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405754240
52	NC_018586	GATTGC	2	12	154597	154608	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405754240
53	NC_018586	AGGCGG	2	12	160246	160257	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	405754244
54	NC_018586	CGTAAC	2	12	162785	162796	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405754245
55	NC_018586	AGTACC	2	12	162830	162841	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405754245
56	NC_018586	GTTTTC	2	12	163806	163817	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405754246
57	NC_018586	GTTGAT	2	12	165422	165433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405754248
58	NC_018586	GTAAAA	2	12	165785	165796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754248
59	NC_018586	TTTTAC	2	12	167829	167840	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405754252
60	NC_018586	TTTTTA	2	12	168866	168877	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405754254
61	NC_018586	GCATTA	2	12	169096	169107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754254
62	NC_018586	AAAGTA	2	12	170078	170089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754255
63	NC_018586	ACACTT	2	12	170995	171006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018586	TTGCAC	2	12	172972	172983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754257
65	NC_018586	AGAAGT	2	12	175120	175131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405754258
66	NC_018586	CAATCC	2	12	177036	177047	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405754260
67	NC_018586	AAAGAT	2	12	179047	179058	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754262
68	NC_018586	TGAAGT	2	12	183292	183303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754263
69	NC_018586	CATTGA	2	12	191403	191414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754271
70	NC_018586	TGCAGC	2	12	192058	192069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405754272
71	NC_018586	TAAAAA	2	12	194296	194307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405754274
72	NC_018586	AATAAA	2	12	197303	197314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018586	AAAGCA	2	12	207512	207523	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405754286
74	NC_018586	TTCTTT	2	12	212211	212222	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405754292
75	NC_018586	GAAAAA	2	12	214300	214311	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405754294
76	NC_018586	GAAAAA	2	12	215524	215535	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405754296
77	NC_018586	GCAAGT	2	12	221351	221362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405754299
78	NC_018586	GAAAAC	2	12	224221	224232	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018586	TGTCGG	2	12	225271	225282	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	405754302
80	NC_018586	AAAAAC	2	12	226768	226779	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405754303
81	NC_018586	GCAGAA	2	12	228312	228323	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405754304
82	NC_018586	TAAAAT	2	12	231619	231630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405754311
83	NC_018586	CCAGAA	2	12	232832	232843	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405754312
84	NC_018586	ATTCAA	2	12	235121	235132	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018586	AAGGAA	2	12	236692	236703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018586	TAGGCG	2	12	238345	238356	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018586	ATTCAA	2	12	241140	241151	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018586	AAGGAA	2	12	242711	242722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018586	TAGGCG	2	12	244364	244375	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018586	AGTCAA	2	12	246178	246189	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018586	TTTACC	2	12	246607	246618	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405754314
92	NC_018586	AGTAAA	2	12	253864	253875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754320
93	NC_018586	AAGTCG	2	12	259939	259950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405754327
94	NC_018586	TTATAT	2	12	260963	260974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018586	ACAGTA	2	12	261292	261303	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405754329
96	NC_018586	AAAACA	2	12	261667	261678	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405754330
97	NC_018586	GCATGG	2	12	261848	261859	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405754330
98	NC_018586	CTGTAG	2	12	264792	264803	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405754335
99	NC_018586	GACAAT	2	12	266303	266314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405754337
100	NC_018586	GTGAGC	2	12	266758	266769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405754337
101	NC_018586	ATTGAT	2	12	266952	266963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405754337
102	NC_018586	TAAAAA	2	12	268022	268033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405754338
103	NC_018586	TGAATC	2	12	268807	268818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754339
104	NC_018586	GCTACT	2	12	270499	270510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754340
105	NC_018586	TTCTGA	2	12	273573	273584	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405754342
106	NC_018586	AAGAAA	2	12	276789	276800	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405754345
107	NC_018586	TTCGTG	2	12	282545	282556	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405754346
108	NC_018586	TAACAA	2	12	285851	285862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405754349
109	NC_018586	TTTAAC	2	12	286924	286935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405754350
110	NC_018586	GTTGAG	2	12	288778	288789	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405754351
111	NC_018586	ATTTTT	2	12	289051	289062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405754351
112	NC_018586	TTTATA	2	12	289595	289606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754352
113	NC_018586	CCAAAT	2	12	291584	291595	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405754353
114	NC_018586	AGAACT	2	12	294199	294210	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405754355
115	NC_018586	AACTTT	2	12	296679	296690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018586	TACAAG	2	12	298443	298454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405754359
117	NC_018586	CGAAAT	2	12	298497	298508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405754359
118	NC_018586	TAAAAA	2	12	302048	302059	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018586	CATTAT	2	12	302227	302238	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405754362
120	NC_018586	TCTTTT	2	12	302688	302699	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405754362
121	NC_018586	ATCAAT	2	12	305095	305106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405754364
122	NC_018586	ATGAAA	2	12	305453	305464	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754365
123	NC_018586	AATACA	2	12	306497	306508	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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158	NC_018586	GCCATC	2	12	382058	382069	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	405754433
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168	NC_018586	TTGTTT	2	12	423158	423169	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_018586	GGAAAA	2	12	558232	558243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754613
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214	NC_018586	GACGGC	2	12	563413	563424	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	405754618
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218	NC_018586	GCAACC	2	12	575857	575868	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	405754630
219	NC_018586	AATCAC	2	12	577160	577171	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405754631
220	NC_018586	TACAGT	2	12	579531	579542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754633
221	NC_018586	ATCCAG	2	12	581698	581709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405754635
222	NC_018586	AGAATT	2	12	583010	583021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405754636
223	NC_018586	TTTGGC	2	12	587528	587539	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405754640
224	NC_018586	TTTGGT	2	12	588233	588244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405754641
225	NC_018586	TACGTT	2	12	591564	591575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405754644
226	NC_018586	CGCAAC	2	12	602255	602266	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	405754657
227	NC_018586	AAATAA	2	12	603271	603282	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
228	NC_018586	AGAATG	2	12	609106	609117	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405754664
229	NC_018586	ACTTTT	2	12	610961	610972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405754665
230	NC_018586	GCACTT	2	12	611417	611428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754666
231	NC_018586	ATTCGT	3	18	611548	611565	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405754666
232	NC_018586	TGTTAG	2	12	611679	611690	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405754666
233	NC_018586	ATAAAG	2	12	613815	613826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405754667
234	NC_018586	ACTTGA	2	12	615226	615237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405754667
235	NC_018586	CTGGAA	2	12	617013	617024	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405754669
236	NC_018586	GCAACC	2	12	617177	617188	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	405754669
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238	NC_018586	ATTTTG	2	12	618349	618360	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405754670
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242	NC_018586	AATTTC	2	12	632203	632214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405754682
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456	NC_018586	GTCCAT	2	12	1232469	1232480	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405755302
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459	NC_018586	GAAACA	2	12	1239369	1239380	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405755317
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462	NC_018586	AGAAAC	2	12	1241962	1241973	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405755325
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496	NC_018586	CCAACA	2	12	1327393	1327404	50 %	0 %	0 %	50 %	405755420
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