MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT2

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018580	CCGA	2	8	281	288	25 %	0 %	25 %	50 %	404212378
2	NC_018580	GCTC	2	8	377	384	0 %	25 %	25 %	50 %	404212378
3	NC_018580	GCCC	2	8	439	446	0 %	0 %	25 %	75 %	404212378
4	NC_018580	GTTC	2	8	776	783	0 %	50 %	25 %	25 %	404212378
5	NC_018580	GTCG	2	8	857	864	0 %	25 %	50 %	25 %	404212378
6	NC_018580	CGTC	2	8	896	903	0 %	25 %	25 %	50 %	404212378
7	NC_018580	CGCT	2	8	1344	1351	0 %	25 %	25 %	50 %	404212379
8	NC_018580	ACGC	2	8	2165	2172	25 %	0 %	25 %	50 %	404212381
9	NC_018580	CAGC	2	8	2739	2746	25 %	0 %	25 %	50 %	404212382
10	NC_018580	GTGG	2	8	2820	2827	0 %	25 %	75 %	0 %	404212382
11	NC_018580	TTCG	2	8	2962	2969	0 %	50 %	25 %	25 %	404212382
12	NC_018580	GTCG	2	8	3600	3607	0 %	25 %	50 %	25 %	404212382
13	NC_018580	TGGG	2	8	3871	3878	0 %	25 %	75 %	0 %	404212382
14	NC_018580	CATC	2	8	4060	4067	25 %	25 %	0 %	50 %	404212382
15	NC_018580	CGGC	2	8	4123	4130	0 %	0 %	50 %	50 %	404212382
16	NC_018580	GTGC	2	8	6045	6052	0 %	25 %	50 %	25 %	404212384
17	NC_018580	GCCG	2	8	6869	6876	0 %	0 %	50 %	50 %	404212384
18	NC_018580	TCCG	2	8	7352	7359	0 %	25 %	25 %	50 %	404212385
19	NC_018580	TCAT	2	8	8075	8082	25 %	50 %	0 %	25 %	404212387
20	NC_018580	GACG	2	8	8442	8449	25 %	0 %	50 %	25 %	404212389
21	NC_018580	CGCC	3	12	8508	8519	0 %	0 %	25 %	75 %	404212389
22	NC_018580	CGGT	2	8	10114	10121	0 %	25 %	50 %	25 %	404212392
23	NC_018580	GTGC	2	8	10180	10187	0 %	25 %	50 %	25 %	404212392
24	NC_018580	GCTG	3	12	10844	10855	0 %	25 %	50 %	25 %	404212393
25	NC_018580	GACT	2	8	11146	11153	25 %	25 %	25 %	25 %	404212393
26	NC_018580	GGAT	2	8	11598	11605	25 %	25 %	50 %	0 %	404212395
27	NC_018580	ACCG	2	8	11689	11696	25 %	0 %	25 %	50 %	404212395
28	NC_018580	CGCC	2	8	11809	11816	0 %	0 %	25 %	75 %	404212395
29	NC_018580	TTGT	2	8	13435	13442	0 %	75 %	25 %	0 %	404212397
30	NC_018580	TCGA	3	12	14681	14692	25 %	25 %	25 %	25 %	404212398
31	NC_018580	CACG	2	8	14762	14769	25 %	0 %	25 %	50 %	404212398
32	NC_018580	GTCG	2	8	14789	14796	0 %	25 %	50 %	25 %	404212398
33	NC_018580	TGGC	2	8	15919	15926	0 %	25 %	50 %	25 %	404212399
34	NC_018580	TCCC	2	8	17413	17420	0 %	25 %	0 %	75 %	404212401
35	NC_018580	CGGC	2	8	19078	19085	0 %	0 %	50 %	50 %	404212403
36	NC_018580	GATC	2	8	19324	19331	25 %	25 %	25 %	25 %	404212403
37	NC_018580	GCGA	2	8	19468	19475	25 %	0 %	50 %	25 %	404212403
38	NC_018580	CGGT	2	8	19597	19604	0 %	25 %	50 %	25 %	404212403
39	NC_018580	GCAC	2	8	19617	19624	25 %	0 %	25 %	50 %	404212403
40	NC_018580	GGCA	2	8	19637	19644	25 %	0 %	50 %	25 %	404212403
41	NC_018580	GACC	2	8	19709	19716	25 %	0 %	25 %	50 %	404212403
42	NC_018580	GACG	2	8	19742	19749	25 %	0 %	50 %	25 %	404212403
43	NC_018580	TCGA	2	8	20137	20144	25 %	25 %	25 %	25 %	404212404
44	NC_018580	GCGA	2	8	21529	21536	25 %	0 %	50 %	25 %	404212406
45	NC_018580	CGAT	2	8	23030	23037	25 %	25 %	25 %	25 %	404212408
46	NC_018580	TGGG	2	8	23139	23146	0 %	25 %	75 %	0 %	404212408
47	NC_018580	CGTG	2	8	23445	23452	0 %	25 %	50 %	25 %	404212408
48	NC_018580	GCTC	2	8	23502	23509	0 %	25 %	25 %	50 %	404212408
