MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2540

Total Repeats: 361

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018586	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018586	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018586	AAATG	2	10	24024	24033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018586	AAAGG	2	10	35585	35594	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018586	TTCTA	2	10	36079	36088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018586	GACTT	2	10	51381	51390	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018586	ATGGT	2	10	53632	53641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018586	AAATA	2	10	55688	55697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018586	TAAAA	2	10	56670	56679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018586	TTATG	2	10	58892	58901	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018586	AATAG	2	10	78960	78969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018586	ATAGC	2	10	80118	80127	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018586	AGTAG	2	10	82241	82250	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018586	AGTAA	2	10	82492	82501	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018586	ATTTT	2	10	92315	92324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018586	ATATC	2	10	112668	112677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018586	AGAGA	2	10	123494	123503	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018586	TTACT	2	10	124933	124942	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018586	AAAGT	2	10	127174	127183	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018586	AGTAG	2	10	148882	148891	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018586	ATAAA	2	10	150093	150102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018586	GATAA	2	10	152271	152280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018586	ATATG	2	10	159252	159261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018586	TTGTA	2	10	171008	171017	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018586	ATAGA	2	10	191702	191711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018586	TTGTC	2	10	197228	197237	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018586	ACAAA	2	10	197593	197602	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018586	ATATA	2	10	205338	205347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018586	GTGAG	2	10	209069	209078	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018586	GAGTG	2	10	213363	213372	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018586	AGCCG	2	10	221540	221549	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_018586	GAATA	2	10	233172	233181	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018586	AAATT	2	10	234858	234867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018586	TAATT	2	10	235059	235068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018586	TCGTG	2	10	236218	236227	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018586	AAGGT	2	10	237686	237695	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018586	TAATT	2	10	241078	241087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018586	TCGTG	2	10	242237	242246	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018586	AAGGT	2	10	243705	243714	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018586	GGCAT	2	10	260997	261006	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018586	AGTGA	2	10	283112	283121	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018586	AATTA	2	10	285270	285279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018586	TGGCT	2	10	295412	295421	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018586	ACTAA	2	10	296788	296797	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018586	TATAA	2	10	302014	302023	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018586	AAAGA	2	10	305242	305251	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018586	TTATT	2	10	327798	327807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018586	TAGAT	2	10	330225	330234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018586	AGTCT	2	10	343803	343812	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018586	ATTGT	2	10	355941	355950	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018586	TTTTA	2	10	365947	365956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018586	AGGAG	2	10	369335	369344	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018586	ATAGA	2	10	369639	369648	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018586	AAATG	2	10	378517	378526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018586	CACAC	2	10	379451	379460	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_018586	AAACT	2	10	379725	379734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018586	AAATT	2	10	380081	380090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018586	GTGAT	2	10	394731	394740	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018586	GAAAC	2	10	399862	399871	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018586	TTTGG	2	10	401642	401651	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018586	AAAAG	2	10	401709	401718	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018586	CAAAA	2	10	423130	423139	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018586	TAGAT	2	10	432356	432365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018586	AGGTG	2	10	454408	454417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018586	GGAAA	2	10	459533	459542	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018586	CTTAT	2	10	474030	474039	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018586	TTTAT	2	10	485080	485089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018586	TTTCT	2	10	489453	489462	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018586	ATACA	2	10	512049	512058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018586	ATAAA	2	10	526307	526316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018586	AAAAC	2	10	538316	538325	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018586	GTTTT	2	10	538338	538347	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018586	AAACA	2	10	540845	540854	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018586	TATAG	2	10	550647	550656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018586	GAAAA	2	10	554756	554765	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018586	TAGAC	2	10	570965	570974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018586	TAAAA	2	10	576894	576903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018586	CTATG	2	10	584339	584348	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018586	AAAGA	2	10	589793	589802	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018586	ATAAA	2	10	604765	604774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018586	AGAAT	2	10	605635	605644	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018586	TGGAA	2	10	605763	605772	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018586	AATCA	2	10	608763	608772	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018586	TATAA	2	10	616707	616716	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018586	ATTGA	2	10	616745	616754	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018586	ATTAA	2	10	630052	630061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018586	ATATA	2	10	661515	661524	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018586	ATCAA	2	10	671200	671209	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018586	ATTTT	2	10	671219	671228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018586	TAAAA	2	10	672273	672282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018586	GAAAT	2	10	694864	694873	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018586	TTACT	2	10	702888	702897	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018586	ATTTA	2	10	708540	708549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018586	GGGGA	2	10	718293	718302	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018586	TATTT	2	10	724531	724540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018586	AGAGA	2	10	724681	724690	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018586	CTTTT	2	10	725656	725665	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018586	CTTTT	2	10	775297	775306	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018586	TAGTT	2	10	775310	775319	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018586	TGAAA	2	10	794204	794213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018586	AATGA	2	10	811297	811306	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018586	AGTGA	2	10	811307	811316	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018586	GTATA	2	10	830817	830826	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018586	AATAA	2	10	835231	835240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018586	ATTTT	2	10	838817	838826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018586	GTTTT	2	10	851752	851761	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018586	AAATT	2	10	852829	852838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018586	AGGAA	2	10	853352	853361	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018586	GATGA	2	10	865442	865451	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018586	ATAGA	2	10	874140	874149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018586	ATCTT	2	10	875320	875329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018586	TAATT	2	10	879529	879538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018586	ATTTT	2	10	879796	879805	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018586	AATGT	2	10	887197	887206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018586	TTATA	2	10	910936	910945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018586	ATAAC	2	10	926928	926937	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018586	TTTTA	2	10	928393	928402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018586	ATAGA	2	10	932305	932314	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018586	TATAA	2	10	946566	946575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018586	TGAAA	2	10	956058	956067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018586	ATTTT	2	10	961516	961525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018586	TTTAT	2	10	961751	961760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018586	ATGAG	2	10	981527	981536	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018586	TTTTA	2	10	988658	988667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018586	TAAAA	2	10	988723	988732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018586	TATAA	2	10	1003194	1003203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018586	TCTAT	2	10	1015965	1015974	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018586	AGATA	2	10	1019653	1019662	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018586	GAGAG	2	10	1028586	1028595	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018586	AAATG	2	10	1033244	1033253	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018586	TTCTA	2	10	1033259	1033268	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018586	CAAAC	2	10	1033425	1033434	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018586	TTTTC	2	10	1037143	1037152	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018586	AGTTT	2	10	1047037	1047046	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018586	CAAAA	2	10	1049403	1049412	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018586	ACTAA	2	10	1049582	1049591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018586	TAGGA	2	10	1064030	1064039	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018586	GTTTT	2	10	1064040	1064049	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018586	TAAAC	2	10	1068054	1068063	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018586	CTTTT	2	10	1068538	1068547	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018586	AAAGC	2	10	1074469	1074478	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018586	TTATT	2	10	1074512	1074521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018586	AAGTT	2	10	1078214	1078223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018586	ATAAA	2	10	1078268	1078277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018586	GCTAT	2	10	1079140	1079149	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018586	TATAT	2	10	1081244	1081253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018586	TTAAT	2	10	1111918	1111927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.