MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT2

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018580	TGGT	2	8	2380	2387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018580	CGCC	2	8	4595	4602	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_018580	AGGT	2	8	8163	8170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018580	TTCG	2	8	9154	9161	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018580	GGGT	2	8	9496	9503	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018580	GGCG	2	8	9608	9615	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018580	GCCG	2	8	11974	11981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018580	TGCG	2	8	12683	12690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018580	CGAA	2	8	12746	12753	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018580	GATT	2	8	15144	15151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018580	TGAC	2	8	15519	15526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018580	GAAC	2	8	15598	15605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018580	GCGG	2	8	16783	16790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018580	GCCC	2	8	16847	16854	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_018580	GGCG	2	8	16865	16872	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018580	AACC	2	8	17841	17848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018580	GGGA	2	8	18292	18299	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018580	GCAC	2	8	20656	20663	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018580	GACG	2	8	21207	21214	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018580	ATCG	2	8	21797	21804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018580	GTTG	2	8	22546	22553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018580	TGAA	2	8	25834	25841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018580	GGAT	2	8	25953	25960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018580	ACCG	2	8	27081	27088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018580	ATCT	2	8	30641	30648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018580	CAGG	2	8	36567	36574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018580	CACG	2	8	36848	36855	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018580	CCCG	2	8	61151	61158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_018580	ACCG	2	8	61194	61201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018580	CCTG	2	8	63296	63303	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018580	TTAT	2	8	63349	63356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018580	GAGT	2	8	69894	69901	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018580	ACGA	2	8	80534	80541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018580	TTGA	2	8	85518	85525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018580	TGCC	2	8	86641	86648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018580	AGCG	2	8	87951	87958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018580	GCTC	3	12	89188	89199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018580	CCAT	2	8	89814	89821	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018580	ATGT	2	8	89859	89866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018580	GGAG	2	8	89885	89892	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018580	CGGC	2	8	90298	90305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018580	CGCA	2	8	90327	90334	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018580	CCGG	2	8	90362	90369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018580	CGAT	2	8	93352	93359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018580	CAGC	2	8	93377	93384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018580	CGAC	2	8	93520	93527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018580	GGTC	2	8	93636	93643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018580	TCGC	2	8	101597	101604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018580	GCAA	2	8	109397	109404	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018580	TGGC	2	8	119329	119336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018580	CACC	2	8	119358	119365	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_018580	ACGT	2	8	121439	121446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018580	AGGA	2	8	122244	122251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018580	CGGC	2	8	129746	129753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018580	AAGC	2	8	129876	129883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018580	GAGT	2	8	130414	130421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018580	CGGA	2	8	132834	132841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018580	TCAC	2	8	136279	136286	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018580	AGGC	2	8	147593	147600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018580	ACTA	2	8	149833	149840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018580	GCCC	2	8	150020	150027	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_018580	GCTG	2	8	150030	150037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018580	GTCA	2	8	151324	151331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018580	GTTG	2	8	151413	151420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018580	ACCC	2	8	152571	152578	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_018580	CGCC	2	8	159582	159589	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_018580	TGGC	2	8	164296	164303	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018580	GGTG	2	8	168651	168658	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018580	CGTC	2	8	170091	170098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018580	TCAC	2	8	171484	171491	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018580	CGTT	2	8	171494	171501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018580	GTCA	2	8	175225	175232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018580	TTCC	2	8	175940	175947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018580	TGAC	2	8	177144	177151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018580	GATC	2	8	179546	179553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018580	CCGA	2	8	180561	180568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.