MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT1

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018582	GCTC	2	8	142	149	0 %	25 %	25 %	50 %	404212536
2	NC_018582	ACCC	2	8	419	426	25 %	0 %	0 %	75 %	404212536
3	NC_018582	CCGA	2	8	1072	1079	25 %	0 %	25 %	50 %	404212537
4	NC_018582	CTGG	2	8	1083	1090	0 %	25 %	50 %	25 %	404212537
5	NC_018582	GCCG	2	8	1105	1112	0 %	0 %	50 %	50 %	404212537
6	NC_018582	GGCC	2	8	1249	1256	0 %	0 %	50 %	50 %	404212537
7	NC_018582	ACGC	2	8	2272	2279	25 %	0 %	25 %	50 %	404212538
8	NC_018582	GTGC	2	8	2390	2397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018582	ACCC	2	8	2537	2544	25 %	0 %	0 %	75 %	404212539
10	NC_018582	GGCC	2	8	2916	2923	0 %	0 %	50 %	50 %	404212540
11	NC_018582	CAGC	2	8	3981	3988	25 %	0 %	25 %	50 %	404212542
12	NC_018582	GGTC	2	8	4209	4216	0 %	25 %	50 %	25 %	404212542
13	NC_018582	CTCG	2	8	4346	4353	0 %	25 %	25 %	50 %	404212543
14	NC_018582	GGTG	2	8	4447	4454	0 %	25 %	75 %	0 %	404212543
15	NC_018582	CGGT	2	8	4886	4893	0 %	25 %	50 %	25 %	404212544
16	NC_018582	CTGC	2	8	4998	5005	0 %	25 %	25 %	50 %	404212544
17	NC_018582	CGGG	2	8	5138	5145	0 %	0 %	75 %	25 %	404212544
18	NC_018582	GCCG	2	8	5286	5293	0 %	0 %	50 %	50 %	404212544
19	NC_018582	GTGC	2	8	5326	5333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018582	CCAG	2	8	5711	5718	25 %	0 %	25 %	50 %	404212545
21	NC_018582	CAAC	2	8	5734	5741	50 %	0 %	0 %	50 %	404212545
22	NC_018582	GCAG	2	8	6692	6699	25 %	0 %	50 %	25 %	404212545
23	NC_018582	CCGC	2	8	7183	7190	0 %	0 %	25 %	75 %	404212545
24	NC_018582	CGGA	2	8	7798	7805	25 %	0 %	50 %	25 %	404212545
25	NC_018582	CAGC	2	8	7949	7956	25 %	0 %	25 %	50 %	404212545
26	NC_018582	AGAT	2	8	7960	7967	50 %	25 %	25 %	0 %	404212545
27	NC_018582	ATCT	2	8	7969	7976	25 %	50 %	0 %	25 %	404212545
28	NC_018582	GCCG	2	8	8220	8227	0 %	0 %	50 %	50 %	404212546
29	NC_018582	CAGC	2	8	8553	8560	25 %	0 %	25 %	50 %	404212546
30	NC_018582	CCGG	2	8	8604	8611	0 %	0 %	50 %	50 %	404212546
31	NC_018582	CAGT	2	8	10008	10015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018582	TTCC	2	8	10196	10203	0 %	50 %	0 %	50 %	404212548
33	NC_018582	CCGA	2	8	10653	10660	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018582	CGGC	2	8	10777	10784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018582	CGGT	2	8	11798	11805	0 %	25 %	50 %	25 %	404212549
36	NC_018582	ACCC	2	8	11806	11813	25 %	0 %	0 %	75 %	404212549
37	NC_018582	ACTC	2	8	12809	12816	25 %	25 %	0 %	50 %	404212550
38	NC_018582	ATCC	2	8	13125	13132	25 %	25 %	0 %	50 %	404212550
39	NC_018582	GATC	2	8	13753	13760	25 %	25 %	25 %	25 %	404212550
40	NC_018582	CGAT	2	8	14192	14199	25 %	25 %	25 %	25 %	404212550
41	NC_018582	TCGG	2	8	14529	14536	0 %	25 %	50 %	25 %	404212550
42	NC_018582	AGGA	2	8	14722	14729	50 %	0 %	50 %	0 %	404212550
43	NC_018582	TGGC	2	8	14820	14827	0 %	25 %	50 %	25 %	404212550
44	NC_018582	CGTG	2	8	15596	15603	0 %	25 %	50 %	25 %	404212550
45	NC_018582	CACC	2	8	16196	16203	25 %	0 %	0 %	75 %	404212550
46	NC_018582	TCGA	2	8	16746	16753	25 %	25 %	25 %	25 %	404212551
47	NC_018582	CGTG	2	8	16784	16791	0 %	25 %	50 %	25 %	404212551
48	NC_018582	GCTT	2	8	16879	16886	0 %	50 %	25 %	25 %	404212551
49	NC_018582	ATCG	2	8	17300	17307	25 %	25 %	25 %	25 %	404212551