49	NC_018580	ATCG	2	8	23641	23648	25 %	25 %	25 %	25 %	404212408
50	NC_018580	GCCG	2	8	24237	24244	0 %	0 %	50 %	50 %	404212409
51	NC_018580	ACCA	2	8	25136	25143	50 %	0 %	0 %	50 %	404212410
52	NC_018580	TCAG	2	8	25323	25330	25 %	25 %	25 %	25 %	404212411
53	NC_018580	AGCG	2	8	25654	25661	25 %	0 %	50 %	25 %	404212411
54	NC_018580	TCGA	2	8	26121	26128	25 %	25 %	25 %	25 %	404212412
55	NC_018580	TCAC	2	8	26231	26238	25 %	25 %	0 %	50 %	404212412
56	NC_018580	CTCG	2	8	26769	26776	0 %	25 %	25 %	50 %	404212413
57	NC_018580	CTGA	2	8	26790	26797	25 %	25 %	25 %	25 %	404212413
58	NC_018580	GCCG	2	8	27292	27299	0 %	0 %	50 %	50 %	404212414
59	NC_018580	TGGC	2	8	27521	27528	0 %	25 %	50 %	25 %	404212414
60	NC_018580	CGGC	2	8	27714	27721	0 %	0 %	50 %	50 %	404212414
61	NC_018580	CGGA	2	8	27894	27901	25 %	0 %	50 %	25 %	404212414
62	NC_018580	ACCT	2	8	28328	28335	25 %	25 %	0 %	50 %	404212415
63	NC_018580	GATT	2	8	28381	28388	25 %	50 %	25 %	0 %	404212415
64	NC_018580	CATC	2	8	28587	28594	25 %	25 %	0 %	50 %	404212415
65	NC_018580	GGCT	2	8	28633	28640	0 %	25 %	50 %	25 %	404212415
66	NC_018580	CGGG	2	8	28954	28961	0 %	0 %	75 %	25 %	404212415
67	NC_018580	CCAC	2	8	28962	28969	25 %	0 %	0 %	75 %	404212415
68	NC_018580	GCTG	2	8	29029	29036	0 %	25 %	50 %	25 %	404212415
69	NC_018580	TCGA	2	8	29576	29583	25 %	25 %	25 %	25 %	404212416
70	NC_018580	AGAA	2	8	30097	30104	75 %	0 %	25 %	0 %	404212417
71	NC_018580	GTCA	2	8	30527	30534	25 %	25 %	25 %	25 %	404212418
72	NC_018580	GGCC	2	8	31647	31654	0 %	0 %	50 %	50 %	404212419
73	NC_018580	GGCT	2	8	31733	31740	0 %	25 %	50 %	25 %	404212419
74	NC_018580	TACT	2	8	32240	32247	25 %	50 %	0 %	25 %	404212420
75	NC_018580	GACC	2	8	32496	32503	25 %	0 %	25 %	50 %	404212420
76	NC_018580	ATCG	2	8	32724	32731	25 %	25 %	25 %	25 %	404212420
77	NC_018580	AGCA	2	8	32823	32830	50 %	0 %	25 %	25 %	404212420
78	NC_018580	CGGG	2	8	33005	33012	0 %	0 %	75 %	25 %	404212420
79	NC_018580	TCGA	2	8	33205	33212	25 %	25 %	25 %	25 %	404212420
80	NC_018580	CCGG	2	8	33339	33346	0 %	0 %	50 %	50 %	404212420
81	NC_018580	CGTT	2	8	33629	33636	0 %	50 %	25 %	25 %	404212420
82	NC_018580	GCTG	2	8	33677	33684	0 %	25 %	50 %	25 %	404212420
83	NC_018580	CGTT	2	8	35075	35082	0 %	50 %	25 %	25 %	404212421
84	NC_018580	CCGG	2	8	35184	35191	0 %	0 %	50 %	50 %	404212421
85	NC_018580	CGGC	2	8	36392	36399	0 %	0 %	50 %	50 %	404212423
86	NC_018580	CCGA	2	8	37946	37953	25 %	0 %	25 %	50 %	404212424
87	NC_018580	GATC	2	8	38149	38156	25 %	25 %	25 %	25 %	404212424
88	NC_018580	GCCG	2	8	38182	38189	0 %	0 %	50 %	50 %	404212424
89	NC_018580	TGTA	2	8	38607	38614	25 %	50 %	25 %	0 %	404212424
90	NC_018580	CTCG	2	8	38705	38712	0 %	25 %	25 %	50 %	404212424
91	NC_018580	CGGC	2	8	39403	39410	0 %	0 %	50 %	50 %	404212426
92	NC_018580	ATGC	2	8	39524	39531	25 %	25 %	25 %	25 %	404212426
93	NC_018580	TCGG	2	8	40475	40482	0 %	25 %	50 %	25 %	404212427
94	NC_018580	TGCA	2	8	40514	40521	25 %	25 %	25 %	25 %	404212427
95	NC_018580	TCCG	2	8	40589	40596	0 %	25 %	25 %	50 %	404212427
96	NC_018580	CGAC	2	8	40691	40698	25 %	0 %	25 %	50 %	404212427
97	NC_018580	CCGA	2	8	42126	42133	25 %	0 %	25 %	50 %	404212427
