MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2378

Total Repeats: 1078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018585	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405751209
2	NC_018585	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405751210
3	NC_018585	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751210
4	NC_018585	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405751210
5	NC_018585	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405751211
6	NC_018585	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405751212
7	NC_018585	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	405751218
8	NC_018585	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405751218
9	NC_018585	ATTTTC	2	12	21959	21970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405751222
10	NC_018585	CTTCAT	2	12	22978	22989	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405751224
11	NC_018585	TTTTGG	2	12	23342	23353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405751224
12	NC_018585	ATTGAA	2	12	26991	27002	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405751227
13	NC_018585	CCAAAA	2	12	37142	37153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405751240
14	NC_018585	AATTAT	2	12	37756	37767	50 %	50 %	0 %	0 %	405751241
15	NC_018585	TCACCA	2	12	38903	38914	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405751243
16	NC_018585	CGATTA	2	12	44333	44344	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751247
17	NC_018585	TTATGT	2	12	48822	48833	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751250
18	NC_018585	AAAGAT	2	12	52474	52485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751253
19	NC_018585	TGAAAT	2	12	53311	53322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405751254
20	NC_018585	TGGCGG	2	12	56444	56455	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405751258
21	NC_018585	TCAAAA	2	12	56564	56575	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405751258
22	NC_018585	AAAAAT	2	12	59011	59022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405751263
23	NC_018585	GCAGAA	2	12	62936	62947	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405751266
24	NC_018585	AGGTAA	2	12	63027	63038	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405751267
25	NC_018585	TGATTG	2	12	64415	64426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405751268
26	NC_018585	TGATTT	2	12	69746	69757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751273
27	NC_018585	TTTTGC	2	12	70351	70362	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405751274
28	NC_018585	AAATAA	2	12	84616	84627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405751288
29	NC_018585	TAAATT	2	12	87768	87779	50 %	50 %	0 %	0 %	405751292
30	NC_018585	CTTTTT	2	12	97115	97126	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405751304
31	NC_018585	ATCACT	2	12	100175	100186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405751307
32	NC_018585	GATATT	2	12	100234	100245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405751307
33	NC_018585	CAGATT	2	12	103751	103762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751307
34	NC_018585	AACTAT	2	12	106527	106538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405751308
35	NC_018585	AACCAG	2	12	111765	111776	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405751313
36	NC_018585	TATTAG	2	12	116058	116069	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405751318
37	NC_018585	TAGCAG	2	12	116121	116132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405751318
38	NC_018585	TTATTT	2	12	119583	119594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405751322
39	NC_018585	ATTACA	2	12	123777	123788	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405751327
40	NC_018585	TAAAAT	2	12	127501	127512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405751330
41	NC_018585	CAAAAT	2	12	127642	127653	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405751330
42	NC_018585	CAAGCG	2	12	128643	128654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405751330
43	NC_018585	GTTTTA	2	12	134409	134420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751338
44	NC_018585	TGATTT	2	12	136425	136436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751342
45	NC_018585	AAGTAA	2	12	140396	140407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751345
46	NC_018585	CCGTTA	2	12	143903	143914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405751352
47	NC_018585	CAACTG	2	12	153649	153660	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405751361
48	NC_018585	TCTGAA	2	12	156630	156641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751367
49	NC_018585	GTTGCA	2	12	162377	162388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405751375
50	NC_018585	GATTGC	2	12	162439	162450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405751375
51	NC_018585	AGGCGG	2	12	168087	168098	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	405751379
52	NC_018585	CGTAAC	2	12	170908	170919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405751380
53	NC_018585	AGTACC	2	12	170953	170964	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405751380
54	NC_018585	GTTTTC	2	12	171930	171941	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405751381
55	NC_018585	GTTGAT	2	12	173546	173557	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405751383
56	NC_018585	GTAAAA	2	12	173909	173920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751383
57	NC_018585	TTTTAC	2	12	175953	175964	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405751387
58	NC_018585	TTTTTA	2	12	176990	177001	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405751389
59	NC_018585	GCATTA	2	12	177220	177231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751389
60	NC_018585	AAAGTA	2	12	178202	178213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751390
61	NC_018585	TTGCAC	2	12	181096	181107	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405751392
62	NC_018585	AGAAGT	2	12	183244	183255	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405751393
63	NC_018585	CAATCC	2	12	185160	185171	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405751395
64	NC_018585	AAAGAT	2	12	187171	187182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751397
65	NC_018585	TGAAGT	2	12	191416	191427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405751398
66	NC_018585	CATTGA	2	12	199549	199560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751406
67	NC_018585	TGCAGC	2	12	200204	200215	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405751407
68	NC_018585	TAAAAA	2	12	202442	202453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405751409
69	NC_018585	AAAGCA	2	12	215654	215665	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405751421
