MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT1

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018582	CA	3	6	1235	1240	50 %	0 %	0 %	50 %	404212537
2	NC_018582	GT	3	6	1618	1623	0 %	50 %	50 %	0 %	404212538
3	NC_018582	CG	4	8	2089	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	404212538
4	NC_018582	GT	3	6	2528	2533	0 %	50 %	50 %	0 %	404212539
5	NC_018582	CG	3	6	2629	2634	0 %	0 %	50 %	50 %	404212539
6	NC_018582	GA	3	6	2796	2801	50 %	0 %	50 %	0 %	404212539
7	NC_018582	CG	3	6	3305	3310	0 %	0 %	50 %	50 %	404212541
8	NC_018582	TG	3	6	3518	3523	0 %	50 %	50 %	0 %	404212541
9	NC_018582	GC	3	6	3734	3739	0 %	0 %	50 %	50 %	404212542
10	NC_018582	CA	3	6	5624	5629	50 %	0 %	0 %	50 %	404212545
11	NC_018582	GC	3	6	6533	6538	0 %	0 %	50 %	50 %	404212545
12	NC_018582	CT	3	6	7340	7345	0 %	50 %	0 %	50 %	404212545
13	NC_018582	GC	3	6	7757	7762	0 %	0 %	50 %	50 %	404212545
14	NC_018582	CG	3	6	7809	7814	0 %	0 %	50 %	50 %	404212545
15	NC_018582	GA	3	6	10235	10240	50 %	0 %	50 %	0 %	404212548
16	NC_018582	GC	3	6	12729	12734	0 %	0 %	50 %	50 %	404212550
17	NC_018582	CA	3	6	13933	13938	50 %	0 %	0 %	50 %	404212550
18	NC_018582	CG	3	6	15186	15191	0 %	0 %	50 %	50 %	404212550
19	NC_018582	CA	3	6	15525	15530	50 %	0 %	0 %	50 %	404212550
20	NC_018582	GC	3	6	15784	15789	0 %	0 %	50 %	50 %	404212550
21	NC_018582	TC	3	6	16680	16685	0 %	50 %	0 %	50 %	404212551
22	NC_018582	GT	3	6	16859	16864	0 %	50 %	50 %	0 %	404212551
23	NC_018582	TC	3	6	16889	16894	0 %	50 %	0 %	50 %	404212551
24	NC_018582	TC	3	6	17200	17205	0 %	50 %	0 %	50 %	404212551
25	NC_018582	GA	3	6	17641	17646	50 %	0 %	50 %	0 %	404212551
26	NC_018582	GC	3	6	18194	18199	0 %	0 %	50 %	50 %	404212552
27	NC_018582	GC	3	6	18534	18539	0 %	0 %	50 %	50 %	404212552
28	NC_018582	AG	3	6	19677	19682	50 %	0 %	50 %	0 %	404212554
29	NC_018582	GC	3	6	21205	21210	0 %	0 %	50 %	50 %	404212556
30	NC_018582	TG	3	6	23851	23856	0 %	50 %	50 %	0 %	404212559
31	NC_018582	GC	3	6	24450	24455	0 %	0 %	50 %	50 %	404212560
32	NC_018582	AG	3	6	26312	26317	50 %	0 %	50 %	0 %	404212562
33	NC_018582	GC	3	6	26432	26437	0 %	0 %	50 %	50 %	404212562
34	NC_018582	AC	3	6	26600	26605	50 %	0 %	0 %	50 %	404212562
35	NC_018582	GC	3	6	27571	27576	0 %	0 %	50 %	50 %	404212563
36	NC_018582	GA	3	6	27867	27872	50 %	0 %	50 %	0 %	404212564
37	NC_018582	AC	3	6	28988	28993	50 %	0 %	0 %	50 %	404212564
38	NC_018582	AC	3	6	30347	30352	50 %	0 %	0 %	50 %	404212565
39	NC_018582	GC	3	6	30691	30696	0 %	0 %	50 %	50 %	404212565
40	NC_018582	CG	3	6	30928	30933	0 %	0 %	50 %	50 %	404212565
41	NC_018582	CG	3	6	31281	31286	0 %	0 %	50 %	50 %	404212565
42	NC_018582	GC	3	6	31588	31593	0 %	0 %	50 %	50 %	404212565
43	NC_018582	GC	4	8	32112	32119	0 %	0 %	50 %	50 %	404212566
44	NC_018582	GC	3	6	32266	32271	0 %	0 %	50 %	50 %	404212566
45	NC_018582	TC	3	6	32318	32323	0 %	50 %	0 %	50 %	404212566
46	NC_018582	GC	3	6	32813	32818	0 %	0 %	50 %	50 %	404212566
47	NC_018582	GC	3	6	34748	34753	0 %	0 %	50 %	50 %	404212568
48	NC_018582	TC	3	6	34801	34806	0 %	50 %	0 %	50 %	404212569