98	NC_018580	CGAC	2	8	42681	42688	25 %	0 %	25 %	50 %	404212428
99	NC_018580	TCGT	2	8	43139	43146	0 %	50 %	25 %	25 %	404212428
100	NC_018580	AGCA	2	8	43163	43170	50 %	0 %	25 %	25 %	404212428
101	NC_018580	ACGT	2	8	43877	43884	25 %	25 %	25 %	25 %	404212428
102	NC_018580	CAGT	2	8	44238	44245	25 %	25 %	25 %	25 %	404212428
103	NC_018580	GACC	2	8	44637	44644	25 %	0 %	25 %	50 %	404212428
104	NC_018580	GGAA	2	8	45034	45041	50 %	0 %	50 %	0 %	404212428
105	NC_018580	AGCC	2	8	45719	45726	25 %	0 %	25 %	50 %	404212428
106	NC_018580	GCCC	2	8	46035	46042	0 %	0 %	25 %	75 %	404212428
107	NC_018580	GATC	2	8	46593	46600	25 %	25 %	25 %	25 %	404212429
108	NC_018580	CTGC	2	8	46717	46724	0 %	25 %	25 %	50 %	404212429
109	NC_018580	CGAG	2	8	48079	48086	25 %	0 %	50 %	25 %	404212430
110	NC_018580	TCTG	2	8	48262	48269	0 %	50 %	25 %	25 %	404212430
111	NC_018580	TGAC	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	404212430
112	NC_018580	CGGA	2	8	48625	48632	25 %	0 %	50 %	25 %	404212431
113	NC_018580	GGTG	2	8	48745	48752	0 %	25 %	75 %	0 %	404212431
114	NC_018580	GCAA	2	8	49489	49496	50 %	0 %	25 %	25 %	404212431
115	NC_018580	GGTC	2	8	49528	49535	0 %	25 %	50 %	25 %	404212431
116	NC_018580	GCAA	2	8	49590	49597	50 %	0 %	25 %	25 %	404212431
117	NC_018580	ATGT	2	8	49749	49756	25 %	50 %	25 %	0 %	404212431
118	NC_018580	ATGT	2	8	49986	49993	25 %	50 %	25 %	0 %	404212431
119	NC_018580	GCAG	2	8	50964	50971	25 %	0 %	50 %	25 %	404212432
120	NC_018580	GGCA	2	8	51005	51012	25 %	0 %	50 %	25 %	404212432
121	NC_018580	GGGT	2	8	51185	51192	0 %	25 %	75 %	0 %	404212432
122	NC_018580	GTCG	2	8	51278	51285	0 %	25 %	50 %	25 %	404212432
123	NC_018580	TGGA	2	8	51431	51438	25 %	25 %	50 %	0 %	404212432
124	NC_018580	AAAG	2	8	51748	51755	75 %	0 %	25 %	0 %	404212433
125	NC_018580	ATTC	2	8	52554	52561	25 %	50 %	0 %	25 %	404212434
126	NC_018580	CCCG	2	8	53163	53170	0 %	0 %	25 %	75 %	404212435
127	NC_018580	AGGC	2	8	53643	53650	25 %	0 %	50 %	25 %	404212435
128	NC_018580	GCCG	2	8	54721	54728	0 %	0 %	50 %	50 %	404212436
129	NC_018580	GTGG	2	8	54778	54785	0 %	25 %	75 %	0 %	404212436
130	NC_018580	CGAC	2	8	55305	55312	25 %	0 %	25 %	50 %	404212436
131	NC_018580	CGGT	2	8	55340	55347	0 %	25 %	50 %	25 %	404212436
132	NC_018580	TCGT	2	8	55505	55512	0 %	50 %	25 %	25 %	404212436
133	NC_018580	CAGC	2	8	55533	55540	25 %	0 %	25 %	50 %	404212436
134	NC_018580	AGTA	2	8	56026	56033	50 %	25 %	25 %	0 %	404212436
135	NC_018580	CGGT	2	8	56089	56096	0 %	25 %	50 %	25 %	404212436
136	NC_018580	ACTG	2	8	56115	56122	25 %	25 %	25 %	25 %	404212436
137	NC_018580	GCCG	2	8	56254	56261	0 %	0 %	50 %	50 %	404212436
138	NC_018580	GACC	2	8	56856	56863	25 %	0 %	25 %	50 %	404212436
139	NC_018580	CGGC	2	8	57944	57951	0 %	0 %	50 %	50 %	404212437
140	NC_018580	CGGC	2	8	58316	58323	0 %	0 %	50 %	50 %	404212437
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408	NC_018580	ACGC	2	8	180791	180798	25 %	0 %	25 %	50 %	404212533
409	NC_018580	GCCA	2	8	180822	180829	25 %	0 %	25 %	50 %	404212533
410	NC_018580	TCCC	2	8	181336	181343	0 %	25 %	0 %	75 %	404212534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.