70	NC_018585	TTCTTT	2	12	220353	220364	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405751426
71	NC_018585	GAAAAA	2	12	222442	222453	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405751428
72	NC_018585	GAAAAA	2	12	223666	223677	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405751430
73	NC_018585	GCAAGT	2	12	229493	229504	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405751433
74	NC_018585	TGTCGG	2	12	233413	233424	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	405751436
75	NC_018585	AAAAAC	2	12	234898	234909	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405751437
76	NC_018585	GCAGAA	2	12	236442	236453	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405751438
77	NC_018585	TAAAAT	2	12	239755	239766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405751443
78	NC_018585	CCAGAA	2	12	240968	240979	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405751444
79	NC_018585	TTTACC	2	12	254743	254754	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405751446
80	NC_018585	AGTAAA	2	12	262000	262011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751452
81	NC_018585	GTACGT	2	12	262806	262817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405751454
82	NC_018585	AAGTCG	2	12	268075	268086	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405751459
83	NC_018585	ACAGTA	2	12	269428	269439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751461
84	NC_018585	AAAACA	2	12	269803	269814	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405751462
85	NC_018585	GCATGG	2	12	269984	269995	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405751462
86	NC_018585	CTGTAG	2	12	272928	272939	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405751467
87	NC_018585	GACAAT	2	12	274440	274451	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751469
88	NC_018585	GTGAGC	2	12	274895	274906	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405751469
89	NC_018585	ATTGAT	2	12	275089	275100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405751469
90	NC_018585	TAAAAA	2	12	276159	276170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405751470
91	NC_018585	TGAATC	2	12	276944	276955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751471
92	NC_018585	GCTACT	2	12	278636	278647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405751472
93	NC_018585	TTCTGA	2	12	281710	281721	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405751474
94	NC_018585	AAGAAA	2	12	284926	284937	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405751477
95	NC_018585	TTCGTG	2	12	290682	290693	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405751478
96	NC_018585	TAACAA	2	12	293987	293998	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405751481
97	NC_018585	TTTAAC	2	12	295060	295071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405751482
98	NC_018585	GTTGAG	2	12	296914	296925	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405751483
99	NC_018585	ATTTTT	2	12	297187	297198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405751483
100	NC_018585	TTTATA	2	12	297731	297742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405751484
101	NC_018585	CCAAAT	2	12	299720	299731	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405751486
102	NC_018585	AGAACT	2	12	302334	302345	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751488
103	NC_018585	TACAAG	2	12	306578	306589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751492
104	NC_018585	CGAAAT	2	12	306632	306643	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751492
105	NC_018585	CATTAT	2	12	310362	310373	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405751495
106	NC_018585	TCTTTT	2	12	310823	310834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405751495
107	NC_018585	ATCAAT	2	12	313230	313241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405751497
108	NC_018585	ATGAAA	2	12	313588	313599	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751498
109	NC_018585	GCTTTT	2	12	314931	314942	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405751500
110	NC_018585	CTTTTA	2	12	315460	315471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405751500
111	NC_018585	TAGAAA	2	12	316406	316417	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751501
112	NC_018585	ACGTTG	2	12	318335	318346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405751503
113	NC_018585	GAAAAC	2	12	320242	320253	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405751504
114	NC_018585	TTTTGA	2	12	325904	325915	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751511
115	NC_018585	GAAGGG	2	12	331006	331017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405751515
116	NC_018585	AGAACC	2	12	334040	334051	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405751518
117	NC_018585	GATTCA	2	12	334647	334658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751518
118	NC_018585	GCAATT	2	12	334677	334688	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751518
119	NC_018585	TCTGTT	2	12	339586	339597	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405751523
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122	NC_018585	TTTCTG	2	12	345145	345156	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405751529
123	NC_018585	CTGGTT	2	12	355053	355064	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405751537
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130	NC_018585	CGCCAG	2	12	375146	375157	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	405751551
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220	NC_018585	GGCTGG	2	12	645646	645657	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405751824
221	NC_018585	AATTTC	2	12	647208	647219	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405751826
222	NC_018585	GGTCCA	2	12	654721	654732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405751836
223	NC_018585	AGATGC	2	12	656724	656735	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405751837
224	NC_018585	GTCAAA	2	12	659872	659883	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751840
225	NC_018585	GAAAAA	2	12	660051	660062	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405751840
226	NC_018585	AAAAGA	2	12	660214	660225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405751841
227	NC_018585	TGCTGG	2	12	660622	660633	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	405751841
228	NC_018585	CTGTTT	2	12	664258	664269	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405751845
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346	NC_018585	TTACTT	2	12	1006791	1006802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405752195
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456	NC_018585	GAAAAA	2	12	1333961	1333972	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405752540
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