MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT3

Total Repeats: 302

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018583	CA	3	6	451	456	50 %	0 %	0 %	50 %	404217372
2	NC_018583	AG	3	6	720	725	50 %	0 %	50 %	0 %	404217372
3	NC_018583	TC	3	6	930	935	0 %	50 %	0 %	50 %	404217372
4	NC_018583	CA	3	6	1320	1325	50 %	0 %	0 %	50 %	404217373
5	NC_018583	AG	3	6	1888	1893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018583	GC	4	8	2594	2601	0 %	0 %	50 %	50 %	404217374
7	NC_018583	CG	3	6	3370	3375	0 %	0 %	50 %	50 %	404217375
8	NC_018583	CG	3	6	3750	3755	0 %	0 %	50 %	50 %	404217376
9	NC_018583	CG	4	8	4886	4893	0 %	0 %	50 %	50 %	404217376
10	NC_018583	GT	3	6	5762	5767	0 %	50 %	50 %	0 %	404217377
11	NC_018583	CG	3	6	6449	6454	0 %	0 %	50 %	50 %	404217378
12	NC_018583	GC	3	6	7539	7544	0 %	0 %	50 %	50 %	404217379
13	NC_018583	GC	3	6	8359	8364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018583	CG	3	6	8388	8393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018583	TC	3	6	9620	9625	0 %	50 %	0 %	50 %	404217380
16	NC_018583	AC	3	6	10182	10187	50 %	0 %	0 %	50 %	404217381
17	NC_018583	GC	3	6	10513	10518	0 %	0 %	50 %	50 %	404217381
18	NC_018583	GC	3	6	10617	10622	0 %	0 %	50 %	50 %	404217381
19	NC_018583	CG	3	6	11071	11076	0 %	0 %	50 %	50 %	404217382
20	NC_018583	GC	3	6	11765	11770	0 %	0 %	50 %	50 %	404217382
21	NC_018583	GC	3	6	12143	12148	0 %	0 %	50 %	50 %	404217382
22	NC_018583	TC	3	6	12397	12402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018583	GC	3	6	13152	13157	0 %	0 %	50 %	50 %	404217383
24	NC_018583	AG	3	6	13887	13892	50 %	0 %	50 %	0 %	404217383
25	NC_018583	GC	3	6	15483	15488	0 %	0 %	50 %	50 %	404217385
26	NC_018583	GC	3	6	16360	16365	0 %	0 %	50 %	50 %	404217385
27	NC_018583	GC	3	6	16624	16629	0 %	0 %	50 %	50 %	404217385
28	NC_018583	CG	3	6	16823	16828	0 %	0 %	50 %	50 %	404217385
29	NC_018583	GC	3	6	16933	16938	0 %	0 %	50 %	50 %	404217385
30	NC_018583	GC	3	6	17142	17147	0 %	0 %	50 %	50 %	404217386
31	NC_018583	CG	3	6	18488	18493	0 %	0 %	50 %	50 %	404217387
32	NC_018583	GC	3	6	18535	18540	0 %	0 %	50 %	50 %	404217387
33	NC_018583	CA	3	6	20018	20023	50 %	0 %	0 %	50 %	404217389
34	NC_018583	CG	4	8	20187	20194	0 %	0 %	50 %	50 %	404217389
35	NC_018583	GC	3	6	20266	20271	0 %	0 %	50 %	50 %	404217389
36	NC_018583	GC	3	6	20376	20381	0 %	0 %	50 %	50 %	404217389
37	NC_018583	GC	3	6	21374	21379	0 %	0 %	50 %	50 %	404217390
38	NC_018583	GC	3	6	21801	21806	0 %	0 %	50 %	50 %	404217390
39	NC_018583	CG	4	8	22671	22678	0 %	0 %	50 %	50 %	404217391
40	NC_018583	GA	3	6	23047	23052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018583	CA	3	6	23232	23237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018583	AC	3	6	23433	23438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018583	GC	4	8	24254	24261	0 %	0 %	50 %	50 %	404217392
44	NC_018583	GC	4	8	24856	24863	0 %	0 %	50 %	50 %	404217393
45	NC_018583	GC	4	8	24959	24966	0 %	0 %	50 %	50 %	404217393
46	NC_018583	GC	3	6	26005	26010	0 %	0 %	50 %	50 %	404217393
47	NC_018583	GC	3	6	26140	26145	0 %	0 %	50 %	50 %	404217393
48	NC_018583	CG	3	6	26273	26278	0 %	0 %	50 %	50 %	404217393
49	NC_018583	CG	3	6	26391	26396	0 %	0 %	50 %	50 %	404217393
50	NC_018583	GC	3	6	26584	26589	0 %	0 %	50 %	50 %	404217393
51	NC_018583	GC	3	6	29082	29087	0 %	0 %	50 %	50 %	404217393
52	NC_018583	CG	3	6	29379	29384	0 %	0 %	50 %	50 %	404217393
53	NC_018583	TG	3	6	29407	29412	0 %	50 %	50 %	0 %	404217393
54	NC_018583	CA	3	6	30016	30021	50 %	0 %	0 %	50 %	404217393
