MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes ATCC 19117

Total Repeats: 1187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018584	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018584	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405748340
3	NC_018584	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405748341
4	NC_018584	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405748341
5	NC_018584	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405748341
6	NC_018584	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405748342
7	NC_018584	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405748343
8	NC_018584	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018584	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018584	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	405748348
11	NC_018584	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405748348
12	NC_018584	ATTTTC	2	12	21960	21971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405748353
13	NC_018584	CTTCAT	2	12	22976	22987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405748355
14	NC_018584	TTTTGG	2	12	23340	23351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405748355
15	NC_018584	ATTGAA	2	12	26989	27000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405748358
16	NC_018584	CCAAAA	2	12	37141	37152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405748370
17	NC_018584	AATTAT	2	12	37755	37766	50 %	50 %	0 %	0 %	405748371
18	NC_018584	TCACCA	2	12	38901	38912	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405748373
19	NC_018584	CGATTA	2	12	44331	44342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748377
20	NC_018584	TTATGT	2	12	48823	48834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405748380
21	NC_018584	AAAGAT	2	12	52475	52486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748383
22	NC_018584	TGAAAT	2	12	53312	53323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405748384
23	NC_018584	TGGCGG	2	12	56445	56456	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405748388
24	NC_018584	TCAAAA	2	12	56565	56576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405748388
25	NC_018584	AAAAAT	2	12	59012	59023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405748393
26	NC_018584	GCAGAA	2	12	62937	62948	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405748395
27	NC_018584	AGGTAA	2	12	63028	63039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405748396
28	NC_018584	TGATTG	2	12	64416	64427	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405748397
29	NC_018584	TGATTT	2	12	69747	69758	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405748402
30	NC_018584	TTTTGC	2	12	70352	70363	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405748403
31	NC_018584	AAAATA	2	12	79384	79395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405748412
32	NC_018584	CTTTTT	2	12	94918	94929	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405748432
33	NC_018584	ATCACT	2	12	97978	97989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405748435
34	NC_018584	GATATT	2	12	98037	98048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405748435
35	NC_018584	CAGATT	2	12	101554	101565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748435
36	NC_018584	AACTAT	2	12	104330	104341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405748436
37	NC_018584	AACCAG	2	12	109568	109579	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405748441
38	NC_018584	TATTAG	2	12	113861	113872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405748446
39	NC_018584	TAGCAG	2	12	113924	113935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405748446
40	NC_018584	ATTACA	2	12	121592	121603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405748455
41	NC_018584	TAAAAT	2	12	125316	125327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405748459
42	NC_018584	CAAAAT	2	12	125457	125468	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405748459
43	NC_018584	CAAGCG	2	12	126458	126469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405748459
44	NC_018584	TGATTT	2	12	134240	134251	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405748471
45	NC_018584	AAGTAA	2	12	138211	138222	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748474
46	NC_018584	CCGTTA	2	12	141718	141729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405748481
47	NC_018584	CAGGTT	2	12	149043	149054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018584	CAACTG	2	12	151465	151476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405748490
49	NC_018584	TCTGAA	2	12	154447	154458	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748495
50	NC_018584	GTTGCA	2	12	160194	160205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405748503
51	NC_018584	GATTGC	2	12	160256	160267	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405748503
52	NC_018584	AGGCGG	2	12	165904	165915	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	405748507
53	NC_018584	CGTAAC	2	12	168740	168751	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405748508
54	NC_018584	AGTACC	2	12	168785	168796	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405748508
55	NC_018584	GTTTTC	2	12	169771	169782	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405748509
56	NC_018584	GTTGAT	2	12	171387	171398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405748511
57	NC_018584	GTAAAA	2	12	171750	171761	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748511
58	NC_018584	TTTTAC	2	12	173794	173805	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405748515
59	NC_018584	TTTTTA	2	12	174831	174842	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405748517
60	NC_018584	GCATTA	2	12	175061	175072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748517
61	NC_018584	AAAGTA	2	12	176043	176054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748518
62	NC_018584	ACACTT	2	12	176960	176971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018584	TTGCAC	2	12	178937	178948	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405748520
64	NC_018584	AGAAGT	2	12	181085	181096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405748521
65	NC_018584	CAATCC	2	12	183002	183013	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405748523
66	NC_018584	AAAGAT	2	12	185013	185024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748525
67	NC_018584	TGAAGT	2	12	189258	189269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405748526
68	NC_018584	CATTGA	2	12	197382	197393	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748533
69	NC_018584	TGCAGC	2	12	198037	198048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405748534
70	NC_018584	TAAAAA	2	12	200275	200286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405748536
71	NC_018584	AATAAA	2	12	203282	203293	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018584	AAAGCA	2	12	213065	213076	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405748547
73	NC_018584	TTCTTT	2	12	217869	217880	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405748552
74	NC_018584	GAAAAA	2	12	219958	219969	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405748554
75	NC_018584	GAAAAA	2	12	221182	221193	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405748556
76	NC_018584	GCAAGT	2	12	227009	227020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405748559
