MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT3

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018583	CCAGA	2	10	1458	1467	40 %	0 %	20 %	40 %	404217373
2	NC_018583	CGATC	2	10	4307	4316	20 %	20 %	20 %	40 %	404217376
3	NC_018583	TCACC	2	10	6729	6738	20 %	20 %	0 %	60 %	404217379
4	NC_018583	CCCCG	2	10	6765	6774	0 %	0 %	20 %	80 %	404217379
5	NC_018583	GCACC	2	10	6796	6805	20 %	0 %	20 %	60 %	404217379
6	NC_018583	GCCCC	2	10	7199	7208	0 %	0 %	20 %	80 %	404217379
7	NC_018583	GCGAA	2	10	7320	7329	40 %	0 %	40 %	20 %	404217379
8	NC_018583	CCCGA	2	10	7727	7736	20 %	0 %	20 %	60 %	404217379
9	NC_018583	GCTGG	2	10	9588	9597	0 %	20 %	60 %	20 %	404217380
10	NC_018583	ACCAC	2	10	9847	9856	40 %	0 %	0 %	60 %	404217380
11	NC_018583	CGGAT	2	10	13135	13144	20 %	20 %	40 %	20 %	404217383
12	NC_018583	CGCAG	2	10	14461	14470	20 %	0 %	40 %	40 %	404217384
13	NC_018583	ACACC	2	10	14555	14564	40 %	0 %	0 %	60 %	404217384
14	NC_018583	CCGAC	2	10	15679	15688	20 %	0 %	20 %	60 %	404217385
15	NC_018583	ACGGC	2	10	15996	16005	20 %	0 %	40 %	40 %	404217385
16	NC_018583	GCGCC	2	10	16123	16132	0 %	0 %	40 %	60 %	404217385
17	NC_018583	AACCC	2	10	17090	17099	40 %	0 %	0 %	60 %	404217386
18	NC_018583	ACCAC	2	10	23022	23031	40 %	0 %	0 %	60 %	404217391
19	NC_018583	CGAAC	2	10	23993	24002	40 %	0 %	20 %	40 %	404217392
20	NC_018583	GACCG	2	10	25520	25529	20 %	0 %	40 %	40 %	404217393
21	NC_018583	CGCGG	2	10	25857	25866	0 %	0 %	60 %	40 %	404217393
22	NC_018583	GCCGA	2	10	27227	27236	20 %	0 %	40 %	40 %	404217393
23	NC_018583	CGTGT	2	10	28088	28097	0 %	40 %	40 %	20 %	404217393
24	NC_018583	GGTCG	2	10	28687	28696	0 %	20 %	60 %	20 %	404217393
25	NC_018583	GACGG	2	10	32190	32199	20 %	0 %	60 %	20 %	404217397
26	NC_018583	CGAGG	2	10	33027	33036	20 %	0 %	60 %	20 %	404217397
27	NC_018583	GTGGA	2	10	33952	33961	20 %	20 %	60 %	0 %	404217398
28	NC_018583	TGTCG	2	10	33993	34002	0 %	40 %	40 %	20 %	404217398
29	NC_018583	GCGTC	2	10	39376	39385	0 %	20 %	40 %	40 %	404217403
30	NC_018583	TCGGC	2	10	39418	39427	0 %	20 %	40 %	40 %	404217403
31	NC_018583	CGGCG	2	10	40205	40214	0 %	0 %	60 %	40 %	404217403
32	NC_018583	AGCGC	2	10	40745	40754	20 %	0 %	40 %	40 %	404217403
33	NC_018583	GTGGC	2	10	41083	41092	0 %	20 %	60 %	20 %	404217403
34	NC_018583	CAGGG	2	10	41920	41929	20 %	0 %	60 %	20 %	404217403
35	NC_018583	GATCG	2	10	42042	42051	20 %	20 %	40 %	20 %	404217403
36	NC_018583	GTCGT	2	10	43663	43672	0 %	40 %	40 %	20 %	404217403
37	NC_018583	ATCCG	2	10	46495	46504	20 %	20 %	20 %	40 %	404217404
38	NC_018583	CCGAC	2	10	46637	46646	20 %	0 %	20 %	60 %	404217405
39	NC_018583	CCGCG	2	10	46995	47004	0 %	0 %	40 %	60 %	404217405
40	NC_018583	CAGCG	2	10	47650	47659	20 %	0 %	40 %	40 %	404217406
41	NC_018583	CGGGT	2	10	49508	49517	0 %	20 %	60 %	20 %	404217409
42	NC_018583	CGGCG	2	10	49672	49681	0 %	0 %	60 %	40 %	404217410
43	NC_018583	CGCTG	2	10	49870	49879	0 %	20 %	40 %	40 %	404217410