55	NC_018583	CG	3	6	30567	30572	0 %	0 %	50 %	50 %	404217394
56	NC_018583	CA	3	6	30803	30808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018583	CG	3	6	31017	31022	0 %	0 %	50 %	50 %	404217395
58	NC_018583	CG	3	6	31097	31102	0 %	0 %	50 %	50 %	404217395
59	NC_018583	GT	3	6	32918	32923	0 %	50 %	50 %	0 %	404217397
60	NC_018583	CG	3	6	33795	33800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018583	GC	3	6	34614	34619	0 %	0 %	50 %	50 %	404217399
62	NC_018583	AC	3	6	35245	35250	50 %	0 %	0 %	50 %	404217399
63	NC_018583	CG	3	6	35547	35552	0 %	0 %	50 %	50 %	404217399
64	NC_018583	CG	3	6	35571	35576	0 %	0 %	50 %	50 %	404217399
65	NC_018583	CG	3	6	35581	35586	0 %	0 %	50 %	50 %	404217399
66	NC_018583	CG	3	6	35658	35663	0 %	0 %	50 %	50 %	404217399
67	NC_018583	GT	3	6	36613	36618	0 %	50 %	50 %	0 %	404217400
68	NC_018583	GC	3	6	37007	37012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018583	GA	3	6	37985	37990	50 %	0 %	50 %	0 %	404217401
70	NC_018583	GA	3	6	38408	38413	50 %	0 %	50 %	0 %	404217402
71	NC_018583	GC	3	6	40216	40221	0 %	0 %	50 %	50 %	404217403
72	NC_018583	GC	3	6	41614	41619	0 %	0 %	50 %	50 %	404217403
73	NC_018583	GT	3	6	42199	42204	0 %	50 %	50 %	0 %	404217403
74	NC_018583	CG	3	6	43788	43793	0 %	0 %	50 %	50 %	404217403
75	NC_018583	GC	3	6	43963	43968	0 %	0 %	50 %	50 %	404217403
76	NC_018583	CG	3	6	44115	44120	0 %	0 %	50 %	50 %	404217403
77	NC_018583	GC	3	6	44149	44154	0 %	0 %	50 %	50 %	404217403
78	NC_018583	GC	3	6	44317	44322	0 %	0 %	50 %	50 %	404217403
79	NC_018583	GT	3	6	44575	44580	0 %	50 %	50 %	0 %	404217403
80	NC_018583	CG	3	6	44876	44881	0 %	0 %	50 %	50 %	404217403
81	NC_018583	CG	3	6	45496	45501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018583	GT	3	6	45837	45842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018583	GC	4	8	46082	46089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018583	GC	3	6	46094	46099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018583	CG	3	6	46142	46147	0 %	0 %	50 %	50 %	404217404
86	NC_018583	GC	3	6	47274	47279	0 %	0 %	50 %	50 %	404217406
87	NC_018583	GC	3	6	47284	47289	0 %	0 %	50 %	50 %	404217406
88	NC_018583	GT	3	6	48237	48242	0 %	50 %	50 %	0 %	404217407
89	NC_018583	CG	3	6	49223	49228	0 %	0 %	50 %	50 %	404217409
90	NC_018583	CG	3	6	49843	49848	0 %	0 %	50 %	50 %	404217410
91	NC_018583	CG	3	6	49975	49980	0 %	0 %	50 %	50 %	404217411
92	NC_018583	GC	3	6	51010	51015	0 %	0 %	50 %	50 %	404217413
93	NC_018583	AC	3	6	52852	52857	50 %	0 %	0 %	50 %	404217416
94	NC_018583	CG	3	6	53634	53639	0 %	0 %	50 %	50 %	404217417
95	NC_018583	GC	3	6	53719	53724	0 %	0 %	50 %	50 %	404217417
96	NC_018583	GC	3	6	54484	54489	0 %	0 %	50 %	50 %	404217418
97	NC_018583	CA	3	6	55177	55182	50 %	0 %	0 %	50 %	404217419
98	NC_018583	GA	3	6	57724	57729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018583	GC	3	6	57910	57915	0 %	0 %	50 %	50 %	404217421
100	NC_018583	GC	3	6	58259	58264	0 %	0 %	50 %	50 %	404217422
101	NC_018583	CG	3	6	58965	58970	0 %	0 %	50 %	50 %	404217423
102	NC_018583	GC	3	6	59922	59927	0 %	0 %	50 %	50 %	404217425
103	NC_018583	CA	3	6	60206	60211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018583	GC	3	6	60338	60343	0 %	0 %	50 %	50 %	404217426
105	NC_018583	GC	3	6	60754	60759	0 %	0 %	50 %	50 %	404217426
106	NC_018583	GA	3	6	61616	61621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018583	CG	3	6	61651	61656	0 %	0 %	50 %	50 %	404217428
108	NC_018583	AC	3	6	63053	63058	50 %	0 %	0 %	50 %	404217431
109	NC_018583	CT	3	6	63727	63732	0 %	50 %	0 %	50 %	404217433