77	NC_018584	GAAAAC	2	12	229879	229890	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018584	TGTCGG	2	12	230929	230940	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	405748562
79	NC_018584	AAAAAC	2	12	232402	232413	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405748563
80	NC_018584	GCAGAA	2	12	233946	233957	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405748564
81	NC_018584	TAAAAT	2	12	237258	237269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405748569
82	NC_018584	CCAGAA	2	12	238471	238482	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405748570
83	NC_018584	ATTCAA	2	12	240759	240770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018584	AAGGAA	2	12	242330	242341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018584	TAGGCG	2	12	243983	243994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018584	ATTCAA	2	12	246778	246789	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018584	AAGGAA	2	12	248349	248360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018584	TAGGCG	2	12	250002	250013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018584	AGTCAA	2	12	251816	251827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018584	TTTACC	2	12	252245	252256	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405748572
91	NC_018584	AGTAAA	2	12	259502	259513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748578
92	NC_018584	GTACGT	2	12	260308	260319	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405748580
93	NC_018584	TTATAT	2	12	266602	266613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018584	ACAGTA	2	12	266931	266942	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405748587
95	NC_018584	AAAACA	2	12	267306	267317	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405748588
96	NC_018584	GCATGG	2	12	267487	267498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405748588
97	NC_018584	CTGTAG	2	12	270431	270442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405748593
98	NC_018584	GACAAT	2	12	271942	271953	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405748595
99	NC_018584	GTGAGC	2	12	272397	272408	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405748595
100	NC_018584	ATTGAT	2	12	272591	272602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405748595
101	NC_018584	TAAAAA	2	12	273661	273672	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405748596
102	NC_018584	TGAATC	2	12	274446	274457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748597
103	NC_018584	GCTACT	2	12	276138	276149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405748598
104	NC_018584	TTCTGA	2	12	279212	279223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405748600
105	NC_018584	AAGAAA	2	12	282428	282439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405748603
106	NC_018584	TTCGTG	2	12	288184	288195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405748604
107	NC_018584	TAACAA	2	12	291490	291501	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405748607
108	NC_018584	TTTAAC	2	12	292563	292574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405748608
109	NC_018584	GTTGAG	2	12	294417	294428	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405748609
110	NC_018584	ATTTTT	2	12	294690	294701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405748609
111	NC_018584	TTTATA	2	12	295234	295245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405748610
112	NC_018584	CCAAAT	2	12	297223	297234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405748612
113	NC_018584	AGAACT	2	12	299836	299847	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405748615
114	NC_018584	AACTTT	2	12	302316	302327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018584	TACAAG	2	12	304080	304091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405748619
116	NC_018584	CGAAAT	2	12	304134	304145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405748619
117	NC_018584	TAAAAA	2	12	307685	307696	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018584	CATTAT	2	12	307864	307875	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405748622
119	NC_018584	TCTTTT	2	12	308325	308336	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405748622
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121	NC_018584	ATGAAA	2	12	311090	311101	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405748625
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227	NC_018584	GGAAAA	2	12	587632	587643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405748894
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230	NC_018584	AGATTT	2	12	592368	592379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
231	NC_018584	GACGGC	2	12	592813	592824	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	405748899
232	NC_018584	CGCACT	2	12	593625	593636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	405748899
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234	NC_018584	TTTTTC	2	12	602060	602071	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405748906
235	NC_018584	GCAACC	2	12	605257	605268	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	405748911
236	NC_018584	AATCAC	2	12	606560	606571	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405748912
237	NC_018584	TACAGT	2	12	608931	608942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748914
238	NC_018584	ATCCAG	2	12	611098	611109	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405748916
239	NC_018584	AGAATT	2	12	612410	612421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405748917
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241	NC_018584	TTTGGT	2	12	617633	617644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405748922
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245	NC_018584	AGAATG	2	12	638508	638519	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405748945
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250	NC_018584	ACTTGA	2	12	644622	644633	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405748948
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269	NC_018584	GGTTGC	2	12	685794	685805	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	405748993
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339	NC_018584	AAAACC	2	12	870788	870799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405749182
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341	NC_018584	ATTTTA	2	12	882403	882414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405749190
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343	NC_018584	GGAGAA	2	12	892206	892217	50 %	0 %	50 %	0 %	405749195
344	NC_018584	TGTAAC	2	12	895031	895042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405749195
345	NC_018584	TTATCT	2	12	902612	902623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405749202
346	NC_018584	AAATAG	2	12	904185	904196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
347	NC_018584	GCGGAA	2	12	908378	908389	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	405749209
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459	NC_018584	CTTTTT	2	12	1192361	1192372	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
460	NC_018584	GCAAAC	2	12	1198828	1198839	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405749516
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