MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT1

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018582	GTGC	2	8	2390	2397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018582	GTGC	2	8	5326	5333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018582	CAGT	2	8	10008	10015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018582	CCGA	2	8	10653	10660	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018582	CGGC	2	8	10777	10784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018582	TGAC	2	8	17791	17798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018582	CCTG	2	8	17957	17964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018582	CCGG	2	8	24061	24068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018582	ACCG	2	8	25067	25074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018582	CCCG	2	8	25116	25123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_018582	CGCT	2	8	25290	25297	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018582	AACC	2	8	25340	25347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018582	GCCG	2	8	29421	29428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018582	CTCC	2	8	29641	29648	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_018582	CCCG	2	8	29860	29867	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_018582	CACC	2	8	30317	30324	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_018582	GTCT	2	8	48222	48229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018582	CACC	2	8	49070	49077	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_018582	TCCC	2	8	50392	50399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_018582	ACCC	2	8	50799	50806	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_018582	CACC	2	8	52253	52260	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_018582	ATGC	2	8	52271	52278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018582	CCAG	2	8	52285	52292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018582	GTGG	2	8	60279	60286	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018582	CAAT	2	8	81707	81714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018582	TCGG	2	8	82347	82354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018582	CTCC	2	8	82356	82363	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_018582	GCCG	2	8	82481	82488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018582	AGTA	2	8	82722	82729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018582	CATG	2	8	84014	84021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018582	TGTC	2	8	86283	86290	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018582	CCGG	2	8	86582	86589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018582	ACTG	2	8	86917	86924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018582	TCCA	2	8	89179	89186	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.