49	NC_018582	AG	3	6	35334	35339	50 %	0 %	50 %	0 %	404212570
50	NC_018582	CA	3	6	38566	38571	50 %	0 %	0 %	50 %	404212572
51	NC_018582	TG	3	6	38616	38621	0 %	50 %	50 %	0 %	404212572
52	NC_018582	CA	3	6	38870	38875	50 %	0 %	0 %	50 %	404212572
53	NC_018582	CG	3	6	38975	38980	0 %	0 %	50 %	50 %	404212572
54	NC_018582	TG	3	6	39570	39575	0 %	50 %	50 %	0 %	404212573
55	NC_018582	CT	3	6	39594	39599	0 %	50 %	0 %	50 %	404212573
56	NC_018582	GC	3	6	40474	40479	0 %	0 %	50 %	50 %	404212573
57	NC_018582	CA	3	6	40927	40932	50 %	0 %	0 %	50 %	404212573
58	NC_018582	CA	3	6	41069	41074	50 %	0 %	0 %	50 %	404212573
59	NC_018582	GC	3	6	41207	41212	0 %	0 %	50 %	50 %	404212574
60	NC_018582	GC	3	6	41308	41313	0 %	0 %	50 %	50 %	404212574
61	NC_018582	GC	3	6	42500	42505	0 %	0 %	50 %	50 %	404212576
62	NC_018582	CT	3	6	43585	43590	0 %	50 %	0 %	50 %	404212578
63	NC_018582	CG	3	6	43908	43913	0 %	0 %	50 %	50 %	404212578
64	NC_018582	GC	3	6	44399	44404	0 %	0 %	50 %	50 %	404212579
65	NC_018582	AC	4	8	45854	45861	50 %	0 %	0 %	50 %	404212582
66	NC_018582	CA	3	6	45934	45939	50 %	0 %	0 %	50 %	404212583
67	NC_018582	CG	3	6	45999	46004	0 %	0 %	50 %	50 %	404212583
68	NC_018582	AC	3	6	46460	46465	50 %	0 %	0 %	50 %	404212583
69	NC_018582	CG	3	6	47820	47825	0 %	0 %	50 %	50 %	404212585
70	NC_018582	AC	3	6	48068	48073	50 %	0 %	0 %	50 %	404212585
71	NC_018582	AC	3	6	48084	48089	50 %	0 %	0 %	50 %	404212585
72	NC_018582	CG	3	6	49286	49291	0 %	0 %	50 %	50 %	404212587
73	NC_018582	CG	3	6	49372	49377	0 %	0 %	50 %	50 %	404212587
74	NC_018582	CG	3	6	49532	49537	0 %	0 %	50 %	50 %	404212587
75	NC_018582	CA	3	6	49548	49553	50 %	0 %	0 %	50 %	404212587
76	NC_018582	GC	3	6	49693	49698	0 %	0 %	50 %	50 %	404212587
77	NC_018582	GC	3	6	49705	49710	0 %	0 %	50 %	50 %	404212587
78	NC_018582	CG	3	6	51673	51678	0 %	0 %	50 %	50 %	404212590
79	NC_018582	AG	3	6	52883	52888	50 %	0 %	50 %	0 %	404212592
80	NC_018582	CG	3	6	53302	53307	0 %	0 %	50 %	50 %	404212593
81	NC_018582	GC	3	6	54320	54325	0 %	0 %	50 %	50 %	404212594
82	NC_018582	GC	3	6	55056	55061	0 %	0 %	50 %	50 %	404212595
83	NC_018582	GT	3	6	55392	55397	0 %	50 %	50 %	0 %	404212595
84	NC_018582	GT	3	6	55740	55745	0 %	50 %	50 %	0 %	404212595
85	NC_018582	TG	3	6	55830	55835	0 %	50 %	50 %	0 %	404212595
86	NC_018582	CG	3	6	56066	56071	0 %	0 %	50 %	50 %	404212595
87	NC_018582	CG	3	6	56886	56891	0 %	0 %	50 %	50 %	404212596
88	NC_018582	CG	3	6	57149	57154	0 %	0 %	50 %	50 %	404212596
89	NC_018582	CG	3	6	57942	57947	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
90	NC_018582	GC	3	6	58110	58115	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
91	NC_018582	GC	3	6	58172	58177	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
92	NC_018582	GC	3	6	58380	58385	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
93	NC_018582	CA	3	6	58421	58426	50 %	0 %	0 %	50 %	404212597
94	NC_018582	CG	3	6	58449	58454	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
95	NC_018582	CG	3	6	58532	58537	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
