MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT1

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018582	CTTGG	2	10	2673	2682	0 %	40 %	40 %	20 %	404212539
2	NC_018582	CGGCA	2	10	3441	3450	20 %	0 %	40 %	40 %	404212541
3	NC_018582	GGCAG	2	10	3941	3950	20 %	0 %	60 %	20 %	404212542
4	NC_018582	AGAGC	2	10	3966	3975	40 %	0 %	40 %	20 %	404212542
5	NC_018582	GAATC	2	10	6562	6571	40 %	20 %	20 %	20 %	404212545
6	NC_018582	CACGT	2	10	6716	6725	20 %	20 %	20 %	40 %	404212545
7	NC_018582	TGAGG	2	10	10241	10250	20 %	20 %	60 %	0 %	404212548
8	NC_018582	ACCTC	2	10	11179	11188	20 %	20 %	0 %	60 %	404212549
9	NC_018582	GACCG	2	10	15644	15653	20 %	0 %	40 %	40 %	404212550
10	NC_018582	TCACC	2	10	15868	15877	20 %	20 %	0 %	60 %	404212550
11	NC_018582	ACTCG	2	10	17150	17159	20 %	20 %	20 %	40 %	404212551
12	NC_018582	AGAGC	2	10	19517	19526	40 %	0 %	40 %	20 %	404212554
13	NC_018582	TCGTG	2	10	22191	22200	0 %	40 %	40 %	20 %	404212558
14	NC_018582	TCGAC	2	10	26468	26477	20 %	20 %	20 %	40 %	404212562
15	NC_018582	AAGCG	2	10	29200	29209	40 %	0 %	40 %	20 %	404212564
16	NC_018582	CCCGG	2	10	32038	32047	0 %	0 %	40 %	60 %	404212566
17	NC_018582	CGCTG	2	10	32054	32063	0 %	20 %	40 %	40 %	404212566
18	NC_018582	GCCGG	2	10	32529	32538	0 %	0 %	60 %	40 %	404212566
19	NC_018582	CGCCA	2	10	36623	36632	20 %	0 %	20 %	60 %	404212571
20	NC_018582	GGCGA	2	10	36765	36774	20 %	0 %	60 %	20 %	404212571
21	NC_018582	GCCGG	2	10	38523	38532	0 %	0 %	60 %	40 %	404212572
22	NC_018582	GGACT	2	10	39864	39873	20 %	20 %	40 %	20 %	404212573
23	NC_018582	GGGTG	2	10	45194	45203	0 %	20 %	80 %	0 %	404212581
24	NC_018582	CCCTG	2	10	45792	45801	0 %	20 %	20 %	60 %	404212582
25	NC_018582	GTCCA	2	10	46042	46051	20 %	20 %	20 %	40 %	404212583
26	NC_018582	ACACC	2	10	46487	46496	40 %	0 %	0 %	60 %	404212583
27	NC_018582	CCAGC	2	10	47218	47227	20 %	0 %	20 %	60 %	404212584
28	NC_018582	GTCCG	2	10	47358	47367	0 %	20 %	40 %	40 %	404212584
29	NC_018582	GCCAG	2	10	47394	47403	20 %	0 %	40 %	40 %	404212584
30	NC_018582	CGAGT	2	10	47479	47488	20 %	20 %	40 %	20 %	404212584
31	NC_018582	GCCGC	2	10	49275	49284	0 %	0 %	40 %	60 %	404212587
32	NC_018582	GCCGC	2	10	49419	49428	0 %	0 %	40 %	60 %	404212587
33	NC_018582	GTGCA	2	10	51011	51020	20 %	20 %	40 %	20 %	404212588
34	NC_018582	GGAGA	2	10	53808	53817	40 %	0 %	60 %	0 %	404212594
35	NC_018582	ACGCG	2	10	54203	54212	20 %	0 %	40 %	40 %	404212594
36	NC_018582	ACCGC	2	10	54288	54297	20 %	0 %	20 %	60 %	404212594
37	NC_018582	CGGTG	2	10	57245	57254	0 %	20 %	60 %	20 %	404212596
38	NC_018582	ACCCG	2	10	57907	57916	20 %	0 %	20 %	60 %	404212597
39	NC_018582	GCTGC	2	10	58596	58605	0 %	20 %	40 %	40 %	404212597
40	NC_018582	TTGGG	2	10	61424	61433	0 %	40 %	60 %	0 %	404212601
41	NC_018582	CCGCT	2	10	62388	62397	0 %	20 %	20 %	60 %	404212603
42	NC_018582	CGGCG	2	10	63781	63790	0 %	0 %	60 %	40 %	404212603
43	NC_018582	CAGCA	2	10	63839	63848	40 %	0 %	20 %	40 %	404212603
44	NC_018582	TGCGG	2	10	64369	64378	0 %	20 %	60 %	20 %	404212604
45	NC_018582	CCGGC	2	10	65256	65265	0 %	0 %	40 %	60 %	404212605
46	NC_018582	GCACC	2	10	66112	66121	20 %	0 %	20 %	60 %	404212607
47	NC_018582	CGCGC	2	10	70426	70435	0 %	0 %	40 %	60 %	404212610
48	NC_018582	GCCGA	2	10	70465	70474	20 %	0 %	40 %	40 %	404212610
49	NC_018582	ACCCG	2	10	72229	72238	20 %	0 %	20 %	60 %	404212611
50	NC_018582	CGATC	2	10	72826	72835	20 %	20 %	20 %	40 %	404212611
51	NC_018582	CGGTC	2	10	73066	73075	0 %	20 %	40 %	40 %	404212611
52	NC_018582	GCGCC	2	10	73649	73658	0 %	0 %	40 %	60 %	404212612
53	NC_018582	GCGGT	2	10	75063	75072	0 %	20 %	60 %	20 %	404212614
54	NC_018582	GGTGC	2	10	76106	76115	0 %	20 %	60 %	20 %	404212617
55	NC_018582	GATCA	2	10	76683	76692	40 %	20 %	20 %	20 %	404212618
56	NC_018582	GGCCA	2	10	77287	77296	20 %	0 %	40 %	40 %	404212619
57	NC_018582	TCGCC	2	10	78010	78019	0 %	20 %	20 %	60 %	404212619
58	NC_018582	TCGCT	2	10	78388	78397	0 %	40 %	20 %	40 %	404212619
59	NC_018582	CCGGC	2	10	78975	78984	0 %	0 %	40 %	60 %	404212620
60	NC_018582	CGGCG	2	10	79767	79776	0 %	0 %	60 %	40 %	404212621
61	NC_018582	CGACC	2	10	80525	80534	20 %	0 %	20 %	60 %	404212621
62	NC_018582	CGGGT	2	10	80707	80716	0 %	20 %	60 %	20 %	404212621
63	NC_018582	CCCTG	2	10	80762	80771	0 %	20 %	20 %	60 %	404212621
64	NC_018582	GCTGC	2	10	83088	83097	0 %	20 %	40 %	40 %	404212624
65	NC_018582	CCGAT	2	10	84866	84875	20 %	20 %	20 %	40 %	404212625
66	NC_018582	GGTCA	2	10	87799	87808	20 %	20 %	40 %	20 %	404212628
67	NC_018582	GGGAA	2	10	88801	88810	40 %	0 %	60 %	0 %	404212628

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.