MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2378

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018585	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018585	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018585	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018585	AATATA	2	12	81811	81822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018585	ATTTAT	2	12	87942	87953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018585	CAGGTT	2	12	151228	151239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018585	ACACTT	2	12	179119	179130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018585	AATAAA	2	12	205448	205459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018585	GAAAAC	2	12	232363	232374	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018585	ATTCAA	2	12	243257	243268	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018585	AAGGAA	2	12	244828	244839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018585	TAGGCG	2	12	246481	246492	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018585	ATTCAA	2	12	249276	249287	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018585	AAGGAA	2	12	250847	250858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018585	TAGGCG	2	12	252500	252511	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018585	AGTCAA	2	12	254314	254325	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018585	TTATAT	2	12	269099	269110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018585	AACTTT	2	12	304814	304825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018585	TAAAAA	2	12	310183	310194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018585	AATACA	2	12	314632	314643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018585	CATAGA	2	12	362960	362971	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018585	AAATTT	2	12	386536	386547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018585	TAGTTT	2	12	406467	406478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018585	TTGTTT	2	12	421973	421984	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018585	TAATTA	2	12	467803	467814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018585	AAGTCA	2	12	476386	476397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018585	TTTTTA	2	12	479228	479239	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018585	TTAAAT	2	12	519253	519264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018585	CTATAA	2	12	521023	521034	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018585	AAATGT	2	12	569846	569857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018585	AGATTT	2	12	577977	577988	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018585	AAATAA	2	12	618280	618291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018585	ATCATT	2	12	646634	646645	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018585	TGTAAA	2	12	668573	668584	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018585	ATCATT	2	12	688393	688404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018585	GAATAA	2	12	718118	718129	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018585	GTTTTA	2	12	723811	723822	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018585	TATAGG	2	12	741028	741039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018585	AATTAG	2	12	768475	768486	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018585	TGTTGA	2	12	779532	779543	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018585	TTACTT	2	12	854477	854488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018585	AAATAG	2	12	890880	890891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018585	GTAATC	2	12	897683	897694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018585	TTACAA	2	12	897701	897712	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018585	ATGAAA	2	12	906305	906316	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018585	TTGACT	2	12	1030242	1030253	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018585	AGGAAG	2	12	1040431	1040442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018585	AACAAT	2	12	1079434	1079445	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018585	CTTTTT	2	12	1095735	1095746	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018585	GTGCAT	2	12	1127430	1127441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018585	AATCCC	2	12	1134977	1134988	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018585	TTAATT	2	12	1136213	1136224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018585	AAATAA	2	12	1139224	1139235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018585	TTTAGT	2	12	1143101	1143112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018585	CTTTTT	2	12	1181480	1181491	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018585	TAGATA	2	12	1201009	1201020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018585	CTTTTT	2	12	1214284	1214295	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018585	GAAAAA	2	12	1244249	1244260	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018585	TATTAA	2	12	1276377	1276388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018585	GTACAA	2	12	1389672	1389683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018585	TAATCA	2	12	1423037	1423048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018585	TACCAA	2	12	1440970	1440981	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018585	TTTCAT	2	12	1467130	1467141	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018585	CTCTTC	2	12	1569816	1569827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018585	TCATTA	2	12	1606140	1606151	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018585	GAATAA	2	12	1622015	1622026	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018585	GTAAAC	2	12	1623166	1623177	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018585	ACAAAA	2	12	1631789	1631800	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018585	AAAATA	2	12	1636109	1636120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018585	TAAAAA	2	12	1637019	1637030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018585	CTTATT	2	12	1723010	1723021	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018585	CGCCTA	2	12	1726516	1726527	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018585	TTTCCT	2	12	1728168	1728179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018585	TTGAAT	2	12	1729740	1729751	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018585	CGCCTA	2	12	1831195	1831206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018585	TTTCCT	2	12	1832847	1832858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018585	TTGAAT	2	12	1834419	1834430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018585	AAATGG	2	12	1835403	1835414	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018585	GTTTTG	2	12	1842371	1842382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018585	AAAAGA	2	12	1925257	1925268	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018585	CTCTAT	2	12	1944581	1944592	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018585	TCATTT	2	12	1945779	1945790	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018585	GTTTTC	2	12	1972948	1972959	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018585	CAAAAA	2	12	1990672	1990683	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018585	GAAAAA	2	12	1994532	1994543	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018585	TTCACT	2	12	2144706	2144717	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018585	ATTCAA	2	12	2155436	2155447	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018585	TTTAAT	2	12	2191249	2191260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018585	TATATT	2	12	2218337	2218348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018585	AATTTT	2	12	2276303	2276314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018585	AAATTG	2	12	2282479	2282490	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018585	CTCTGT	2	12	2289324	2289335	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018585	ATAAAT	2	12	2312006	2312017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018585	TTATTT	2	12	2380107	2380118	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018585	TAATAC	2	12	2408852	2408863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018585	CGCCTA	2	12	2429647	2429658	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018585	TTTCCT	2	12	2431550	2431561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018585	TTGAAT	2	12	2433122	2433133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018585	CTTTTT	2	12	2584248	2584259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018585	ATCCCA	2	12	2604161	2604172	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018585	TTTTTA	2	12	2615988	2615999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018585	CGCCTA	2	12	2659481	2659492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018585	TTTCCT	2	12	2661384	2661395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018585	TTGAAT	2	12	2662956	2662967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018585	CCTCTT	2	12	2705418	2705429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018585	AGCTAG	2	12	2720413	2720424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018585	TAAATC	2	12	2732453	2732464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018585	TTTTTC	2	12	2789756	2789767	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018585	TATCAA	2	12	2880018	2880029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018585	AAATGA	2	12	2880032	2880043	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018585	TAAAAA	2	12	2880102	2880113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018585	AAGTAT	2	12	2880969	2880980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.