MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2378

Total Repeats: 365

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018585	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018585	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018585	AAATG	2	10	26107	26116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018585	AAAGG	2	10	37666	37675	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018585	CTATT	2	10	38162	38171	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018585	GACTT	2	10	53459	53468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018585	ATGGT	2	10	55711	55720	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018585	AAATA	2	10	57767	57776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018585	TAAAA	2	10	58749	58758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018585	TTATG	2	10	60956	60965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018585	AAATG	2	10	82805	82814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018585	AATAG	2	10	85341	85350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018585	ATAGC	2	10	86499	86508	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018585	AGTAG	2	10	88622	88631	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018585	AGTAA	2	10	88873	88882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018585	ATTTT	2	10	98564	98573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018585	ATATC	2	10	120512	120521	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018585	AGAGA	2	10	131338	131347	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018585	TTACT	2	10	132777	132786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018585	AAAGT	2	10	135018	135027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018585	AGTAG	2	10	156724	156733	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018585	ATAAA	2	10	157935	157944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018585	GATAA	2	10	160113	160122	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018585	ATATG	2	10	167093	167102	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018585	TTGTA	2	10	179132	179141	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018585	ATAGA	2	10	199848	199857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018585	TTGTC	2	10	205373	205382	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018585	ACAAA	2	10	205738	205747	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018585	ATATA	2	10	213480	213489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018585	GTGAG	2	10	217211	217220	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018585	ATTTA	2	10	218273	218282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018585	GAGTG	2	10	221505	221514	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018585	AGCCG	2	10	229682	229691	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_018585	GAAAA	2	10	237811	237820	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018585	GAAAA	2	10	238220	238229	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018585	GAATA	2	10	241308	241317	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018585	AAATT	2	10	242994	243003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018585	TAATT	2	10	243195	243204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018585	TCGTG	2	10	244354	244363	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018585	AAGGT	2	10	245822	245831	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018585	TAATT	2	10	249214	249223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018585	TCGTG	2	10	250373	250382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018585	AAGGT	2	10	251841	251850	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018585	AGTGA	2	10	291249	291258	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018585	AATTA	2	10	293407	293416	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018585	TGGCT	2	10	303547	303556	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018585	ACTAA	2	10	304923	304932	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018585	TATAA	2	10	310149	310158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018585	AAAGA	2	10	313377	313386	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018585	TTATT	2	10	335933	335942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018585	TAGAT	2	10	338360	338369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018585	TTTAT	2	10	348538	348547	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018585	TAAAA	2	10	351711	351720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018585	AATAA	2	10	360900	360909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018585	ATTGT	2	10	362258	362267	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018585	TTTTA	2	10	372265	372274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018585	AGGAG	2	10	375896	375905	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018585	ATAGA	2	10	376199	376208	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018585	AAATG	2	10	385077	385086	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018585	CACAC	2	10	386011	386020	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_018585	AAACT	2	10	386285	386294	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018585	AAATT	2	10	386641	386650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018585	GTGAT	2	10	401291	401300	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018585	GAAAC	2	10	406423	406432	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018585	TGGTT	2	10	414713	414722	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018585	CAAAA	2	10	421945	421954	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018585	TAGAT	2	10	431172	431181	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018585	AGGTG	2	10	453223	453232	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018585	GGAAA	2	10	458349	458358	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018585	AAGTT	2	10	480648	480657	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018585	AACAT	2	10	484671	484680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018585	CTTAT	2	10	489936	489945	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018585	TTTAT	2	10	500264	500273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018585	TTTCT	2	10	504637	504646	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018585	TAATC	2	10	512108	512117	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018585	GGTTC	2	10	517588	517597	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018585	AATTT	2	10	519100	519109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018585	ATAGT	2	10	519135	519144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018585	ATAGT	2	10	521354	521363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018585	TTATT	2	10	523233	