96	NC_018582	GC	3	6	58604	58609	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
97	NC_018582	GC	3	6	58626	58631	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
98	NC_018582	GC	3	6	58824	58829	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
99	NC_018582	GC	3	6	58995	59000	0 %	0 %	50 %	50 %	404212597
100	NC_018582	CA	3	6	59368	59373	50 %	0 %	0 %	50 %	404212597
101	NC_018582	GC	3	6	61448	61453	0 %	0 %	50 %	50 %	404212601
102	NC_018582	GC	3	6	61701	61706	0 %	0 %	50 %	50 %	404212602
103	NC_018582	CA	3	6	61842	61847	50 %	0 %	0 %	50 %	404212602
104	NC_018582	GC	3	6	61887	61892	0 %	0 %	50 %	50 %	404212602
105	NC_018582	GC	3	6	62415	62420	0 %	0 %	50 %	50 %	404212603
106	NC_018582	GC	3	6	63035	63040	0 %	0 %	50 %	50 %	404212603
107	NC_018582	CG	3	6	63648	63653	0 %	0 %	50 %	50 %	404212603
108	NC_018582	AC	3	6	64097	64102	50 %	0 %	0 %	50 %	404212604
109	NC_018582	GC	4	8	65573	65580	0 %	0 %	50 %	50 %	404212606
110	NC_018582	CG	3	6	65710	65715	0 %	0 %	50 %	50 %	404212606
111	NC_018582	GC	3	6	66467	66472	0 %	0 %	50 %	50 %	404212607
112	NC_018582	GC	3	6	66882	66887	0 %	0 %	50 %	50 %	404212607
113	NC_018582	GC	3	6	68069	68074	0 %	0 %	50 %	50 %	404212608
114	NC_018582	GA	3	6	68193	68198	50 %	0 %	50 %	0 %	404212608
115	NC_018582	AC	3	6	68459	68464	50 %	0 %	0 %	50 %	404212609
116	NC_018582	AC	4	8	69004	69011	50 %	0 %	0 %	50 %	404212609
117	NC_018582	CG	3	6	69306	69311	0 %	0 %	50 %	50 %	404212609
118	NC_018582	GC	3	6	69758	69763	0 %	0 %	50 %	50 %	404212609
119	NC_018582	CG	3	6	69840	69845	0 %	0 %	50 %	50 %	404212609
120	NC_018582	GC	3	6	69970	69975	0 %	0 %	50 %	50 %	404212609
121	NC_018582	CG	3	6	70358	70363	0 %	0 %	50 %	50 %	404212610
122	NC_018582	CG	3	6	70806	70811	0 %	0 %	50 %	50 %	404212610
123	NC_018582	CG	3	6	71265	71270	0 %	0 %	50 %	50 %	404212610
124	NC_018582	GC	3	6	71672	71677	0 %	0 %	50 %	50 %	404212610
125	NC_018582	GC	3	6	73155	73160	0 %	0 %	50 %	50 %	404212611
126	NC_018582	GA	3	6	74172	74177	50 %	0 %	50 %	0 %	404212613
127	NC_018582	GA	3	6	74384	74389	50 %	0 %	50 %	0 %	404212613
128	NC_018582	TG	3	6	75418	75423	0 %	50 %	50 %	0 %	404212615
129	NC_018582	TG	3	6	75431	75436	0 %	50 %	50 %	0 %	404212615
130	NC_018582	TG	3	6	75807	75812	0 %	50 %	50 %	0 %	404212617
131	NC_018582	GC	3	6	76127	76132	0 %	0 %	50 %	50 %	404212617
132	NC_018582	CG	3	6	76170	76175	0 %	0 %	50 %	50 %	404212617
133	NC_018582	GT	3	6	76356	76361	0 %	50 %	50 %	0 %	404212617
134	NC_018582	CA	3	6	76612	76617	50 %	0 %	0 %	50 %	404212618
135	NC_018582	GT	3	6	76627	76632	0 %	50 %	50 %	0 %	404212618
136	NC_018582	CG	3	6	77034	77039	0 %	0 %	50 %	50 %	404212618
137	NC_018582	CG	3	6	77128	77133	0 %	0 %	50 %	50 %	404212618
138	NC_018582	GC	3	6	77436	77441	0 %	0 %	50 %	50 %	404212619
139	NC_018582	GC	3	6	77776	77781	0 %	0 %	50 %	50 %	404212619
140	NC_018582	CG	3	6	79358	79363	0 %	0 %	50 %	50 %	404212620
141	NC_018582	AC	3	6	80729	80734	50 %	0 %	0 %	50 %	404212621
142	NC_018582	CG	3	6	80970	80975	0 %	0 %	50 %	50 %	404212621
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.