44	NC_018583	AGGCC	2	10	50163	50172	20 %	0 %	40 %	40 %	404217411
45	NC_018583	AGGCC	2	10	50608	50617	20 %	0 %	40 %	40 %	404217412
46	NC_018583	GTGGC	2	10	50640	50649	0 %	20 %	60 %	20 %	404217412
47	NC_018583	GGTGT	2	10	51018	51027	0 %	40 %	60 %	0 %	404217413
48	NC_018583	CCGGC	2	10	51409	51418	0 %	0 %	40 %	60 %	404217414
49	NC_018583	TGACT	2	10	52035	52044	20 %	40 %	20 %	20 %	404217414
50	NC_018583	CCACC	2	10	52867	52876	20 %	0 %	0 %	80 %	404217416
51	NC_018583	GCGCG	2	10	55160	55169	0 %	0 %	60 %	40 %	404217419
52	NC_018583	GATCA	2	10	57398	57407	40 %	20 %	20 %	20 %	404217420
53	NC_018583	CGCGC	2	10	58375	58384	0 %	0 %	40 %	60 %	404217422
54	NC_018583	GCGTG	2	10	60493	60502	0 %	20 %	60 %	20 %	404217426
55	NC_018583	TCGCA	2	10	63425	63434	20 %	20 %	20 %	40 %	404217433
56	NC_018583	CGGCG	2	10	63456	63465	0 %	0 %	60 %	40 %	404217433
57	NC_018583	CCCAG	2	10	63693	63702	20 %	0 %	20 %	60 %	404217433
58	NC_018583	CGGTT	2	10	66096	66105	0 %	40 %	40 %	20 %	404217435
59	NC_018583	CGGTT	2	10	71171	71180	0 %	40 %	40 %	20 %	404217440
60	NC_018583	TCGAT	3	15	71208	71222	20 %	40 %	20 %	20 %	404217440
61	NC_018583	CCCAG	2	10	72389	72398	20 %	0 %	20 %	60 %	404217442
62	NC_018583	CCCAC	2	10	72606	72615	20 %	0 %	0 %	80 %	404217442
63	NC_018583	CAACG	2	10	72749	72758	40 %	0 %	20 %	40 %	404217442
64	NC_018583	GCGAA	2	10	73778	73787	40 %	0 %	40 %	20 %	404217443
65	NC_018583	GGCGC	2	10	74514	74523	0 %	0 %	60 %	40 %	404217443
66	NC_018583	GCCAC	2	10	75077	75086	20 %	0 %	20 %	60 %	404217443
67	NC_018583	TCCCG	2	10	76077	76086	0 %	20 %	20 %	60 %	404217443
68	NC_018583	CGGCG	2	10	78415	78424	0 %	0 %	60 %	40 %	404217447
69	NC_018583	ACCGG	2	10	80242	80251	20 %	0 %	40 %	40 %	404217448
70	NC_018583	CGATC	2	10	89550	89559	20 %	20 %	20 %	40 %	404217456
71	NC_018583	GACCT	2	10	89926	89935	20 %	20 %	20 %	40 %	404217456
72	NC_018583	TGGCG	2	10	90798	90807	0 %	20 %	60 %	20 %	404217457
73	NC_018583	TGAGC	2	10	93310	93319	20 %	20 %	40 %	20 %	404217460
74	NC_018583	CACAG	2	10	93839	93848	40 %	0 %	20 %	40 %	404217461
75	NC_018583	TGTCC	2	10	96050	96059	0 %	40 %	20 %	40 %	404217463
76	NC_018583	TGCGA	2	10	97390	97399	20 %	20 %	40 %	20 %	404217465
77	NC_018583	AGGTC	2	10	100552	100561	20 %	20 %	40 %	20 %	404217469
78	NC_018583	GATCG	2	10	100928	100937	20 %	20 %	40 %	20 %	404217469
79	NC_018583	CTTCG	2	10	104908	104917	0 %	40 %	20 %	40 %	404217472
80	NC_018583	TGGCG	2	10	105926	105935	0 %	20 %	60 %	20 %	404217473
81	NC_018583	GCGTG	2	10	106584	106593	0 %	20 %	60 %	20 %	404217474
82	NC_018583	GGAAT	2	10	109001	109010	40 %	20 %	40 %	0 %	404217476
83	NC_018583	CCGGG	2	10	109842	109851	0 %	0 %	60 %	40 %	404217477
84	NC_018583	GCTCC	2	10	109854	109863	0 %	20 %	20 %	60 %	404217477
85	NC_018583	GGGCT	2	10	110963	110972	0 %	20 %	60 %	20 %	404217478
86	NC_018583	GAATG	2	10	111342	111351	40 %	20 %	40 %	0 %	404217478
87	NC_018583	GATCC	2	10	112707	112716	20 %	20 %	20 %	40 %	404217480
