MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT3

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018583	GACG	2	8	1877	1884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018583	CTGT	2	8	3433	3440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018583	GGGC	2	8	8311	8318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018583	GAAG	2	8	8759	8766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018583	ACCG	2	8	8955	8962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018583	GCGG	2	8	9048	9055	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018583	GAAG	2	8	19993	20000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018583	CCAC	2	8	23319	23326	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_018583	GCCC	2	8	30242	30249	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_018583	GACC	2	8	30259	30266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018583	GCCG	2	8	37066	37073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018583	GTCG	2	8	37098	37105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018583	GTCT	2	8	37425	37432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018583	TTTC	2	8	38151	38158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018583	TGCA	2	8	52956	52963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018583	GCGG	2	8	58199	58206	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018583	GCGG	2	8	59253	59260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018583	ACGG	2	8	59299	59306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018583	GACG	2	8	60073	60080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018583	GCCT	2	8	67495	67502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018583	GTCC	2	8	68333	68340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018583	TCGT	2	8	69381	69388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018583	CCAG	2	8	73404	73411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018583	GGTG	2	8	77114	77121	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018583	CACC	2	8	77138	77145	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_018583	GCGG	2	8	80468	80475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018583	GTCG	2	8	82327	82334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018583	CGAA	2	8	82382	82389	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018583	GACC	2	8	82562	82569	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018583	GGCA	2	8	82994	83001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018583	CGGT	2	8	83082	83089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018583	GAGC	2	8	83136	83143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018583	TGAT	2	8	85987	85994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018583	CGAC	2	8	86895	86902	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018583	GAAC	2	8	91891	91898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018583	ACGC	2	8	98441	98448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018583	CCCA	2	8	99064	99071	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_018583	CACG	2	8	99078	99085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018583	AGCC	2	8	101354	101361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018583	CGAC	2	8	101482	101489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018583	GTCC	2	8	101509	101516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018583	CACG	2	8	111523	111530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018583	ACGC	2	8	115549	115556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018583	CGGC	2	8	119643	119650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018583	GCCC	2	8	132462	132469	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_018583	AGCG	2	8	134633	134640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018583	GGCA	2	8	134689	134696	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018583	CCGA	2	8	137352	137359	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018583	CGGG	2	8	139255	139262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018583	CGGT	2	8	139519	139526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018583	CACC	2	8	140518	140525	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_018583	CCGG	2	8	140695	140702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018583	CGCA	2	8	141448	141455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018583	GACT	2	8	141581	141588	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018583	GGCT	2	8	142522	142529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018583	TGCT	3	12	143254	143265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018583	CGGG	2	8	143375	143382	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018583	GAGG	2	8	143575	143582	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018583	CCCG	2	8	147916	147923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_018583	TGGC	2	8	150137	150144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018583	GTCG	2	8	150433	150440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018583	GAAG	2	8	151796	151803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018583	ACCC	2	8	153328	153335	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_018583	GACC	2	8	153392	153399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018583	CAGA	2	8	162699	162706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018583	AACG	2	8	162928	162935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018583	GGCC	2	8	162969	162976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018583	CCTG	2	8	164988	164995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018583	CGAC	2	8	166219	166226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018583	ACGA	2	8	166958	166965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018583	GGCC	2	8	167001	167008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018583	CCAC	2	8	169105	169112	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_018583	GGCA	2	8	170279	170286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.