MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT2

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018580	TCGACC	2	12	154	165	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404212378
2	NC_018580	CGGCCG	2	12	466	477	0 %	0 %	50 %	50 %	404212378
3	NC_018580	ACCGCC	2	12	1072	1083	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	404212379
4	NC_018580	CGACGC	2	12	5744	5755	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212384
5	NC_018580	CGGTGA	2	12	6178	6189	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404212384
6	NC_018580	CAGGTG	2	12	9834	9845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404212391
7	NC_018580	GAGACC	2	12	10932	10943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212393
8	NC_018580	ATGCTC	2	12	11100	11111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404212393
9	NC_018580	CCCGAA	2	12	13208	13219	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	404212397
10	NC_018580	GCACCC	2	12	16335	16346	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	404212400
11	NC_018580	CAGCGA	2	12	16586	16597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018580	CCGCTG	2	12	19656	19667	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	404212403
13	NC_018580	GCGGGT	2	12	19727	19738	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404212403
14	NC_018580	CGGCCT	2	12	21068	21079	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	404212405
15	NC_018580	TTGCCC	2	12	22179	22190	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	404212407
16	NC_018580	GCGGCT	2	12	22222	22233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404212407
17	NC_018580	GATCGC	2	12	22977	22988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212408
18	NC_018580	GCCAGG	2	12	23609	23620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	404212408
19	NC_018580	TGAAGG	2	12	25194	25205	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018580	GGCGCC	2	12	26906	26917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018580	CCCGGA	2	12	27265	27276	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212414
22	NC_018580	CGACGT	2	12	29080	29091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212415
23	NC_018580	CGGAAA	2	12	29431	29442	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404212416
24	NC_018580	TGTTCG	2	12	35417	35428	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404212422
25	NC_018580	TCGAGA	2	12	38763	38774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404212424
26	NC_018580	GAGGCT	2	12	43049	43060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404212428
27	NC_018580	CAAGGA	2	12	49283	49294	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404212431
28	NC_018580	ACTCGC	2	12	49559	49570	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404212431
29	NC_018580	CCGGCA	2	12	51470	51481	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212433
30	NC_018580	CTCCGG	2	12	52053	52064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	404212433
31	NC_018580	CACGTG	2	12	55180	55191	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212436
32	NC_018580	CGACAC	2	12	57513	57524	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	404212437
33	NC_018580	CGAGGC	2	12	59334	59345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	404212438
34	NC_018580	CAGCTG	2	12	66224	66235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212443
35	NC_018580	GGCAGC	2	12	73971	73982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	404212445
36	NC_018580	CCCGAC	2	12	74023	74034	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	404212445
37	NC_018580	CAGCGC	2	12	75419	75430	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212446
38	NC_018580	TCGAGA	2	12	80735	80746	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404212448
39	NC_018580	CGACAG	2	12	88232	88243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212453
40	NC_018580	CAACAG	2	12	91847	91858	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404212457
41	NC_018580	CGACGG	2	12	101628	101639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018580	AAGCCG	2	12	102431	102442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212467
43	NC_018580	GGCGGA	2	12	102522	102533	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	404212467
44	NC_018580	CGCACT	2	12	103569	103580	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404212468
45	NC_018580	CGACCG	2	12	104322	104333	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212468
46	NC_018580	GGCCGA	2	12	105543	105554	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	404212468
47	NC_018580	CAGATG	2	12	107556	107567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404212469
48	NC_018580	ACCGCG	2	12	108408	108419	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212469
49	NC_018580	CGACCT	2	12	108479	108490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404212469
50	NC_018580	AGCGAT	2	12	111353	111364	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404212470
51	NC_018580	ACCGCG	2	12	112315	112326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212471
52	NC_018580	GGGTGA	2	12	112697	112708	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	404212471
53	NC_018580	CGACCT	2	12	114755	114766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404212471
54	NC_018580	GGCAGA	2	12	117042	117053	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	404212472
55	NC_018580	CGCGAG	2	12	122153	122164	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018580	CCGACT	2	12	124326	124337	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404212478
57	NC_018580	CACGAC	2	12	126756	126767	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	404212481
58	NC_018580	TCGACG	2	12	129283	129294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212481
59	NC_018580	GTCATC	2	12	132660	132671	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404212484
60	NC_018580	GAGCGG	2	12	137659	137670	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	404212488
61	NC_018580	TCGACG	2	12	138117	138128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212488
62	NC_018580	CGGGGT	2	12	147537	147548	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404212495
63	NC_018580	CGAGAT	2	12	149252	149263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404212496
64	NC_018580	TCTCTT	2	12	151740	151751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212499
65	NC_018580	ATTGCG	2	12	154750	154761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	404212502
66	NC_018580	CGCCGG	2	12	156503	156514	0 %	0 %	50 %	50 %	404212504
67	NC_018580	CTTCGG	2	12	159341	159352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212506
68	NC_018580	GTACCG	2	12	160115	160126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212507
69	NC_018580	GGAGGT	2	12	160923	160934	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	404212507
70	NC_018580	GCCTCG	2	12	162004	162015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	404212507
71	NC_018580	GAACGA	2	12	172223	172234	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404212522
72	NC_018580	TCGGTT	2	12	175248	175259	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018580	ACCAGC	2	12	178336	178347	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	404212531
74	NC_018580	AACGCG	2	12	178692	178703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212531
75	NC_018580	TTCGAG	2	12	179560	179571	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.