50	NC_018582	CAGC	2	8	17704	17711	25 %	0 %	25 %	50 %	404212551
51	NC_018582	TGAC	2	8	17791	17798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018582	CCTG	2	8	17957	17964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018582	GTGG	2	8	18036	18043	0 %	25 %	75 %	0 %	404212552
54	NC_018582	GCTG	2	8	18337	18344	0 %	25 %	50 %	25 %	404212552
55	NC_018582	GTGC	2	8	18577	18584	0 %	25 %	50 %	25 %	404212552
56	NC_018582	CGGA	2	8	18760	18767	25 %	0 %	50 %	25 %	404212553
57	NC_018582	ACCG	2	8	19016	19023	25 %	0 %	25 %	50 %	404212553
58	NC_018582	CTGC	2	8	19360	19367	0 %	25 %	25 %	50 %	404212554
59	NC_018582	TCGT	2	8	19734	19741	0 %	50 %	25 %	25 %	404212554
60	NC_018582	GACA	2	8	20965	20972	50 %	0 %	25 %	25 %	404212556
61	NC_018582	TCGG	2	8	22049	22056	0 %	25 %	50 %	25 %	404212558
62	NC_018582	CCAG	2	8	23633	23640	25 %	0 %	25 %	50 %	404212559
63	NC_018582	CCGG	2	8	24061	24068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018582	GCAC	2	8	24269	24276	25 %	0 %	25 %	50 %	404212560
65	NC_018582	ACCG	2	8	25067	25074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018582	CCCG	2	8	25116	25123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_018582	CGCT	2	8	25290	25297	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018582	AACC	2	8	25340	25347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018582	ACCT	2	8	26438	26445	25 %	25 %	0 %	50 %	404212562
70	NC_018582	TTTC	2	8	26547	26554	0 %	75 %	0 %	25 %	404212562
71	NC_018582	ATCC	2	8	26797	26804	25 %	25 %	0 %	50 %	404212562
72	NC_018582	TCGG	2	8	27115	27122	0 %	25 %	50 %	25 %	404212563
73	NC_018582	GCCG	2	8	27305	27312	0 %	0 %	50 %	50 %	404212563
74	NC_018582	CGGA	2	8	27440	27447	25 %	0 %	50 %	25 %	404212563
75	NC_018582	TTGG	2	8	27779	27786	0 %	50 %	50 %	0 %	404212564
76	NC_018582	CGGC	2	8	27914	27921	0 %	0 %	50 %	50 %	404212564
77	NC_018582	CCTC	2	8	28067	28074	0 %	25 %	0 %	75 %	404212564
78	NC_018582	TGGG	2	8	28136	28143	0 %	25 %	75 %	0 %	404212564
79	NC_018582	GCCG	2	8	28655	28662	0 %	0 %	50 %	50 %	404212564
80	NC_018582	CGTC	2	8	28848	28855	0 %	25 %	25 %	50 %	404212564
81	NC_018582	GCCC	2	8	29154	29161	0 %	0 %	25 %	75 %	404212564
82	NC_018582	GCCG	2	8	29421	29428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018582	CTCC	2	8	29641	29648	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_018582	CCCG	2	8	29860	29867	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_018582	CACC	2	8	30317	30324	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_018582	GCGT	2	8	30489	30496	0 %	25 %	50 %	25 %	404212565
87	NC_018582	CGAC	2	8	30615	30622	25 %	0 %	25 %	50 %	404212565
88	NC_018582	GAAG	2	8	31426	31433	50 %	0 %	50 %	0 %	404212565
89	NC_018582	CCGC	2	8	31485	31492	0 %	0 %	25 %	75 %	404212565
90	NC_018582	TGGC	2	8	31520	31527	0 %	25 %	50 %	25 %	404212565
91	NC_018582	GGTG	2	8	32094	32101	0 %	25 %	75 %	0 %	404212566
92	NC_018582	GACC	2	8	32135	32142	25 %	0 %	25 %	50 %	404212566
93	NC_018582	CGCT	2	8	32232	32239	0 %	25 %	25 %	50 %	404212566
94	NC_018582	CCAC	2	8	32329	32336	25 %	0 %	0 %	75 %	404212566
95	NC_018582	GACC	2	8	33882	33889	25 %	0 %	25 %	50 %	404212567
96	NC_018582	GGTG	2	8	34583	34590	0 %	25 %	75 %	0 %	404212568
