MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes ATCC 19117

Total Repeats: 346

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018584	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018584	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018584	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018584	GAAAA	2	10	36437	36446	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018584	AGATA	2	10	36694	36703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018584	AAAGG	2	10	37665	37674	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018584	TTCTA	2	10	38158	38167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018584	GACTT	2	10	53460	53469	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018584	ATGGT	2	10	55712	55721	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018584	AAATA	2	10	57768	57777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018584	TAAAA	2	10	58750	58759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018584	TTATG	2	10	60957	60966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018584	AGTAG	2	10	81172	81181	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018584	TAAAA	2	10	86817	86826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018584	TAGTG	2	10	87098	87107	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018584	ATTTT	2	10	96367	96376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018584	ATATC	2	10	118327	118336	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018584	AGAGA	2	10	129153	129162	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018584	TTACT	2	10	130592	130601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018584	AGTAG	2	10	154541	154550	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018584	ATAAA	2	10	155752	155761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018584	GATAA	2	10	157930	157939	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018584	ATATG	2	10	164910	164919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018584	TTGTA	2	10	176973	176982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018584	ATAGA	2	10	197681	197690	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018584	TTGTC	2	10	203207	203216	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018584	ACAAA	2	10	203572	203581	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018584	ATATA	2	10	210891	210900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018584	GTGAG	2	10	214727	214736	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018584	ATTTA	2	10	215789	215798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018584	GAGTG	2	10	219021	219030	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018584	AGCCG	2	10	227198	227207	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_018584	GAAAA	2	10	235723	235732	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018584	GAATA	2	10	238811	238820	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018584	AAATT	2	10	240496	240505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018584	TAATT	2	10	240697	240706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018584	TCGTG	2	10	241856	241865	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018584	AAGGT	2	10	243324	243333	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018584	TAATT	2	10	246716	246725	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018584	TCGTG	2	10	247875	247884	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018584	AAGGT	2	10	249343	249352	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018584	GGCAT	2	10	266636	266645	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018584	AGTGA	2	10	288751	288760	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018584	AATTA	2	10	290909	290918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018584	TGGCT	2	10	301049	301058	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018584	ACTAA	2	10	302425	302434	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018584	TATAA	2	10	307651	307660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018584	AAAGA	2	10	310879	310888	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018584	TTATT	2	10	333435	333444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018584	TAGAT	2	10	335862	335871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018584	AATAA	2	10	369032	369041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018584	ATTGT	2	10	370390	370399	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018584	TTTTA	2	10	380397	380406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018584	AGGAG	2	10	384028	384037	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018584	ATAGA	2	10	384332	384341	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018584	TATAC	2	10	394830	394839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018584	GTGAT	2	10	413649	413658	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018584	GAAAC	2	10	418780	418789	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018584	CAAAA	2	10	434302	434311	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018584	TAGAT	2	10	443529	443538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018584	AGGTG	2	10	465581	465590	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018584	GGAAA	2	10	470707	470716	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018584	AAGTT	2	10	493006	493015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018584	AACAT	2	10	497029	497038	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018584	CTTAT	2	10	502294	502303	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018584	TTTAT	2	10	512622	512631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018584	TTTCT	2	10	516995	517004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018584	AATTT	2	10	531154	531163	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018584	ATAGT	2	10	531189	531198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018584	ATAGT	2	10	533408	533417	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018584	TTATT	2	10	535254	535263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018584	CTATG	2	10	535420	535429	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018584	CGAGG	2	10	537644	537653	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018584	ATACA	2	10	541339	541348	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018584	AAAAC	2	10	566169	566178	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018584	GTTTT	2	10	566191	566200	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018584	AAACA	2	10	568697	568706	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018584	TATAG	2	10	580046	580055	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018584	GAAAA	2	10	584156	584165	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018584	TAGAC	2	10	600365	600374	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018584	TAAAA	2	10	606294	606303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018584	CTATG	2	10	613739	613748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018584	AAAGA	2	10	619193	619202	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018584	ATAAA	2	10	634164	634173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018584	AGAAT	2	10	635034	635043	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018584	TGGAA	2	10	635162	635171	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018584	AATCA	2	10	638165	638174	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018584	TATAA	2	10	646103	646112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018584	ATTGA	2	10	646141	646150	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018584	ATTAA	2	10	659449	659458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018584	ATATA	2	10	690919	690928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018584	ATTTT	2	10	699149	699158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018584	TACAT	2	10	699586	699595	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018584	TATAA	2	10	700640	700649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018584	GAAAT	2	10	721810	721819	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018584	TTACT	2	10	729833	729842	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018584	ATTTA	2	10	735485	735494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018584	GGGGA	2	10	745238	745247	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018584	TATTT	2	10	751476	751485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018584	AGAGA	2	10	751626	751635	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018584	CTTTT	2	10	752601	752610	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018584	CTTTT	2	10	803799	803808	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018584	TAGTT	2	10	803812	803821	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018584	TGAAA	2	10	815994	816003	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018584	AATGA	2	10	833089	833098	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018584	GTATA	2	10	852606	852615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018584	