88	NC_018583	TCCGA	2	10	112911	112920	20 %	20 %	20 %	40 %	404217480
89	NC_018583	ATCAC	2	10	116847	116856	40 %	20 %	0 %	40 %	404217482
90	NC_018583	TGCGG	2	10	117540	117549	0 %	20 %	60 %	20 %	404217483
91	NC_018583	CGATC	2	10	118930	118939	20 %	20 %	20 %	40 %	404217485
92	NC_018583	GACCT	2	10	119306	119315	20 %	20 %	20 %	40 %	404217485
93	NC_018583	GTCAC	2	10	120400	120409	20 %	20 %	20 %	40 %	404217486
94	NC_018583	GCAAC	2	10	121125	121134	40 %	0 %	20 %	40 %	404217487
95	NC_018583	TCGTT	2	10	124294	124303	0 %	60 %	20 %	20 %	404217490
96	NC_018583	TGATC	2	10	126970	126979	20 %	40 %	20 %	20 %	404217493
97	NC_018583	AGCTG	2	10	127177	127186	20 %	20 %	40 %	20 %	404217493
98	NC_018583	TCAAC	2	10	128214	128223	40 %	20 %	0 %	40 %	404217494
99	NC_018583	GGACG	2	10	128470	128479	20 %	0 %	60 %	20 %	404217494
100	NC_018583	GAATC	2	10	129939	129948	40 %	20 %	20 %	20 %	404217496
101	NC_018583	CGATC	2	10	133024	133033	20 %	20 %	20 %	40 %	404217500
102	NC_018583	GACCT	2	10	133400	133409	20 %	20 %	20 %	40 %	404217500
103	NC_018583	CGGCG	2	10	134266	134275	0 %	0 %	60 %	40 %	404217501
104	NC_018583	TCCGC	2	10	134446	134455	0 %	20 %	20 %	60 %	404217501
105	NC_018583	CGGGT	2	10	135230	135239	0 %	20 %	60 %	20 %	404217503
106	NC_018583	GCCAC	2	10	135513	135522	20 %	0 %	20 %	60 %	404217503
107	NC_018583	TCTCC	2	10	137578	137587	0 %	40 %	0 %	60 %	404217506
108	NC_018583	CCGCG	2	10	138551	138560	0 %	0 %	40 %	60 %	404217506
109	NC_018583	GGCCG	2	10	139839	139848	0 %	0 %	60 %	40 %	404217508
110	NC_018583	CGTCT	2	10	143646	143655	0 %	40 %	20 %	40 %	404217512
111	NC_018583	TCGGC	2	10	144014	144023	0 %	20 %	40 %	40 %	404217512
112	NC_018583	ACCGC	2	10	145351	145360	20 %	0 %	20 %	60 %	404217512
113	NC_018583	CGGCC	2	10	147322	147331	0 %	0 %	40 %	60 %	404217515
114	NC_018583	TCGGG	2	10	151142	151151	0 %	20 %	60 %	20 %	404217518
115	NC_018583	TCGAA	2	10	154291	154300	40 %	20 %	20 %	20 %	404217521
116	NC_018583	GGGCT	2	10	155323	155332	0 %	20 %	60 %	20 %	404217522
117	NC_018583	CGGGC	2	10	155686	155695	0 %	0 %	60 %	40 %	404217522
118	NC_018583	GGCGA	2	10	155824	155833	20 %	0 %	60 %	20 %	404217522
119	NC_018583	CGCGG	2	10	156028	156037	0 %	0 %	60 %	40 %	404217522
120	NC_018583	GCGCG	2	10	157675	157684	0 %	0 %	60 %	40 %	404217523
121	NC_018583	GCCAG	2	10	158250	158259	20 %	0 %	40 %	40 %	404217524
122	NC_018583	TCGTG	2	10	158541	158550	0 %	40 %	40 %	20 %	404217524
123	NC_018583	GCCGA	2	10	160291	160300	20 %	0 %	40 %	40 %	404217525
124	NC_018583	GCCCT	2	10	160996	161005	0 %	20 %	20 %	60 %	404217525
125	NC_018583	CAAGC	2	10	162530	162539	40 %	0 %	20 %	40 %	404217526
126	NC_018583	CCGCC	2	10	163716	163725	0 %	0 %	20 %	80 %	404217527
127	NC_018583	GTTCG	2	10	168448	168457	0 %	40 %	40 %	20 %	404217530
128	NC_018583	GGTCA	2	10	171293	171302	20 %	20 %	40 %	20 %	404217533
129	NC_018583	GTATC	2	10	171475	171484	20 %	40 %	20 %	20 %	404217533

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.