110	NC_018583	CT	3	6	64480	64485	0 %	50 %	0 %	50 %	404217434
111	NC_018583	CG	4	8	64560	64567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018583	GC	3	6	64717	64722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018583	CG	3	6	64963	64968	0 %	0 %	50 %	50 %	404217435
114	NC_018583	CG	3	6	65212	65217	0 %	0 %	50 %	50 %	404217435
115	NC_018583	TC	3	6	66550	66555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018583	AT	3	6	66601	66606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018583	CG	3	6	68324	68329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018583	CG	3	6	68800	68805	0 %	0 %	50 %	50 %	404217438
119	NC_018583	GT	3	6	69481	69486	0 %	50 %	50 %	0 %	404217439
120	NC_018583	GT	3	6	70356	70361	0 %	50 %	50 %	0 %	404217439
121	NC_018583	GC	3	6	70638	70643	0 %	0 %	50 %	50 %	404217439
122	NC_018583	GT	3	6	71281	71286	0 %	50 %	50 %	0 %	404217440
123	NC_018583	GT	3	6	71396	71401	0 %	50 %	50 %	0 %	404217440
124	NC_018583	GT	3	6	72806	72811	0 %	50 %	50 %	0 %	404217442
125	NC_018583	GC	3	6	72870	72875	0 %	0 %	50 %	50 %	404217442
126	NC_018583	GC	3	6	73719	73724	0 %	0 %	50 %	50 %	404217443
127	NC_018583	CG	3	6	75118	75123	0 %	0 %	50 %	50 %	404217443
128	NC_018583	CG	3	6	75794	75799	0 %	0 %	50 %	50 %	404217443
129	NC_018583	AG	3	6	76451	76456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018583	GC	3	6	77236	77241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018583	CT	3	6	77380	77385	0 %	50 %	0 %	50 %	404217445
132	NC_018583	CG	3	6	77718	77723	0 %	0 %	50 %	50 %	404217446
133	NC_018583	CG	3	6	78241	78246	0 %	0 %	50 %	50 %	404217447
134	NC_018583	CG	3	6	78265	78270	0 %	0 %	50 %	50 %	404217447
135	NC_018583	CT	3	6	78745	78750	0 %	50 %	0 %	50 %	404217448
136	NC_018583	CG	3	6	79084	79089	0 %	0 %	50 %	50 %	404217448
137	NC_018583	TG	3	6	79792	79797	0 %	50 %	50 %	0 %	404217448
138	NC_018583	CG	3	6	79949	79954	0 %	0 %	50 %	50 %	404217448
139	NC_018583	GA	3	6	81126	81131	50 %	0 %	50 %	0 %	404217449
140	NC_018583	TA	3	6	81781	81786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018583	GC	3	6	81790	81795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018583	CG	3	6	82884	82889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018583	CT	3	6	84576	84581	0 %	50 %	0 %	50 %	404217451
144	NC_018583	CG	3	6	85158	85163	0 %	0 %	50 %	50 %	404217451
145	NC_018583	GC	3	6	85920	85925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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288	NC_018583	GA	3	6	168718	168723	50 %	0 %	50 %	0 %	404217530
289	NC_018583	GC	4	8	168742	168749	0 %	0 %	50 %	50 %	404217530
290	NC_018583	CG	3	6	169348	169353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
291	NC_018583	GC	3	6	169413	169418	0 %	0 %	50 %	50 %	404217531
292	NC_018583	CG	3	6	169680	169685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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295	NC_018583	CG	3	6	170157	170162	0 %	0 %	50 %	50 %	404217532
296	NC_018583	GC	3	6	170337	170342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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298	NC_018583	TC	3	6	171435	171440	0 %	50 %	0 %	50 %	404217533
299	NC_018583	GC	3	6	171610	171615	0 %	0 %	50 %	50 %	404217533
300	NC_018583	GC	3	6	171850	171855	0 %	0 %	50 %	50 %	404217534
301	NC_018583	GA	3	6	172329	172334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
302	NC_018583	CG	3	6	172377	172382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.