AATAA	2	10	859044	859053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018584	ATTTT	2	10	862630	862639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018584	GTTTT	2	10	875564	875573	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018584	AAATT	2	10	876641	876650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018584	AGGAA	2	10	877164	877173	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018584	GATGA	2	10	889255	889264	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018584	ATAGA	2	10	897916	897925	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018584	ATCTT	2	10	899096	899105	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018584	TAATT	2	10	903305	903314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018584	ATTTT	2	10	903572	903581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018584	AATGT	2	10	910972	910981	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018584	TTATA	2	10	934710	934719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018584	ATAAC	2	10	950701	950710	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018584	TTTTA	2	10	952167	952176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018584	ATAGA	2	10	956079	956088	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018584	TATAA	2	10	970340	970349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018584	TGAAA	2	10	981382	981391	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018584	TTTTA	2	10	987718	987727	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018584	TTTAT	2	10	988010	988019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018584	TTTTA	2	10	1014916	1014925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018584	TAAAA	2	10	1014981	1014990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018584	TATAA	2	10	1029453	1029462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018584	TCTAT	2	10	1042224	1042233	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018584	AGATA	2	10	1045912	1045921	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018584	GAGAG	2	10	1054854	1054863	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018584	AAATG	2	10	1059512	1059521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018584	TTCTA	2	10	1059527	1059536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018584	CAAAC	2	10	1059693	1059702	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_018584	TTTTC	2	10	1063412	1063421	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018584	AGTTT	2	10	1073307	1073316	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018584	CAAAA	2	10	1075673	1075682	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018584	ACTAA	2	10	1075852	1075861	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_018584	TAGGA	2	10	1090300	1090309	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018584	GTTTT	2	10	1090310	1090319	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018584	TAAAC	2	10	1094324	1094333	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018584	CTTTT	2	10	1094808	1094817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018584	AAAGC	2	10	1100739	1100748	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018584	TTATT	2	10	1100782	1100791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018584	AAGTT	2	10	1104484	1104493	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018584	ATAAA	2	10	1104538	1104547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018584	GCTAT	2	10	1105410	1105419	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_018584	ATTTA	2	10	1282295	1282304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_018584	TCTAT	2	10	1630334	1630343	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_018584	TTACC	2	10	2441747	2441756	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
286	NC_018584	CACGA	2	10	2443468	2443477	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_018584	AATTA	2	10	2444625	2444634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018584	AAGTT	2	10	2464952	2464961	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018584	AATTT	2	10	2484248	2484257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018584	TTATG	2	10	2489579	2489588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_018584	AAACA	2	10	2491796	2491805	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_018584	CTCAT	2	10	2495483	2495492	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
293	NC_018584	TATTT	2	10	2501061	2501070	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_018584	TCCTC	2	10	2505460	2505469	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
295	NC_018584	ATAAG	2	10	2515507	2515516	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_018584	GTTTT	2	10	2524092	2524101	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_018584	TCAAA	2	10	2542945	2542954	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
298	NC_018584	TTTTA	2	10	2555624	2555633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_018584	CTTTT	2	10	2561771	2561780	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_018584	AGCAA	2	10	2582766	2582775	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
301	NC_018584	GGAAA	2	10	2584921	2584930	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
302	NC_018584	ATCTT	2	10	2592887	2592896	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
303	NC_018584	TATCA	2	10	2595637	2595646	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
304	NC_018584	TACCA	2	10	2597087	2597096	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
305	NC_018584	AAACA	2	10	2608110	2608119	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
306	NC_018584	GCTTT	2	10	2610109	2610118	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
307	NC_018584	ATAAA	2	10	2610122	2610131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_018584	GTTTG	2	10	2627932	2627941	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
309	NC_018584	GAAAG	2	10	2639787	2639796	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
310	NC_018584	AAATA	2	10	2653620	2653629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_018584	AAGTC	2	10	2653649	2653658	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
312	NC_018584	TTTAT	2	10	2653659	2653668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_018584	AAAAG	2	10	2654450	2654459	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
314	NC_018584	ATTAT	2	10	2656819	2656828	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_018584	ATCAT	2	10	2665986	2665995	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
316	NC_018584	TTATA	2	10	2677927	2677936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_018584	TTTTA	2	10	2678342	2678351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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320	NC_018584	CACGA	2	10	2686165	2686174	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
321	NC_018584	AATTA	2	10	2687324	2687333	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_018584	TCGTT	2	10	2691707	2691716	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
323	NC_018584	CAAGG	2	10	2691753	2691762	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
324	NC_018584	GAAAA	2	10	2691784	2691793	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
325	NC_018584	AAACT	2	10	2703738	2703747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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327	NC_018584	TACAA	2	10	2719537	2719546	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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329	NC_018584	ATTTT	2	10	2719853	2719862	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_018584	TAAAA	2	10	2738649	2738658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_018584	ATAAA	2	10	2767061	2767070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_018584	ATTAA	2	10	2777845	2777854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_018584	TTTCC	2	10	2779067	2779076	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
334	NC_018584	TAAAA	2	10	2786009	2786018	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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337	NC_018584	GGCTA	2	10	2795278	2795287	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
338	NC_018584	TTGGA	2	10	2804173	2804182	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
339	NC_018584	TATAG	2	10	2810361	2810370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
340	NC_018584	TATAT	2	10	2828441	2828450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_018584	CTTAA	2	10	2872587	2872596	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
342	NC_018584	TTTTA	2	10	2874088	2874097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_018584	TAAAA	2	10	2886377	2886386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_018584	GGTTT	2	10	2895702	2895711	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
345	NC_018584	CACTC	2	10	2907597	2907606	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
346	NC_018584	TATCA	2	10	2951104	2951113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.