MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018582	ACCGGC	2	12	903	914	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212537
2	NC_018582	GCGATC	2	12	1772	1783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212538
3	NC_018582	CGACCT	2	12	2026	2037	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404212538
4	NC_018582	CGCAGT	2	12	6122	6133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212545
5	NC_018582	GTGATC	2	12	9487	9498	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404212547
6	NC_018582	CACCGA	2	12	14093	14104	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	404212550
7	NC_018582	GTCATC	2	12	14985	14996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404212550
8	NC_018582	TCGGCT	2	12	19128	19139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212553
9	NC_018582	CATCGT	2	12	24719	24730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404212560
10	NC_018582	TCCGTA	2	12	28688	28699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404212564
11	NC_018582	CCGAAG	2	12	30438	30449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212565
12	NC_018582	CCCCGG	2	12	32067	32078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212566
13	NC_018582	GGGTCG	2	12	32750	32761	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404212566
14	NC_018582	GATCCG	2	12	33765	33776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212567
15	NC_018582	CACCGA	2	12	33798	33809	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	404212567
16	NC_018582	CCGACC	2	12	40798	40809	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	404212573
17	NC_018582	ACCATC	2	12	42713	42724	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	404212577
18	NC_018582	AGGTGA	2	12	44533	44544	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	404212580
19	NC_018582	GCAAAC	2	12	48453	48464	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404212586
20	NC_018582	GATCAC	2	12	49108	49119	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404212587
21	NC_018582	ACCGTC	2	12	49310	49321	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404212587
22	NC_018582	CTCACC	2	12	51537	51548	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	404212590
23	NC_018582	GCCCGC	2	12	51636	51647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212590
24	NC_018582	CGCGAC	2	12	53913	53924	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212594
25	NC_018582	CGGGTG	2	12	54536	54547	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404212595
26	NC_018582	CCGGCG	2	12	56357	56368	0 %	0 %	50 %	50 %	404212595
27	NC_018582	CGGTGC	2	12	57497	57508	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404212597
28	NC_018582	CGGCCG	2	12	59408	59419	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
29	NC_018582	CCGGCC	2	12	60415	60426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212600
30	NC_018582	GGCCGC	2	12	60744	60755	0 %	0 %	50 %	50 %	404212601
31	NC_018582	CCGCGG	2	12	61230	61241	0 %	0 %	50 %	50 %	404212601
32	NC_018582	GTAGAT	2	12	62488	62499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212603
33	NC_018582	GTCGCG	2	12	65228	65239	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404212605
34	NC_018582	CAGCGC	2	12	67970	67981	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212607
35	NC_018582	CGGCCA	2	12	68253	68264	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212608
36	NC_018582	TGATCA	2	12	68753	68764	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404212609
37	NC_018582	TCGCCG	2	12	69107	69118	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	404212609
38	NC_018582	GCCCAG	2	12	70239	70250	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212610
39	NC_018582	GCTTCG	2	12	70537	70548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212610
40	NC_018582	CGCGGC	2	12	70863	70874	0 %	0 %	50 %	50 %	404212610
41	NC_018582	ACGTCG	2	12	73876	73887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212612
42	NC_018582	CCGCTC	2	12	74946	74957	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	404212614
43	NC_018582	GGCGAT	2	12	75477	75488	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404212616
44	NC_018582	CGCGGC	2	12	79178	79189	0 %	0 %	50 %	50 %	404212620
45	NC_018582	ACGCAC	2	12	82259	82270	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	404212623
46	NC_018582	ACGCCC	2	12	85959	85970	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	404212627
47	NC_018582	TCGACC	2	12	87329	87340	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404212628
48	NC_018582	CCGCGA	2	12	88170	88181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212628
49	NC_018582	ACGGCC	2	12	88376	88387	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212628

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.