523242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018585	CTATG	2	10	523399	523408	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018585	ATACA	2	10	528494	528503	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018585	AAAAC	2	10	553324	553333	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018585	GTTTT	2	10	553346	553355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018585	AAACA	2	10	555852	555861	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018585	TATAG	2	10	565655	565664	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018585	GAAAA	2	10	569765	569774	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018585	TAGAC	2	10	585974	585983	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018585	TAAAA	2	10	591903	591912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018585	CTATG	2	10	599348	599357	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018585	AAAGA	2	10	604802	604811	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018585	ATAAA	2	10	619774	619783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018585	AGAAT	2	10	620644	620653	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018585	TGGAA	2	10	620772	620781	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018585	AATCA	2	10	623774	623783	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018585	TATAA	2	10	631712	631721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018585	ATTGA	2	10	631750	631759	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018585	ATTAA	2	10	645058	645067	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018585	ATATA	2	10	676506	676515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018585	ATTTT	2	10	684737	684746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018585	TACAT	2	10	685174	685183	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018585	TATAA	2	10	686228	686237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018585	GAAAT	2	10	710057	710066	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018585	TTACT	2	10	718080	718089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018585	ATTTA	2	10	723732	723741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018585	GGGGA	2	10	733485	733494	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018585	TATTT	2	10	739723	739732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018585	AGAGA	2	10	739873	739882	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018585	CTTTT	2	10	740848	740857	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018585	CTTTT	2	10	790492	790501	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018585	TAGTT	2	10	790505	790514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018585	TGAAA	2	10	802687	802696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018585	AATGA	2	10	819782	819791	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018585	GTATA	2	10	839298	839307	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018585	AATAA	2	10	845736	845745	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018585	ATTTT	2	10	849322	849331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018585	GTTTT	2	10	862258	862267	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018585	AAATT	2	10	863335	863344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018585	AGGAA	2	10	863858	863867	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018585	GATGA	2	10	875949	875958	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018585	ATAGA	2	10	884610	884619	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018585	ATCTT	2	10	885790	885799	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018585	TAATT	2	10	889999	890008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018585	ATTTT	2	10	890266	890275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018585	AATGT	2	10	897667	897676	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018585	TTATA	2	10	921405	921414	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018585	ATAAC	2	10	937396	937405	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018585	TTTTA	2	10	938863	938872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018585	ATAGA	2	10	942775	942784	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018585	TATAA	2	10	957035	957044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018585	TGAAA	2	10	966527	966536	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018585	TTTTA	2	10	972863	972872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018585	TTTAT	2	10	973155	973164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018585	ATGAG	2	10	992932	992941	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018585	TTTTA	2	10	1000063	1000072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018585	TAAAA	2	10	1000128	1000137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018585	TATAA	2	10	1014598	1014607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018585	TCTAT	2	10	1027369	1027378	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_018585	AGATA	2	10	1031056	1031065	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018585	GAGAG	2	10	1039999	1040008	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018585	AAATG	2	10	1044657	1044666	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018585	TTCTA	2	10	1044672	1044681	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018585	CAAAC	2	10	1044838	1044847	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_018585	TTTTC	2	10	1048557	1048566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018585	AGTTT	2	10	1058452	1058461	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018585	CAAAA	2	10	1060818	1060827	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018585	ACTAA	2	10	1060997	1061006	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_018585	TTATG	2	10	2302888	2302897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018585	TGAAA	2	10	2313700	2313709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018585	TATAT	2	10	2316743	2316752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018585	ATTTT	2	10	2318934	2318943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_018585	CTATA	2	10	2408792	2408801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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329	NC_018585	TTATA	2	10	2653623	2653632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_018585	TTTTA	2	10	2654038	2654047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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334	NC_018585	GCATG	2	10	2662746	2662755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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342	NC_018585	TTAGA	2	10	2695445	2695454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
343	NC_018585	ATTTT	2	10	2695540	2695549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.