97	NC_018582	GACC	2	8	34625	34632	25 %	0 %	25 %	50 %	404212568
98	NC_018582	CTGG	2	8	35544	35551	0 %	25 %	50 %	25 %	404212570
99	NC_018582	GTCG	2	8	36114	36121	0 %	25 %	50 %	25 %	404212571
100	NC_018582	GCCG	2	8	36694	36701	0 %	0 %	50 %	50 %	404212571
101	NC_018582	CATG	2	8	36879	36886	25 %	25 %	25 %	25 %	404212571
102	NC_018582	TTCG	2	8	36962	36969	0 %	50 %	25 %	25 %	404212571
103	NC_018582	CTCG	2	8	37191	37198	0 %	25 %	25 %	50 %	404212571
104	NC_018582	CCGC	2	8	38790	38797	0 %	0 %	25 %	75 %	404212572
105	NC_018582	CCAC	2	8	39246	39253	25 %	0 %	0 %	75 %	404212572
106	NC_018582	GGCC	2	8	39665	39672	0 %	0 %	50 %	50 %	404212573
107	NC_018582	CGAC	2	8	41848	41855	25 %	0 %	25 %	50 %	404212575
108	NC_018582	TCGA	2	8	41876	41883	25 %	25 %	25 %	25 %	404212575
109	NC_018582	GACC	2	8	42705	42712	25 %	0 %	25 %	50 %	404212577
110	NC_018582	TCGA	2	8	42836	42843	25 %	25 %	25 %	25 %	404212577
111	NC_018582	GCCA	2	8	42850	42857	25 %	0 %	25 %	50 %	404212577
112	NC_018582	GGAA	2	8	43062	43069	50 %	0 %	50 %	0 %	404212577
113	NC_018582	CGTG	2	8	44146	44153	0 %	25 %	50 %	25 %	404212579
114	NC_018582	CGCC	2	8	44777	44784	0 %	0 %	25 %	75 %	404212580
115	NC_018582	GCTG	2	8	44900	44907	0 %	25 %	50 %	25 %	404212580
116	NC_018582	GCCG	2	8	45356	45363	0 %	0 %	50 %	50 %	404212581
117	NC_018582	CGGT	2	8	45378	45385	0 %	25 %	50 %	25 %	404212581
118	NC_018582	GCAT	2	8	45622	45629	25 %	25 %	25 %	25 %	404212582
119	NC_018582	CCCG	2	8	46247	46254	0 %	0 %	25 %	75 %	404212583
120	NC_018582	CGGC	2	8	46294	46301	0 %	0 %	50 %	50 %	404212583
121	NC_018582	TCGC	2	8	47074	47081	0 %	25 %	25 %	50 %	404212584
122	NC_018582	CACG	2	8	47919	47926	25 %	0 %	25 %	50 %	404212585
123	NC_018582	GTCT	2	8	48222	48229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018582	CGAC	2	8	48720	48727	25 %	0 %	25 %	50 %	404212586
125	NC_018582	GACC	2	8	49035	49042	25 %	0 %	25 %	50 %	404212586
126	NC_018582	CACC	2	8	49070	49077	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_018582	TTCG	2	8	49209	49216	0 %	50 %	25 %	25 %	404212587
128	NC_018582	GGCC	2	8	49300	49307	0 %	0 %	50 %	50 %	404212587
129	NC_018582	CCGA	2	8	49362	49369	25 %	0 %	25 %	50 %	404212587
130	NC_018582	GGCC	2	8	49411	49418	0 %	0 %	50 %	50 %	404212587
131	NC_018582	TCCC	2	8	50392	50399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_018582	ACCC	2	8	50799	50806	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_018582	TGGC	2	8	52080	52087	0 %	25 %	50 %	25 %	404212590
134	NC_018582	CACC	2	8	52253	52260	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_018582	ATGC	2	8	52271	52278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018582	CCAG	2	8	52285	52292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018582	GACA	2	8	52754	52761	50 %	0 %	25 %	25 %	404212591
138	NC_018582	CTCA	2	8	53631	53638	25 %	25 %	0 %	50 %	404212594
139	NC_018582	GCCG	2	8	54336	54343	0 %	0 %	50 %	50 %	404212594
140	NC_018582	GACC	2	8	54448	54455	25 %	0 %	25 %	50 %	404212594
141	NC_018582	GCGG	2	8	54768	54775	0 %	0 %	75 %	25 %	404212595
142	NC_018582	GTCG	2	8	55122	55129	0 %	25 %	50 %	25 %	404212595
143	NC_018582	TGGC	2	8	55497	55504	0 %	25 %	50 %	25 %	404212595
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.